# Cynthia de Oliveira Lage Ferreira

- Cargo: Livre
- Unidade: Instituto de Ciências Matemáticas e de Computação (Universidade de São Paulo)
- Departamento: Departamento de Matemática Aplicada e Estatística
- Currículo Lattes: http://lattes.cnpq.br/8936337530468942
- Currículo atualizado em: 01/09/2025
- Perfil completo: https://uspaberta.ime.usp.br/docentes/8936337530468942

Cita-se como: FERREIRA, Cynthia;Ferreira, Cynthia;FERREIRA, Cynthia de O.L.;FERREIRA, CYNTHIA DE OLIVEIRA LAGE;de Oliveira Lage Ferreira, Cynthia

## Resumo

Possui graduação em Licenciatura em Matemática pela Universidade do Estado do Rio de Janeiro (2002), mestrado em Matemática pela Pontifícia Universidade Católica do Rio de Janeiro (2005) e doutorado em Matemática pela Université de Toulouse, Institut de Mathématiques de Toulouse (2009). É docente da Universidade de São Paulo desde 2013. Atualmente tem se dedicado à pesquisa de temas relativos à análise de dados e sistemas complexos biológicos.

## Áreas de atuação

- Ciencias Exatas E Da Terra › Matemática › Matemática Aplicada › Geometria Computacional
- Ciencias Exatas E Da Terra › Física › Sistemas Complexos

## Formação

- Pós-Doutorado · Pontifícia Universidade Católica do Rio de Janeiro · 2010–2012
- Doutorado · Matematica · Université de Toulouse, Institut de Mathématiques de Toulouse · 2005–2009
- Mestrado · Matemática · Pontifícia Universidade Católica do Rio de Janeiro · 2003–2005
- Graduação · Licenciatura em Matemática · Universidade do Estado do Rio de Janeiro · 1998–2002

## Vínculos profissionais (9)

- Universidade de São Paulo · Docente · 2022–atual
- Universidade de São Paulo · Docente · 2019–2022
- Universidade de São Paulo · Docente · 2013–2019
- Institut National des Sciences Appliquées de Toulouse · Professor · 2009
- Institut National des Sciences Appliquées de Toulouse · Monitor · 2005–2008
- Universidade do Estado do Rio de Janeiro · Professor Substituto · 2005
- Pontifícia Universidade Católica do Rio de Janeiro · Professor Agregado · 2005
- Universidade do Estado do Rio de Janeiro · Monitor · 2000–2001
- Escola de Educação Comunitária · Professor · 1999–2000

## Produção acadêmica

Total: 31 itens.

- Apresentações: 12
- Trabalhos em eventos: 7
- Artigos publicados: 6
- Organização de eventos: 4
- Capítulos de livro: 2

### Produção bibliográfica (12 mais recentes de 15)

- 2025 · **Identifying key genes in cancer networks using persistent homology** · Scientific Reports · Artigos publicados · Ramos, Rodrigo Henrique; BARDELOTTE, YAGO AUGUSTO; Cynthia de Oliveira Lage Ferreira et al. · DOI: 10.1038/s41598-025-87265-4
- 2025 · **Exploring the Influence of Gene Networks on Driver Gene Classification** · Journal of Computational Biology · Artigos publicados · Paulo Henrique Ribeiro; Cutigi, Jorge Francisco; Ramos, Rodrigo Henrique et al. · DOI: 10.1089/cmb.2025.0043
- 2024 · **Human Protein-Protein Interaction Networks: A Topological Comparison Review** · HELIYON · Artigos publicados · Rodrigo Henrique Ramos; Cynthia de Oliveira Lage Ferreira; SIMÃO, ADENILSO · DOI: 10.1016/j.heliyon.2024.e27278
- 2024 · **ACDBio: The Biological Data Computational Analysis group at ICMC/USP, IFSP, and Barretos Cancer Hospital** · Journal of Information and Data Management - JIDM · Artigos publicados · Simao, Adenilso; Evangelista, Adriane Feijo; Alfredo Guilherme Souza et al. · DOI: 10.5753/jidm.2024.2622
- 2022 · **The Survival Rate Among Unvaccinated, First Dose, and Second Dose Brazilian Hospitalized and ICU COVID Patients by Age Group** · SBCAS - XXII Simpósio Brasileiro de Computação Aplicada à Saúde · Trabalhos em eventos · Rodrigo Henrique Ramos; Cynthia de Oliveira Lage Ferreira; Simao, Adenilso · DOI: 10.5753/sbcas.2022.222445
- 2021 · **Topological Characterization of Cancer Driver Genes Using Reactome Super Pathways Networks** · Advances in Bioinformatics and Computational Biology · Capítulos de livro · Ramos, Rodrigo Henrique; Cutigi, Jorge Francisco; Cynthia de Oliveira Lage Ferreira et al. · DOI: 10.1007/978-3-030-91814-9_3
- 2020 · **Analyzing different cancer mutation data sets from breast invasive carcinoma (BRCA), lung adenocarcinoma (LUAD), and prostate adenocarcinoma (PRAD)** · Anais Principais do Simpósio Brasileiro de Computação Aplicada à Saúde · Trabalhos em eventos · RAMOS, RODRIGO; CUTIGI, JORGE; Cynthia de Oliveira Lage Ferreira et al. · DOI: 10.5753/sbcas.2020.11500
- 2020 · **Combining Mutation and Gene Network Data in a Machine Learning Approach for False-Positive Cancer Driver Gene Discovery** · Lecture Notes in Computer Science · Capítulos de livro · Cutigi, Jorge Francisco; Evangelista, Renato Feijo; Ramos, Rodrigo Henrique et al. · DOI: 10.1007/978-3-030-65775-8_8
- 2018 · **Resilience and Structure of Metabolic Networks** · CNMAC 2018 XXXVIII Congresso Nacional de Matemática Aplicada e Computacional · Trabalhos em eventos · PESSOA, VICTOR HUGO DE MELLO; Cynthia de Oliveira Lage Ferreira · DOI: 10.5540/03.2018.006.02.0318
- 2015 · **Redes de Hopfield: uma introdução aos sistemas dinâmicos e às redes complexas** · 23ª Simpósio Internacional de Iniciação Científica e Tecnológica da USP - SIICUSP · Trabalhos em eventos · Victoria Maria Gomes Velame; Cynthia de Oliveira Lage Ferreira
- 2012 · **Colorization by Multidimensional Projection** · SIBGRAPI 2012 - Conference on Graphics, Patterns and Images · Trabalhos em eventos · Wallace Casaca; Erick Gomez-Nieto; Cynthia de Oliveira Lage Ferreira et al.
- 2011 · **Nonlinear lattice models for biopolymers: Dynamical coupling to a ionic cloud and application to actin filaments** · Discrete and Continuous Dynamical Systems. Series S · Artigos publicados · Cynthia de Oliveira Lage Ferreira; James, Guillaume; Peyrard, Michel · DOI: 10.3934/dcdss.2011.4.1147

### Produção técnica (12 mais recentes de 16)

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- 2022 · **Análise de dados em câncer: mutações significativas e caracterização topológica de genes driver em redes de pathways.** · Apresentações · Cynthia de Oliveira Lage Ferreira
- 2022 · **Challenges in COVID-19 dynamics and diagnostic in the State of Rio de Janeiro** · Apresentações · Stefanella Boatto; Renata Campos; Jose Antonio Suzano et al.
- 2022 · **Topologia dos dados: oportunidades para a pesquisa em câncer** · Apresentações · Cynthia de Oliveira Lage Ferreira
- 2022 · **Topological Characterization of Cancer Driver Genes using Reactome Super Pathways Networks** · Apresentações · Cynthia de Oliveira Lage Ferreira
- 2022 · **Topological Characterization of Cancer Driver Genes using Reactome Super Pathways Networks** · Apresentações · Cynthia de Oliveira Lage Ferreira
- 2022 · **Conscientização e Análise de Dados para Ajudar Pacientes com Câncer** · Apresentações · Cynthia de Oliveira Lage Ferreira
- 2021 · **Análise de dados e mutações no câncer.** · Apresentações · Cynthia de Oliveira Lage Ferreira
- 2018 · **Resilience and structure of metabolic networks** · Apresentações · Victor Hugo de Mello Pessoa; Cynthia de Oliveira Lage Ferreira
- 2018 · **3o Workshop de Iniciação Científica do Departamento de Matemática Aplicada e Estatística** · Organização de eventos · Cynthia de Oliveira Lage Ferreira; Maria Luísa Bambozzi de Oliveira
- 2017 · **2o Workshop de Iniciação Científica do Departamento de Matemática Aplicada e Estatística** · Organização de eventos · Cynthia de Oliveira Lage Ferreira; Maria Luísa Bambozzi de Oliveira; Washington Luiz Marar
- 2016 · **Matemática nas animações** · Apresentações · Cynthia de Oliveira Lage Ferreira

## Projetos (10 mais recentes de 12)

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## Linhas de pesquisa

- Sistemas Complexos
- Ciência de Dados
- Análise de dados do câncer

## Orientações

### Em andamento (4)

- DOUTORADO · Edmara Viana da Silva · **Homologia persistente e redes de câncer** · 2024
- INICIACAO CIENTIFICA · Moniely Silva Barboza · **Usando a linguagem Scratch para desenvolver habilidades de pensamento computacional e lógico dos estudantes do ensino fundamental** · 2023
- INICIACAO CIENTIFICA · Vitoria Gomes Guimaraes · **Análise Topológica de Dados na Doença de Alzheimer** · 2025
- INICIACAO CIENTIFICA · Gabriel Carbinatto · **Homologia persistente de redes complexas: métodos e aplicações** · 2025

### Concluídas (12 mais recentes de 58)

- 2024 · MESTRADO · Leandro Aparecido Nogueira · **A cartografia como objeto de ensino de matemática no ensino fundamental**
- 2024 · DOUTORADO · Rodrigo Henrique Ramos · **Utilizing Structural Features from Protein Interaction Sub-Networks to Analyze Cancer Genes**
- 2024 · GRADUACAO · Anderson Cardoso Gonçalves · **Homologia persistente de redes complexas**
- 2024 · OUTRO · Arthur Antônio Rezende Pereira · **Análise topológica de dados: modelagem, aspectos estatísticos e aplicações a dados biológicos.**
- 2024 · GRADUACAO · Gabriel Sotto Rodrigues · **Análise Topológica de Dados Biomédicos: Investigação das Variações no Algoritmo Mapper com Diferentes Parâmetros**
- 2024 · GRADUACAO · Vinicius Willian da Siva · **Detecção de Anomalias em Dados de Imagens Médicas com Análise Topológica de Dados**
- 2023 · OUTRO · Theo da Mota dos Santos · **Análise topológica de redes complexas associadas a pathways em câncer: uma abordagem via homologia de persistência.**
- 2023 · OUTRO · Lucca Baptista Silva Ferraz · **Usando a linguagem Scratch para desenvolver habilidades de pensamento computacional e lógico dos estudantes do ensino fundamental**
- 2023 · OUTRO · Adalton de Sena Almeida Filho · **Análise topológica de dados biológicos**
- 2023 · OUTRO · Olavo Morais Borges Pereira · **Análise topológica de dados de expressão gênica usando o algoritmo Mapper**
- 2023 · GRADUACAO · Anderson Cardoso Gonçalves · **Caracterização topológica dos genes causadores da diabetes usando redes de Reactome superpathways**
- 2023 · GRADUACAO · Murilo Henrique Gomes · **Análise de características topológicas em imagens de manchas dérmicas**

## Bancas (9)

- 2025 · DOUTORADO · Rodrigo Henrique Ramos · Utilizing Structural Features from Protein Interaction Sub-Networks to Analyze Cancer Genes · Universidade de São Paulo
- 2024 · EXAME QUALIFICACAO · Amanda Araujo Silva · Estudo de propriedades de redes complexas biológicas explorando a predição de interações proteína-proteína em interactoma humano · Universidade de São Paulo
- 2024 · EXAME QUALIFICACAO · Matheus Gaseta · Causal Inference in Oncology: Methods and Applications in Cancer Genomics · Universidade de São Paulo
- 2023 · MESTRADO · Merge trees decoradas e TDA · Merge trees decoradas e TDA · Universidade Federal de São Carlos
- 2023 · EXAME QUALIFICACAO · Guilherme de Carvalho Fasarella · Merge trees decoradas e TDA · Universidade Federal de São Carlos
- 2022 · DOUTORADO · MUHSEN HAMMOUD · COMPUTATIONAL APPROACHES FOR ANALYZING STRUCTURED DATA IN BIOLOGICAL SYSTEMATICS AND BIOGEOGRAPHY · Universidade Federal do ABC
- 2019 · MESTRADO · Juliana Perpétua Elias · Estudo de algoritmos e programação de computadores para resolver problemas de matemática no Ensino Médio · Universidade de São Paulo
- 2019 · GRADUACAO · Kaue Alves Rosário · Um estudo de espaço aéreo brasileiro através de redes complexas. · Universidade de São Paulo
- 2018 · MESTRADO · Luiz Otavio Toratti · Design de campos vetoriais em volumes usando RBF · Universidade de São Paulo

## Prêmios e títulos (8)

- 2025 · **Menção Honrosa no 32o SIICUSP pelo trabalho do aluno Olavo Morais Borges Pereira , entitulado TOPOLOGICAL ANALYSIS OF GENE EXPRESSION DATA USING THE MAPPER ALGORITHM** · Pró-Reitoria de Pesquisa e Inovação (PRPI)
- 2022 · **Homenagem pelo desempenho docente à turma do Bacharelado em Ciência da Computação USP. Disciplina Álgebra Linear e Aplicações ministrada no segundo semestre de 2022.**
- 2021 · **Homenagem pelo desempenho docente à turma do Bacharelado em Ciência da Computação USP 2019. Disciplina Cálculo Numérico ministrada no primeiro semestre de 2021.**
- 2020 · **Prêmio de excelência pelo desempenho em ministrar a disciplina Métodos Numéricos e Computacionais II, tendo sido escolhida a melhor docente do curso de Engenharia Civil pelos alun…** · Secretaria Acadêmica de Engenharia Civil da EESC
- 2020 · **Prêmio de excelência pelo desempenho em ministrar a disciplina Métodos Numéricos e Computacionais II, do curso de Engenharia Aeronáutica pelos alunos do 4o período.** · Secretaria Acadêmica de Engenharia Aeronáutica da EESC
- 2020 · **Homenagem pelo desempenho docente à turma do Bacharelado em Ciência da Computação USP 2018. Disciplina Cálculo ministrada no segundo semestre de 2020.**
- 2019 · **Homenagem pelo desempenho docente à turma do Bacharelado em Ciência da Computação USP 2018. Disciplina Álgebra Linear e Equações Diferenciais ministrada no segundo semestre de 201…**
- 2018 · **Prêmio ABMES de Jornalismo (http://premiodejornalismo.abmes.org.br/) - Reportagem baseada no trabalho da aluna Gabriela Dall'Agnol** · Associação Brasileira de Mantedores do Ensino Superior

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Fonte: Plataforma Lattes (CNPq), organizado por USP Aberta — https://uspaberta.ime.usp.br/docentes/8936337530468942
Ao citar, referencie USP Aberta e o currículo Lattes do docente.