# Carlos Alberto Montanari

- Cargo: Livre
- Unidade: Instituto de Química de São Carlos (Universidade de São Paulo)
- Departamento: Departamento de Química e Física Molecular
- Currículo Lattes: http://lattes.cnpq.br/9200533791228786
- ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4963-0316
- Currículo atualizado em: 18/09/2025
- Perfil completo: https://uspaberta.ime.usp.br/docentes/9200533791228786

Cita-se como: MONTANARI, C. A.;Montanari, Carlos Alberto;MONTANARI, C;Alberto Montanari, Carlos;Montanari, Carlos A.;Montanari, Carlos;Montanari, Carlos A;MONTANARI, C.A.;MONTANARI, C.;MONTANARI, A.

## Resumo

Possui graduação em Química (Bacharelado e Licenciatura) - Faculdades Oswaldo Cruz (1981), mestrado em Química Orgânica pela Universidade de São Paulo (1987) e doutorado em Química Orgânica pela Universidade de São Paulo com estágio na Universidade de Londres (1991). Em 1995, realizou estágio de pós-doutorado em Química Medicinal sob a supervisão de Michael Tute, Pfizer/University of Kent, UK. Por cerca de 20 anos foi professor na UFOP e UFMG dos quais 4 foram dedicados à vice-presidência do comitê de ética em experimentação em seres humanos do Hospital das Clínicas da UFMG (com especialização na Organização Mundial da Saúde em Genebra). Foi diretor (2014-2016) da Divisão de Química Medicinal da Sociedade Brasileira de Química e desde 2014 é diretor da Calorimetry Conference USA. Dentre suas premiações, há destaque para o prêmio Jabuti de 2012 para o livro de Química Medicinal editado pela EDUSP em 2011. Em 2003, obteve o título de Livre Docente no Instituto de Química da USP. Atualmente é professor titular do Instituto de Química de São Carlos da Universidade de São Paulo. Exerce o mandato de vice-diretor do IQSC/USP no período 2022-2026. Tem experiência na área de Química, com ênfase em Química Medicinal, atuando principalmente nos seguintes temas: planejamento molecular de substâncias químicas candidatas a fármacos, QSAR 3D e biocalorimetria. Métodos em quiminformática são usados para a geração de dados, sistemas de informação e conhecimento para a descrição do espaço químico-biológico com propriedades farmacodinâmicas e farmacocinéticas otimizadas desde o início da gênese planejada de fármacos. É coordenador do Grupo de Química Medicinal e Biológica do IQSC/USP (NEQUIMED). Tem experiência de mais de 20 anos em planejamento molecular de novas entidades químicas relevantes ao conhecimento da farmacoterapia da doença de Chagas. É um dos autores que participou da descoberta de dois novos candidatos a fármacos para o tratamento da doença de Chagas e COVID-19. Atualmente é membro do corpo editorial do Chemical Biology Drug Design e também é Editor Associado do Frontiers in Drug Discovery - Anti-Infective Agents.

## Outras fontes (enriquecimento)

- Descrição (Enriquecimento: Wikidata): investigador
- ads (Enriquecimento, consultado em 2026-10-21): 4 obras
- europepmc (Enriquecimento, consultado em 2026-10-21): 65 obras
- openaire (Enriquecimento, consultado em 2026-10-21): 83 obras
- pubmed (Enriquecimento, consultado em 2026-10-21): 18 obras
- zenodo (Enriquecimento, consultado em 2026-10-21): 4 obras
- DBLP (Enriquecimento: DBLP, Wikidata): https://dblp.org/pid/46%2F9017
- ORCID (Enriquecimento: DBLP, Wikidata): https://orcid.org/0000-0002-4963-0316
- WIKIDATA (Enriquecimento: DBLP, Wikidata): https://www.wikidata.org/wiki/Q38799935

## Áreas de atuação

- Ciencias Exatas E Da Terra › Química › Química Orgânica › Química Medicinal
- Ciencias Da Saude › Farmácia › Química Farmacêutica

## Formação

- Pós-Doutorado · University Of Kent At Canterbury · 1994–1995
- Doutorado · Química Orgânica · Universidade de São Paulo · 1987–1991
- Mestrado · Química Orgânica · Universidade de São Paulo · 1983–1987
- Graduação · Química · Faculdades Oswaldo Cruz · 1978–1981
- Livre-docência · Universidade de São Paulo

## Vínculos profissionais (10 mais recentes de 27)

- Chemical Biology & Drug Design (Print) · 2015–atual
- Chemical Biology & Drug Design · 2015–atual
- Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo · 2006–atual
- Instituto de Quimica de São Carlos · PROFESSOR_TITULAR · 2005–atual
- Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior · 2000–atual
- Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico · 1995–atual
- Journal of Medicinal Chemistry · 2015–2022
- Agencia Nacional de Promoción Científica y Tecnológica · 2014
- Química Nova · 2005–2012
- Universidade Federal de Minas Gerais · Professor Adjunto IV · 1994–2005

## Produção acadêmica

Total: 554 itens.

- Trabalhos em eventos: 221
- Artigos publicados: 121
- Trabalhos técnicos: 97
- Apresentações: 60
- Organização de eventos: 28
- Capítulos de livro: 13
- Jornais & revistas: 11
- Livros: 2
- Outra produção bibliográfica: 1

### Produção bibliográfica (12 mais recentes de 369)

- 2024 · **Differential specificity of\<scp\>SARS-CoV\</scp\>-2 main protease variants on peptide versus protein-based substrates** · FEBS Journal · Artigos publicados · ROCHO, FERNANDA R.; SNIPAS, SCOTT J.; SHAMIM, ANWAR et al. · DOI: 10.1111/febs.16970
- 2024 · **Novel selective proline-based peptidomimetics for human cathepsin K inhibition** · BIOORGANIC & MEDICINAL CHEMISTRY LETTERS · Artigos publicados · CARDOSO PRADO MARTINS, FELIPE; DOS REIS ROCHO, FERNANDA; BONATTO, VINÍCIUS et al. · DOI: 10.1016/j.bmcl.2024.129887
- 2023 · **Nitriles: an attractive approach to the development of covalent inhibitors** · Rsc Medicinal Chemistry · Artigos publicados · BONATTO, VINÍCIUS; LAMEIRO, RAFAEL F.; ROCHO, FERNANDA R. et al. · DOI: 10.1039/d2md00204c
- 2023 · **Investigating the Lack of Translation from Cruzain Inhibition toTrypanosoma cruzi\</i\>Activity with Machine Learning and Chemical Space Analyses** · ChemMedChem · Artigos publicados · LAMEIRO, RAFAEL F.; Carlos Alberto Montanari · DOI: 10.1002/cmdc.202200434
- 2022 · **A patent review on cathepsin K inhibitors to treat osteoporosis (2011 - 2021)** · EXPERT OPINION ON THERAPEUTIC PATENTS · Artigos publicados · ROCHO, FERNANDA R.; BONATTO, VINÍCIUS; LAMEIRO, RAFAEL F. et al. · DOI: 10.1080/13543776.2022.2040480
- 2022 · **Assessment of Reversibility for Covalent Cysteine Protease Inhibitors Using Quantum Mechanics/Molecular Mechanics Free Energy Surfaces** · Journal of Chemical Information and Modeling · Artigos publicados · DOS SANTOS, ALBERTO M.; OLIVEIRA, AMANDA RUSLANA SANTANA; DA COSTA, CLAUBER H. S. et al. · DOI: 10.1021/acs.jcim.2c00466
- 2021 · **Synthesis, biochemical evaluation and molecular modeling studies of nonpeptidic nitrile-based fluorinated compounds** · Future Medicinal Chemistry · Artigos publicados · FONSECA LAMEIRO, RAFAEL DA; SHAMIM, ANWAR; ROSINI, FABIANA et al. · DOI: 10.4155/fmc-2020-0057
- 2021 · **Design, synthesis and stepwise optimization of nitrile-based inhibitors of cathepsins B and L** · BIOORGANIC & MEDICINAL CHEMISTRY · Artigos publicados · CIANNI, LORENZO; ROCHO, FERNANDA DOS REIS; BONATTO, VINÍCIUS et al. · DOI: 10.1016/j.bmc.2020.115827
- 2021 · **Nitrile-based peptoids as cysteine protease inhibitors** · BIOORGANIC & MEDICINAL CHEMISTRY · Artigos publicados · ALVES, LUANA; SANTOS, DEBORAH A.; CENDRON, RODRIGO et al. · DOI: 10.1016/j.bmc.2021.116211
- 2021 · **Predicting the Relative Binding Affinity for Reversible Covalent Inhibitors by Free Energy Perturbation Calculations** · Journal of Chemical Information and Modeling · Artigos publicados · BONATTO, VINÍCIUS; SHAMIM, ANWAR; ROCHO, FERNANDA DOS R. et al. · DOI: 10.1021/acs.jcim.1c00515
- 2021 · **Structural, thermodynamic and functional studies of human 71 kDa heat shock cognate protein (HSPA8/hHsc70)** · BIOCHIMICA ET BIOPHYSICA ACTA-PROTEINS AND PROTEOMICS · Artigos publicados · SILVA, NOELI SOARES MELO; RODRIGUES, LUIZ FERNANDO DE CAMARGO; DORES-SILVA, PAULO ROBERTO et al. · DOI: 10.1016/j.bbapap.2021.140719
- 2020 · **Crystal structure of Leishmania mexicana cysteine protease B in complex with a highly potent azadipeptide nitrile inhibitor** · BIOORGANIC & MEDICINAL CHEMISTRY · Artigos publicados · RIBEIRO, JEAN F.R.; LAMEIRA, JERONIMO; Leitão, Andrei et al. · DOI: 10.1016/j.bmc.2020.115743

### Produção técnica (12 mais recentes de 185)

- 2016 · **Energetics and Structural Characterization of Cysteine Protease Cruzain Inhibition Using X-ray and Calorimetry** · Apresentações · Carlos Alberto Montanari
- 2016 · **Thermodynamic Signatures of Cruzain-dipeptidyl nitrile Ligand Interactions: The Energetic Basis for Optimization of Cysteine Protease Inhibitors'** · Apresentações · Carlos Alberto Montanari
- 2016 · **MOLECULAR DESIGN, SYNTHESIS AND TRYPANOCIDAL ACTIVITY OF DIPEPTIDYL NITRILES AS CRUZAIN INHIBITORS** · Apresentações · Carlos Alberto Montanari
- 2016 · **Energetics and Structural Characterization of Cysteine Protease Cruzain Inhibition Using X-ray and Calorimetry** · Apresentações · Carlos Alberto Montanari
- 2016 · **Thermodynamic Signatures of Cruzain-dipeptidyl nitrile Ligand Interactions: The Energetic Basis for Optimization of Cysteine Protease Inhibitors** · Apresentações · Carlos Alberto Montanari
- 2016 · **MOLECULAR DESIGN. SYNTHESIS AND TRYPANOCIDAL ACTIVITY OF DIPEPTIDYL NITRILES AS CRUZAIN INHIBITORS** · Apresentações · Carlos Alberto Montanari
- 2016 · **Planejamento Molecular de Inibidores da Cruzaína como Agentes Tripanossomicidas** · Apresentações · Carlos Alberto Montanari
- 2015 · **Energetic and Structural Characterization of Cysteine Protease Cruzain Inhibition Employing Calorimetry and X-Ray Crystallography** · Apresentações · Carlos Alberto Montanari
- 2015 · **Energética e Caracterização Estrutural da Cisteíno Protease Vruzaína Usando Biocalorimetria e Cristalografia de Raios X** · Apresentações · Carlos Alberto Montanari
- 2014 · **A Química Medicinal e o Planejamento Molecular de Substâncias Químicas Bioativas** · Apresentações · Carlos Alberto Montanari
- 2014 · **The 7th Brazilian Symposium on Medicinal Chemistry** · NEQUIMED/IQSC/USP · Organização de eventos · Ricardo Bicca de Alencastro; Andrei Leitao; Carlos Alberto Montanari et al.
- 2013 · **DISCOVERY AND CHARACTERIZATION OF TRYPANOSOMA CRUZI GAPDH INHIBITORS BY INTEGRATING IN SILICO AND ISOTHERMAL TITRATION CALORIMETRY METHODS** · Apresentações · Carlos Alberto Montanari

## Projetos (10 mais recentes de 14)

- **Sobre o Desenvolvimento de Inibidores da Principal Protease do Coronavírus SARS-CoV-2 3CL Mpro como Agentes Antivirais** · 2022–atual · PESQUISA · 0 · O presente surto mundial do coronavírus com pandemia declarada pela Organização Mundial da Saúde (OMS) começa a assolar em terras brasileiras. Essa pandemia in…
- **Planejamento Molecular e Síntese de Inibidores da Principal Protease do Coronavírus SARS-Cov-2 Mpro** · 2020–2022 · PESQUISA · 0 · O presente surto mundial do coronavirus com pandemia declarada pela Organização Mundial da Saúde (OMS) começa a assolar em terras brasileiras. Essa pandemia in…
- **PROJETO TEMÁTICO Planejamento, Síntese e Atividade Tripanossomicida de Inibidores Covalentes Reversíveis da Enzima Cruzaína** · 2014–2020 · PESQUISA · Financiamento: Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo · Todos os compostos sintetizados no NEQUIMED, financiados pela FAPESP através dos Processos 2011/01893-3, 2011/20572-3 e 2008/04127-7, foram ativos contra a cru…
- **Molecular Design, Synthesis, Structural Biology, and Biological Evaluation of Reversible Covalent Inhibitors for the treatment of Visceral Leishmaniasis** · 2014–2018 · PESQUISA · Financiamento: Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior · 1. Caracterizar as propriedades responsáveis pela definição da reversibilidade em CPB Leishmania spp usando warheads 2. Caracterizar as propriedades de reconhe…
- **Molecular Design of Cruzain Reversible Covalent Inhibitors** · 2014–2018 · PESQUISA · Financiamento: Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico · CHAMADA DE PROJETOS MEC/MCTI/CAPES/CNPQ/FAPS - BOLSA PESQUISADOR VISITANTE ESPECIAL - PVE 2014
- **Otimização de agentes tripanossomatídeos por integração de ensaios in silico, biocalorimétricos e celulares** · 2011–2013 · PESQUISA · Financiamento: Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo · O presente projeto envolve o estudo in silico, in vitro e in vivo de inibidores enzimaticos visando a otimizacao de ligantes candidatos a farmacos para o trata…
- **Química às 16** · 2009–2012 · EXTENSAO · 0 · Ciclo de Conferências, Palestras e Seminários que discute o futuro da química.
- **Desenvolvimento de bioproduto de elevada afinidade pela enzima gliceraldeído 3-fosfato desidrogenase de Trypanosoma cruzi** · 2009–2011 · PESQUISA · Financiamento: Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo · Há um grande interesse no desenvolvimento de novos agentes tripanossomicidas com impacto potencial no tratamento de indivíduos que sofrem da doença de Chagas.…
- **Instituto Nacional de Ciência e Tecnologia para Inovação Farmacêutica (INCT_if)** · 2008–2013 · PESQUISA · 0 · Projeto INCT-if coordenado pelo Prof. Ivan da Rocha Pitta
- **PLANEJAMENTO DE NOVOS QUIMIOTERÁPICOS TRIPANOSSOMICIDAS** · 2005–2009 · PESQUISA · Financiamento: Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo · As estruturas das enzimas gliceraldeído-3-fosfato desidrogenase glicossomais (gGAPDH) dos parasitos tripanosomatídeos Leishmania mexicana e Trypanosoma cruzi f…

## Linhas de pesquisa

- Síntese de acilidrazinas e acil(tio)semicarbazidas com atividade antimicrobiana.
- RECONHECIMENTO MOLECULAR DE SEQUENCIAS ESPECIFICAS DO DNA
- Planejamento Molecular, Síntese e Bioensaios de Inibidores Enzimáticos como Agentes Tripanossomicidadas

## Orientações

### Em andamento (8)

- MESTRADO · Vitor Emanuel Pereira Cota · **Síntese de Novos Inibidores da Cruzaína com Atividade anti-Trypanosoma cruzi** · 2024
- MESTRADO · Priscila Martini de Souza · **Síntese e Planejamento Molecular de Di e Tri peptídeos Não-naturais Com Possível Atividade Inibidora De Cisteíno Proteases** · 2023
- DOUTORADO · Rafael Lameiro · **Como a inibição enzimática pode ser traduzida com sucesso para ensaios baseados em células?** · 2020
- DOUTORADO · Thiago Gomes Menzonatto · **Desenvolvimento de modelos preditivos utilizando parâmetros mecânico quânticos para avaliação da atividade farmacológica e reatividade de ligantes reversíveis na família das ciste…** · 2022
- DOUTORADO · Luiz Fernando Barbosa da Silva · **Investigação Termodinâmica Comparativa das Cisteíno Proteases Cruzaína e Catepsina L** · 2025
- DOUTORADO · Evelin Ribeiro Cardoso · **Desenvolvimento de Novas Entidades Químicas como Potenciais Inibidores de Cisteino Proteases para Combater o SARS-CoV-2** · 2023
- DOUTORADO · Larissa Gaiola · **Determinação do Coeficiente de Partição e da Solubilidade de Novos Inibidores de Cisteíno Endoptidades de Parasitos e da SARS CoV-2 Mpro do Novo Coronavirus** · 2022
- POS DOUTORADO · Saulo de Tarso Alves dos Passos · **** · 2025

### Concluídas (12 mais recentes de 95)

- 2023 · MESTRADO · Luiz Fernando Barbosa da Silva · **Síntese e avaliação da relação estrutura-atividade de inibidores da principal protease (Mpro) do SARS-CoV-2**
- 2021 · MESTRADO · Bruna Carolina de Melo · **Determinação do perfil termodinâmico de inibidores de cisteíno proteases do tipo cruzaína e catepsina L**
- 2021 · MESTRADO · Wellington Falcão de Souza · **Planejamento e Síntese de Inibidores da Mpro de SARS-CoV-2**
- 2021 · OUTRO · FIHAMA DE CASSIA SANTOS SILVA · **PLANEJAMENTO E SÍNTESE DE ANÁLOGOS DE DIPEPTIDIL NITRILAS COMO INIBIDORES REVERSÍVEIS DE CISTEÍNO PROTEASES**
- 2020 · MESTRADO · Larissa Gaiola · **Determinação do Coeficiente de Partição e da Solubilidade de Novos Inibidores de Cisteíno Endoptidades de Parasitos e da SARS CoV-2 Mpro do Novo Coronavirus**
- 2020 · DOUTORADO · Felipe Cardoso Prado Martins · **Synthesis of Novel dual-Inhibitors Targeting SARS-CoV-2 Mpro**
- 2020 · DOUTORADO · FERNANDA DOS REIS ROCHO · **DETERMINAÇÃO DA ASSINATURA TERMODINÂMICA DE INIBIDORES DE CISTEÍNO PROTEASES DE MAMÍFEROS E CORONAVIRUS**
- 2020 · POS DOUTORADO · Anwar Shamim · ****
- 2020 · OUTRO · Gabriel Pires · **Síntese de inibidores covalentes reversíveis da SARS-CoV-2 Mpro**
- 2019 · MESTRADO · Rodrigo Cendron · **Estudo de cisteíno proteases de parasitos do gênero Leishmania**
- 2019 · DOUTORADO · Vinícius Bonatto · **MODELAGEM MOLECULAR DE INIBIDORES COVALENTES REVERSÍVEIS DE CISTEÍNO PROTEASES**
- 2019 · DOUTORADO · Fabiana Rosini · **Determinação da Assinatura Termodinâmica de Inibidores da Cisteíno Protease Cruzaína**

## Bancas (10 mais recentes de 110)

- 2016 · EXAME QUALIFICACAO · David Esteban Quintero Jimenez · Síntese de adultos de Knoevenagel e compostos tetrazólicos via radiação micro-ondas e ene-redução pelo fungo Penicillium citrinum CBMAI 1186 · Instituto de Quimica de São Carlos
- 2016 · EXAME QUALIFICACAO · Ariane Fernandes Bertonha · "Síntese de derivados dos alcaloides bromopirrólicos pseudoceratidina e agelastatina A" · Instituto de Quimica de São Carlos
- 2015 · DOUTORADO · Jonathan Resende de Almeida · Planejamento, ensaio e otimização in silico de novos potótipos inibidores da enzima acetilcolinesterase · Universidade de São Paulo
- 2015 · CONCURSO PUBLICO · Professor Doutor junto ao Departamento de Farmácia, na Área de Química Farmacêutica · Universidade de São Paulo
- 2014 · MESTRADO · Cristian David Camilo Reyes · Síntese de dipeptidil-nitrilas como inibidores da enzíma cruzaína · Instituto de Quimica de São Carlos
- 2014 · DOUTORADO · Ricardo Pereira Rodrigues · Caseína quinase 1 como alvo para o planejamento de fármacos em mal de Alzheimer · Universidade de São Paulo
- 2014 · EXAME QUALIFICACAO · Guilhermo Federico Padilla Gonzalez · Estudo metabolômico do gênero Espeletia (Asteraceae) · Universidade de São Paulo
- 2014 · EXAME QUALIFICACAO · Meire Yasuko Kawamura · Emprego de Diazocetonas alfa,beta-Insaturadas com Geometria Z na Direta Construção de Esqueletos Indolizidínicos Funcionalizados. Aplicação da Síntese dos Alcaloides 8-Desidrodesm… · Instituto de Quimica de São Carlos
- 2014 · PROFESSOR TITULAR · Professor adjunto com setorização em modelagem molecular, do Centro de Ciências Matemáticas e da Natureza · Universidade Federal do Rio de Janeiro
- 2013 · MESTRADO · Jean Francisco Rosa Ribeiro · Estudo in vitro do metabolismo microssomal hepático de agentes tripanossomicidas · Instituto de Quimica de São Carlos

## Prêmios e títulos (14)

- 2015 · **A 3-year membership in recognition of your engagement with our Society's mission of service to the global community of chemists** · American Chemical Society
- 2014 · **Recognized Reviewer Status** · Elsevier
- 2014 · **Prêmio Honorário** · Sociedade Brasileira de Química/BrazMedChem2014
- 2013 · **Outstanding Reviewer in 2012. ACS** · Journal of Medicinal Chemistry
- 2012 · **54º Prêmio Jabuti - 2º lugar categoria Ciências Exatas (Química Medicinal: métodos e fundamentos em planejamento de fármacos)** · Câmara Brasileira do Livro
- 2011 · **For your valuable contribution and dedicated service in the peer review of manuscripts submitted to ACS Journals** · ACS Journals
- 2010 · **Top 10 most-accessed articles from the Journal of Chemical Information and Modeling Most Accessed Articles** · American Chemical Society
- 2010 · **Moção de Congratulação pelo trabalho científico desenvolvido no IQSC-USP** · Câmara Municipal de São Carlos - SP
- 2009 · **"Tetrahedron Publications - Special Recognition Prize: Top-50 articles published in Bioorganic and Medicinal Chemistry 2006-2009"** · Tetrahedron Publications da Elsevier
- 2008 · **Artigos mais interessantes de 2007 (9º -** · Bioorganic and Medicinal Chemistry
- 2008 · **Artigo destaque da Eur. J. Med. Chem: sétimo lugar na "Top-25 Hottest Articles of 2008", Leitao, A.; Andricopulo, A.D.; Montanari, C. A. Eur. J. Med. Chem. 2007, 43, 1412** · Science Direct
- 2002 · **Homenagem do II Congresso de Ciências Farmacêuticas** · Universidade Estadual do Oeste do Paraná
- 2000 · **Melhor trabalho na Divisão de Química Medicinal da 22a. RA da SBQ** · SBQ
- 1998 · **Melhor Painel da DMD durante a 21 RA da SBQ** · SBQ

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Fonte: Plataforma Lattes (CNPq), organizado por USP Aberta — https://uspaberta.ime.usp.br/docentes/9200533791228786
Ao citar, referencie USP Aberta e o currículo Lattes do docente.
