Rachel Santos Bueno Carvalho.

A atividade rural é fundamental para o equilíbrio econômico e social de um país ou região, mesmo em sociedades organizadas. Nesse sentido, estudos mostram que a permanência do pequeno produtor no campo é essencial. Porém a realidade da atividade rural moderna é de margens de lucro cada vez mais estreitas o que vem a dificultar a viabilidade de pequenas propriedades, as quais não possuem produção em grande escala. Sendo assim este projeto visa a inserção da estrutura universitária na sociedade no sentido de colaborar com o desenvolvimento da região, através da aplicação de um plano de ação conforme a necessidade de cada propriedade leiteira avaliada, visando melhoria genética do rebanho, aumento da produção de leite por vaca, melhorias nas ofertas de forragem, redução do uso de medicamentos, maior eficiência na reprodução e melhoria da qualidade do produto final, sempre buscando o menor impacto ambiental com a atividade.

Ferrari Fumes (2017) propuseram uma classe de distribuições intitulada Box-Cox simétrica para variáveis aleatórias assimétricas positivas. Esta classe de distribuições permite através de sua estrutura que seja feita uma interpretação dos parâmetros das distribuições que a compõe em termos de quantis (em particular da mediana), dispersão relativa e assimetria, o que a torna atrativa para modelagem de regressão. Estas distribuições têm sido aplicadas em diferentes contextos e os resultados têm sido apropriados. Como exemplos, tem-se um procedimento de estimação robusto baseado no modelo Box-Cox t, através de modelos com efeitos aleatórios para a estimação da distribuição usual de consumo alimentar e um modelo baseado na distribuição Box-Cox Normal para predizer crescimento de mudas de eucalipto. Dentre a classe das distribuições Box-Cox simétricas, as distribuições Box-Cox Normal (ou Box-Cox Cole Green), Box-Cox t e Box-Cox exponencial potência estão implementadas na rotina gamlss do programa R. Todavia, as demais distribuições que compõe tal classe precisam de uma implementação computacional. Desse modo, o trabalho presente visa implementar cada distribuição da classe Box-Cox simétrica proposta por Ferrari Fumes (2017) e aplicar tais distribuições a dados de crescimento de plantas, consumo alimentar e outros.

A pecuária de corte é um dos principais destaques do agronegócio nacional, e tem grande importância no mercado mundial, pois o Brasil possui um dos maiores rebanhos de bovinos do mundo, com mais de 200 milhões de cabeças. Esse rebanho é composto, predominantemente por animais de origem Bos indicus, sendo que a raça Nelore e seus cruzamentos compõe aproximadamente 90% do total. Os dados efetivos de produção de carne bovina em 2012 indicam que 16,5% foram exportadas e a maior parte da produção (83,5%) abasteceu o mercado interno. Devido à importância, interesse econômico e aumento da produção de alimentos, melhorias são necessárias para maior eficiência de produção, como, por exemplo, a seleção de animais geneticamente superiores e resistentes ao ambiente adverso dos trópicos. O uso de painéis contendo centenas de milhares de polimorfismos de nucleotídeo único (SNP - Single Nucleotide Polymorphisms) tem possibilitado aos programas de melhoramento genético animal traçar estratégias para identificação de genes ou regiões genômicas responsáveis pelas características de interesse, tornando mais eficiente o processo de seleção. A metodologia de Genome-wide Association Study (GWAS) compara os resultados dos painéis de alta densidade disponíveis em indivíduos não relacionados, que possuam uma condição fenotípica de interesse, para identificar marcadores associados a tal fenótipo, e pode apontar regiões de interesse no genoma que possam influenciar em características quantitativas. O objetivo deste projeto é realizar um estudo de genética de sistemas, abordando análises de associação genômica, desequilíbrio de ligação, variações do número de cópias de regiões genômicas (CNVs) e enriquecimento funcional em medidas de crescimento, reprodução, qualidade de carne e eficiência alimentar em bovinos da raça. Adicionalmente, realizar um estudo de expressão gênica global (sequenciamento do RNA mensageiro total - RNA-Seq) e dos mecanismos epigenéticos de controle da expressão da eficiência alimentar em bovinos da raça Nelore. Com o expertise gerado, as metodologias poderão, ainda dentro da abrangência deste projeto temático, ser aplicadas a outras espécies animais.

Este é um projeto essencialmente multidisciplinar e que requer cooperação entre várias instituições. Os avanços nas últimas décadas da genética e biologia molecular possibilitaram o sequenciamento completo do genoma bovino, bem como abriu um largo leque de novas possibilidades de estudo nesse genoma. A ferramenta mais utilizada na avaliação de dados genômicos associados à produção de bovinos é a identificação de polimorfismos de nucleotídeo único (SNP). Muitos SNP já foram identificados em Bos taurus, em diversos genes relacionados com desempenho ponderal, qualidade de carcaça, eficiência alimentar e outras características produtivas. Em zebuínos ainda são raros os estudos com milhares de SNP associados com características de interesse zootécnico, principalmente os que consideram as importantes características ligadas à eficiência e ingestão alimentar. O objetivo desse projeto é caracterizar e associar alguns SNP com ingestão e eficiência alimentar além de estimar o valor genético molecular para essas características em bovinos da raça Nelore, a mais expressiva e importante na pecuária brasileira. Serão utilizados dados de ingestão de matéria seca e eficiência alimentar de cerca de 1200 bovinos dessa raça. A partir dessa amostra, o DNA genômico individual será extraído e posteriormente essas amostras de DNA serão genotipadas por meio de chips comerciais (BovineHD e BovineSNP50 Beadchip, Illumina Inc). Esses dados genômicos serão utilizados, em conjunto com os dados fenotípicos, para caracterização dos SNP e cálculo de frequências gênicas e genotípicas, efeitos aditivos, de substituição alélica e dominância. Adicionalmente, serão incluídos dados de pedigree para estimar o valor genético molecular de cada animal por meio de metodologia GBLUP e métodos Bayesianos (Bayes A, B, C, Cπ e Lasso). O projeto encontra-se em fase adiantada, necessitando de recursos adicionais para genotipar a segunda metade dos animais.

O sistema intensivo de criação de frangos de corte apresenta excelentes resultados de produção, mas recentemente, o sistema semi-intensivo de criação de aves está chamando a atenção para novas pesquisas devido à uma diferente demanda. Os consumidores têm exigido alimentos mais saudáveis, produzidos de acordo com regras mínimas de segurança alimentar, segundo normas de criação que garantam o bem-estar animal, o que resulta em um produto final com características diferenciadas. Para que a avicultura alternativa conquiste o mercado consumidor será necessário evidenciar objetivamente que as aves obtidas neste sistema de produção apresentam qualidades superiores às procedentes do sistema intensivo, quanto à suas características organolépticas e que satisfaçam algumas demandas essenciais do consumidor: produto de qualidade reconhecida, oriundo de produção tradicional, com rastreabilidade em todos os estágios de produção, assegurado por controles de qualidade e um preço atrativo. No entanto, a falta de padronização dos produtos podem retardar o avanço da avicultura alternativa. Das linhagens comerciais de frangos caipira no mercado, ao contrário do que acontece com as industriais, o diferencial de aptidão e desempenho entre elas é grande. Isto provém destas linhagens estarem a pouco no mercado e também pela pequena quantidade de trabalhos realizados nesta área. Trabalhos na área de genética vêm sendo realizados com o objetivo de avaliar estas linhagens e desenvolver aves mais adaptadas, visando à melhoria dos índices produtivos da criação alternativa. Porém, com relação as características de carcaça e da carne poucos são os trabalhos publicados. A pesquisa tem como objetivo verificar os efeitos de fatores genéticos e do sistema de criação sobre o rendimento e qualidade da carcaça de frangos tipo caipira.

A produção de carne no Brasil enfrenta desafios tecnológicos que devem ser superados a fim de garantir sua posição privilegiada no mercado de exportações de carne. Avaliações genéticas dos animais para as características de crescimento, carcaça e qualidade de carne são necessárias para melhorar a produção e a qualidade do produto final. O objetivo desta pesquisa é a estimação de parâmetros genéticos para características de crescimento (peso ao nascer, aos 205 dias e aos 390 dias), de carcaça (peso de carcaça e rendimento, área do olho do lombo, espessura de gordura subcutânea e da picanha) e de qualidade de carne (cor, pH, maciez, marmoreio e conteúdo de lipídios) de bovinos compostos Montana Tropical® com aplicação de tecnologias modernas para coleta de dados e novas metodologias na avaliação multirracial. Aproximadamente 2500 machos terminados a pasto e em confinamento serão utilizados na obtenção de informações de características de carcaça. Dados da área do olho do lombo (AOL), espessura de gordura subcutânea (EGS) e espessura de gordura da picanha (EGP) serão obtidas in vivo por ultra-som. Após o abate, será avaliado o peso de carcaça quente (PCQ), carcaça fria (PCF) e o rendimento (RDC). As características de qualidade de carne serão avaliadas no músculo Longissimus dorsi mediante o uso de espectrometria de infravermelho próximo (NIRS). Valores genéticos (VG), coeficientes de herdabilidade (ĥ2), correlações genéticas (rg) e fenotípicas (rf) serão estimados para todas as características avaliadas utilizando metodologias de análise genética multirracial. Com esse estudo será possível a obtenção de informações sobre a variabilidade e valor genético dos diferentes grupos biológicos que compõem a raça Montana Tropical.

O modelo básico de desempenho animal define a expressão fenotípica do caráter na soma dos efeitos genético, ambiente e da interação entre eles. A interação genótipo-ambiente (IGA) é observada quando diferenças fenotípicas entre genótipos são desiguais de um ambiente para outro. Os bovinos compostos são hoje uma alternativa para a pecuária de corte, podendo aumentar de maneira rápida a produtividade e competitividade dos sistemas de produção. As diferentes composições raciais destes animais (Bos taurus x Bos indicus) fornecem uma série de alternativas para os diferentes ambientes do Brasil. Seria então importante, determinar qual a melhor composição racial para cada região. A avaliação da IGA, neste caso, torna-se imprescindível, visto que a composição racial que permite melhor desempenho zootécnico em uma determinada localidade pode não ser em outra. Se confirmada sua presença, a inclusão da IGA como uma fonte de variação nas avaliações genéticas pode contribuir para o aumento da acurácia de predição e melhorar a eficiência da seleção. Apesar da importância da existência da IGA, a incorporação deste componente de variação nas avaliações genéticas não é uma realidade no melhoramento de bovinos de corte no Brasil. No presente estudo serão avaliadas as características peso à desmama, ganho de peso pós-desmama, perímetro escrotal e musculosidade de 300.000 bovinos de corte compostos com diferentes composições raciais, provenientes de rebanhos localizados nas regiões Sudeste, Centro-Oeste e Norte do país, com o objetivo de definir e caracterizar ambientes comuns de produção para se realizar a investigação da IGA por meio de diferentes metodologias.

As linhagens caipiras ou alternativas são conhecidas por essa denominação pela maneira a qual são criadas, diferente do frango industrial, com linhagens próprias para atividade, conforme legislação brasileira (oficio circular DOI/DIPOA nº 007/99, de 19/05/1999 e completo pelo Ofício Circular DOI/DIPOA nº 014/2000 de 11/05/00). São consideradas alternativas para pequenos e médios produtores, pela atividade apresentar baixo investimento e preço de venda diferenciado. Os frangos alternativos, por serem abatidos tardiamente, quando comparados aos frangos industriais, possuem consistência e sabor diferenciado de carne, características que atraem diversos consumidores. Porém, apesar do crescente mercado, são escassos os trabalhos de melhoramento para essas linhagens alternativas no Brasil, conseqüentemente, impedindo o melhor aproveitamento da atividade, pois inibe o progresso genético destas linhagens, não havendo o máximo aproveitamento do potencial genético destas aves. Este trabalho tem como objetivo a implantação do controle de pedigree de quatro linhagens de aves alternativas ou caipiras: Caipirão ESALQ, Caipirinha ESALQ, 7P e Carijó Barbada. A partir deste banco de dados serão estimados os parâmetros genéticos (correlações genéticas e herdabilidade) e fenotípicos (correlações fenotípicas) para as características de crescimento, carcaça e qualidade de carne. Importantes ferramentas para o melhoramento animal, pois através da mensuração destes parâmetros é possível selecionar os melhores genótipos, aumentado o desempenho genético dessas linhagens.

O objetivo geral deste projeto é desenvolver um programa computacional, utilizando de técnicas de otimização com auxilio de programação linear mista, visando possibilitar a tomada de decisão na seleção e acasalamento de um programa de melhoramento genético para bovinos compostos.

Dentre as ferramentas disponíveis para aumentar, de maneira rápida e eficiente, sua produtividade e competitividade de bovinos de corte é o cruzamento. Existem vários sistemas propostos destinados a explorar as vantagens dos cruzamentos. Uma opção é a formação de compostos obtidos a partir de diferentes raças. Animais compostos tentam reunir os efeitos da heterose e complementaridade entre as raças envolvidas. Alguns grupos de melhoramento genético têm realizado avaliações genéticas em população de bovinos compostos objetivando a seleção de animais geneticamente superiores. A despeito da importância dos processos de avaliação genética em populações de bovinos de corte, permanecem escassas na literatura informações pormenorizadas sobre os impactos dos modelos que consideram os efeitos de heterozigosidades na avaliação genética de populações obtidas por cruzamentos. Os objetivos gerais deste estudo são: (i) avaliar, por meio de diferentes modelos comumente utilizados na avaliação genética de bovinos de corte, a incorporação dos efeitos das heterozigosidades sobre as estimativas dos componentes de (co)variância e parâmetros genéticos em características de desenvolvimento ponderal de bovinos cruzados; e (ii) avaliar o impacto de diferentes estratégias de incorporações dos efeitos das heterozigosidades na classificação geral de touros.

O projeto tem como objetivo correlacionar a medida de espessura de gordura subcutânea, medida por ultrasonografia, com características indicadoras de precocidade sexual. Outro objetivo é a determinação, usando técnica de biologia molecular, da proporção de genes Bos taurus taurus e Bos taurus indicus e a verificação da sua influência sobre as características de desenvolvimento ponderal, características reprodutivas e de carcaça.