Augusto Alberto Valero Flores.

Renovação do parque náutico para atividades de pesquisa nas proximidades do CEBIMar - USP, como apoio transversal aos pesquisadores do próprio centro e de instituições associadas.

Marine Protected Areas (MPAs) are globally recognized as an effective intervention for preserving fisheries, maintaining habitat integrity, and conserving biodiversity. However, current MPA assessments in tropical areas often focus mainly on coral reefs, overlooking the complex interplay among diverse surrounding habitats. This proposal outlines a holistic approach to building lasting capacity for standardized evaluations of MPAs as interconnected ecosystems in the tropical West Atlantic, focusing on how multi-habitat connectivity can inform recommendations for more effective conservation.

Mussel beds are paramount for the ecological equilibrium of rocky shores lying at the interface of marine and terrestrial ecosystems. One key ecosystem function of mussel beds is the ecological facilitation of a diversified invertebrate fauna, including the early recruitment of species that contribute to the ecological equilibrium of the whole ecosystem. However, heat waves may collapse such a function, or even trigger mass mortality events on mussel populations themselves, completely destabilizing the biogenic habitat. In this project, we will make use of extreme environmental variability along an 80-km coastline to understand the mechanisms generating gradients of thermal stress and potential desiccation, and how the latter restrain the formation of mussel beds and their facilitating capacity. As deliverables of this proposal, we expect to (i) identify the environmental conditions required for the stability of mussel beds, (ii) predict the extent of habitat loss to be caused by climate change, and (iii) assess the resistance of facilitated invertebrate assemblages along stress gradients.

MISSION ATLANTIC develops and systematically applies Atlantic Integrated Ecosystem Assessments (IEAs). IEAs enable identification of ecosystem components most at risk from natural hazards and the consequences of human activities. The project employs all available information on those sources, the pressures they impose and the ecosystem components are affected, to identify the most important risk factors influencing sustainable development. IEAs are developed at basin and regional scales, using a nested approach with key case study (CS) areas including sub- Arctic and Tropical regions in the Atlantic Ocean. To support IEAs we map, model and assess Atlantic Ocean ecosystems including resilience and responses to cumulative pressures. Regional indicators are provided for both pelagic and benthic components, using existing and new data from monitoring programs, including information from new glider technology. Coupled end-to-end physical-biological models are developed and validated at the basin scale to simulate ecosystem dynamics, defining new biogeographical regions and resolving connectivity between CSs. Ecosystem state indicators are then evaluated under four future climate projections of the models, to identify future risks of crossing identified tipping points into undesirable ecosystem states. In support of the Bélem Statement, the project brings together scientists, managers and stakeholders from Brazil, S.Africa and the EU as well as US & Canada. Regional stakeholder platforms are established to support the IEAs and the interactions between researchers, industries, policy makers and authorities across the Atlantic. The platforms are delivered via partners with recognized experience in ?science to governance? interfacing. Training and professional development opportunities across the Atlantic are provided via mobility, PhD and MsC programmes building around IEA theory and using an adaptive e-learning platform and examples to ensure program legacy.

Shallow vegetated habitats provide important physical structure and trophic resources for very diverse communities of mobile invertebrates. This associated fauna may in turn sustain higher-order consumers, chiefly fish recruits that use seagrass or canopy-forming macroalgae (complex vegetated habitats, CVHs) as nursery grounds. Despite of potential impacts on several ecosystem services, such as fisheries, the dynamics of this benthic-pelagic trophic link remain poorly understood. This proposal aims to (i) understand how invertebrate communities change from unstructured habitat to CVHs (spatial processes), (ii) assess how phytal invertebrate groups assemble in markedly seasonal CVHs (temporal processes), (iii) compare predation pressure upon unstructured benthic habitats, seagrass meadows and reef macroalgal canopies, and (iv) evaluate the relative importance of top-down and bottom-up processes controlling mobile invertebrates through consumer-exclusion experiments. The results of this project will contribute for a better assessment of the importance of CVHs as a link between the benthic and the pelagic realm through the feeding activity of demersal consumers, and would potentially assist any conservation policies aiming the resilience of coastal benthic habitats or the protection of coastal fisheries.

The orange cup coral, Tubastraea coccinea, has been recognized as an invasive species, rapidly colonizing coastal environments from Florida to Brazil. The high rates of recruitment, high larval dispersion, high growth rates, early maturation and great ecological tolerance, have made this a cosmopolitan species. It has a potential to invade new areas and increase its current range in Brazilian coastal waters. Moreover, it produces deleterious effects on the most abundant native coral, Mussismilia hispida, which is an endemic species. Although T. coccinea has been the focus of many recent studies, there is no information on how it will respond to the temperature increase predicted to occur due to global warming. The present proposal aims to compare the responses of T. coccinea and M. hispida to higher temperatures caused by climate warming, through experimental assays in a controlled environment. Low temperatures will also be tested, to assess its invasive potential beyond the tropics, as well as its resilience to extreme cold events, also more probable in the future due to the increase in climate variability predicted by climate change models. The effect of temperature on the ability of T. coccinea and M. hispida to reproduce sexually and assexually will be investigated, through experimental tests in captivity. The water temperatures chosen to investigate responses to future climate warming will be: 26˚C (control = mean summer temperature), 29˚C (+3˚C than the mean summer temperature), 32˚C (+6˚C than the mean summer temperature). To investigate extreme cold events, the water temperatures tested will be: 18˚C (temperature reached during cold waves) and 15˚C (minimum temperature registered). These are reference temperatures for the littoral coast of São Paulo, at an approximate latitude of 23˚49?S, where corals will be collected from nature. To investigate sexual reproduction, (i) propagule release rate, (ii) duration of the larval phase, (iii) larval survival, and (iv) settlement rate will be tested. In order to test the ability of the two coral species to reproduce asexually, growth rates of fragments will be investigated, in captivity, isolated from each other, and side by side. Regeneration time of experimentally inflicted wounds will also be investigated. The overall aim of this proposal is to assess the consequences for the future invasive ability of T. coccinea and competition potential with the native M. hispida. This will lead to the production of two communications in international scientific meetings, one in a national meeting and at least three articles, which will contribute to a more informed management of coastal areas in Brazil and in other parts of the world.

Field and laboratory studies in Brazil and the UK aim the understanding of recruitment dynamics of the intertidal barnacle species Chthamalus bisinuatus (Brazil) and Chthamalus stellatus and Chthamalus montagui (UK). The results from the proposed work will show potential differences in recruitment processes of marine invertebrates between temperate and sub-tropical regions. The work will feed into the ongoing FAPESP-funded project by Prof Flores (2013/01446-2), and will also provide baseline information and pilot studies that are necessary to set up future collaborative work. In a series of short research visits, we aim to address (i) the frequency and length of favorable temporal conditions for larval settlement and recrutment in coastal waters of Brazil and the UK, (ii) the dietary requirements of temperate and sub-tropical species, (iii)	bottom-up limitation for the development of larvae of sub-tropical and temperate barnacle species, (iv) consequences of early larval nutritional experience on post-settlement performance.

Contribuições recentes têm mostrado que a retenção larval em populações de invertebrados marinhos costeiros é muito mais frequente do que o sugerido por modelos físicos de transporte. Sendo assim, processos que ocorrem à escala local, até às unidades de km, podem ser determinantes na estruturação e persistência dessas populações. Cracas são organismos dominantes na região do entre-marés de costões rochosos e, por serem filtradores, representam um elo importante de transferência energética entre o ambiente pelágico e o bentônico. Na região tropical, a disponibilidade de alimento na coluna de água pode limitar o desempenho de larvas e adultos, estes últimos ainda sujeitos a um estresse térmico, no limiar da tolerância, durante os meses de verão. Devido à limitação de espaço no entre-marés, as larvas precisam estocar reservas energéticas para que em seu estágio final, lecitotrófico, possam sondar uma área suficiente do substrato e selecionar um local adequado para o seu desenvolvimento até à fase adulta. É proposto neste projeto entender como a população bentônica interage com a variação ambiental para maximizar sua aptidão, em termos da produção de recrutas que possam chegar à fase adulta. Para tal são propostos três módulos de trabalho, com foco (i) na estratégia de alocação de recursos para maximizar o sucesso reprodutivo em condições contrastantes de suprimento alimentar e estresse térmico, (ii) nos efeitos da qualidade larval na seleção de substratos e no desempenho pós-assentamento e (iii) na relação entre o estado trófico da coluna de água e qualidade larval à mesoescala, a qual, conjuntamente com estimativas de fluxo genético, poderão indicar processos de isolamento ao longo de sua distribuição natural. Espera-se propor um modelo mais refinado de regulação do recrutamento de invertebrados marinhos tropicais com base nos resultados a obter.

1. Estabelecimento de protocolos comuns de pesquisa entre o CASEB (Chile) e o NP-Biomar (Brasil) de modo a institucionalizar a cooperação bilateral vigente ente os dois pesquisadores,
2. Delineamento e início de atividades de pesquisa de estudante sob a orientação dos dois pesquisadores,
3. Redação de dois manuscritos, resultantes de atividades suplementares de projeto desenvolvido com o apoio da FAPESP.
4. Oferecimento de disciplina de pós-graduação sobre a ecologia de comunidades marinhas.

Tem como missão promover pesquisa interdisciplinar entre áreas consolidadas e emergentes neste tema. Neste sentido suas linhas de pesquisa convergem em dois temas centrais correlacionados: conservação e bioprospecção. O objetivo geral da proposta é agregar conhecimento para subsidiar o uso sustentável da biodiversidade marinha, inclusive frente às demandas de políticas públicas (criação de áreas e modelos de preservação de ecossistemas marinhos), da intensa atividade econômica em várias regiões costeiras (pesca, exploração mineral e especulação imobiliária, monitoramento ambiental), e de novas fronteiras biotecnológicas (agregar valores no uso sustentado da diversidade marinha).

Estudo de padrões de biodiversidade na zona entre-marés nas costas pacífica e atlântica da América do Sul

Uma das feições universais do entre-marés de costas rochosas é a presença de um povoamento denso de cracas ctamalídeas, definindo uma zona horizontal correspondente ao mesolitoral superior. Esses organismos são filtradores e sua importância no ambiente é crucial, representando um elo importante na transferência energética entre o ambiente pelágico e o bentônico. O equivalente ecológico na costa sudeste corresponde à espécie Chthamalus bisinuatus. No presente projeto serão estudados processos importantes na regulação de suas populações. No primeiro módulo, pretende-se verificar a importância relativa de processos físicos e biológicos no assentamento larval. Para tal, serão monitoradas variáveis meteorológicas e oceanográficas que determinam o transporte larval, assim como a emissão de náuplius e a taxa de fixação de cipris, ao longo de uma série temporal de três meses. Um estudo da migração vertical no plâncton permitirá inferir a importância do comportamento larval. Uma segunda atividade será realizada para testar o efeito da predação e do recrutamento na regulação da densidade e distribuição vertical dos povoamentos, assim como identificar estágios de sucessão nesse habitat após perturbação experimental. Finalmente, experimentos de manipulação (transplantes), amostragem de populações naturais e monitoramento de variáveis-chave na coluna de água serão conduzidos a diferentes escalas espaciais, ao longo de 170 km do litoral paulista, para verificar se existe um controle ascendente do desempenho desses invertebrados, ditado pelas condições oceanográficas adjacentes.

Sand reefs are prominent features in the intertidal seascape of rocky shores along most of the Brazilian coastline. In southeast Brazil, the sabellariid worm Phragmatopoma caudata may build exuberant colonies, harboring a remarkably rich assemblage of marine invertebrates. Wave action upon the reef, and further reconstruction, results in the formation of galleries and crevices, which are used by larger predators such as crabs and gastropods. Apart from locally enhancing diversity, sabellariid worm reefs play also a crucial role in the latitudinal distribution of many taxa. Several species are found in association with worm reefs far beyond their usual geographical limits. In spite of their importance for ongoing conservation efforts, the available information on the dynamics of sand reef systems is scarce.
We propose to examine key processes responsible for the resilience of sand reefs. Colonies at two different locations are experimentally disturbed at different seasons, and replicate independent plots are examined to check the recovery rate of the reef and monitor the succession of the accompanying invertebrate fauna. We are interested to (1) estimate the overall rate of reef reconstruction, (2) assess the relative importance of juvenile recruitment and adult rebuilding in this process, (3) check for seasonal trends by following manipulative disturbances at different times and (4) verify the impact of disturbance in relevant characteristics of the associated fauna, such as richness, evenness and diversity.

Uma das feições universais do entre-marés de costas rochosas é a presença de um povoamento denso de cracas ctamalídeas, definindo uma zona horizontal correspondente ao mesolitoral superior. Esses organismos são filtradores e sua importância no ambiente é crucial, representando um elo importante na transferência energética entre o ambiente pelágico e o bentônico. O equivalente ecológico na costa sudeste corresponde à espécie Chthamalus bisinuatus. No presente projeto serão estudados processos importantes na regulação de suas populações. No primeiro módulo, pretende-se verificar a importância relativa de processos físicos e biológicos no assentamento larval. Para tal, serão monitoradas variáveis meteorológicas e oceanográficas que determinam o transporte larval, assim como a emissão de náuplius e a taxa de fixação de cipris, ao longo de uma série temporal de três meses. Um estudo da migração vertical no plâncton permitirá inferir a importância do comportamento larval. Uma segunda atividade será realizada para testar o efeito da predação e do recrutamento na regulação da densidade e distribuição vertical dos povoamentos, assim como identificar estágios de sucessão nesse habitat após perturbação experimental. Finalmente, experimentos de manipulação (transplantes), amostragem de populações naturais e monitoramento de variáveis-chave na coluna de água serão conduzidos a diferentes escalas espaciais, ao longo de 170 km do litoral paulista, para verificar se existe um controle ascendente do desempenho desses invertebrados, ditado pelas condições oceanográficas adjacentes.

Apesar de extrema importância para a regulação de populações bentônicas de invertebrados meroplanctônicos, alguns processos relacionados ao assentamento larval ainda não são bem conhecidos. Uma questão ainda pendente é se a taxa de assentamento depende do suprimento de larvas às áreas adjacentes aos estoques parentais. Essa questão será abordada no presente projeto levando em consideração diferentes escalas espaciais. Durante o período de assentamento de 2005, serão instalados coletores artificiais para estimar a taxa de assentamento de braquiúros em seis costões, distribuídos em duas enseadas no município de Ubatuba, SP. Paralelamente, serão realizados arrastos de plâncton nas áreas contiguas aos costões e, durante os eventos principais de assentamento, em estações pré-definidas nas duas baías de estudo. Pretende-se correlacionar as séries temporais nos coletores e no plâncton adjacente para verificar se existe uma relação de causa e efeito entre estas variáveis. O grau de competência larval dos indivíduos obtidos nos coletores e daqueles amostrados no plâncton será determinado para melhor avaliar essa associação. As amostras obtidas dentro das enseadas permitirão descrever a dinâmica das manchas larvais durante a fase final da migração em direção à costa e tentar explicar em parte a variação espacial da taxa de assentamento entre os costões de estudo. Serão ainda realizados experimentos pontuais para estudar o padrão de migração batimétrica na coluna de água e os rítmos circadianos e circamareais da taxa de assentamento, uma vez que esses processos podem explicar os padrões de suprimento e assentamento de larvas na região costeira.

No presente projeto, é proposto examinar a dinâmica de produção e deposição de larvas de braquiúros em seis áreas de costão rochoso ao longo de uma seção do litoral norte do Estado de São Paulo de aproximadamente 30 kms. O período amostral cobrirá três anos consecutivos para verificar se existe uma consistência na variabilidade espacial dos parâmetros quantificados. Três objetivos parciais são propostos: 1) determinar a variabilidade espacial da produção de larvas mediante a obtenção de estimativas da densidade, estrutura e rendimento reprodutivo da população adulta, e a quantificação da densidade de larvas emitidas no plâncton adjacente; 2) avaliar o potencial de diferentes processos físicos no transporte de megalopas à costa e detectar padrões de deriva larval; e 3) comparar as taxas de assentamento larval entre as populações examinadas. Os valores médios do rendimento reprodutivo e da taxa de assentamento serão comparados para verificar se as populações estudadas podem ser classificadas como fontes preferenciais de emissão de larvas ou locais de deposição de recrutas. A correlação entre a taxa de assentamento e a densidade populacional será testada para poder elaborar hipóteses específicas sobre a importância relativa da taxa de suprimento de larvas face à mortalidade pós-assentamento nas populações estudadas.

Os objectivos do projecto ProRecruit são a descrição da variabilidade temporal do recrutamento de espécies de invertebrados costeiros que apresentam uma fase larvar no seu ciclo de vida, e a compreensão das interacções do forçamento físico com a biologia das larvas que controlam o fornecimento de larvas aos sistemas costeiros. O enquadramento ambiental em que este projecto terá lugar é a costa oeste da Península Ibérica, localizada na margem este de uma grande bacia oceânica. Este sistema é fortemente controlado pelo vento, onde a circulação costeira é dominada por eventos de afloramento e ressurgência regulados por ventos que sopram ao longo da costa.Os objectivos específicos são (1) desenvolver um enquadramento conceptual e modelos simples para um melhor planeamento dos trabalhos de campo e de modelação, (2) descrever os padrões de recrutamento de cracas e de caranguejos em sistemas costeiros seleccionados, e analisar a variabilidade entre sistemas e entre anos, (3) descrever a oceanografia costeira e a distribuição tridimensional de megalopas e cypris adjacente aos sistemas, (4) modelar o forçamento atmosférico e a circulação costeira, bem como os seus efeitos na advecção das larvas e (5) relacionar o recrutamento nos sistemas com o forçamento físico.

The proposed project will study the ecology of an extreme environment, the wave swept t zone of rocky shores (MAST III. A.2.3). The findings will also increase understanding of the importance of biodiversity in ecosystem function (MAST III. A.1.3). The approach will be to integrate field-experimental and modelling studies from the individual through the population to the community level. Most importantly, generality of ecological processes will be investigated on a European-wide scale using common methodologies and experimental designs. This will enable valid north-south and Atlantic-Mediterranean comparisons of the relative importance of abiotic factors and biological interactions within the wave swept zone. Specifically the aims are to: 
1) Co-ordinate the activities of individual research groups 
via the development of standardised methodologies and implementation of current international standards of experimental design, thereby enabling European-scale research. 
2) Develop technologies for continuous automatic measurement of the physical environment of the wave-swept zone; refine telemetric methods for studying foraging jbehaviour; refine image analysis methods for use in studies of recruitment and community interactions. 
3) Investigate the role of abiotic factors and biological interactions in influencing the spatial and temporal patterns of foraging by major grazers and predators, including previously-ignored mobile predators, on Atlantic and Mediterranean coasts. 
4) Investigate the relative importance of physical factors, recruitment fluctuations and activities of consumers (investigated in 3) in structuring rocky shore communities along a European geographic gradient. 5) In parallel with the information from 2), 3) and 4), develop models linking iindividual behaviour with population and community processes. These models, together with the expertise derived from 2), 3) and 4), will increase understanding of current impacts on the European rocky coas

The main objectives are (1) to provide a deep knowledge of the reproductive biology, recruitment patterns and population dynamics of the crustaceans and molluscs playing an important economic role within the East African mangrove ecosystems, (2) to investigate the temporal patterns of key species' larval release in relation to environmental parameters and to describe larval stages, (3) to provide the population genetic structure of two decapods, Macrobrachium rosenbergi and Scylla serrata, selected because of their commercial importance and geographical distribution, (4) to appraise the traditional exploitation activities on mangrove forests and to analyse their transformation and changes, thus to weight the cultural heritage of the local population, and (5) to define the proposal risen from local population and verify their practicability in a small local scale.
Main activities comprise standardised sampling protocols and methods applied along the whole geographical gradient, to estimate macrobenthos biomass and reproductive status of key species. A new method based on a permanent TV system will be developed, together with image analysis systems, to gain information on the density and population structure. Population genetics of key species will be investigated by analysing anonymous DNA markers amplified by PCR with single primers, RAPDs. Partitioning of the revealed variability into within- and between- population components will be done. Contacts with traditional authorities will furnish information on infrastructures, market facilities, social services, demographic implications and other activities related to mangrove exploitation. The Participatory Rural Appraisal (PRA) will be applied to enable local people to share, enhance and analyse their knowledge of life and conditions, in relationship with the mangrove ecosystem.