Elaine Cristina Pereira De Martinis.

Sigla: AEX-FMRP-00045.01Título: Dia Mundial da Segurança dos Alimentos 2025Versão: 1Oferecimento n 1Período de realização: 05/05/2025 a 07/06/2025

Edital Inclusão Social e Diversidade na USP, contempla a temática Igualdade de Gênero e outros Objetivos de Desenvolvimento Sustentável da agenda proposta pela ONU aos chefes de Estado e de governo em 2015, que devem ser cumpridos até 2030, e é uma parceria entre as Faculdades de Ciências Farmacêuticas (FCFRP), de Filosofia, Ciências e Letras (FFCLRP), ambas da USP em Ribeirão Preto, e o Serviço Brasileiro de Apoio às Micro e Pequenas Empresas (Sebrae).

EDITAL 02/2021 - INCLUSÃO SOCIAL E
DIVERSIDADE NA USP E EM MUNICÍPIOS DE SEUS CAMPI da PRÓ-REITORIA DE
CULTURA E EXTENSÃO UNIVERSITÁRIA da USP e tem vigência de 24 de agosto de
2021 a 23 de agosto de 2022. COOPERAÇÃO ENTRE A FCF, ESALQ e FCFRP-USP.

Fui coordenadora adjunta da equipe da FCFRP-USP que participou desta operação, sob coordenação do Prof. Auro Nomizo. Desenvolvemos atividades do projeto Rondon (https://projetorondon.defesa.gov.br/portal/) na cidade de Boa Hora - PI, em conjunto com o Instituto Federal de Educação, Ciência e Tecnologia Sudoeste de Minas Gerais ? Campus Rio Pomba ? IFSEMG.

O crescente número de pacientes com sequelas da COVID-19 (síndrome pós-aguda da COVID-19-PACS), aponta para a necessidade de atenção especial às interações entre SARS-CoV-2 (coronavírus 2 da síndrome respiratória aguda grave) e outros órgãos além dos pulmões. O intestino também é afetado pelo vírus e sintomas gastrointestinais (GI) são relatados na infecção aguda, podendo surgir ou persistir como PACS. Pacientes apresentando Doenças Inflamatórias Intestinais (DII) como a Retocolite Ulcerativa (RCU), são geralmente tratados com imunossupressores capazes de afetar a eficácia de vacinas e respostas antivirais eficientes. Especula-se que poderiam ser importantes reservatórios de SARS-CoV-2, com manutenção de respostas de memória associadas à PACS. De forma interessante, a persistência de antígenos de SARS-CoV-2 no intestino de pacientes com DII está relacionada à manifestação de PACS pelos mesmos. Assim, hipotetizamos que PACS pode estar relacionada a uma possível disfunção imunológica desencadeada por antígenos virais remanescentes no intestino. Ainda, novas sequelas da COVID-19 são cada vez mais descritas, não apenas no trato GI, mas também em outros órgãos. Não se sabe certamente quais são as consequências tardias da infecção em pacientes predispostos às DII ou mesmo se SARS-CoV-2 pode atuar como gatilho para uma nova RCU. Por outro lado, a suscetibilidade de pacientes com RCU à PACS, assim como os impactos posteriores da infecção viral na remissão da colite, ainda são questionáveis. Portanto, pretendemos investigar a relação entre a desregulação da imunidade intestinal na RCU e a infecção por SARS-CoV-2, como um modelo para estudar a patogênese de PACS e estratégia para entender os impactos recíprocos entre a COVID-19 e a RCU. Esperamos contribuir para o manejo de pacientes afetados tanto pela RCU quanto pela COVID-19, considerando-se especialmente as sequelas do vírus nessa população com DII, previamente propensa à quebra da homeostase. Inicialmente será investigada a associação entre respostas sistêmicas e manifestações gastrointestinais em pacientes apresentando COVID-19 aguda ou pós-aguda (sem DII), assim como em pacientes com RCU em atividade ou remissão. Organoides intestinais humanos infectados in vitro por SARS-CoV-2 serão tratados com os principais mediadores sistêmicos de inflamação relacionados ao agravamento da COVID-19 e/ou da RCU, de forma a se determinar seus mecanismos de modulação das respostas ao vírus, na presença ou ausência de LPS bacteriano, presente na microbiota intestinal. Serão utilizados modelos murinos de colite experimental e infecção por SARS-CoV-2 para melhor compreensão dos efeitos da colite na infecção viral, assim como os efeitos do vírus e da memória imunológica na indução ou agravamento de inflamação intestinal posterior. Ainda, pacientes com RCU em remissão serão monitorados e, frente a um diagnóstico subsequente de COVID-19, terão amostras de sangue, fezes e biopsias intestinais coletadas em diferentes períodos, juntamente ao acompanhamento em longo prazo (180 dias), de forma a elucidar se sequelas da infecção podem estar relacionadas a recaídas da RCU. Serão realizados exames hematológicos e bioquímicos, transcriptoma de leucócitos circulantes e metaboloma (plasma e fezes), juntamente à avaliação da resposta imune e transcriptoma espacial das biópsias intestinais, para detecção de repertório de TCRs e memória ao vírus. Além disso, propomos sequenciar o bacterioma intestinal, identificar vírus e anticorpos específicos a antígenos intestinais, por PhIP-Seq (Phage ImmunoPrecipitation Sequencing). Os resultados obtidos serão interpretados em conjunto com a progressão clínica das doenças, em análises integrativas.

A produção sustentável de alimentos depende grandemente de insetos polinizadores, sendo as abelhas sem ferrão (ASF) protagonistas nesse processo, especialmente em regiões tropicais e subtropicais. Além dessa importância inquestionável, as ASFs podem produzir méis com características sensoriais muito apreciadas, e com propriedade biotecnológicas que podem beneficiar a saúde humana e animal, atributos esses devidos em parte à sua microbiota rica, mas ainda pouco conhecida. Neste projeto, é proposto o estudo de méis de abelha sem ferrão quanto à sua diversidade microbiana cultivável e não cultivável durante o processo fermentativo. Os isolados obtidos serão triados quanto à atividade antimicrobiana (bacteriocinas) e também fenotipicamente para o mecanismo regulatório de Quorum Sensing, utilizando ensaio clássico de bioluminescência. Será investigado ainda o potencial probiótico dos isolados, utilizando o modelo de zebrafish como uma Nova Alternativa Metodológica simples e de alto rendimento. Adicionalmente, será feita também a pesquisa exploratória de bacteriófagos por método fenotípico, tendo em vista a crescente importância dessas partículas virais como plataformas para inovações tecnológicas e o inedistimo de sua busca em amostras de mel de ASF. Os resultados a serem alcançados poderão indicar as complexas relações dessa microbiota, com aplicações que poderão contribuir para o avanço da legislação de alimentos, técnicas de manejo na meliponicultura, além de permitir vislumbrar aplicações para combater problemas atuais de resistência a antimicrobianos e outras aplicações em alimentos e a saúde.

Objetivos: conhecer e estabelecer parceria em pesquisa e extensão no Department of Food Science da School of Environmental and Biological Sciences, Rutgers, the State University of New Jersey.Apresentar os projetos desenvolvidos pelo Laboratorio de Microbiologia de Alimentos da Faculdade de Ciencias Farmaceuticas e da FoRC (Food Research Center) da USP aos docentes do Department of Food Safety da Rutgers University para estabelecimento de possíveis projetos de pesquisa colaborativos entre a FCF/USP e Rutgers, The State University of New Jersey.

Bactérias láticas (BAL) podem ser consideradas ?biofábricas? de compostos de interesse em saúde humana, animal e em alimentos, destacando-se a produção de peptídeos antimicrobianos (bacteriocinas), compostos antifúngicos, enzimas (lactase, proteinases) e vitaminas (complexo B), além do possível efeito de exclusão competitiva de patógenos quando administradas diretamente na forma de probióticos. O objetivo deste projeto é estudar detalhadamente o genoma de BAL comprovadamente produtoras de compostos de interesse biotecnológico, utilizando para isso culturas isoladas de alimentos variados por nosso grupo ao longo de quase 20 anos de pesquisa. Para isso, de acordo com nossa experiência recente em sequenciamento de genoma completo (WGS) e bioinformática, a utilização dessas ferramentas poderosas permitirá avançar na fronteira do conhecimento e potencialmente viabilizar a aplicação biotecnológica das culturas de BAL. Os resultados esperados estão relacionados a: (1) desenho de primers que permitam a prospecção de BAL de matrizes diversas; (2) entendimento da dinâmica de adaptação nicho-específica dos microrganismos, por meio de estudos comparativos, principalmente por análises de pangenoma, (3) proposição de novos genes marcadores de potencial biotecnológico, e (4) complementação de bancos de dados públicos com genomas de cepas de interesse biotecnológico oriundas de diversas matrizes alimentares e localidades, que podem ajudar a definir produtos de origem controlada (biogeografia), com alto valor agregado e possível geração de renda para o país.

In recent years, the importance of food-producing animals as an expanding reservoir of methicillin-resistant strains of Staphylococcus aureus (MRSA) has attracted worldwide attention. There are indications that these livestock-associated MRSA strains have originated from methicillin-sensitive strains from humans that, during the jump, have lost some well-known phage-carried human virulence genes and acquired antimicrobial resistance genes. Studies that may improve our understanding of the functions and mechanisms of action of the virulence determinants involved in the pathogenesis of MRSA are important for identifying potential intervention targets to prevent or treat the clinical onset of staphylococcal diseases. In this project, high-throughput transposon sequencing will be initiated to study putative virulence genes of the methicillin-resistant Staphylococcus aureus SABRC13, isolated from a Brazilian dairy. Mutants will be screened for virulence changes in a tridimensional model of eukaryotic cell culture. The Swedish team is highly skilled in molecular techniques and large dataset analysis, which will be complemented by the ability of the Brazilian team to obtain 3D eukaryotic cell culture for studies of bacterial pathogens. Together, this constitutes a robust model for large-scale genetic studies of virulence mechanisms in selected pathogens, which will contribute to detecting new targets to interfere with bacterial infection.

A Rede de Pesquisas em Queijos Artesanais Brasileiros (REPEQUAB) foi criada em junho de 2018 com o objetivo de reunir pesquisadores que atuam na área de queijos artesanais brasileiros a fim de promover a troca de conhecimento e fomentar parcerias para abrir novas frentes de pesquisa.

A proposta da criação da rede surgiu quando pesquisadores do Centro de Pesquisas em Alimentos (FoRC ? Food Research Center) realizaram um projeto de microbiologia de alimentos junto aos produtores de queijo da Serra da Canastra (MG).

Conforme o projeto foi ganhando corpo, seus líderes constataram que havia um número significativo de pesquisadores desenvolvendo projetos na área, muitas vezes semelhantes. Neste contexto, a REPEQUAB foi criada para unir esforços, de forma que os resultados dos trabalhos científicos sejam otimizados.

O processo espontâneo de fermentação do cacau não é padronizado, uma vez que os microrganismos que compõem o meio fermentativo são autóctones do ambiente externo às sementes de cacau que serão fermentadas. Trata-se de um processo complexo, em que se observa ao longo de sua execução uma sucessão microbiana, iniciando com a colonização por leveduras e é mantido e finalizado pelas bactérias ácido láticas e ácido acéticas. Diversos autores realizaram esforços no sentido de obter uma cultura de bactérias definidas, uma cultura starter, que garantiria a padronização do aroma e sabor (flavour) característicos do chocolate, o qual depende dos metabólitos liberados pelos microrganismos envolvidos no processo. Além disso, em algumas fermentações, a qualidade do alimento fermentado foi relacionada com a presença e ausência de cepas que expressam genes associados às vias clássicas de Quorum Sensing (QS) ou Quorum Quenching (QQ), tornando importante entender a dinâmica do processo fermentativo sob a ótica da comunicação bacteriana. Assim, objetivamos: (I) isolar DNA microbiano nas amostras de cacau durante a fermentação em tempos específicos; (II) sequenciar o DNA das amostras e analisar na plataforma ou HiSeq 2500 da Illumina; (III) identificar por meio de análise de bioinformática as bactérias que expressam genes moduladores das vias de QS; (IV) analisar fenotipicamente em ensaio de QS; (V); quantificar as moléculas autoindutoras presentes na cultura de bactérias por meio de HPLC-MS/MS; (VI) produzir uma cultura starter com populações bacterianas definidas; (VII) realizar a análise sensorial das sementes fermentadas por técnicos especializados.

Desenvolvido em colaboração com a Profa. Ellen Cristini de Freitas da Escola de Educação Física e Esporte de Ribeirão Preto, EEFERP USP e sua orientada, doutoranda Gabriela Batitucci Miranda (Programa de Pós-Graduação em Alimentos e Nutrição, Faculdade deCiências Farmacêuticas da Unesp campus Araraquara/SP). Nossa contribuição é na realização de análises relacionadas à microbiota intestinal, envolvendo análises metagenômicas e de bioinformática.

UNIVERSIDADE DE SÃO PAULO, BRASIL & INSTITUT NATIONAL DE LA RECHERCHE AGRONOMIQUE, NANTES - FRANÇA - PROGRAMA USP - COFECUB
Coordenadores: Prof. Dr. Bernadette Dora Gombossy de Melo Franco - USP e Prof. Dr. Thomas Haertlé - INRA, Nantes -França.
A soja representa uma fonte importante de proteínas de alto valor nutricional e uma alternativa de aporte protéico para indivíduos vegetarianos, intolerantes à lactose ou alérgicos às proteínas do leite bovino. Além disso, o consumo de soja e/ou produtos derivados vem sendo associado a diversos benefícios à saúde. Estes fatos contribuíram para o aumento significativo do consumo de soja observado nas últimas décadas. Porém, o consumo deste grão pode desencadear reações alérgicas em indivíduos sensibilizados. A alergia à soja é provocada pela ligação dos epitopos presentes em suas proteínas com IgEs específicas, desencadeando a liberação de mediadores inflamatórios e causando distúrbios nos sistemas respiratório e gastrointestinal, problemas cutâneos e, em casos mais graves, anafilaxia. Os principais alérgenos presentes na soja são a β-conglicinina (7S) e a glicinina (11S), que representam entre 70 e 80% das proteínas totais desta leguminosa. Segundo o FDA-USA, a soja faz parte do grupo que inclui os oito alimentos mais alérgicos reconhecidos, afetando 1-6% de crianças menores de 3 anos e entre 3-4% de adultos. Sendo assim, o estudo de estratégias que permitam a redução da imunoreatividade das proteínas da soja apresenta grande relevância na tentativa de minimizar os efeitos adversos deste problema para os indivíduos alérgicos. A fermentação por bactérias láticas proteolíticas, capazes de hidrolisar os epitopos responsáveis pela ligação com a IgE, constitui uma alternativa interessante para reduzir a alergenicidade da soja. Em estudos anteriores, realizados em parceria entre os grupos de Microbiologia de Alimentos (FCF-USP, Brasil) e de Engenharia de Proteínas, do INRA, França, foram isoladas cepas proteolíticas de BAL com forte atividade contra as proteínas alergênicas do leite e com potencial para aplicação na elaboração de produtos lácteos fermentados hipoalergênicos. Sendo assim, torna-se interessante estender o estudo da atividade proteolítica dessas cepas contra outras matrizes alimentares com resposta antigênica, como a soja, aumentando o potencial de aplicação dessas BAL na redução das alergias alimentares. Portanto, o presente projeto pretende avaliar o potencial de aplicação dessas culturas láticas proteolíticas na elaboração de produtos fermentados hipoalergênicos à base de soja. Além da contribuição científica, o projeto objetiva formar recursos humanos em nível de doutorado e pós-doutorado, especializados no tema em pauta.

coordenadores: Elaine Cristina Pereira De Martinis (Brasil) e àtrícia Castellano (Argentina)

Projeto temático aprovado na chamada FAPESP-DCSR (2012/50507-1). 
Coordenadores: Lone K. Gram (Dinamarca)
 Elaine Cristina Pereira De Martinis (Brasil)

Coordenadora - Profa. Beatriz Rosana Cordenunsi - Faculdade de Ciências FarmacêuticasVice Coordenadora - Profa. Carmen Cecília Tadini - Escola Politécnicahttp://www.usp.br/napan/O NAPAN congrega 15 unidades de Pesquisa e tem como objetivo fortalecer na USP competência para o desenvolvimento de projetos de pesquisa multidisciplinares em áreas de fronteira, voltados à solução de problemas de Alimentos e Nutrição visando à saúde da população e a inovação.

A criação do FoRC foi uma iniciativa dos pesquisadores da USP no sentido de serem pioneiros na concepção do primeiro centro de pesquisa focado em alimentos e nutrição no Brasil. Além disso, ele explora o fato da nutrição e saúde apresentarem um caráter multidisciplinar, empreendendo diferentes contextualizaçoes que os vários perfis de profissionais podem elaborar acerca de um mesmo tema.

Por esta natureza tão enriquecedora, os objetivos do FoRC se capilarizam em interações com diferentes comunidades, como a acadêmica, de profissionais, governo, terceiro setor e sociedade em geral, fomentando a difusão do conhecimento gerado para eles e também transferindo a tecnologia a fim de perpetuar um círculo virtuoso de incentivos. http://cepid.fapesp.br/centro/21/

FAPESP n° 2011/07062-6

As alergias alimentares associadas ao leite e produtos lácteos, bem como a ocorrencia de enfermidades de origem alimentar causadas por microrganismos contaminantes de produtos lácteos constituem um desafio para produtores e consumidores. As bactérias lácticas apresentam um potencial de aplicação na solução destes problemas, uma vez que são capazes de produzir uma série de compostos metabolicos bioativos, resultantes da hidrólise das proteínas do leite. Este projeto objetiva aliar as experiêcias do grupo de Microbiologia de Alimentos da USP, São Paulo, e de Engenharia de Proteínas, do INRA, França, para selecionar, identificar e caracterizar bactérias láticas (BAL) com atividade proteolítica e antimicrobiana contra bactérias, fungos e vírus; caracterizar a atividade antimicrobiana das proteínas das BAL (mecanismos de ação, espectro de atividade, determinantes genéticos); avaliar o impacto das BAL na estabilidade de proteínas do lactosoro e no reconhecimento dos epitopos destas proteínas pelas imunoglobulinas IgE de pacientes alérgicos na França e no Brasil, comparando os resultados obtidos nos dois países; avaliar os efeitos das interações entre as proteínas do lactosoro e polissacaridios na digestibilidade e alergenicidade destas proteínas e avaliar a atividade antimicrobiana dos peptídios resultantes da hidrolise das proteínas do lactosoro. Além da contribiuição científica de per se, o projeto objetiva formar recursos humanos em nível de doutorado e pós-doutorado, especializados no tema em pauta, pavimentando o caminho para um futuro programa de co-tutela entre a USP e o INRA..

2009/07169-5 Estudo sobre a participação dos leucotrienos e prostaglandinas na
fagocitose de Cronobacter sakazakii por macrófagos

A vida moderna tem gerado mudanças importantes nos hábitos alimentares em todo o mundo e, observa-se um aumento da demanda por alimentos prontos para o consumo, submetidos a processamento mínimo e refrigerados. Nesta classe de alimentos, estão incluídas as hortaliças minimamente processadas. As condições de embalagem e armazenamento destes produtos podem favorecer a contaminação por Salmonella sp., um importante patógeno causador de enterocolite e que pode deixar seqüelas crônicas. Também pode haver o desenvolvimento de bactérias psicrotróficas, destacando-se o patógeno Listeria monocytogenes. Esta bactéria é de grande interesse em saúde pública, devido à severidade da doença que causa (listeriose) e sua dose mínima infecciosa para o homem não está bem definida. Para estudos de avaliação de risco microbiológico relativos a Listeria monocytogenes, são necessários dados quantitativos e, os métodos para enumeração disponíveis atualmente são trabalhosos e demoram de 4-7 dias a obtenção de resultados. De Martinis et al. (2007) desenvolveram um método de NMP empregando-se PCR em tempo real baseada em genes que codificam para 16S rRNA. Neste projeto, será realizada a quantificação clássica de populações de Salmonella sp em vegetais minimamente processados, bem como será realizada a triagem de amostras positivas para Listeria sp. por meio de método imunoenzimático (Listeria Rapid Test, Oxoid), até perfazer 5% do total de amostras positivas. As amostras positivas para Listeria sp também serão avaliadas quantitativamente para Listeria monocytogenes e, para tanto, será empregado um método clássico comparado com um método molecular (PCR em tempo real). Esses experimentos deverão contribuir para uma futura aplicação do método de PCR em tempo real, para quantificação combinada destes patógenos em alimentos, bem como fornecerão importantes dados para dar suporte a análises de risco.