Marcio Roberto Costa Martins.

O Brasil tem o compromisso de avaliar o risco de extinção das cerca de 10.000 espécies de vertebrados, utilizando as diretrizes da IUCN para analisar a condição e a tendência das populações. A partir dessa avaliação, é elaborada a Lista Nacional de Espécies Ameaçadas de Extinção. Também são identificadas espécies cujas informações são insuficientes para uma avaliação precisa, que, portanto, tornam-se prioridades para a pesquisa em biodiversidade. No entanto, o monitoramento dessas espécies por meio de métodos tradicionais é dificultado, especialmente para aquelas que são de pequeno porte, raras ou de difícil detecção. Nesse cenário, o DNA ambiental (eDNA) metabarcoding, surge como uma abordagem inovadora, proporcionando a detecção de espécies raras e ameaçadas de maneira não invasiva. Embora o uso de eDNA em ambientes terrestres e abertos, como o cerrado, seja ainda pouco explorado, essa técnica apresenta grande potencial. Além disso, as bases de dados de sequências de DNA disponíveis ainda apresentam uma baixa representatividade de espécies neotropicais, limitando sua aplicação. Este projeto visa aprimorar o uso do eDNA metabarcoding para o registro de vertebrados terrestres raros, elusivos, ameaçados ou com dados insuficientes do cerrado do Planalto Central. Seus objetivos principais são: (1) ampliar a representatividade de genomas mitocondriais (mtDNA) de mamíferos brasileiros em bases públicas e (2) comparar a eficácia do eDNA metabarcoding com metodologias tradicionais de levantamento da herpetofauna e de pequenos mamíferos em ambientes savânicos. O projeto conta com o apoio do programa Genômica da Biodiversidade Brasileira (GBB), uma parceria entre o Instituto Chico Mendes de Conservação da Biodiversidade (ICMBio) e o Instituto Tecnológico Vale (ITV), que será responsável pelo sequenciamento de genomas mitocondriais de espécies cujos tecidos estão depositados em coleções brasileiras. No entanto, algumas espécies ainda não possuem tecidos disponíveis e, para essas, o sequenciamento será realizado a partir de espécimes de coleções zoológicas, com o apoio do projeto "Amostra velha é que conta história boa" sob a responsabilidade de Joyce do Prado que apoiará o campo e a obtenção de DNA histórico (hDNA) de ossos, dentes ou fragmentos de pele. Este será o primeiro estudo a comparar a detectabilidade do eDNA metabarcoding com métodos tradicionais para o estudo da fauna de vertebrados no cerrado, criando uma oportunidade valiosa para o registro de espécies raras e ameaçadas nesse bioma. Neste estudo serão tomadas 90 amostras entre solo e água no Parque Nacional da Chapada dos Veadeiros, localizado no estado de Goiás, concomitante com uma coleta de 30 dias com armadilhas de interceptação e queda (pitfall) e armadilhas do tipo caixa e gaiola (sherman e tomahawk). Esperamos que o eDNA recupere um maior número de espécies e com maior representação das espécies ameaçadas e com dados insuficientes comparado com as metodologias tradicionais para répteis, anfíbios e mamíferos.

Responsável por Projeto Temático pelo Programa Biota-Fapesp, em colaboração com o RAN-ICMBio
Resumo: O Brasil possui cerca de 2.000 espécies de anfíbios e répteis, várias delas ameaçadas, o que implica em uma enorme responsabilidade de nosso país para conservá-las. Neste projeto, como forma de contribuir para a conservação dos anfíbios e répteis Squamata, com ênfase no Brasil, desenvolveremos, em estreita colaboração com o Centro Nacional de Pesquisa e Conservação de Répteis e Anfíbios (RAN-ICMBio), pesquisas e outras atividades visando (1) obter dados básicos sobre populações, espécies e comunidades; (2) explorar processos potencialmente responsáveis por padrões de diversidade; (3) diagnosticar vulnerabilidades e ameaças, lacunas de conhecimento e lacunas de conservação; e (4) detectar áreas prioritárias para a conservação e restauração. Além disso, desenvolveremos ações visando disseminar os conhecimentos obtidos por meio de divulgação científica e educação ambiental. Todos os resultados deste projeto serão compartilhados com o RAN-ICMBio, para que sejam utilizados em atividades voltadas à conservação. Este projeto representa uma parceria ampla, fortemente colaborativa, entre um grupo de acadêmicos especialistas nos grupos taxonômicos e/ou com grande experiência em biologia da conservação, e o órgão público brasileiro responsável pela produção das listas de espécies ameaçadas e pela elaboração e implementação de planos de ação de conservação para anfíbios e répteis, o RAN-ICMBio. Assim, pode-se prever que esta parceria sem precedentes contribuirá de maneira efetiva para a conservação dos anfíbios e répteis Squamata brasileiros. Outro aspecto que torna esta proposta original é que ela integra várias abordagens de conservação ao mesmo tempo, incluindo diagnósticos, planejamentos e ações, concentradas em dois grupos taxonômicos megadiversos na Região Neotropical.

Embora o conhecimento sobre as espécies e as comunidades biológicas tenha aumentado significativamente ao longo das últimas décadas, ainda é necessário um grande esforço no sentido de obtermos as informações necessárias para uma melhor compreensão dos efeitos das mudanças ambientais antropogênicas sobre a biodiversidade. As alterações antropogênicas dos ambientes naturais podem afetar as espécies de diversas formas, havendo grande variação no efeito das mesmas sobre diferentes espécies ou grupos funcionais. Este projeto tem dois objetivos principais: (1) avaliar o efeito do fogo prescrito sobre a diversidade (de espécies, funcional e filogenética) em comunidades de anfíbios e lagartos no Cerrado, como forma de fornecer subsídios para a conservação das espécies e o manejo integrado de fogo em UCs; e (2) avaliar o efeito da substituição de floresta nativa por plantações comerciais de árvores sobre a diversidade (de espécies, funcional e filogenética) em comunidades de serpentes e anfíbios, como forma de fornecer subsídios para a conservação das espécies e o manejo de paisagens onde predominam florestas nativas e plantações comerciais de árvores. Os conhecimentos gerados por este projeto subsidiarão a avaliação do estado de conservação e a definição de ações de conservação para as espécies de anfíbios, lagartos e serpentes estudadas. Três estudos concomitantes de estrutura de comunidades serão realizados, sendo dois relacionados ao efeito do fogo sobre as comunidades de lagartos e anuros em duas localidades do Cerrado (Estação Ecológica de Santa Bárbara, SP, e Estação Ecológica Serra Geral do Tocantins, TO, usando armadilhas de queda em ambos os casos) e outro sobre o efeito da substituição da floresta nativa por plantação de eucalipto sobre comunidades de serpentes e anfíbios da Mata Atlântica (na Fazenda Melhoramentos, Monte Verde, Camaducaia, MG, por meio de procura visual, encontros ocasionais e observações por terceiros). Em todos os casos, os métodos correntes de análise de diversidade de espécies, funcional e filogenética serão empregados.

Embora o conhecimento sobre as espécies e as comunidades biológicas tenha aumentado significativamente ao longo das últimas décadas, ainda é necessário um grande esforço no sentido de obtermos as informações necessárias para uma melhor compreensão dos efeitos das mudanças ambientais sobre a biodiversidade e, com isso, subsidiar a tomada de decisões em conservação. As alterações antropogênicas dos ambientes naturais podem afetar as espécies de diversas formas, havendo grande variação no efeito das mesmas sobre diferentes espécies ou grupos funcionais. Este projeto tem dois objetivos principais: (1) avaliar o efeito do fogo prescrito sobre a diversidade (de espécies, funcional e filogenética) de anfíbios e lagartos no Cerrado, como forma de fornecer subsídios para o manejo integrado de fogo em UCs e para a definição de ações de conservação; e (2) avaliar o efeito da substituição de floresta nativa por plantações comerciais de árvores sobre a diversidade (de espécies, funcional e filogenética) de anfíbios e serpentes, como forma de fornecer subsídios para o manejo de paisagens onde predominam florestas nativas e plantações comerciais de árvores e para a definição de ações de conservação. Os conhecimentos gerados por este projeto subsidiarão, ainda, a avaliação do estado de conservação das espécies de anfíbios, lagartos e serpentes estudadas. Três estudos concomitantes serão realizados, sendo dois relacionados ao efeito do fogo sobre as comunidades de lagartos e anuros em duas localidades do Cerrado (Estação Ecológica de Santa Bárbara, SP, e Estação Ecológica Serra Geral do Tocantins, TO, usando armadilhas de queda em ambos os casos) e outro sobre o efeito da substituição da floresta nativa por plantação de eucalipto sobre comunidades de serpentes e anfíbios da Mata Atlântica (na Fazenda Melhoramentos, Monte Verde, Camaducaia, MG, por meio de procura visual, encontros ocasionais, observações por terceiros e armadilhas de queda). Em todos os casos, os métodos correntes de análise de diversidade de espécies, funcional e filogenética serão empregados.

Bolsa de Pesquisa - Exterior, duração 10/02/2013 a 09/12/2013. As serpentes atuais exibem uma enorme diversidade biológica e o entendimento da sua biologia evolutiva tem aumentado consideravelmente nos últimos anos, em grande parte pela disponibilização de novas filogenias. Além destas, têm sido essenciais para esse avanço o acúmulo de informações sobre a história natural e a distribuição geográfica das serpentes. Tais conhecimentos são essenciais para diversos estudos ecológicos e evolutivos, bem como para avaliar o estado de conservação das diferentes linhagens. Neste projeto é proposto um estudo abrangente sobre os viperídeos, um grupo monofilético com mais de 300 espécies descritas, distribuídas por quase todos os continentes. Para tanto, é proposta (1) a construção de uma base de dados abrangente sobre biologia e distribuição geográfica, (2) a descrição dos padrões de história natural das diferentes linhagens da família, (3) a exploração da biologia evolutiva do grupo por meio de métodos comparativos e (4) a avaliação do estado de conservação de todos os viperídeos, identificando padrões filogenéticos e geográficos de vulnerabilidades e de ameaças. Propõe-se que uma parte significativa de tais iniciativas sejam concretizadas por meio de uma estadia de 10 meses na Universidade da Florida (UF, Gainesville), o que permitiria o trabalho na abrangente coleção herpetológica local, facilitaria o acesso às principais coleções herpetológicas dos Estados Unidos e permitiria interações (colaborativas ou não) com diversos especialistas em viperídeos.

Este projeto tem como objetivo principal estudar os padrões filogenéticos, ecológicos e bio-geográficos das serpentes, bem como os processos evolutivos envolvidos na origem destes padrões. Pretendemos estudar estes aspectos através de uma abordagem multidisciplinar ao longo de um intervalo de tempo que se estende desde o Cretáceo até o recente, focando nossos esforços em questões pertinentes à origem e diversificação filogenética e ecológica das Serpentes, e mais especialmente da irradiação neotropical de Dipsadidae. Neste sentido, o projeto se valerá dos dados derivados de abordagens distintas e complementares, que englobam as áreas de paleontologia, biologia molecular, biogeografia, ecologia comparativa, morfometria geométrica, anatomia comparada e embriologia. Para abordar o tema referente à origem das serpentes e evolução inicial das suas características compartilhadas pretendemos estudar os fósseis que representam táxons-chave para o grupo, tais como os Pachyophiidae, Madtsoidae e ?booideos? norte-americanos, e as suas afinidades com os grupos atuais em uma abordagem de evidência total (Kluge, 1989). Esta análise será estendida aos Colubroides, o grupo mais diversificado de serpentes atuais. Neste, pretendemos elaborar uma filogenia que abranja a grande maioria das espécies pertencentes à irradiação neotropical de Dipsadidae, que representa um dos seus componentes mais diversos. Tanto a filogenia dos grandes grupos de serpentes, envolvendo fósseis e atuais, quanto a filogenia do clado Colubroides e dos Dipsadidae neotropicais, fornecerão o arcabouço histórico necessário para a elaboração dos estudos de ecologia e biogeografia comparativas.O tema acerca da origem e evolução das serpentes e das suas características de vida oferece um conteúdo único para a elaboração de material didático e de divulgação científica, como solicitado no edital da Fapesp. Desta forma, propõe-se a elaboração de dois principais produtos de divulgação científica: 1) uma serie de

Dados bons de história natural e distribuição são essenciais para diversos tipos de estudos em ecologia e evolução, bem como para subsidiar a tomada de decisões em conservação. Este projeto tem como objetivo principal obter informações de história natural e de distribuição de anfíbios e serpentes de forma a abordar questões importantes em ecologia, evolução e conservação. Populações de espécies focais e comunidades serão estudadas em ambiente natural. Comunidades terão sua diversidade e história natural caracterizadas utilizando-se ao procedimentos correntes. Para os estudos sobre a prevalência de quitrideomicose em anfíbios, animais encontados em campo serão capturados e submetidos a coleta de material biológico com o uso de cotonetes (swabs), para análise por PCR para quitrídeo. A extração de DNA para a detecção de quitrídeos nas amostras de cotonete (swabs) seré feita pelos métodos correntes. Em coleções científicas, exemplares das espécies de interesse serão medidos e eventualmente terão suas gônadas e trato digestivo examinados. As informações geográficas obtidas na literatura e em coleções serão utilizadas para a confecção de mapas de distribuição. Serão descritas as mudanças em ecologia e morfologia ocorridas durante a história evolutiva de uma linhagem por meio de reconstrução dos estados de caracteres ecológicos em filogenias. A exploração dos fatores responsáveis pelas mudanças observadas será baseada na utilização de contrastes independentes. O risco de extinção será estimado por meio de fatores intrínsecos (vulnerabilidades) e extrínsecos (ameaças), e uma metodologia de pontuação. Com base nestes fatores, serão produzidos índices de vulnerabilidade (IV). A contribuição de cada fator para a vulnerabilidade à extinção será explorada por meio de Análise de Componentes Principais.

Os efeitos da degradação de ecossistemas sobre os organismos não são homogêneos entre diferentes grupos taxonômicos e nem entre espécies com diferentes requerimentos ecológicos. O tamanho da área de distribuição e a intensidade de troca de alelos entre as populações ou sub-populações são características que podem determinar em grande parte a vulnerabilidade à extinção. Estudos de campo detalhados sobre história natural e ecologia permitem inferir os efeitos da degradação de habitats sobre os diferentes organismos, de forma a propor medidas para sua conservação. Este projeto tem como objetivo realizar estudos sobre ecologia e evolução de anfíbios e répteis neotropicais, de forma a possibilitar e estimular sua conservação. Os objetivos específicos incluem: (1) elucidar a ecologia de populações ou taxocenoses focais de anfíbios e répteis; (2) explorar a história evolutiva de espécies focais de anfíbios e répteis; e (3) avaliar o estado de conservação de espécies de anfíbios e répteis.

Visita científica do Dr. Harry W. Greene ao Departamento de Ecologia do IB - USP, entre 16/12/2005 e 10/07/2006.

O objetivo principal do presente projeto é ampliar o conhecimento sobre a história natural e a ecologia de vertebrados brasileiros, abordando os seguintes objetivos centrais: A) compreender a estruturação (padrões ecológicos, de história natural, de utilização de recursos e de diversidade) de taxocenoses e comunidades de vertebrados brasileiros, incluindo avaliação da importância de fatores históricos e contemporâneos responsáveis por esta estruturação; e B) desvendar os fatores ecológicos que levam a variações atuais e aquelas que se fixaram ao longo da história evolutiva de diferentes espécies e linhagens de vertebrados. A integração entre os estudos com os diversos grupos será feita em torno de questões comuns relacionadas a estes objetivos centrais: 1. Quais são os padrões de história natural em taxocenoses e linhagens monofiléticas de vertebrados brasileiros? 2. Como são estruturadas as taxocenoses de vertebrados brasileiros em relação à diversidade e à utilização de recursos? 3. Como as comunidades de vertebrados brasileiros se organizam em torno de recursos alimentares? 4. Como variam os atributos ecológicos de vertebrados brasileiros que ocorrem em diferentes hábitats? 5. Como evoluíram determinados caracteres morfológicos e ecológicos em linhagens monofiléticas de vertebrados brasileiros? O projeto está dividido em três sub-projetos, que se integram e se complementam na abordagem dos objetivos e questões acima: (1) História Natural, Ecologia e Evolução de Vertebrados Terrestres; (2) Estruturação Trófica em Comunidades de Vertebrados Carnívoros; (3) História Natural e Ecologia de Peixes Litorâneos e Recifais. As informações serão obtidas em estudos de campo e laboratório. Os trabalhos de campo serão realizados em diversas localidades, em algumas delas com estudos de médio a longo prazo. Os trabalhos de laboratório visam principalmente a complementar as informações obtidas no campo.

Auxílio Publicação Regular - Artigo

Este projeto tem como objetivo caracterizar as comunidades de vertebrados em campos e campos cerrados da Estação Ecológica de Itirapina, que possui cerca de 2.500 ha de habitats relativamente bem preservados. Pretende-se, ainda, investigar a diversidade de alguns grupos de vertebrados em áreas alteradas ao redor da reserva (principalmente eucaliptais, pinheirais e pastos), de forma a avaliar os efeitos de alterações ambientais sobre a diversidade de vertebrados de campos e campos cerrados.

Os resultados obtidos permitirão: (1) a elaboração de vários trabalhos científicos descrevendo a diversidade, a estrutura das comunides e a história natural dos vertebrados da região; (2) a preparação de guias de identificação de campo e de outros materiais didáticos sobre a fauna de vertebrados; (3) a proposição de atividades de manejo que auxiliem na preservação da fauna de vertebrados de Cerrado da região; e (4) o treinamento de diversos alunos de graduação e pós-graduação em métodos padronizados para amostragem de diversidade de vertebrados.

É proposta a obtenção de informações básicas e detalhadas sobre a história natural das jararacas brasileiras (Bothrops spp., sensu lato) através de trabalhos de campo, em cativeiro e através de exame de animais preservados. Estudos de campo, em diversas regiões do país, enfocarão utilização do ambiente, hábitos alimentares, padrões de atividade, defesa e eventuais informações sobre reprodução; parte destes estudos será realizada através de rádio, rastreamento, que também fornecerá informações sobre área de vida e deslocamentos. Em cativeiro são propostos estudos especialmente sobre comportamento alimentar e defensivo. Informações adicionais sobre dieta, reprodução e forma do corpo serão obtidas através de exame de serpentes preservadas em coleções científicas ou obtidas durante este projeto. Com as informações acumuladas através dos trabalhos descritos acima, bem como através de levantamento bibliográfico incluindo as demais espécies de Bothrops (sensu lato), é proposta a criação de um banco de dados sobre história natural (incluindo imagens) de todas as espécies do gênero Bothrops (sensu lato). Como resultados deste acúmulo de informações, são propostas 1) a publicação de diversos estudos detalhados enfocando uma ou mais espécies estudadas; 2) a preparação de um livro científico sobre história natural de viperídeos brasileiros e 3) análises sobre a evolução de hábitos nesta linhagem através da utilização de filogenias disponíveis na literatura. Embora seja proposta a coordenação do projeto apenas pelo solicitante, para o desenvolvimento do mesmo, desde suas etapas iniciais de obtenção de dados até as etapas finais de análise e interpretação dos resultados, é proposta a colaboração com pesquisadores especialistas nas áreas abordadas e a participação de alunos de graduação e pós graduação. (AU)