Thaís Regina Boufleur.

O grupo GEFISMA atuará em extensão. O objetivo principal do grupo é levar conhecimento científico para a prática, através de treinamentos dos alunos envolvidos em diagnóstico e manejo de doenças, possibilitando a eles transmitir a informação para o público externo à ESALQ.Busca-se estabelecer parcerias com instituições de ensino técnico (como ETECs), ensino médio, cooperativas e associações de produtores (como COPLACANA e AFOCAPI), bem como empresas privadas para a troca de conhecimentos e a implementação de projetos de extensão em conjuntos, de tal forma que possamos difundir a informação ao público externo a ESALQ.Entre as metas, destacam-se difundir o incentivo das práticas sustentáveis que minimizem os impactos ambientais, a promoção do uso de sementes sadias e certificadas e o manejo adequado do solo, contribuindo para o aumento da produtividade e a redução de perdas causadas por patógenos.Para ampliar o alcance das ações, o grupo utilizará ferramentas de comunicação como mídias sociais (Instagram e LinkedIn), boletins técnicos e plataformas digitais, facilitando o acesso às informações para produtores, alunos e setor público e privado. Serão divulgados materiais técnicos com base nas informações estudadas e pesquisadas pelo grupo, com o objetivo de construir uma ponte sólida entre o conhecimento acadêmico e sua aplicação prática no campo.

O eucalipto (Eucalyptus spp.), pertencente a família Myrtaceae, é a espécie mais plantada para a produção de madeira, celulose e derivados. Austropuccinia psidii, agente causal da ferrugem das mirtáceas, é uma constante ameaça à produção de eucalipto e à biodiversidade de florestas nativas, figurando entre os dez fungos mais temidos da humanidade. Enquanto no Brasil as populações de A. psidii são estruturadas pelo hospedeiro, no resto do mundo há predominância de uma população pandêmica, patogênica a centenas de hospedeiros. A resistência genética e o controle químico são as estratégias mais utilizadas no controle da doença em cultivo comercial. Entretanto, o surgimento de novas políticas públicas na busca pela sustentabilidade dos agroecossistemas tem redirecionado a busca por novas estratégias no manejo de doenças de plantas. Reside no microbioma das plantas uma das ferramentas mais promissoras à longo prazo. Na busca por microbiomas com potencial de uso para o biocontrole, a co-evolução entre hospedeiro e microrganismos é uma grande aliada, e pode levar ao surgimento de ambientes supressivos da doença, devido a comunidades microbianas presentes no solo ou na filosfera. Assim, o presente projeto visa (i) modular a filosfera de clones de eucalipto, a partir de comunidades microbianas do campo, sob pressão de seleção de isolados distintos de A. psidii, para reduzir a severidade de ferrugem; (ii) caracterizar as mudanças na comunidade microbiana da filosfera desenvolvida em (i) ao longo do tempo; e (iii) verificar se existem semelhanças entre os microbiomas da filosfera identificados em (ii), na busca por um microbioma core. O desenvolvimento da filosfera supressiva e a análise das comunidades microbianas moduladas são fundamentais para explorar abordagens inovadoras e sustentáveis no controle da ferrugem das mirtáceas em eucalipto e em outras espécies.

Perdas de produção da soja devido a doenças podem impactar diretamente na segurança alimentar, por sua importância global e seus múltiplos usos na alimentação humana e animal. A antracnose é uma doença de etiologia complexa, causada por diversas espécies do gênero Colletotrichum, sendo C. truncatum e C. orchidearum os complexos mais representativos. Enquanto os estudos relacionados a C. truncatum avançaram durante os últimos anos, o entendimento da interação entre soja e espécies do complexo C. orchidearum (C. musicola, C. plurivorum e C. sojae) reveladas recentemente ainda é insipiente. Nossos dados indicam que as quatro espécies de Colletotrichum pertencem a duas linhagens distintas, que não compartilham genes candidatos a efetores identificados anteriormente (2017/09178-8), e que as duas linhagens patogênicas adquiriram a capacidade de infectar soja independentemente, enfatizando a importância da correta identificação das espécies presentes nos campos de soja para o manejo adequado da doença. Assim, esse projeto visa: (i) investigar se a evolução de C. truncatum foi direcionada pelo hospedeiro através de análises de genômica comparativa entre isolados de soja e pimenta, que podem revelar repertórios de genes relacionados à adaptação de fungos a hospedeiros distintos; (ii) identificar marcadores genéticos por estudos de associação genômica ampla (GWAS), que possam ser usados em programas de melhoramento da soja para resistência à antracnose; (iii) e realizar a caracterização molecular e patogênica de uma coleção de isolados de Colletotrichum a fim de esclarecer a diversidade de espécies associadas à antracnose no Brasil. A compreensão da evolução no patossistema irá contribuir para a identificação de genes relacionados à patogenicidade, de espécies de Colletotrichum associadas à doença e para a obtenção de cultivares de soja portando resistências de maior durabilidade à antracnose. (AU)

Não há dúvida de que as mudanças climáticas antropogênicas, cada vez mais evidentes nos dias atuais, têm impacto importante na emergência de doenças de plantas cultivadas, particularmente nas ferrugens. O século XXI vem testemunhando pandemias de ferrugens em diversos hospedeiros, como soja, videira, mirtáceas, dentre outros. Os patógenos invasivos causadores de ferrugens vêm sendo responsáveis por elevados prejuízos nas culturas em que incidem, inclusive em áreas anteriormente indenes. Embora vários trabalhos sinalizem que as mudanças climáticas serão responsáveis pelo aumento da incidência das ferrugens, poucos estudos dedicaram-se a avaliar o impacto dessas mudanças na severidade dessas doenças. Uma complexa rede de interações moleculares controlam as respostas de plantas submetidas a estresses bióticos e abióticos, envolvendo mudanças na expressão gênica, que se refletem em mudanças histológicas e fisiológicas da planta. Estudos recentes revelaram que a resposta das plantas a uma combinação de diferentes estresses é única, não podendo ser diretamente extrapolada a partir do estudo individualizado de cada um dos diferentes estresses aplicados isoladamente. Resultados preliminares obtidos por nosso grupo de pesquisa mostraram que estresses abióticos de intensidade moderada, aplicados em videiras, podem ocasionar significativo aumento na severidade da ferrugem causada por Phakopsora euvitis. Também observou-se que a ferrugem da framboeseira causa necrose extensiva no limbo foliar de plantas mantidas sob temperaturas elevadas. A principal hipótese deste projeto é que estresses abióticos, principalmente temperaturas moderadamente elevadas e limitações hídricas moderadas, por períodos superiores à latência, provocam aumentos de diferente magnitude na severidade de ferrugens adaptadas ao clima tropical e de ferrugens adaptadas ao clima temperado, sendo mais drástica nestas do que naquelas. Para testar essa hipótese e (i) aumentar a compreensão dos mecanismos que levam ao efeito sinergístico entre estresses abióticos e bióticos (nos níveis histológico, fisiológico e genético); (ii) quantificar as consequências epidemiológicas dos estresses abióticos no progresso das ferrugens; e (iii) propor medidas que minimizem a severidade dessas doenças num futuro cenário de mudança climática, propõe-se uma série de experimentos que utilizarão como modelos de ferrugens temperadas os patossistemas Phakopsora euvitis - videira e Pucciniastrum americanum - framboeseira e como modelos de ferrugens adaptadas aos trópicos, Phakopsora pachyrhizi - soja e Austropuccinia psidii - goiabeira.

Descrição: No Brasil, a antracnose era considerada uma doença de final de ciclo da soja. Entretanto, pesquisadores e produtores têm relatado ultimamente seu aparecimento desde as fases iniciais de implantação da cultura na região Centro-Oeste, indicando que o programa de controle químico não tem sido eficiente contra antracnose da soja. A incidência e as perdas devido à doença na soja têm sido negligenciadas, porém seu impacto pode ameaçar a produção do grão, uma vez que a região é responsável por 53% da produção nacional. Para compreender a associação de espécies patogênicas de Colletotrichum à antracnose da soja, este projeto visa: a) esclarecer a direção da transmissão de C. cliviae e C. truncatum entre sementes e plantas de soja; b) desenvolver um ensaio LAMP para a detecção de C. cliviae em soja; c) testar a sensibilidade in vitro de C. cliviae a fungicidas; d) estudar a histologia da infecção e colonização de soja por linhagens de C. cliviae e C. truncatum; e) identificar genes diferencialmente expressos por RNA-seq na interação C. truncatum-soja, em diferentes estágios de desenvolvimento da planta e graus de patogenicidade do fungo; f) acessar a estrutura genética e inferir o modo reprodutivo de populações de C. truncatum na soja usando marcadores SSRs e SNPs; g) sequenciar o genoma completo de um isolado e ressequenciar o genoma de 18 isolados de C. truncatum patogênicos à soja, testando se a variação genômica pode ser correlacionada aos genótipos do hospedeiro ou à localização geográfica de amostragem desses isolados. Conhecendo a direção da transmissão dos patógenos na soja, pode-se indicar se seria recomendado o tratamento das sementes com os fungicidas avaliados. Um teste rápido por LAMP poderia diagnosticar a presença de C. cliviae em sementes e plantas assintomáticas, prevenindo a entrada do patógeno na área de cultivo da soja. Estudos histológicos da infecção de soja por C. cliviae e C. truncatum podem auxiliar a compreender a estratégia de colonização celular recrutada por cada espécie, em cada fase do seu ciclo de vida. A identificação de genes diferencialmente expressos por isolados de C. truncatum com graus de patogenicidade distintos pode indicar quais vias bioquímicas são recrutadas em cada estágio de crescimento da planta hospedeira. A abordagem genômica pode revelar o que faz de C. truncatum um patógeno tão bem sucedido, e indicar genes candidatos envolvidos na patogenicidade, especialização do hospedeiro e resistência a fungicidas, com implicações diretas na capacidade adaptativa do patógeno ao ambiente e, consequentemente, na eficácia e durabiblidade das estratégias de controle da antracnose na soja. Baseado nos eficientes mecanismos de disseminação de C. truncatum a longas distâncias e nos níveis de recombinação previamente relatados, serão testadas as hipóteses de que populações de C. truncatum não são diferenciadas entre os campos de soja, de que o patógeno exibe estrutura genética recombinante e de que a distribuição geográfica atual de C. truncatum reflete a expansão histórica da cultura da soja no Brasil, a partir do Sul em direção às regiões Centro-Oeste e Norte. Um claro entendimento dos fatores responsáveis pela infecção e colonização de C. cliviae e C. truncatum em soja é essencial para desenvolver medidas de controle a longo prazo, visando o manejo da antracnose.