Simone Raposo Cotta.
Livre · Departamento de Genética
- Departamento
- Departamento de Genética
Currículo atualizado em 05/12/2025
Cita-se como: COTTA, S. R.;Cotta, Simone Raposo;COTTA, SIMONE R.;SIMONE, RAPOSO COTTA;RAPOSO COTTA, SIMONE
Resumo biográfico
Professora Doutora da Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz (ESALQ/USP) e Pesquisadora Associada do "Center for Carbon Research in Tropical Agriculture (CCarbon/USP)". Membro do Programa de Pós-Graduação em Microbiologia Agrícola e do Programa de Pós-Graduação em Solos e Nutrição de Plantas, ambos pela ESALQ/USP. Possui experiência na área de microbiologia do solo, ecologia microbiana e ecogenômica.
Indicadores
Áreas de atuação
01 registro- Ciencias BiologicasMicrobiologiaMicrobiologia Aplicada
Formação acadêmica
07 registros- 2019 – 2023Pós-DoutoradoConcluídoPós-Doutorado · Centro de Energia Nuclear na Agricultura - Universidade de São PauloBolsa Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo
- 2015 – 2016Pós-DoutoradoConcluídoPós-Doutorado · University of Groningen
- 2014 – 2018Pós-DoutoradoConcluídoPós-Doutorado · Universidade de São PauloBolsa Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior
- 2013 – 2014Pós-DoutoradoConcluídoPós-Doutorado · Universidade de São PauloBolsa Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico
- 2009 – 2013DoutoradoConcluídoCiências (Microbiologia) · Universidade Federal do Rio de Janeiro“Análise do impacto do cultivo de milho (Zea mays) geneticamente modificado sobre as comunidades microbianas em solos brasileiros”Orientação: Lucy SeldinBolsa Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior
- 2007 – 2009MestradoConcluídoCiências (Microbiologia) · Universidade Federal do Rio de Janeiro“Caracterização das substâncias antimicrobianas ativas contra fungos dermatófitos e identificação das estirpes produtoras”Orientação: Lucy SeldinBolsa Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico
- 2003 – 2006GraduaçãoConcluídoCiencias Biológicas Microbiologia e Imunologia · Universidade Federal do Rio de JaneiroOrientação: Lucy Seldin
Idiomas
02 registros| Idioma | Leitura | Fala | Escrita | Compreensão |
|---|---|---|---|---|
| Inglês | Bem | Razoável | Bem | Bem |
| Alemão | Razoável | Razoável | Razoável | Razoável |
Atuação profissional
09 registros- 2025 – presenteVínculo atualFundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São PauloRevisor de projeto de fomento
- 2024 – presenteVínculo atualDedicação exclusivaEscola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz/ USPProfessor (a) Doutor (a)Celetista40h/sem
- 2021 – presenteVínculo atualFrontiers in Soil ScienceMembro de corpo editorial
- 2019 – 2023Centro de Energia Nuclear na Agricultura - Universidade de São PauloPós doutorandaBolsista
- 2013 – 2018Dedicação exclusivaEscola Superior de Agricultura Luiz de QueirozPós doutorandaPós doutorado
- 2009 – 2013Dedicação exclusivaUniversidade Federal do Rio de JaneiroEstudante de DoutoradoEstudante40h/sem
- 2007 – 2009Dedicação exclusivaUniversidade Federal do Rio de Janeiroestudante de mestrado40h/sem
- 2005 – 2006Universidade Federal do Rio de JaneiroEstagiário de Iniciação CientíficaEstagiário de In. Científica20h/sem
- 2003 – 2005Dedicação exclusivaUniversidade Federal do Rio de JaneiroEstagiária de Iniciação CientíficaEstagiário de In. Científica20h/sem
Produção bibliográfica
77 registros- 2022The role of Cyanobacteria in ameliorating stress conditions for bacterial community in Brazilian soda lakesSimone Raposo Cotta; PELLEGRINETTI, THIERRY A.; Marli de Fátima Fiore · 17o International Symposium on Phototrophic Prokaryote · Liverpool
- 2017Mobilome of mangrove sedimentsSimone Raposo Cotta; Armando Cavalcante Franco Dias; Fernando Dini Andreote; Jan Dirk van Elsas · 29 Congresso Brasileiro de Microbiologia · Foz do Iguaçu
- 2017Influence of microbial diversity on phosphorus availabilityYasmin Florentino Rodriguez; Julia Capozzi Franke; Armando Cavalcante Franco Dias; FERNANDO, DINI ANDREOTE; Simone Raposo Cotta · 29 Congresso Brasileiro de Microbiologia · Foz do Iguaçu
- 2014The Role of Genetics Mobile Elements in the Adaptation to Life in Mangrove SoilsSimone Raposo Cotta; Armando Cavalcante Franco Dias; filipe rafael salveti nunes; Andreote, F. D. · XIV Encontro Nacional de Microbiologia Ambiental · João Pessoa
- 2014The Selection of Burkholderia and Pseudomonas in the Sugarcane Rhizospherelucas dantas lopes; Danielle Gonçalves dos Santos; Pedro A M Andrade; Simone Raposo Cotta; Andreote, F. D. · XIV Encontro Nacional de Microbiologia Ambiental · João Pessoa
- 2014Isolamento de Grupos Microbianos da Rizosfera de Cana-de-açúcar e suas inter-relaçõesDanielle Gonçalves dos Santos; Simone Raposo Cotta; lucas dantas lopes; Andreote, F. D. · XIV Encontro Nacional de Microbiologia Ambiental · João Pessoa
- 2014Meta-Omics of Microbial Genes Linked to Nitrogen and Sulfur Cycles in Mangrove SoilsLuana Lira Cadete; Julia Lima E Perin; Simone Raposo Cotta; Andreote, F. D.; Armando Cavalcante Franco Dias · XIV Encontro Nacional de Microbiologia Ambiental · João Pessoa
- 2014Towards the Role of Mobile Elements in the Adaptation to Life in Mangrove SoilSimone Raposo Cotta; Armando Cavalcante Franco Dias; Fernando Dini Andreote · 15th International Symposium on Microbial Ecology · Seoul
- 2013Assessment of the effect of genetic modified (GM) Maize cultivation on ammonia-oxidazing bacterial and archaeal communitiesSimone Raposo Cotta; Dias, A. C. F.; Ivanildo Evódio Marriel; Fernando Dini Andreote; Lucy Seldin; Jan Dirk van Elsas · 12th Symposium on Bacterial Genetics and Ecology · Ljubliana - Eslovênia
- 2013Validação de Iniciadores Específicos para o Estudo das Comunidades Microbianas Disponibilizadora de Fósforo no SoloSimone Raposo Cotta; Dias, A. C. F.; Andreote, F. D.; Lucy Seldin; Jan Dirk van Elsas · 27 CBM - Congresso Brasileiro de Microbiologia · Natal
- 2013Análise Molecular da Comunidade Microbiana Presente na Raiz de Milho Geneticamente Modificado e sua Respectiva Linhagem Isogênica não TransgênicaDebora Alves F Silva; Simone Raposo Cotta; Ivanildo Evódio Marriel; Joana M Marques; Jurelevicius, Diogo; Lucy Seldin · 27 CBM - Congresso Brasileiro de Microbiologia · Natal
- 2012Temporal dynamycs of microbial communities in the rhizosphere of two genetically modified (GM) maize hybrids in tropical agrosystemsSimone Raposo Cotta; Armando Cavalcante Franco Dias; Ivanildo Evódio Marriel; Eliane Aparecida Gomes; Jan Dirk van Elsas; Seldin, Lucy · 14th. International Symposium on Microbial ecology · Copenhagem
- 2012Avaliação do possível impacto de milho geneticamente modificado na ciclagem do nitrogênio em solo de CerradoSimone Raposo Cotta; Armando Cavalcante Franco Dias; Ivanildo Evódio Marriel; Eliane Aparecida Gomes; Jan Dirk van Elsas; Seldin, Lucy · FertBio · Maceió
- 2012Diversidade de Bactérias Totais e Fixadoras de Nitrogênio em Sedimentos de ManguezaisArmando Cavalcante Franco Dias; Simone Raposo Cotta; Michele de Cássia Pereira e Silva; Fábio Lino Soares Júnior; João Lúcio Azevedo; Itamar Melo +2 autores · FertBio · Maceió
- 2010Diversidade da comunidade bacteriana presente na rizosfera de milho transgênico e na sua respectiva linhagem isogênica não transgênicaSimone Raposo Cotta; Ivanildo Evódio Marriel; Eliane Aparecida Gomes; Lucy Seldin · XX Congreso Latinoamericano de Microbiología · Montevideo
- 2010Bactérias solubilizadoras de fosfato da rizosfera de milho transgênico e de sua linhagem isogênica não transgênicaCarlos Eduardo Sousa; Simone Raposo Cotta; Ivanildo Evódio Marriel; Eliane Aparecida Gomes; Lucy Seldin · Jornada de Iniciação Científica da UFRJ · Rio de Janeiro
- 2010Análise da comunidade bacteriana endofítica de dois genótipos de milho geneticamente modificados( Guardian e Herculex) e sua respectiva linhagem isogênica não transgênica plantados em solo de cerradoCarlos Eduardo Sousa; Simone Raposo Cotta; Ivanildo Evódio Marriel; Eliane Aparecida Gomes; Lucy Seldin · XVI Semana de Microbiologia e Imunologia · Rio de Janeiro
- 2009PRODUÇÃO DE SUBSTÂNCIAS ANTIMICROBIANAS ATIVAS CONTRA O FUNGO DERMATÓFITO TRICOPHYTON RUBRUM PELA ESPÉCIE PAENIBACILLUS KRIBBENSISSimone Raposo Cotta; Gleiser Tupinambá; Daniela Sales Alviano; Celuta Sales Alviano; Lucy Seldin · 25o. Congresso Brasileiro de Microbiologia · Porto de Galinhas
- 2008Produção de substância antimicrobianas ativas contra fungos dermatófios pela estirpe POC115 de Paenbacillus kribbensisSimone Raposo Cotta; Gleiser Tupinambá; Daniela Sales Alviano; Celuta Sales Alviano; Lucy Seldin · XI Encontro Nacional de Microbiologia Ambiental · Fortaleza
- 2007Production fo antimicrobial substance by Paenibacillus strains against dermatophytes fungiSimone Raposo Cotta; Fabio Faria da Mota; Daniela Sales Alviano; Celuta Sales Alviano; Lucy Seldin · XXXVI Annual Meeting/ Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular-SBBq · Salvador
- 2007Identificação de estirpes de Paenibacillus produtoras de substânias antimicrobianas ativas contra fungos dermatófitosSimone Raposo Cotta; Fabio Faria da Mota; Gleiser Tupinambá; Daniela Sales Alviano; Celuta Sales Alviano; Lucy Seldin · XXIV Congresso Brasileiro de Microbiologia · Brasília
- 2007Identificação de estirpes produtoras de substâncias antimicrobianas(SAM) ativas contra fungos dermatófitos e caracterização parcial dessas SAMSimone Raposo Cotta; Fabio Faria da Mota; Gleiser Tupinambá; Daniela Sales Alviano; Celuta Sales Alviano; Lucy Seldin · I Semana de Pós-Graduação do Instituto de Bioquímica Médica · Rio de Janeiro
- 2006Produção de substâncias ativas contra fungos dermatófitos por estirpes pertencentes ao gênero PaenibacillusSimone Raposo Cotta; Fabio Faria da Mota; Daniela Sales Alviano; Celuta Sales Alviano; Lucy Seldin · XXVIII Jornada Giulio Massarani de Iniciação Científica, Artística e Cultural da UFRJ · Rio de Janeiro
- 2005Produção de substâncias antimicrobianas por estirpes pertencentes ao gênero Paenibacillus com atividade contra fungos dermatófitosSimone Raposo Cotta; Fabio Faria da Mota; Daniela Sales Alviano; Celuta Sales Alviano; Lucy Seldin · XXVII Jornada Giulio Massarani de Iniciação Científica, Artística e Cultural da UFRJ · Rio de Janeiro
- 2005Atividade imunomodulatória da warifteina purificada do extrato da Cissampelos sympodialis EICH (Menispermaceae) sobre linfócitos B in vitro e in vivoJuliana Dutra Barbosa da Rocha; Debora Decote Ricardo Lima; Simone Raposo Cotta; Luciana Barros de Arruda Hinds; Marcia R. Piuvezam; Ligia Maria Torres Peçanha · XXVII Jornada Giulio Massarani de Iniciação Científica, Artística e Cultural da UFRJ · Rio de Janeiro
Produção técnica
08 registros- 2023Climate change and the dynamics of saline-alkaline lakes in the Brazilian Pantanal.Simone Raposo CottaConferencia
- 2023Mudanças Climáticas e a Dinâmica das Lagoas Salino-alcalinas no Pantanal BrasileiroSimone Raposo CottaConferencia
- 2021Disentangling the bacterial metabolic-interactions on Brazilian soda lakesSimone Raposo CottaConferencia
- 2020PlasmidomaSimone Raposo CottaComunicacao
- 2015A rizosfera como consequência da mudança no uso do soloSimone Raposo CottaConferencia
Projetos
08 registrosProjetos de pesquisa e de desenvolvimento tecnológico registrados no Currículo Lattes.
- Em andamento2025 – presentePesquisa
Enriquecimento de auxotróficos na rizosfera: Desvendando as respostas bacterianas aos exsudados das plantas em condições de estresse nutricional
As plantas influenciam a comunidade bacteriana no solo rizosférico ao liberarem compostos como aminoácidos, que atuam como nutrientes ou moléculas sinalizadoras. Isso pode favorecer a seleção de bactérias auxotróficas, que não conseguem sintetizar esses compostos por conta própria. Propomos que esses auxotróficos sejam enriquecidos na rizosfera devido à disponibilidade de aminoácidos e que esses organismos possam auxiliar as plantas a superar o estresse nutricional. Para testar essas hipóteses, empregaremos uma abordagem polifásica que combina metodologias dependentes e independentes de cultivo para avaliar a comunidade bacteriana, analisar seus perfis auxotróficos e examinar as consequências da presença desses organismos tanto em condições padrão quanto de deficiência nutricional. O fósforo será usado como o nutriente modelo. Além disso, analisaremos os metabólitos produzidos pelas plantas, como aminoácidos e vitaminas, para entender seu papel na estruturação e organização das comunidades bacterianas. Esses experimentos visam elucidar a prevalência de bactérias auxotróficas na rizosfera e seu impacto na resiliência e resistência das plantas sob estresse nutricional.As plantas influenciam a comunidade bacteriana no solo rizosférico ao liberarem compostos como aminoácidos, que atuam como nutrientes ou moléculas sinalizadoras. Isso pode favorecer a seleção de bactérias auxotróficas, que não conseguem sintetizar esses compostos por conta própria. Propomos que esses auxotróficos sejam enriquecidos na rizosfera devido à disponibilidade de aminoácidos e que esses organismos possam auxiliar as plantas a superar o estresse nutricional. Para testar essas hipóteses, empregaremos uma abordagem polifásica que combina metodologias dependentes e independentes de cultivo para avaliar a comunidade bacteriana, analisar seus perfis auxotróficos e examinar as consequências da presença desses organismos tanto em condições padrão quanto de deficiência nutricional. O fósforo será usado como o nutriente modelo. Além disso, analisaremos os metabólitos produzidos pelas plantas, como aminoácidos e vitaminas, para entender seu papel na estruturação e organização das comunidades bacterianas. Esses experimentos visam elucidar a prevalência de bactérias auxotróficas na rizosfera e seu impacto na resiliência e resistência das plantas sob estresse nutricional.Resumo em Inglês
Financiadores- Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo · AUXILIO_FINANCEIRO
EquipeSimone Raposo Cotta (Responsável), Andreote, F. D., PELLEGRINETTI, THIERRY A., Noah Fierer, Elisa Korenblum
- Em andamento2025 – presentePesquisa
Mecanismos dos sistemas de cultivo diversificados na redução das emissões de gases de efeito estufa por meio de alterações nas comunidades microbiana
O presente projeto tem como objetivo abordar o desafio de reduzir as emissões de gases de efeito estufa (GEE) em sistemas agrícolas, particularmente na China e no Brasil, que são contribuintes significativos para as emissões globais. O estudo foca em sistemas de plantio diversificados, especificamente em sistemas integrados de grãos e plantas de cobertura, que têm o potencial de aumentar o sequestro de carbono no solo e mitigar as emissões de NO. No entanto, os mecanismos que governam essas reduções, especialmente aqueles relacionados aos exsudatos radiculares e suas interações com microrganismos do solo, permanecem pouco compreendidos. Para abordar essa lacuna do conhecimento, o projeto investigará os efeitos de diferentes sistemas de plantio diversificados nas emissões de GEE, com foco nos tipos e funções dos metabolitos radiculares presente no solo desses agroecossistemas. A pesquisa explorará como os metabolitos influenciam os microrganismos envolvidos no ciclo do nitrogênio e os genes funcionais relacionados, impactando assim as emissões de NO. Estudos de campo serão realizados tanto na China quanto no Brasil, comparando as emissões de GEE e as comunidades microbianas do solo em diversos sistemas de cultivo, incluindo aqueles que utilizam plantas de cobertura. Ao integrar análises metabolômicas, microbiológicas, metagenômicas e o uso de isótopos, este estudo visa elucidar as complexas interações entre exsudatos radiculares das plantas e microrganismos do solo. Os resultados fornecerão uma base científica para otimizar os sistemas de plantio diversificados a fim de promover a mitigação das emissões de GEE, oferecendo estratégias adaptáveis regionalmente para uma agricultura sustentável. A colaboração eficaz em pesquisas pode fortalecer as redes diversificadas de monitoramento de plantio, aprofundar a cooperação de longo prazo entre as equipes e impulsionar o desenvolvimento conjunto de uma agricultura inteligente, sustentável e de baixo carbono na China e no Brasil.
EquipeSimone Raposo Cotta (Responsável), Maurício Roberto Cherubin, Lucas Pecci Canisares, Yangquanwei Zhong, Zhouping Shangguan, Weiming Yan
- Em andamento2023 – presentePesquisa
TRANSPLANTE DE MICROBIOMA DA RIZOSFERA DE FEIJÃO PARA INDUÇÃO DE RESISTÊNCIA À SECA
O estresse hídrico é considerado o maior problema da produção agrícola mundial, uma vez que asprincipais regiões de agricultura do mundo são afetadas pela seca, impactando negativamente aeconomia e a sociedade. O melhoramento genético de culturas para a tolerância à seca tem recebido muita atenção nos últimos anos e novas pesquisas têm fornecido informações sobre a capacidade de microrganismos específicos do solo influenciar a tolerância ao estresse hídrico nas plantas. Nesse contexto, entendemos que verificar se a microbiota de plantas resistentes à seca pode induzir a resistência de plantas suscetíveis é de extrema importância para o futuro sustentável da agricultura perante as mudanças climáticas. A justificativa desse trabalho é fundamentada na necessidade do estudo e desenvolvimento de estratégias utilizando o microbioma das plantas resistentes à seca como promotoras da resistência de plantas suscetíveis. Assim, hipotetizamos que o microbioma da rizosfera de feijão tolerante à seca induz tolerância em cultivares de feijão suscetíveis, por meio do transplante de solo. O objetivo geral do projeto é estabelecer o efeito da casualidade experimental, buscando verificar se a modulação do microbioma é capaz de impactar o fenótipo da planta hospedeira. Para o enriquecimento do microbioma do solo, serão utilizados cultivares de feijão tolerante que serão cultivados por 3 gerações até o florescimento. Esse solo será então coletado e utilizado em experimento de casa de vegetação utilizando os cultivares suscetíveis. Os vasos serão dispostos em delineamento inteiramente casualizado, com 5 repetições de cada tratamento, sendo 2 genótipos de feijão suscetíveis à seca, um tratamento controle sem planta, 2 regimes hídricos (<40 e >80 da capacidade de campo, sendo seca e irrigação normal, respectivamente) e 4 concentrações de solo enriquecido (0, 10, 50 e 100) que serão adicionados a um solo não enriquecido para o cultivo dos genótipos suscetíveis [(2 genótipos + 1 Bulk) X 2 regimes hídricos X 4 concentrações de solos enriquecido X 5 repetições]. Nas plantas serão avaliados as trocas gasosas, expressão gênica e características nutricionais e produtivas. O microbioma da rizosfera será caracterizado por meio do sequenciamento de amplicon de Bacteria e Archaea (16S rRNA) e fungos (ITS) e através do sequenciamento metagenômico. Espera-se com esse projeto obter dados e informações que aumentem nosso conhecimento sobre o papel da microbiota da rizosfera no auxílio da mitigação dos efeitos do estresse hídrico em plantas, fornecendo subsídios para o desenvolvimento de técnicas para um uso mais sustentável do ecossistema.
EquipeSimone Raposo Cotta, FRANCISCO DINI-ANDREOTE, Lucas William Mendes (Responsável), PELLEGRINETTI, THIERRY A., TSAI, SIU MUI, Dennis Goss-Souza, Victor José Carrión
- Concluído2019 – 2023Pesquisa
Biogeografia de comunidades microbianas em lagoas salino- alcalinas do Pantanal brasileiro
Estudos na área de biogeografia microbiana tem como principal objetivo buscar aexistência de padrões nas comunidades desses organismos. Tais estudos sãoparticularmente recentes e importantes em ambientes extremos onde a biodiversidademicrobiana é pouco explorada e incomum. O Pantanal brasileiro é uma das planíciesde inundação mais extensas do mundo e possui em seu sistema hidrológico lagoassalino-alcalinas (salinas) que são consideradas ambientes extremos devido aoselevados valores de pH e altas concentrações de sal, selecionando organismosadaptados a sobreviver nesse meio. Estudos sobre a diversidade nessas salinas sãoescassos e sobre biogeografia microbiana do Pantanal brasileiro inexistem. Portanto, oobjetivo deste estudo é identificar e mapear a diversidade microbiana, taxonômica efuncional, em salinas do Pantanal, avaliando a influência, ao longo do tempo, dasvariáveis químicas e eventos históricos na composição dessas comunidades. Serãocoletadas amostras de água de diversasa salinas durante as estações de cheia(maio) e seca (setembro). Análises físico-químicas de pH, condutividade elétrica,turbidez da água, temperatura, oxigênio dissolvido, macro e micronutrientes serãorealizadas em cada coleta para obtenção dos dados de variáveis ambientais. O DNA das amostras serão extraídos e sequenciados para a realização do metagenoma. Análises de PCR quantitativo em tempo real dos genes rRNA 16S e18S, estudados como marcadores filogenéticos, serão realizadas com o objetivo dequantificar micro-organismos dos domínios Archaea e Bacteria. A partir dosdados obtidos pelo sequenciamento metagenômico, será feita a caracterização dopotencial metabólico das salinas. Ainda, serão estudados ospadrões biogeográficos que determinam a estrutura das comunidades microbianas dassalinas do Pantanal permitindo uma melhor compreensão da funcionalidade dessesecossistemas e a percepção de quais variáveis estão influenciando diretamente nadiversidade microbiana desses ambientes extremos brasileiros.
EquipeSimone Raposo Cotta, Marli F Fiore (Responsável), PELLEGRINETTI, THIERRY A.
- Concluído2018 – 2022Pesquisa
O uso de comunidades microbianas sintéticas (SynCom) na melhoria da eficiência da fertilização fosfatada de plantas
EquipeSimone Raposo Cotta (Responsável), Lucy Seldin, Fernando Dini Andreote, Victor Satler Pylro
- Concluído2017 – 2023Pesquisa
MUDANÇAS CLIMÁTICAS E IMPACTOS AMBIENTAIS EM ÁREAS ALAGADAS (WETLANDS) DO PANTANAL (BRASIL): QUANTIFICAÇÃO, FATORES DE CONTROLE E PREVISÃO EM LONGO PRAZO
As áreas alagadas (wetlands) têm papel fundamental no controle de fatores que podeminfluenciar ou serem influenciados por mudanças climáticas e ambientais O projeto apresentadoserá desenvolvido na Nhecolândia (MS), região caracterizada por um sistema de lagoas cujaságuas variam de doce a hipersalina. Trata-se de uma pesquisa multi e interdisciplinar cujodesafio científico é elucidar o funcionamento geoquímico e biogeoquímico dessa região,transferir os conhecimentos adquiridos para a elaboração de balanços regionais dos fluxos degases de efeito estufa (GEE), e compreender os processos de disponibilização do arsênio (As)para as águas, considerando a influência de fatores ambientais, em particular, das mudançasclimáticas. O projeto está estruturado em quatro ações cujos objetivos específicos são : (i)identificar os processos que controlam os funcionamentos biogeoquímicos das lagoas e avaliarsuas consequências nos ciclos do C e do N, nas emissões de GEE e na distribuição e especiaçãodo As na paisagem ; (ii) verificar a evolução dos solos ao redor das lagoas, para compreendero funcionamento do sistema solo-água; (iii) desenvolver um modelo numérico dofuncionamento hidrológico e hidroquímico das lagoas, para predizer a evolução do sistema faceaos estresses ambientais ; (iv) verificar o potencial de utilização dos dados de sensoriamentoremoto para identificar feições espectrais e topográficas que permitam associar as variáveis quepoderiam estar relacionadas as emissões de GEE e sua extrapolação para a escala regional. Osresultados obtidos poderão fornecer subsídios científicos para elaboração de políticas públicaspara o gerenciamento sustentável do Pantanal.
EquipeSimone Raposo Cotta, Marli F Fiore, Plínio Barbosa de Camargo, Hugo Sarmento, Ary Tavares Resende-Filho, Adolpho José Melphi (Responsável), PELLEGRINETTI, THIERRY A., MONTES, CELIA R. +1 integrantes
- Concluído2014 – 2017Pesquisa
PLASMIDOMA DE SOLOS DE MANGUEZAIS
Os manguezais são áreas localizadas nas planícies de inundação das marés, compondo um dos ambientes naturais mais degradados no Brasil. O uso de metodologias que acessam a estrutura e o funcionamento dos grupos microbianos nos manguezais, bem como a descrição dos plasmídeos que hospedam genes relacionados a importantes transformações neste sistema, é importante no avanço do conhecimento sobre este ambiente diverso, encontrado apenas em regiões tropicais e subtropicais de nosso planeta. Este projeto tem como objetivo compreender os mecanismos adaptativos das comunidades microbianas presentes nos solos de manguezais por meio da descrição da composição dos plasmídeos desse sistema. Essas adaptações são vitais para a manutenção e para o funcionamento do sistema.
EquipeSimone Raposo Cotta, Armando Cavalcante Franco Dias (Responsável), Michele de Cássia Pereira e Silva, ANDREOTE, FERNANDO DINI
- Concluído2013 – 2016Pesquisa
Ecologia das comunidades microbianas que disponibilizam fósforo na rizosfera de cana de açúcar
O fósforo é um dos elementos químicos mais importantes da natureza, sendo essencial para a manutenção da vida, atuando como componente de moléculas energéticas e de estruturais vitais como DNA e o RNA. É um dos nutrientes que mais limitam o crescimento vegetal, pois sua disponibilidade na natureza é bastante reduzida devido ao elevado poder reativo dos íons fosfatos, que quando presentes na solução dos solos, rapidamente se ligam a íons metálicos e as cargas do solo, tornando-se indisponível. Mesmo solos considerados férteis podem apresentar deficiência deste nutriente. Deficiências nos níveis de fósforo podem levar a danos no crescimento vegetal com comprometimento no desenvolvimento de raízes e partes aéreas. Atualmente, a correção dessa deficiência é realizada através da utilização de fertilizantes químicos, sendo essa medida essencial para culturas que possuem uma elevada demanda nutricional, como no caso da cultura de cana-de-açúcar. A utilização maciça de fertilizantes na agricultura vem causando danos irreversíveis à natureza, poluindo aquíferos e lençóis freáticos, e gerando preocupação por se tratar de uma fonte não renovável e finita de fertilidade. Além disso, este uso excessivo diminui a capacidade nutritiva de grande parte dos solos, visto que muitos dos fertilizantes utilizados se acumulam nas partículas de solo, fazendo com que devam ser aplicadas altas doses de fertilizantes para obter o efeito desejado. Uma alternativa que tem sido proposta é o uso de rochas fosfatadas associadas a micro-organismos. Esse uso combinado se deve ao fato de que muitos micro-organismos possuem a capacidade de disponibilizar o fósforo para o consumo das plantas a partir de desta fonte. Apesar da sua importância indiscutível, os processos envolvidos na disponibilização do fósforo, a ecologia das comunidades microbianas envolvidas e os fatores limitantes e essenciais para a renovação do mesmo no ambiente ainda são pouco conhecidos. O desconhecimento desses processos dificulta a aplicação dessas metodologias, além de se não obter o aproveitamento máximo deste recurso. O principal objetivo deste projeto é avaliar a estrutura e a diversidade das comunidades microbianas associadas à rizosfera de cana-de-açúcar e sua participação nos processos de solubilização e mineralização de distintas fontes de fósforo no solo
EquipeSimone Raposo Cotta, Seldin, Lucy, ANDREOTE, FERNANDO DINI (Responsável)
Orientações
- Mestrado
desde 2025Mateus Belarmino da Silva · OrientaçãoCaracterização dos vírus de solos de manguezais e seu impacto no ciclo biogeoquímico do carbono · Solos Nutrição e Plantas · Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz · Bolsa Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível SuperiorEm andamento - Mestrado
desde 2025Caio Simões dos Santos Nicolau · OrientaçãoMecanismos dos sistemas de cultivo diversificados na redução das emissões de gases de efeito estufa por meio de mudanças nas comunidades microbianas · Solos e Nutrição em Plantas · Escola Superior de Agricultura "Luiz de Queiroz" · Bolsa Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível SuperiorEm andamento - Doutorado
desde 2025Laura Camila Cardona Austudillo · OrientaçãoSucessão microbiana em crostas biológicas e seu impacto no sequestro de carbono em solos da Caatinga · Microbiologia Agrícola · Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz/ USP · Bolsa Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível SuperiorEm andamento - Iniciação Científica
desde 2025Gabriel de Castro Theodoro · OrientaçãoDetecção de bactérias auxotróficas na rizosfera de milho · Escola Superior de Agricultura "Luiz de Queiroz"Em andamento - Mestrado
desde 2024Dúber Alejandro Mora Motta · OrientaçãoDirect and indirect roles of auxotrophic organisms in plant development under nutritional deficiency · Programa de Pós Graduação em Microbiologia Agrícola · Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz/ USP · Bolsa Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível SuperiorEm andamento - Mestrado
desde 2024Rafael Ferreira Silva · OrientaçãoDesenvolvimento de comunidade bacteriana sintética (SynCom) para disponibilização de fósforo no solo · Programa de Pós Graduação em Microbiologia Agrícola · Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz/ USP · Bolsa Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível SuperiorEm andamento
Bancas julgadoras
46 registros- 2023XIV Simpósio Científico dos Pós Graduandos no Cena· Centro de Energia Nuclear na Agricultura - Universidade de São PauloBanca: Simone Raposo CottaOutra
- 2023V Simpósio de Microbiologia Agrícola: Aplicações e perspectivas para a agricultura do futuro· Escola Superior de Agricultura "Luiz de Queiroz"Banca: Simone Raposo CottaOutra
- 2022Kelly Jaqueline AlvesEfeito dos pesticidas na comunidade microbiana em solos com diferentes diversidades e na rizosfera da soja · Microbiologia Agrícola · Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz/ USPBanca: Simone Raposo Cotta, Fernando Dini Andreote, PELLIZARI, VIVIAN HELENA, DE OLIVEIRA, VALERIA MAIADoutorado
- 202213o. Simpósio dos Pós-Graduandos no CENA: Sustentabilidade da Agricultura e Meio Ambiente· Centro de Energia Nuclear na Agricultura - Universidade de São PauloBanca: Simone Raposo CottaOutra
- 202230o. SIICUSP - Simpósio Internacional de Iniciação Científica e Tecnológica da Universidade de São Paulo· Universidade de São PauloBanca: Simone Raposo CottaOutra
- 2020Shilton Reino CavalcanteIdentificação da microbiota cecal de duas linhagens de galinha caipira e associação com consumo alimentar residual · Ciência Animal e Pastagens · Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz/ USPBanca: Luiz Lehmann Coutinho, Polyana Cristine Tizioto, Simone Raposo CottaMestrado
- 2020Fernanda de Almeida GodoyIdentificação de bactérias promotoras de crescimento de trigo e seu impacto na comunidade bacteriana da rizosfera · Microbiologia Agrícola · Escola Superior de Agricultura Luiz de QueirozBanca: Rodrigo Mendes, Itamar Melo, Rodrigo G Taketani, Simone Raposo CottaMestrado
- 2020Laura BononiBioprospecção de Trichoderma spp. envolvidas na solubilização de fosfato e controle biológico de Sclerotinia scleotiorium em soja · Microbiologia Agrícola · Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz/ USPBanca: Itamar Melo, Gileno Vieira Lacerda Júnior, Marli de Fátima Fiore, Simone Raposo CottaDoutorado
- 2020Luis Fernando MerlotiDinâmica de oxidantes de amônio em solos de Mata Atlântica: impacto da conversão floresta-pastagem e da adubação nitrogenada · Microbiologia Agrícola · Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz/ USPBanca: Rodrigo Mendes, FERNANDO, DINI ANDREOTE, Simone Raposo CottaExame de qualificação de doutorado
- 2020Felipe Martins Rêgo BarrosInteração entre o microbioma do solo e a atividade de fitonematoides na cultura da soja · Solos e Nutrição de Plantas · Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz/ USPBanca: Simone Raposo Cotta, Rodrigo Mendes, Carlos Eduardo Pellegrino CerriExame de qualificação de doutorado
- 2020Antonio Marcos Miranda SilvaMitigação do estresse hídrico em milho (Zea mays L.) mediante a inoculação de fungos micorrízicos arbusculares e rizobacterias promotoras de crescimento vegetal · Solos e Nutrição de Plantas · Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz/ USPBanca: Simone Raposo Cotta, Carlos Eduardo Pellegrino Cerri, Itamar MeloExame de qualificação de doutorado
- 2019Bruna Andréia Bacco LopesFungos micorrízicos arbusculares e espécies de Eucalyptus com diferentes níveis de tolerância ao estresse hídrico · Solos e Nutrição em Plantas · Escola Superior de Agricultura "Luiz de Queiroz"Banca: Simone Raposo Cotta, Tsai Siu Mui, Elke Jurandy Bran Nogueira Cardoso, José Leonardo de Moraes GonçalvesMestrado
- 2019Andressa Monteiro VenturiniConversão floresta-pastagem na Amazônia Oriental: impacto sobre as comunidades microbianas do metano do solo · Biologia na Agricultura e no Ambiente · Centro de Energia Nuclear na Agricultura - Universidade de São PauloBanca: Simone Raposo Cotta, Tsai Siu Mui, PELLIZARI, VIVIAN HELENA, Jackson Antonio Marcondes de SouzaDoutorado
- 2019Leandro Nascimento LemosModelagem integrativa e in silico de dados multi-ômicos de filos de Archaea e Bacteria em solos amazônicos · Biologia na Agricultura e no Ambiente · Centro de Energia Nuclear na Agricultura - Universidade de São PauloBanca: Simone Raposo Cotta, Tsai Siu Mui, Fernando Dini Andreote, Alessandro de Mello VaraniDoutorado
- 2019Julia Brandão GontijoDinâmica das comunidades microbianas associadas ao ciclo do metano e do enxofre em solos inundáveis amazônicos · Biologia na Agricultura e no Ambiente · Centro de Energia Nuclear na Agricultura - Universidade de São PauloBanca: Simone Raposo Cotta, Plínio Barbosa de Camargo, Cristina Rossi NakayamaExame de qualificação de doutorado
- 2019Maiele Cintra SantanaRemoção de resíduos em florestas de eucalipto: influência na comunidade de fungos e na ciclagem do fósforo no solo · Microbiologia Agrícola · Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz/ USPBanca: José Leonardo de Moraes Gonçalves, Lucas William Mendes, Simone Raposo CottaExame de qualificação de doutorado
- 2019Kelly Jaqueline AlvesA interação entre o microbioma do solo e o uso de pesticidas agrícolas - um enfoque ecológico · Microbiologia Agrícola · Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz/ USPBanca: Simone Raposo Cotta, Rodrigo Mendes, Jussara Borges RegitanoExame de qualificação de doutorado
- 2018Iara Donadão PretoIdentificação do potencial biotecnológico de microrganismos endofíticos na produção de compostos inseticidas e biorremediação · Programa de Pós Graduação em Ciências · Centro de Energia Nuclear na Agricultura - Universidade de São PauloBanca: Simone Raposo Cotta, Paulo Teixeira Lacava, João Lúcio AzevedoMestrado
- 2018Maiele Cintra SantanaAnálise da comunidade de fungos em áreas de monocultura e consórcio de Eucalyptos grandis e Acacia mangium · Programa de Pós Graduação em Microbiologia Agrícola · Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz/ USPBanca: Simone Raposo Cotta, Elke Jurandy Bran Nogueira Cardoso, Agnès Amandine Robin, Marcílio de AlmeidaMestrado
- 2018Iara Donadão PretoIdentificação do potencial biotecnológico de microrganismos endofíticos na produção de compostos inseticidas e biorremediação · Programa de Pós Graduação em Ciências · Centro de Energia Nuclear na Agricultura - Universidade de São PauloBanca: João Lúcio Azevedo, Paulo Texeira Lacava, Simone Raposo CottaMestrado
- 2018Yasmin Florentino RodriguezInfluência da diversidade microbiana presente na rizosfera do milho na disponibilização de fósforo · Programa de Pós Graduação em Microbiologia Agrícola · Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz/ USPBanca: Simone Raposo Cotta, Lucy Seldin, Fernando Dini Andreote, Maike RossmanMestrado
- 2018Mariley de Cassia da FonsecaFósforo e sua dinâmica no solo decorrente das interações de fatores bióticos e abióticos · Programa de Pós Graduação em Ciências · Centro de Energia Nuclear na Agricultura - Universidade de São PauloBanca: Simone Raposo Cotta, Acacio Aparecido Navarrete, Francisco Scaglia LinharesExame de qualificação de mestrado
- 2018Gabriela Garcia MedeirosDecomposição foliar em rios sob diferentes intensidades de perturbação · Química na Agricultura e no Ambiente · Centro de Energia Nuclear na Agricultura - Universidade de São PauloBanca: Simone Raposo Cotta, Regina Teresa Rosim Monteiro, Adriana Oliveira MedeirosExame de qualificação de doutorado
- 2018Lucianne Ferreira Paes de OliveiraBioprospecção de compostos produzidos por Actinobacterias isoladas de ilhas do Litoral Norte de São Paulo · Programa de Pós Graduação em Microbiologia Agrícola · Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz/ USPBanca: Simone Raposo Cotta, Simone Possedente Lira, Maria Carolina QuecineExame de qualificação de mestrado
- 2018Miriam Gonçalves de ChavesAbordagem multianalitica no estudo da composição e funcionalidade da microbiota associada aos ciclos do C e do N em solos agrícolas e naturais · Biologia na Agricultura e no Ambiente · Centro de Energia Nuclear na Agricultura - Universidade de São PauloBanca: Simone Raposo Cotta, Marli de Fátima Fiore, Jackson Antonio Marcondes de SouzaExame de qualificação de doutorado
Revisor de periódico
20 registros- 2023 – presenteVínculo atualENVIRONMENTAL MICROBIOLOGYRevisor de periódico
- 2022 – presenteVínculo atualnpj Biofilms and MicrobiomesRevisor de periódico
- 2022 – presenteVínculo atualBMC Plant BiologyRevisor de periódico
- 2021 – presenteVínculo atualLETTERS IN APPLIED MICROBIOLOGYRevisor de periódico
- 2021 – presenteVínculo atualEnvironmental Science and Pollution ResearchRevisor de periódico
- 2020 – presenteVínculo atualPLANT AND SOIL (DORDRECHT. ONLINE)Revisor de periódico
- 2020 – presenteVínculo atualLand Degradation and DevelopmentRevisor de periódico
- 2020 – presenteVínculo atualAquatic ToxicologyRevisor de periódico
- 2020 – presenteVínculo atualEstuarine Coastal and Shelf ScienceRevisor de periódico
- 2020 – presenteVínculo atualScientific ReportsRevisor de periódico
- 2019 – presenteVínculo atualFrontiers in MicrobiologyRevisor de periódico
- 2019 – presenteVínculo atualMICROBIAL ECOLOGYRevisor de periódico
- 2019 – presenteVínculo atualJOURNAL OF AGRONOMY (PRINT)Revisor de periódico
- 2019 – presenteVínculo atualPLANT AND SOILRevisor de periódico
- 2019 – presenteVínculo atual3BiotechRevisor de periódico
- 2018 – presenteVínculo atualECOLOGICAL INDICATORSRevisor de periódico
- 2017 – presenteVínculo atualSOIL BIOLOGY & BIOCHEMISTRYRevisor de periódico
- 2016 – presenteVínculo atualEnvironmental Pollution (London)Revisor de periódico
- 2013 – presenteVínculo atualAgrária (Recife. Online)Revisor de periódico
- 2012 – presenteVínculo atualBrazilian Journal of Microbiology (Impresso)Revisor de periódico
Prêmios e títulos
06 registros- 2022Outstanding Review EditorFrontiers in Soil Science
- 2018Prêmio Aluno Destaque - SIICUSPESALQ/USP
- 2013Melhor trabalho da área de Microbiologia Ambiental27 - Congresso Brasileiro de microbiologia
- 2013Melhor trabalho de Iniciação científica do Centro de Ciências da Saúde - UFRJUniversidade Federal do Rio de Janeiro
- 2006Menção honrosa da XII Semana de Microbiologia e ImunologiaUniversidade Federal do Rio de Janeiro
- 2006Diploma de Dignidade Acadêmica grau Cum LaudeUniversidade Federal do Rio de Janeiro - UFRJ
Participação em eventos
27 registros- 2022ESALQSHOWOuvinte · Piracicaba
- 2022The role of Cyanobacteria in ameliorating stress conditions for bacterial community in Brazilian soda lakes17th. International Symposium on Phototrophic Prokaryotes · Poster / Painel · Participante · Liverpool
- 2022Disentangling the bacterial interactions and their consequences on Pantanal soda lakes' functionalityII International Symposium of Agriculture Microbiology · Poster / Painel · Participante · Lavras
- 2015A rizosfera como consequência da mudança no uso do solo28 Congresso Brasileiro de Microbiologia · Apresentação oral · Participante · Florianópolis
- 2014The Role of Genetics Mobile Elements in the Adaptation to Life in Mangrove SoilsXIV Encontro Nacional de Microbiologia Ambiental · Poster / Painel · Participante · João Pessoa
- 2014Towards the Role of Mobile Elements in the Adaptation to Life in Mangrove Soil15th International Symposium on Microbial Ecology - ISME · Poster / Painel · Participante · Seoul
- 2014Meta-Omics and Bioinformatics in Microbial EcologyOuvinte · Piracicaba
- 2013Assessment of the effect of genetic modified (GM) Maize cultivation on ammonia-oxidazing bacterial and archaeal communities12th Symposium on Bacterial Genetics and Ecology - BAGECO · Poster / Painel · Participante
- 2013Poster27 CBM - Congresso Brasileiro de Microbiologia · Poster / Painel · Participante · Natal
- 2012Temporal dynamics of microbial communities in the rhizosphere of two genetically modified (GM) maize hybrids in tropical agrosystems14th. International Symposium on Microbial Ecology - ISME · Poster / Painel · Participante · CopenhagemDivulgação científica
- 2012Avaliação do possível impacto de milho geneticamente modificado na ciclagem do nitrogenio em solo de cerradoFertBio · Poster / Painel · Participante · MaceióDivulgação científica
- 2010Diversidade da comunidade bacteriana presente na rizosfera de milho transgênico e na sua respectiva linhagem isogênica não transgênicaXX Congreso Latinoamericano de Microbiología · Poster / Painel · Participante · Montevideo
- 2009PRODUÇÃO DE SUBSTÂNCIAS ANTIMICROBIANAS ATIVAS CONTRA O FUNGO DERMATÓFITO TRICOPHYTON RUBRUM PELA ESPÉCIE PAENIBACILLUS KRIBBENSIS25o. Congresso Brasileiro de Microbiologia · Poster / Painel · Participante · Porto de Galinhas
- 2008Produção de substância antimicrobianas ativas contra fungos dermatófios pela estirpe POC115 de Paenbacillus kribbensisXI Encontro Nacional de Microbiologia Ambiental · Poster / Painel · Participante · Rio de Janeiro
- 2007Identificação de estirpes de Paenibacillus produtoras de substâncias antimicrobianas ativas contra fungos dermatófitosXXIV Congresso Brasileiro de Microbiologia · Poster / Painel · Participante · Brasília
- 2007Production of antimicrobial substance by Paenibacillus strains against dermatophytes fungiXXXVI Annual Meeting/ Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular-SBBq · Poster / Painel · Participante · Salvador
- 2007Identificação de estirpes produtoras de substâncias antimicrobianas (SAM) ativas contra fungos dermatófitos e caracterização parcial dessas SAMI Semana de Pós-Graduação do Instituto de Bioquímica Médica · Poster / Painel · Participante · Rio de Janeiro
- 2006Produção de substâncias antimicrobianas por estirpes de Paenibacillus ativas contra fungos dermatófitosXII Semana de Microbiologia e Imunologia · Poster / Painel · Participante · Rio de Janeiro
- 2006Produção de substâncias ativas contra fungos dermatófitos por estirpes pertencentes ao gênero PaenibacillusXXVIII Jornada Giulio Massarani de Iniciação Científica, Artística e Cultural da UFRJ · Poster / Painel · Participante · Rio de Janeiro
- 2005Produção de substâncias antimicrobianas por estirpes de Paenibacillus com atividade contra fungos dermatófitosXXVII Jornada Giulio Massarani de Iniciação Científica, Artística e Cultural da UFRJ · Poster / Painel · Participante · Rio de Janeiro
- 2005Produção de substâncias antimicrobianas por estirpes de Paenibacillus ativas contra fungos dermatófitosXI Semana de Microbiologia e Imunologia · Poster / Painel · Participante · Rio de Janeiro
- 2005Atividade imunomodulatória da warifteína purificada do extrato da Cissampelos sympodialis EICH (menispermaceae) sobre linfócitos B in vitro e in vivoXXVII Jornada Giulio Massarani de Iniciação Científica, Artística e Cultural da UFRJ · Poster / Painel · Participante · Rio de Janeiro
- 2004Modulação da resposta dos linfócitos B a warifteína purificada extraída do extrato de Cissampelos sympodialisInflamation and Chemokines · Poster / Painel · Participante · Ouro Preto
- 2004Modulação da resposta dos linfócitos B a warifteína purificada extraída do extrato de Cissampelos sympodialisX Semana de Microbiologia e Imunologia · Poster / Painel · Participante · Rio de Janeiro
- 2004Modulação da resposta de linfócitos B pela warifteína purificada do extrato de Cissampelos sympodialisXXVI Jornada de Iniciação Científica, Artística e Cultural da UFRJ · Poster / Painel · Participante · Rio de Janeiro
Formação complementar
08 registrosCoautorias
15 coautores- 28 obras
- 16 obras
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Na imprensa
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