Luiz Ricardo Lopes de Simone.

As faunas de ilhas, chamadas de faunas insulares, representam uma importante fonte de dados biológicos.
Por seu isolamento, essas faunas propiciam estudos com enfoque evolutivo, vicariância e de dispersão. O presente projeto surgiu da necessidade e de refinar o conhecimento levando em conta três fatores: 1) O
levantamento sobre as maiores ilhas oceânicas brasileiras ainda está incompleto, uma vez que um relevante
número de novos táxons, ou táxons previamente não levantados, ainda aparece nas amostragens recentes;
2) Uma grande quantidade de espécies endêmicas foi detectada em estudos pretéritos, na ordem de 60%;
boa parte ainda precisa ser descrita e, para isso, é necessário incluir aspectos mais modernos, como
anatomia e sequenciamento de DNA ? barcoding, fatores que ainda não foram plenamente obtidos por falta
de verba. 3) As espécies supostamente em comum dessas ilhas, i.e., não endêmicas, em maioria também em
comum com o continente, precisam ser mais bem estudadas a fim de se determinar se realmente são
espécies que mantêm um intercâmbio gênico geral, formando populações com conectividade variável, ou se
são populações isoladas, espécies incipientes cujas características morfológicas não se modificaram o
suficiente para serem detectadas. Adicionalmente, propõe-se neste uma investigação inédita, a comparação
com a fauna da ilha de Ascensão, uma vez que várias espécies supostamente são em comum com aquela
ilha de concessão inglesa. Por ter sido alvo de estudos pretéritos às ilhas brasileiras, Ascensão é localidadetipo
de várias espécies que supostamente ocorrem nas ilhas brasileiras (e.g., Nerita ascensionis). Pela
primeira vez propõe-se uma expedição para a Ilha de Ascensão em busca de amostras dessas espécies,
visando uma comparação detalhada, incluindo dados conquiliológicos, anatômicos e de DNA, entrando no
aspecto de fluxo gênico, se concentrando nos princípios de conectividade e estruturação populacional.

A expedição MD55, durante os meses de Maio a Junho de 1987, foi uma grande parceria entre o MNHN e a Universidade Santa Ursula (RJ), nessa expedição que abrangeu 3180 milhas náuticas que cobriu o litoral do Rio de janeiro, Espírito Santo e cadeia Vitória-Trindade foram coletados diversas famílias de Molusco de mar profundo entre profundidades de ~200 a 2000m. O material referente a família Turridae encontra-se sob tutela do Prof. Luiz Ricardo Lopes de Simone (MZSP) e durante o desenvolvimento desse projeto será incorporado na coleção Malacológica do Museu de Zoologia da USP. É notável a necessidade da compreensão da taxonomia desses animas assim como a incorporação desse material ao acervo do laboratório de Malacologia, uma vez que servirá como uma importante fonte de dados para projetos e estudos futuros. É rotina na Malacologia do MZUSP selecionar elencos representativos de famílias e, então, realizar uma análise completa deste material, para que posteriormente sirva de base para estudos mais abrangentes. Para a obtenção desses dados, trabalho esse que já vem sendo realizado há cinco meses pelo proponente, técnicas tradicionais de taxonomia serão adotadas como, por exemplo, o levantamento de características conquiliológicas, assim como o levantamento de bibliografias de revisão da família e levantamento de tipos. Posteriormente os lotes serão submetidos a um processo de curadoria completa, os animais devidamente identificados, serão adicionados ao banco de dados virtual da coleção (Specify) e acomodados nos armários da coleção, de forma que sua busca seja rápida e eficiente. A médio prazo, os dados taxonômicos serão publicados em revistas cientificas pertinentes com relativa urgência, uma vez que o MNHN cobra de forma positiva a divulgação desses dados o quanto antes possível.

Análises de comparação de anatomia detalhada, através de dissecções e de análises moleculares em gruposcomplicados como os representantes das famílias Limidae (Pteriomorpha: Limoida) e Chamidae(Heterodonta: Veneroida) tem como objetivo: 1) Testar o monofiletismo das famílias Limidae e Chamidaebaseado em caracteres de morfologia e anatomia; 2) Determinar as relações filogenéticas das famílias com base na metodologia cladística; 3) Re-avaliar a classificação dos Limidae e Chamidae com base nashipóteses evolutivas estimadas com os dados morfológicos; 5) Realizar uma revisão taxonômica dasespécies de Limidae e Chamidae do Atlântico Oeste. Limidae é caracterizada por possuir conchas claras,manto com longos tentáculos, normalmente de cores vibrantes, pela capacidade de natação e presença deolhos. Chamidae, por sua vez, é conhecida por seu formato de ?caixa de joias?, conchas bem cimentadas àsubstratos duros e de colorações variadas. Foram escolhidas tais famílias pelo grande número deexemplares nas coleções zoológicas e pela facilidade de coleta em mergulhos autônomos. Serão analisadosrepresentantes de quatro gêneros de Limidae, compreendendo até o momento nove espécies, e Chamidaecom quatro gêneros e onze espécies, todas do Atlântico Oeste. OBJETIVO1) Testar o monofiletismo das famílias Limidae e Chamidae baseado em caracteres de morfologia eanatomia; 2) Confrontar a análise cladistica dos morfológicos com os dados moleculares; 3) Determinar asrelações filogenéticas das famílias com base na metodologia cladística; 4) Re-avaliar a classificação dosLimidae e Chamidae com base nas hipóteses evolutivas estimadas com os dados

Através de estudos morfo-anatômicos e de sequenciamento genético, analisar-se-á espécies-chaves de nudibrânquios que supostamente são anfi-atlânticos, para confirmação se há fluxo gênico entre as populações de ambos os lados do Oceano Atlântico, ou se são populações isoladas, pertencentes a espécies diferentes.

Revisar taxonomicamente da subfamília Crassostreinae, testando o monofiletismo
da subfamília Crassostreinae, utilizando a metodologia cladística;
? Com base no método cladístico, analisar a relação de parentesco de entre os
gêneros próximos e as espécies da subfamília Crassostreinae, incluindo a relação
de parentesco dentro da superfamília Ostreoidea;
? Realisar uma análise comparativa entre os dados morfológicos e moleculares.

Sendo Mollusca um grupo mega-diverso e com relações filogenéticas ainda pouco esclarecidas, não é possível realizar uma análise filogenética envolvendo absolutamente todos os constituintes de um táxon alto, como superfamília. Por isso, estudos sobre representantes de todas as vertentes desses táxons são considerados passos importantes no conhecimento filogenético e vem sendo realizados em projetos que antecederam este, voltados á outras superfamílias de Caenogastropoda. O presente estudo enfoca Naticoidea, gastrópodes marinhos predadores, conhecidos por perfurar conchas de outros invertebrados com uma glândula especial na probóscide. Os passos anteriores envolveram 8 superfamílias, como segue: 1) Cyclophoroidea, 2) Ampullarioidea, 3) Viviparoidea, 4) Cerithioidea, 5) Rissooidea, 6) Stromboidea, 7) Calyptraeoidea, e 8) Cypraeoidea, os quais foram publicados (Simone 1999a, 2000, 2001a, 2002, 2004a, 2004b, 2005a, 2006a, 2006b, 2007a, dentre outros artigos menores). Assim como nos estudos anteriores, a base de dados para análise será a morfologia e anatomia detalhadas de uma amostragem heterogênea de representantes da superfamília, cerca de 30 espécies, perfazendo perto de 20% das espécies do táxon. A base de dados será reunida em cenário comparativo e processada por programas computacionais visando a obtenção de um cladograma. Esse obtido, inferências taxonômicas e evolutivas poderão ser realizadas, assim como uma reorganização de Caenogastropoda como um todo em nível de superfamília poderá ser deduzida. Tentar-se-á, também, extrair dados moleculares dos exemplares mais bem preservados e os que vierem a ser coletados, visando a obtenção de uma base comparativa puramente molecular e posterior confronto com os dados obtidos na análise morfológica. Adicionalmente, as 17 espécies de Naticoidea presentes na costa brasileira serão revisadas taxonomicamente, pois a maioria das espécies é ainda mal definida, e boa parte será incluída na análise.

Este Projeto visa fornecer a comunidade científica nacional e internacional um catálogo iconográfico ilustrado, inventariando todas as espécies ora conhecidas de moluscos marinhos e de estuário de ambas as costas da América do Sul (atlântica e pacífica). Este é continuação natural de outros projetos prévios que culminaram com a publicação de um catálogo sobre moluscos fósseis do Brasil (1994) e outro de moluscos terrestres e de água doce (2006). As espécies serão listadas de acordo com a mais moderna sistemática filogenética, contendo dados sintéticos de distribuição, sinonímia, uma completa lista de referências bibliográficas e ao menos uma figura. A figura é o ponto de destaque do catálogo, por isso procurar-se-á ilustrar principalmente exemplares-tipo ou provenientes de revisões. Tais exemplares em geral encontram-se em instituições estrangeiras que precisarão ser visitadas. Também objetiva-se reunir nesta obra as referências de toda a bibliografia relativa aos moluscos desta região, desde Linné (1758) até a atualidade. O referido inventário vem a preencher uma lacuna na Malacologia sul-americana; uma empreitada nunca previamente realizada mas que o proponente tem experiência em fazer. Tal inventário, organizado como um catálogo ilustrado, tem a intenção de ser o primeiro passo para qualquer pessoa interessada em estudar qualquer aspecto de alguma espécie de molusco sul-americano e, em seguida, possa expandir seu conhecimento com a bibliografia indicada.

-Levantamento da fauna bentônica do infra-litoral, que apresenta conhecimento insuficiente, uma vez que levantamentos anteriores apenas levam em conta organismos de médio litoral e coletados esporadicamente. Esse conhecimento é imprescindível para ações de manejo de conservação da região.
- O endemismo é considerado patrimônio genético. Visto que uma boa quantidade de espécies endêmicas foi encontrada nos demais arquipélagos estudados, é esperado que o mesmo ocorra para região de Trindade, fato este que ainda não foi evidenciado.
- Visto que estudos da mesma ordem realizados anteriormente nos Arquipélagos de Fernando de Noronha e São Pedro e São Paulo, há a necessidade de levantamento da mesma ordem de grandeza na região de Trindade. A comparação entres estes biomas possibilitará a comparação de padrões biogeográficos insulares e costeiros, importantes para evidenciação de possíveis padrões evolutivos dos organismos que nela habitam.

Objetivo Geral: Levantar a composição, estrutura e dinâmica do ecossistema do Arquipélago de Trindade e Martin Vaz no que tange a fauna bentônica de invertebrados, com certo enfoque em Mollusca e Crustácea.
Objetivos específicos: 
- Atualizar a taxonomia dos invertebrados;
- Comparar a fauna local com ecossistemas de outras ilhas oceânicas;
- Comparar a fauna local com a fauna da costa continental.
- Realizar inferências evolutivas e de colonização da fauna insular.
- Publicar os dados coligidos em periódicos especializados e em um manual.

Dentro de um projeto maior que visa o levantamento e o entendimento da vida insular no Brasil, a fauna, em particular de Mollusca, proveniente de ilhas francamente oceânicas (e.g., Fernando de Noronha) está sendo coligida e comparada com a fauna costeira e de ilhas situadas a uma distância intermediária. O levantamento abrange tanto a malacofauna marinha quanto não-marinha. Através de vários métodos, que vão desde a catação, mergulho autônomo e dragagem, amostras serão coletadas da fauna de três ilhas paulistas: Alcatrazes, da Vitória e dos Búzios. A seleção dessas ilhas levou em conta a importância delas em aspectos preservacionistas e a carência de dados, já que elas não sofreram levantamento nos projetos paralelos. Todo o material coletado será triado, os organismos não-moluscos que por ventura sejam capturados serão encaminhados para os respectivos especialistas/coleções. A malacofauna será levantada em detalhe pela equipe, analisada em sua taxonomia e constituição, as novidades taxonômicas serão encaminhadas para publicação, e haverá uma intensa análise comparativa da malacofauna dessas ilhas com as demais ilhas paulistas e com a costa e ilhas oceânicas. O estudo comparativo, considerado o principal, com vistas principalmente em aspectos evolutivos, ecológicos, sistemáticos e de dispersão, será realizado e devidamente publicado.

Através de estudos comparativos de espécies supostamente em comum entre as regiões da Flórida, Estados Unidos, e Brasil, pertencentes à classe Bivalvia (Mollusca), com base em morfo-anatomia e em sequenciamento genético, analisa-se se apresentam diferenças ou distanciamento genético suficiente para serem separadas em nível específico.

Viagem para World Congress of Malacology, 2007, Antuérpia, Bélgica

A coleção do casal Marcus, de imprescindível valor para a zoologia dos moluscos, foi recentemente adquirida pelo MZUSP. O serviço de curadoria preliminar e mais urgente fora feito, entretanto, é necessário termina-lo, deixando esta importante coleção, assim como os dados nela contidos, disponíveis para a comunidade científica. O principal objetivo deste projeto é criar uma base laboratorial e de infra-estrutura para que a total curadoria seja feita no período de 2 anos. Isso inclui a seleção de um bolsista de treinamento técnico e a busca na bibliografia e nos apontamentos do casal os dados para completar dados ausentes nos lotes. Além da total organização da coleção e sua incorporação ao acervo do MZUSP, é intenção publicar os dados em periódico e via Internet. Processo n. 2005/00131-1

Auxílio Publicação do livro Land and Freshwater Molluscs of Brasil de autoria de Luiz Ricardo L. Simone.
Processo n. 2006/01394-9

Vinda do Prof. Guido Pastorino do Museo Argentino de Ciencias Naturales, Argentina
Processo n. 2006/02524-3

Através de técnicas modernas de captura, que vão desde coletas manuais com mergulho a armadilhas oceânicas de curta e longa duração, fazer-se-á um levantamento principalmente de macro-invertebrados do Arquipélago. Análises concomitantes e posteriores de comparação taxonômica serão realizadas, visando o inventário da biodiversidade local e análises comparativas com a fauna de outras ilhas oceânicas e com a costa brasileira.
Maior enfoque será dado nos moluscos e crustáceos, que perfazem parte significativa dos organismos bentônicos em diversidade de espécies e de biomassa.
Processo n. 558436/2005-6

Dentro da filosofia que a coleção zoológica é de fundamental importância para a pesquisa biológica, pretende-se otimizar os dados contidos na maior coleção de moluscos do Brasil, do Museu de Zoologia da USP, com mais de 50 mil lotes. A otimização será realizada através de duas frentes: 1) transferência dos dados dos livros tombo para o formato digital, em MS Excel (que possui interfaces para outros programas); desta forma, os dados poderão ser coligidos em poucos segundos, viabilizando a distribuição para a comunidade científica; 2) revisão dos cerca de 50.000 lotes da coleção, atualizando a sistemática, identificando os lotes ainda não determinados, renovando a forma de armazenamento do material, e confrontando os dados com os digitados com base nos livros tombo. Quatro bolsas de apoio técnico serão pleiteadas, sendo duas para a primeira frente e outras duas para a segunda. A criação de uma infra-estrutura mínima, tanto na coleção, quanto de informática também será criada. Todas as atividades transcorrerão sob a intensa supervisão do proponente.
Processo n. 2004/00309-2

Tendo em vista que os bivalves são extremamente importantes economicamente e em biomassa, assim como representam o segundo maior grupo de moluscos, é de se estranhar que o conhecimento sobre sua morfologia e filogenia sejam ainda muito superficiais. Adicionalmente, as espécies que ocorrem na costa do Brasil são comumente identificadas como sendo as mesmas do Caribe e Golfo do México, entretanto, estudos de anatomia interna têm revelado que na maior parte dos casos que eventualmente sejam estudados, amostras de ambas as regiões representam, na verdade, espécies diferentes com concha similar.
Visando contribuir para o estudo da morfologia dos bivalves, com o conhecimento de sua filogenia, assim como confirmar a identidade específica das espécies ocorrentes no Brasil, pretendo estudar comparativamente amostras provenientes tanto da Flórida (onde existe a maior parte das localidades-tipo), quanto do Brasil, levando em conta uma morfologia detalhada, que tem se mostrado suficiente para uma reavaliação taxonômica em moluscos. Pretende-se estudar por volta de 80 espécies, contando ambas as regiões.
Aproveitar-se-á essa base de dados para realizar, pela primeira vez para bivalves, uma analise filogenética das espécies estudadas, com base em morfologia detalhada. Este resultado certamente contribuirá com o conhecimento sobre a filogenia da classe Bivalvia como um todo, uma vez que representantes de todas as principais subdivisões serão analisados.
Processo n. 2004/02333-8

Através de dissecções, fazer-se-á uma análise detalhada da morfologia de vários representantes de cada uma das 9 subfamílias de Muricidae (Mollusca, Caenogastropoda, Muricoidea). Após cuidadosa análise comparativa, levantar-se-á caracteres que servirão de base para uma análise filogenética. Incicialmente a análise será individual de cada subfamília ou grupos de subfamílias aparentemente próximas. Em seguida reunir-se-á todos os dados para a obtenção de uma análise filogenética global da família como um todo. O projeto é continuação de estudos prévios financiados pela Fapesp que culminaram com a filogenia geral da ordem Caenogastropoda e de Muricoidea como um todo. Muricidae é um dos táxons no qual uma análise detalhada ficou postergada. A lacuna deixada pela análise relativamente superficial dos Muricidae poderá então ser preenchida.
Processo n. 2004/10793-9

Publicação do Artigo sobre filogenia de Stromboidea e Xenophoroidea.
Processo n. 2003/02436-9

Bolsa de pós-doutoramento no setor de invertebrados
Field Museum of Natural History, Chicago, Illinois, USA
Processo n. 2003/02447-0

Toda a literatura referente a moluscos terrestres e de água doce ocorrentes no território brasileiro e imediações foi levantada, totalizando mais de 2500 referências. Todas as espécies de moluscos desses ambientes foram também levantadas. Os dados sobre estas foram dispostos sinteticamente como um catálogo, contendo inclusive a listagem das referências que as estudaram. Pretende-se que tal levantamento seja publicado na forma de um catálogo ilustrado, que seria utilizado como primeiro passo para qualquer interessado no assunto, que facilmente acessaria os dados de cada espécie, sua sistemática atual (incluindo sinonímia), uma foto e uma lista de todas as referências alusivas à esta
Processo n. 2003/13210-1

Bolsa de produtividade em Pesquisa CNPq
Processo n. 304010/2003-0

Auxílio publicação do livro sobre Filogenia de Cypraeoidea
Processo n. 2001/01884-2

Participação no Congresso Mundial de Malacologia com apresentação de trablhos e palestras.
Processo n. 2001/04068-1

Ediçãod e imagens, digitação e descodificação par ao livro "Landa and Freshwater Molluscs of Brazil!
Processo n. 2001/10148-8