Resumo biográfico
É Bel. em Ciências de Computação pela Universidade de São Paulo (1983), com Mestrado em Ciências de Computação pelo ICMSC da Universidade de São Paulo (1987), e Doutorado em Física Computacional pela Universidade de São Paulo (1991), e pós-doutorado em Computação pela Carnegie Mellon University (1998-2000). Atualmente é Professora Titular no Instituto de Ciências Matemáticas e de Computação da Universidade de São Paulo (SP). Supervisionou mais de 60 alunos de Pós-Graduação e tem coordenado projetos de pesquisa em grandes redes nacionais e internacionais. Tem experiência na área de Ciências da Computação, com ênfase em Processamento Gráfico (Graphics) e Bases de Dados Complexos, atuando principalmente nos seguintes temas: recuperação de imagens baseada em conteúdo, imagens médicas, CBIR, consultas por similaridade, extração de características de imagens, visualização de informação e mineração de imagens e dados complexos.
Indicadores
Áreas de atuação
02 registros- Ciencias Exatas E Da TerraCiência da ComputaçãoMetodologia e Técnicas da Computação › Processamento Gráfico (Graphics)
- Ciencias Exatas E Da TerraCiência da ComputaçãoMetodologia e Técnicas da Computação › Banco de Dados
Formação acadêmica
05 registros- 1998 – 2000Pós-DoutoradoConcluídoPós-Doutorado · Carnegie Mellon UniversityBolsa Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo
- 1987 – 1991DoutoradoConcluídoFísica Computacional · Universidade de São Paulo“Estudo e Implementação de 'Software'Dedicado para um Sistema de Visualização de Imagens”Orientação: Jan Franz W Slaets
- 1984 – 1987MestradoConcluídoCiências de Computação São Carlos · Universidade de São Paulo“Desenvolvimento de Software Básico para Gerenciamento de um Sistema Multiusuário Distribuído”Orientação: Jan Franz W SlaetsBolsa Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo
- 1980 – 1983GraduaçãoConcluídoBacharelado em Informática · Universidade de São PauloOrientação: Odelar Leite LinharesBolsa Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo
- Livre-docênciaConcluídoLivre-docência · Universidade de São Paulo
Idiomas
02 registros| Idioma | Leitura | Fala | Escrita | Compreensão |
|---|---|---|---|---|
| Inglês | Bem | Bem | Bem | Bem |
| Espanhol | Razoável | Pouco | Pouco | Razoável |
Atuação profissional
25 registros- 2025 – presenteVínculo atualIEEE Open Journal of the Computer SocietyMembro de corpo editorial
- 2024 – presenteVínculo atualJournal of the Brazilian Computer SocietyMembro de corpo editorial
- 2023 – presenteVínculo atualUniversidade de São PauloCâmara de Atividades Docente - ReitoriaColaborador2h/sem
- 2023 – 2023Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São PauloCAD - Ciências Exatas e EngenhariasColaborador10h/sem
- 2021 – 2023Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São PauloCoordenação de Adjunta Pesquisa para InovaçãoColaborador10h/sem
- 2020 – presenteVínculo atualCOMPUTERS IN BIOLOGY AND MEDICINEMembro de corpo editorial
- 2019 – 2021Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São PauloCoordenação de Área - ComputaçãoProfessor Visitante10h/sem
- 2014 – 2016Universidade de São PauloSubstituta da Pró-Reitora Pós-Graduação USP16h/sem
- 2014 – 2018Universidade de São PauloAssessora TI - Pró-Reitoria Pós-Graduação-USPServidor Publico12h/sem
- 2014 – 2016Empresa Brasileira de Pesquisa AgropecuáriaProfessor TitularColaborador2h/sem
- 2013 – 2014Universidade de São PauloSubstituta do Pró-Reitor de Pós-Graduação USPServidor Publico16h/sem
- 2013 – 2017Universidade Federal da BahiaProfessor TitularColaborador4h/sem
- 2010 – presenteVínculo atualJournal of Multimedia Processing and Technologies (JMPT)Membro de corpo editorial
- 2008 – presenteVínculo atualDedicação exclusivaUniversidade de São PauloProfessora titular40h/sem
- 2008 – presenteVínculo atualDedicação exclusivaInstituto de Ciências Matemáticas e de Computação - USPProfessora TitularOutro (especifique)40h/sem
- 2005 – presenteVínculo atualFundação de Amparo à Pesquisa do Estado da BahiaRevisor de projeto de fomento
- 2004 – presenteVínculo atualFundação de Amparo à Ciência e Tecnologia do Estado de PernambucoRevisor de projeto de fomento
- 2001 – 2008Dedicação exclusivaUniversidade de São PauloProfessora Associada (Livre-docente)Servidor Publico40h/sem
- 2000 – presenteVínculo atualFundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Minas GeraisRevisor de projeto de fomento
- 1995 – presenteVínculo atualConselho Nacional de Desenvolvimento Científico e TecnológicoRevisor de projeto de fomento
- 1994 – presenteVínculo atualCoordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível SuperiorRevisor de projeto de fomento
- 1994 – presenteVínculo atualFundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São PauloRevisor de projeto de fomento
- 1991 – 2001Dedicação exclusivaUniversidade de São PauloProfessora DoutoraServidor Publico40h/sem
- 1988 – 1991Dedicação exclusivaUniversidade de São PauloProfessora AssistenteServidor Publico40h/sem
- 1987 – 1988Universidade de São PauloAnalista de SoftwareCeletista40h/sem
Produção bibliográfica
495 registros- 2025FairMed-FL: Federated Learning for Fair and Unbiased Deep Learning in Medical ImagingDO CARMO, ÊRICA PETERS; TRAINA-JR, CAETANO; Agma Juci Machado Traina · 2025 IEEE 38th International Symposium on ComputerBased Medical Systems (CBMS) · IEEE · ISBN 9798331526108 · Madrid
- 2025Improving U-Net with Attention Mechanism for Medical Image Segmentation ApplicationsEduardo S. Honorato; Mariana Aya Suzuki Uchida; Agma Juci Machado Traina; Denis F. wolf · 38th IEEE Intl. Symposium on Computer-Based Medical Systems (CBMS2025) · IEEE Computer Society · Madrid
- 2025AI-Driven Public Health Surveillance: Analyzing Vulnerable Areas in Brazil Using Remote Sensing and Socioeconomic DataSILVA, JOAO PEDRO; DE AGUIAR, ERIKSON J.; SPADON, GABRIEL; Agma Juci Machado Traina; RODRIGUES, JOSE F. · 2025 IEEE 38th International Symposium on ComputerBased Medical Systems (CBMS) · IEEE · ISBN 9798331526108 · Madrid
- 2025Modeling Clinical Data with Attention Mechanisms: A Knowledge Graph Approach with CliniKGEduardo Moura; Rafael Comitre Garcia Conrado; Leonardo de Oliveira Campos; Mauro Marcel Olivatto; Marco Antônio Gutierrez; Agma Juci Machado Traina +1 autores · 38th IEEE Intl. Symposium on Computer-Based Medical Systems (CBMS2025) · IEEE Computer Society · Madrid
- 2025Agente Autônomo Guiado por LLMs para Extração de NotíciasJoão Neres de Sousa; Lucas Mingardo; Carlos Freire; Agma Juci Machado Traina; Caetano Traina Jr · 40 Simpósio Brasileiro de Banco de Dados (SBBD 2025) · Sociedade Brasileira de Computação - SBC · Fortaleza
- 2025Efficient Reuse of Metric Indexes for Multi-resolution QueriesRodrigo César Arboleda; Caetano Traina Jr; Agma Juci Machado Traina · 40 Simpósio Brasileiro de Banco de Dados (SBBD 2025) · Sociedade Brasileira de Computação - SBC · Fortaleza
- 2025From Tables to Graphs with AKGrApp: Leveraging LLMs to Support Modeling and Mining Knowledge GraphsRafael Comitre Garcia Conrado; Eduardo de Moura Campos; Caetano Traina Jr; Agma Juci Machado Traina; Mirela Teixeira Cazzolato · 40 Simpósio Brasileiro de Banco de Dados (SBBD 2025) - Sessão de Demos e Aplicações · Sociedade Brasileira de Computação - SBC · Fortaleza
- 2025Data Augmentation for Medical Image Segmentation: A Comparative Analysis of Traditional Techniques and Synthetic Data GenerationMariana Aya Suzuki Uchida; Erikson Júlio de Aguiar; Caetano Traina Jr; Agma Juci Machado Traina · 40 Simpósio Brasileiro de Banco de Dados (SBBD 2025) - Short paper · SBC · Fortaleza
- 2025DiveScan: um módulo para Recuperação de dados por Similaridade com Diversidade em PostgresAnna Júlia Costa Lauton; Agma Juci Machado Traina; Caetano Traina Jr · 40 Simpósio Brasileiro de Banco de Dados (SBBD 2025) - Short paper · SBC · Fortaleza
- 2025Conjunto de notícias para avaliação de investimentos em regiões do estado de São PauloGabriel Lucca Melo; João Victor Cosme Neres Sousa; Willian Dener de Oliveira; Lucas Mingardo; Carlos Freire; Agma Juci Machado Traina +1 autores · Dataset Showcase Workshop (DSW 2025) do 40 Simpósio Brasileiro de Banco de Dados (SBBD 2025) · SBC · Fortaleza
- 2025Assessing Large Language Models for Structuring Patient RecordsEduardo M. Campos; Rafael Comitre Garcia Conrado; Caetano Traina Jr; Agma Juci Machado Traina; Mirela Teixeira Cazzolato · Workshop de Trabalhos de Graduação em Andamento (WTAG 2025) do SBBD 2025 · SBC · Fortaleza
- 2024MIGUE-Sim: Speeding Up Similarity Queries with Native RDBMS ResourcesIgor A. R. Eleutério; Mirela Teixeira Cazzolato; Larissa R. Teixeira; Marco Antônio Gutierrez; Agma Juci Machado Traina; Caetano Traina Jr · 39th ACM/SIGAPP Symposium On Applied Computing (SAC 2024) · ACM Press · ISBN 9798400702433 · Avila
- 2024KluSIM: Speeding up K-Medoids Clustering over Dimensional Data with Metric Access MethodTEIXEIRA, LARISSA; ELEUTÉRIO, IGOR; CAZZOLATO, MIRELA; GUTIERREZ, MARCO; Agma Juci Machado Traina; TRAINA-JR., CAETANO · 26th International Conference on Enterprise Information Systems · SCITEPRESS - Science and Technology Publications · ISBN 9789897586927 · Angers
- 2024Similarity-Slim Extension: Reducing financial and computational costs of similarity queries in document collections NoSQL databasesWilliam Zaniboni Silva; Igor A. R. Eleutério; Larissa Roberta Teixeira; Agma Juci Machado Traina; Caetano Traina Jr · 26th International Conference on Enterprise Information Systems (ICEIS 2024) · SciTePress · ISBN 9789897586927 · Angers, France
- 2024RadPleura: A Radiomics-Based Framework for Lung Pleura Classification in Histology Images from Interstitial Lung DiseasesLINARES, OSCAR CUADROS; BELIZARIO, IVAR VARGAS; BATAH, SABRINA SETEMBRE; HAMANN, BERND; FABRO, ALEXANDRE TODOROVIC; AZEVEDO-MARQUES, PAULO M. +1 autores · 2024 IEEE International Symposium on Biomedical Imaging (ISBI) · IEEE Press · ISBN 9798350313338 · Athens
- 2024TraiRANN: Evaluating Data Reduction Methods for Neural Network Training in Medical ApplicationsMariana Aya Suzuki Uchida; Igor A. R. Eleutério; COSTA, MARCUS V. L.; Rodrigo C. Arboleda; Caetano Traina Jr; Agma Juci Machado Traina · XXIX Congresso Brasileiro de Engenharia Biomédica (CBEB24) · Sociedade Brasileira de Engenharia Biomédica · ISBN 1680-0737 · Ribeirão Preto
- 2024MedTimeSplit: Continual dataset partitioning to mimic real-world settings for federated learning on Non-IID medical image dataDE AGUIAR, ERIKSON J.; Agma Juci Machado Traina; HELAL, SUMI · 2024 IEEE International Conference on Big Data (BigData) · IEEE Computer Society · ISBN 9798350362480 · Washington
- 2024A symptom-based community-weighted similarity approach for inpatient health condition monitoringPONCIANO, JEAN R.; Mirela Teixeira Cazzolato; GUTIERREZ, MARCO ANTONIO; Traina, Caetano; Agma Juci Machado Traina · 2024 IEEE 37th International Symposium on ComputerBased Medical Systems (CBMS) · IEEE Computer Press · ISBN 9798350384727 · Guadalajara
- 2024RADAR-MIX: How to Uncover Adversarial Attacks in Medical Image Analysis through ExplainabilityDE AGUIAR, ERIKSON J.; Traina, Caetano; Agma Juci Machado Traina · 2024 IEEE 37th International Symposium on ComputerBased Medical Systems (CBMS) · IEEE Computer Press · ISBN 9798350384727 · Guadalajara
- 2023TgrApp: Anomaly Detection and Visualization of Large-Scale Call GraphsMirela Teixeira Cazzolato; Christos Faloutsos; Saranya Vijayakumar; Xinyi Zheng; Meng-Chieh Lee; D.H. Chau +4 autores · 37th AAAI Conference on Artificial Intelligence (AAAI-23) - Demonstrations Program · ACM Press · Washington DC
- 2023Exploratory Data Analysis in Electronic Health Records Graphs: Intuitive Features and Visualization ToolsMirela Teixeira Cazzolato; Marco Antônio Gutierrez; Caetano Traina Jr; Agma Juci Machado Traina; Christos Faloutsos · IEEE 36th Intl. Symposium on Computer-Based Medical Systems (CBMS 2023) · IEEE CS Press · L'Aquila
- 2023A Deep Learning-based Radiomics Approach for COVID-19 Detection from CXR Images using Ensemble Learning ModelCOSTA, MÁRCUS V. L.; DE AGUIAR, ERIKSON J.; RODRIGUES, LUCAS S.; RAMOS, JONATHAN S.; TRAINA, CAETANO; Agma Juci Machado Traina · 2023 IEEE 36th International Symposium on ComputerBased Medical Systems (CBMS) · IEEE CS Press · ISBN 9798350312249 · L'Aquila
- 2023Assessing Vulnerabilities of Deep Learning Explainability in Medical Image Analysis Under Adversarial SettingsDE AGUIAR, ERIKSON J.; COSTA, MÁRCUS V. L.; TRAINA, CAETANO; Agma Juci Machado Traina · 2023 IEEE 36th International Symposium on ComputerBased Medical Systems (CBMS) · IEEE CS Press · ISBN 9798350312249 · L'Aquila
- 2023Calibração de Distância em Métodos de Acesso Métrico por meio de Realimentação de RelevânciaRenato Gomes Marcacini; Agma Juci Machado Traina · 38 Simpósio Brasileiro de Banco de Dados (SBBD 2023) · SBC · Belo Horizonte
- 2023CallMine: Fraud Detection and Visualization of Million-Scale Call GraphsMirela Teixeira Cazzolato; Saranya Vijayakumar; Meng-Chieh Lee; Catalina Vajiac; Namyong Park; Pedro Fidalgo +2 autores · 32nd ACM International Conference on Information and Knowledge Management (CIKM 2023) · ACM Press · Birmingham
Produção técnica
49 registros- 1999Distance Exponent: A New Concept for Selectivity Estimation in Metric TreesCaetano Traina Jr; Agma Juci Machado Traina; Christos Faloutsos · Estimar a seletividade de consultas do tipo range query a bases de dados multimídia
- 1999Slim-Trees: High Performance Metric Trees Miniminzing Overlap Between NodesCaetano Traina Jr; Agma Juci Machado Traina; Christos Faloutsos · Indexar dados métricos
- 1999Algoritmos Para Indexação em Bases de Dados Através de Estruturas MultidimensionaisRoberto Figueira Santos Filho; Agma Juci Machado Traina; Caetano Traina Jr · Analisar o estado da arte das estruturas de indexação de dados multidimensionais
- 1999Indexando Pontos em Espaços com Altas Dimensões Através dos Métodos de Indexação Espacial K-D-B-Tree, R-Tree e TV-Tree: Uma Breve Comparação AnalíticaRoberto Figueira Santos Filho; Agma Juci Machado Traina; Caetano Traina Jr · comparação de métodos de indexação de dados multidimensionais
Produção artística
01 registro- 1992Fractais em MovimentoAgma Juci Machado Traina; Jan Franz W Slaets · São Carlos
Projetos
21 registrosProjetos de pesquisa e de desenvolvimento tecnológico registrados no Currículo Lattes.
- Em andamento2025 – presentePesquisa
Gestão Inteligente de Dados Multimodais de Saúde para Tomada de Decisão em Cenários de Big Data - IHealth-MD
O foco desde projeto de pesquisa Temático são os desafios de gerenciar e integrar dados de saúde multimodais para descoberta de conhecimento, visando extrair informações significativas de grandes volumes de dados de saúde complexos e diversos, criando, desenvolvendo e se beneficiando de técnicas de Big Data e Inteligência Artificial (IA) em Ciências da Saúde. Hoje, quase todas as atividades humanas geram e exigem o armazenamento e processamento de grandes quantidades de dados diversos e complexos, desde atividades científicas, acadêmicas e empresariais até atividades de lazer. As atividades relacionadas à saúde não são diferentes, pois produzem big data e podem se beneficiar de avanços tecnológicos para aprimorar os processos de tomada de decisão por meio das informações extraídas desses dados. Em um ambiente clínico, os registros eletrônicos de pacientes (REPs) são a base para o desenvolvimento de estratégias de extração de informações. Nesta proposta, pretendemos desenvolver e integrar algoritmos novos e escaláveis alimentados por métodos de engenharia de dados (DE) e IA. Esses algoritmos alavancarão grandes quantidades de REPs e repositórios de dados clínicos para reunir informações valiosas e significativas para a tomada de decisão. Os aspectos de comunicação e segurança de dados serão cuidadosamente considerados, garantindo a integridade e a privacidade dos dados, ao mesmo tempo em que permitirão a descoberta eficiente de conhecimento. O tamanho e a complexidade dos bancos de dados de REPs, que incluem texto estruturado e não estruturado, sinais, imagens, resultados de exames laboratoriais e dados genômicos, apresentam desafios significativos para o processamento. Esses desafios abrangem a aplicação de técnicas de análise e o desenvolvimento de ferramentas práticas e aplicações subsequentes. No entanto, esses bancos de dados também apresentam inúmeras oportunidades para desenvolver novos algoritmos e métodos capazes de exibir de modo inteligente informações relevantes relacionadas a pacientes individuais ou grupos de pacientes. Isso pode transformar REPs em plataformas mais eficazes, aprimorando o suporte para profissionais de saúde, otimizando aplicativos médicos e informando decisões governamentais estratégicas em linha com as demandas e benefícios do big data. Neste projeto, pretendemos abordar os desafios de gerenciar e integrar não apenas as informações, mas também o conhecimento de várias modalidades de dados de saúde, com foco inicial em doenças pulmonares, principalmente câncer de pulmão, bem como doenças cardiovasculares. Desenvolveremos métodos e algoritmos que serão finalmente materializados em uma plataforma modular, que será disponibilizada à comunidade de saúde.
Financiadores- Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de SP · AUXILIO_FINANCEIRO
EquipeAgma Juci Machado Traina (Responsável), Luís Fernando Cozin, Marco Antônio Gutierrez, José Fernando Rodrigues Junior, Richard Chbeir, Willian Dener de Oliveira, Joe Tekli, Rudinei Goularte +45 integrantes
- Em andamento2024 – presentePesquisa
Centro de Ciência de Dados para Estatísticas Públicas (CCDEP)
O Centro de Ciência de Dados em Estatísticas Públicas (CCDEP) buscará soluções para o seguinte problema de pesquisa: como usar dados de alta frequência para produzir indicadores de políticas públicas? Para tanto, o projeto será organizado em linhas de pesquisa com as seguintes características: produção de conhecimento novo para uma área de política pública específica; utilização de dados de alta frequência, em grande volume e estruturados ou não estruturados; parcerias com órgãos públicos, entidades não governamentais, empresas públicas e privadas para obtenção e análise de dados e disseminação de resultados. O Centro contemplará inicialmente cinco linhas de pesquisa: 1. MONITOR DE ATIVIDADE ECONÔMICA: Utilizar dados de alta frequência e registros administrativos digitais de órgãos públicos, concessionárias de serviços públicos e outras fontes para desenvolver indicadores, modelos preditivos e análises sobre a economia paulista de forma tempestiva e com desagregação geográfica. 2. MONITOR TRABALHO: Combinar bases de dados tradicionais com diferentes métodos de coleta (por telefone assistido, URA - "robô" e Internet) para produzir indicadores sobre ocupação e desocupação, formação e inserção no mercado de trabalho. 3. MONITOR MOBILIDADE: Desenvolver indicadores a partir de grandes conjuntos de dados de coleta automática (localização de usuários e bilhetagem) articulados a dados tradicionalmente usados em planejamento e gestão de transportes (pesquisas de origem e destino) e de infraestrutura e equipamentos georreferenciados. 4. MONITOR SEGURANÇA PÚBLICA: Elaborar novos indicadores e aperfeiçoar metodologias de construção de indicadores de eventos criminais, empregando novas fontes de dados e tecnologias de automatização de leitura, classificação e codificação de texto, como modelos de aprendizado de máquina. 5. TECNOLOGIAS EM ENGENHARIA DE DADOS E DE SOFTWARE: Desenvolvimento de tecnologias para análise de dados e geração de aplicativos apoiados em ciências de dados e em tecnologias facilitadoras atuais: estudo e desenvolvimento de aspectos teóricos; geração de algoritmos e tecnologias; construção, produção, suporte e hospedagem de aplicativos e suas ferramentas associadas. As atividades estarão voltadas para gerar soluções práticas de apoio às demais linhas de pesquisa do Centro. O Centro articula uma rede de parceiros, sendo o SEADE a instituição sede, agência com tradição em produzir estatísticas para as políticas públicas paulistas e para os cidadãos do Estado. Serão instituições de pesquisa (como USP, Unesp, FGV, UCL e Cebrap), entidades não governamentais (como Fórum Brasileiro de Segurança Pública) e órgãos governamentais (como secretarias de Estado, Metrô e CPTM). Novas parcerias poderão ser firmadas ao longo da existência do Centro. Técnicos do SEADE, pesquisadores das instituições parceiras e gestores públicos dos órgãos compõem uma equipe multidisciplinar do projeto. O plano de gestão de dados contempla a necessidade de uma infraestrutura computacional de armazenamento, processamento e disseminação de dados com flexibilidade e capacidade para processos de ETL (extração, transformação e carregamento) e construção de modelos de machine learning, além de recursos computacionais de alta capacidade e softwares (livres e proprietários). Os resultados das pesquisas serão compartilhados entre os parceiros e disseminados em: dashboards, repositórios, APIs; boletins analíticos; artigos científicos; conteúdos audiovisuais; e eventos. Os canais de comunicação oficiais (como website, redes sociais, assessoria de comunicação) divulgarão os conteúdos para públicos de diferentes perfis, principalmente órgãos de governo, que serão beneficiários diretos do novo conhecimento produzido pelo Centro.
Financiadores- Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo · AUXILIO_FINANCEIRO
EquipeAgma Juci Machado Traina (Responsável), Caetano Traina Junior, Kelly Rosa Braghetto, Carlos Eduardo Torres Freire, Alvaro Augusto Comin, Eduardo de Rezende Francisco, Paulo Roberto Miranda Meirelles, Renato Sérgio de Lima +12 integrantes
- Concluído2020 – 2023Pesquisa
Analisando Dados Complexos Vinculados a COVID-19 para Apoio à Tomada de Decisão e Prognóstico
Este projeto de pesquisa visa propor, explorar e desenvolver novos métodos e algoritmos a serem usados em processos de tomada de decisão para diagnóstico médico e prognóstico de pacientes no contexto da COVID-19. Estes métodos e algoritmos serão instanciados em sistemas e aplicativos que serão disponibilizados à comunidade científica para apoiar de modo rápido e preciso tal processo de tomada de decisão. Os desafios a serem sobrepujados começam na montagem de bases de dados e imagens provenientes de plataformas distintas e muitas vezes incompletas, e à aplicação da técnica de radiômica sobre imagens de Raio-X (RX) e tomografia computadorizada (TC), com a premissa de que características quantitativas e qualitativas massivas sobre imagens de RX podem trazer a informação necessária ao diagnóstico de COVID-19, do mesmo modo que a TC fornece. A vantagem dessa abordagem que será investigada é o custo menor e a maior disponibilidade de RX, permitindo que mais pacientes sejam beneficiados pelos resultados dessa proposta. Além de disponibilizar material curado e consistente para pesquisas e avanços na área de COVID-19. Além disso, bases de dados e imagens consistentes para pesquisa serão disponibilizadas para a comunidade da área.
Financiadores- Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo · AUXILIO_FINANCEIRO
EquipeAgma Juci Machado Traina (Responsável), Caetano Traina Jr, Marco Antônio Gutierrez, José Fernando Rodrigues Junior, Éderson Antônio Gomes Dorileo, Willian Dener de Oliveira, Elaine Parros Machado de Sousa, Mirela Teixeira Cazzolato +20 integrantes
- Concluído2018 – 2022Pesquisa
Recuperação Perceptual de Imagens por Conteúdo e Mineração de Imagens com Suporte de Radiômica para Sistemas de Apoio a Diagnóstico
Fornecer subsídios para tomada de decisões que levem o especialista médico a elaborar diagnósticos mais precisos, com maior rapidez e segurança, certamente traz benefícios para o tratamento e recuperação dos pacientes. Esse projeto de pesquisa visa atuar nessa direção, com o desenvolvimento de novos algoritmos e técnicas de recuperação de imagens por conteúdo para o processamento de consultas por similaridade, que atendam à percepção de similaridade do usuário. Por meio da integração da abordagem radiômica, que integra um volume importante de dados quantitativos, que aliados a dados qualitativos do paciente, que se processados apropriadamente, podem trazer novos impulsos positivos à área de computação em sistemas médicos.Os resultados desta pesquisa trarão impactos relevantes tanto à área de ciências de computação: por meio de algoritmos de extração de características de imagens e dados complexos de exames médicos, como algoritmos de armazenagem e recuperação eficiente desses dados em bases de dados complexos; quanto à área de medicina, permitindo a construção de sistemas de apoio ao diagnóstico (CAD Computer Aided Diagnosis) mais precisos e eficientes. O maior beneficiário será o paciente, que receberá tratamentos mais confiáveis, seguros, e mais celeremente.
EquipeAgma Juci Machado Traina (Responsável), Caetano Traina Jr, Marcela Ribeiro Xavier, José Fernando Rodrigues Jr., Daniel Y. T. Chino, Willian Dener de Oliveira, Jonathan S Ramos, Glauco Vitor Pedrosa +9 integrantes
- Concluído2017 – 2024Pesquisa
Mining, Indexing and Visualizing Big Data in Clinical Decision Support Systems (MIVisBD)
Projeto Temático envolvendo 3 instituições nacionais e 8 instituições internacionais.
Financiadores- Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo · AUXILIO_FINANCEIRO
EquipeAgma Juci Machado Traina (Responsável), Caetano Traina Jr, Christos Faloutsos, Renato Bueno, Marco Antônio Gutierrez, Solange Oliveira Rezende, André Guilherme Ribeiro Balan, José Fernando Rodrigues Jr. +44 integrantes
- Em andamento2015 – presentePesquisa
Desenvolvimento de Técnicas para Buscas por Similaridade em Sistemas de Gerenciamento de Bases de Dados Complexos Relacionais
Os Sistemas de Gerenciamento de Bases de Dados (SGBD) baseados na Teoria Relacional foram desenvolvidos para atender às necessidades de armazenagem e recuperação de grandes volumes de dados representados por valores numéricos, datas e pequenas cadeias de caracteres, chamados genericamente ``dados escalares''. Com a evolução da tecnologia da informação, vem se tornando necessário organizar, armazenar e recuperar outros tipos de dados, a que nos referimos como ``dados complexos'', tais como imagens, vídeo, séries temporais, sequências genômicas, etc. As consultas por identidade ou por relação de ordem (RO), úteis para dados escalares, não são adequadas para dados complexos. Para eles, as consultas por similaridade têm sido a opção mais estudada, mas a sua disponibilidade em SGBD é ainda bastante restrita. Este projeto visa abordar a incorporação de recursos para recuperação de dados complexos por similaridade em SGBD Relacionais, desenvolvendo técnicas que cubram de maneira abrangente as principais necessidades dos módulos que constituem um SGBD, incluindo: a) integração da representação de consultas por similaridade em uma extensão da linguagem SQL; b) definição unificada dos operadores algébricos por similaridade segundo a teoria relacional, como operadores interoperáveis com os tradicionais; c) desenvolvimento de técnicas para otimização lógica e física dos planos de execução de consultas, e d:) desenvolvimento de técnicas para indexação e recuperação eficiente combinando operações de busca por similaridade, por identidade e por RO. O conhecimento e a tecnologia gerados poderão ser aplicados a muitas áreas de atividade humana, mas no projeto serão validadas em aplicações de apoio ao diagnóstico em medicina e em estudos de modelos climáticos, dando continuidade às atividades que já vem sendo realizadas pelo GBdI. Assim, além do grande potencial de inovação em tecnologia da informação inerente ao projeto, sua aplicação nessas áreas trará benefícios imediatos a toda a população.
Financiadores- Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo · AUXILIO_FINANCEIRO
EquipeAgma Juci Machado Traina, Caetano Traina Jr (Responsável), Ives Rene Venturini Pola, Elaine Parros de Sousa, José Fernando Rodrigues Jr., Luciana Alvim Romani, Alceu Ferraz Costa, Robson L. F. Cordeiro +8 integrantes
- Concluído2014 – 2018Pesquisa
Mineração de Imagens e Recuperação Perceptual de Imagens por Conteúdo para Sistemas de Apoio ao Diagnóstico Médico
A proposta deste projeto consiste em promover a aproximação dos sistemas de recuperação de imagens por conteúdo (CBIR) à realidade médica e explorar sua capacidade em Sistemas de Auxílio ao Diagnóstico (Computer-Aided Diagnosis) por imagens integrando essas duas novas abordagens: percepção do especialista e perfil do usuário no processo de recuperação e de mineração de imagens médicas. Para isso, serão disponibilizadas aos sistemas CBIR técnicas e ferramentas que permitam incorporar a perspectiva de análise de imagens e dados do ponto de vista do conhecimento do especialista, diminuindo o gap semântico. A inclusão da percepção do especialista e dos perfis dos usuários na construção de ferramentas CBIR irá aproximar essa tecnologia do especialista médico, quebrando a barreira entre a ciência médica e a ciência da computação.
EquipeAgma Juci Machado Traina (Responsável), Caetano Traina Jr, Renato Bueno, Elaine Parros de Sousa, Marcela Xavier Ribeiro, José Fernando Rodrigues Jr., Pedro Bugatti, Marcelo Ponciano da Silva +12 integrantes
- Concluído2014 – 2016Pesquisa
AgroComputing.net - Digital Infrastructure and Novel Computational Methods for Analyzing and Mining Climate and Remote Sensing Large Databases to improve Agricultural Monitoring and Forecasting
This project aims at developing a computational platform to integrate climatic and remote sensor data obtained from several databases; and to propose computational methods to consist data, to fill absent data in the series, to identify new and useful patterns in order to improve the agricultural yield monitoring and forecasting models. The challenge for Computer Science comprehends the development of new algorithms to process, store, mine and analyze vast volumes of data (big data), as well as to propose a mechanism to provide autonomy for agricultural meteorologists to access data with parameterized query, to define new research needs, and to reformulate, intercompare and integrate agroenvironmental models. On the other hand, the scientific advance in Agrometeorology depends on a consistent, reliable and complete climatic database with spatial and temporal density (regular grades) for the whole country in order to generate models that can better support decisions in the agricultural business. Considering the climate change scenarios, the integration between computer scientists and agrometeorologists becomes essential, especially due to the increased amount of data generated by simulations of climate models, and from ground-based meteorological stations and remote sensors. In this context, improving computational methods for visual analytics, data mining, pattern recognition and visualization related to scientific workflow will allow upgrading models to analyze data in the current and future agroclimatic perspective. In an effort to better understand Climate Change and its impact on Agriculture, investigators of Embrapa Agricultural Informatics, ICMC-USP (São Carlos), Cepagri/UNICAMP, CPTEC/INPE, UFSCar, UFABC e UFU have been working together for several years, generating important contributions in both Computer Science and Agrometeorology fields. The validation of results will be done with economically and socially relevant agriculture crops in Brazil, such as sugar cane and coffee. Workshops and a virtual environment will be used to facilitate and support the integration, collaboration and communications among researchers in the project.
Financiadores- Instituto Microsoft Research-FAPESP de Pesquisas em TI · AUXILIO_FINANCEIRO
EquipeAgma Juci Machado Traina, Caetano Traina Jr, Humberto L Razente, Elaine Parros de Sousa, Marcela Xavier Ribeiro, Luciana Alvim Romani (Responsável), Maria Camila Nardini Barioni, Ana Maria H. Avila +5 integrantes
- Concluído2013 – 2015Pesquisa
XML-based Geo-Climate Approximate Pattern Search and Pattern Discovery in Large Databases (CAPES SticAMSUD)
The goal of our project is to develop efficient techniques for i) approximate pattern search, and ii) approximate pattern discovery of spatio-temporal climate (and related agronomic) data in large databases. On one hand, the huge amount of heterogeneous geo-climate data originating from diverse sources (e.g., climate forecasting models, satellite imagery, GISs) underlines an increasing need in interoperability, and efficient data exchange and retrieval. On the other hand, XML has been gaining importance as the backbone for scientific data description formats (e.g., XSIL, XDF, CML, etc.) as well as geographic data (namely GML ? Geography Mark-up Language), and complex multimedia data descriptions (SVG, X3D, etc.) on the Web. Hence, providing XML-based solutions to handle geo-climate (and related) data seems a promising step toward achieving highly flexible and extensible solutions for geo-climate data mining systems. By combining the efforts of researchers from the LE2I-CNRS laboratory, Dijon, France (specialized in XML similarity-related studies), ICMC-USP laboratory, Sao Carlos, Brazil (specialized in similarity search, access methods and mining of complex data), II-FCM-UNMSM laboratory, Lima, Peru (specialized in Semantic Web technologies as XML, RDF, OWL and JADE), SI-UPC laboratory, Lima, Peru (specialized in information system methods and techniques), and GRyDs-USB laboratory in Caracas-Venezuela (specialized in semantic web technologies), we aim at: i) investigating the use and/or combination of XML-based formats to describe agronomic/meteorological measurements, and related geo-climate data, ii) investigating the use of domain specific knowledge bases (thesauri, taxonomies and/or ontologies) to handle the semantics of geo-climate and related agronomic data, iii) introducing dedicated XML-based similarity measures, considering both data structure (hierarchical organization) and semantics (meaning), for approximate geo-climate data search and pattern discovery,
Financiadores- CAPES - Centro Anhanguera de Promoção e Educação Social · AUXILIO_FINANCEIRO
EquipeAgma Juci Machado Traina (Responsável), Caetano Traina Jr, Monica Ribeiro Porto Ferreira, Luciana Alvim Romani, Richard Chbeir, Joe Tekli, Nestor Adolfo Mamani Macedo, Carlos Arturo Raymundo Ibañez +4 integrantes
- Em andamento2013 – presenteDesenvolvimento
RESCUER - Reliable and Smart Crowdsourcing Solution for Emergency and Crisis Management - EU
Disasters occurring during large-scale events and in industrial areas may have a huge impact on human lives, property, and the environment. Fast reaction is vital in order to avoid physical damages as well as damages to the public image of the involved organisations. As a result several measures are taken and periodically bolstered to ensure effective and efficient emergency and crisis management. The use of a software system is among those measures, together with staff assignments to a command centre, trainings, and (virtual) simulation exercises. The main challenge for a command centre is to quickly obtain contextual information about the emergency situation in order to make the right decisions. Late decisions or decisions based on inaccurate information have a great potential for causing more damages. As mobile devices are widely used and in many cases connected to the Internet, crowdsourcing information and mobile technologies offer great potential for addressing this challenge. However, existing crowdsourcing information based platforms for emergency and crisis management present several shortcomings. In particular and more importantly, they are neither tailored for use in mobile devices nor for use close to the place of an incident, when people are still under stress. Moreover, there is a lack of resources for automatic analysis of the collected multimedia data. RESCUER aims at developing a smart and interoperable computer platform for using crowdsourcing information mashed up with open data to support emergency and crisis management. The RESCUER platform will be capable of 1) gathering crowdsourcing information in real-time by providing user interaction mechanisms especially developed to be used in emergency situations, 2) greatly improving situational awareness in a command centre in a timely manner, through novel multimedia data analysis methods and effective visualisation and manipulation mechanisms, and 3) semi-automatically providing official and accurate announcement of emergencies to the affected community and general public through an efficient approach for deriving specific documents from generic ones. Furthermore, RESCUER will support ad-hoc communication. Both European and Brazilian industries will benefit from the project results, several of which have the potential for becoming at least de facto standards. As industrial areas periodically simulate incidents for training purposes, the RESCUER platform can be experimentally validated before the Olympic Summer Games in 2016.
Financiadores- Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico · AUXILIO_FINANCEIRO
EquipeAgma Juci Machado Traina, Manoel Gomes de Mendonça Neto (Responsável), José Fernando Rodrigues Jr., Letrícia Pereira Soares Avalhais, Daniel Y. T. Chino, Willian Dener de Oliveira, Jonathan S Ramos, Mirela Teixeira Cazzolato +4 integrantes
- Concluído2012 – 2014Pesquisa
Processamento Perceptual de Consultas por Similaridade Integrando Perfil do Especialista em Imagens Apoiando o Diagnóstico Médico
Este projeto visa o desenvolvimento de um sistema robusto de apoio ao diagnóstico por imagens (CliniCAD) que busca a aproximação dos sistemas CBIR à realidade médica por meio da inclusão de parâmetros perceptuais do especialista médico nas etapas de processamento de imagens, extração de características, consulta por similaridade e a etapa opcional de Realimentação por Relevância. Tais parâmetros são obtidos por meio de entrevistas com os especialistas e acompanhamento das atividades de análise e laudo dos exames. Serão utilizados perfis dos especialistas de modo a tornar o sistema mais próximo do que o especialista busca, conseguindo desse modo contornar o problema de lacuna semântica (?semantic gap?). Serão desenvolvidas técnicas de mineração de imagens e de textos (para integrar os laudos às imagens), e serão utilizadas técnicas de visualização de informação como uma ferramenta de apoio à calibração dos algoritmos e métodos implementados. Os resultados serão avaliados por meio de um protótipo que será utilizado no Centro de Ciências de Imagens e Física Médica do Hospital das Clínicas de Ribeirão Preto. O sistema será disponibilizado para utilização pela comunidade da área.
Financiadores- Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico · AUXILIO_FINANCEIRO
EquipeAgma Juci Machado Traina (Responsável), Caetano Traina Jr, Renato Bueno, Paulo Mazzoncini de Azevedo Marques, Elaine Parros M de Sousa, Carolina Yukari Veludo Watanabe, Ives Rene Venturini Pola, Marcela Xavier Ribeiro +9 integrantes
- Em andamento2009 – 2011Pesquisa
Consultas por Similaridade em Imagens Médicas: Da Viabilidade Clínica à Prática do Auxílio ao Diagnóstico Médico: Aplicações em um Hospital Escola - 476520/2009-6 CNPq - Universal - Edital MCT/CNPq 14/2009
Os sistemas de informação para medicina têm por objetivo disponibilizar a informação necessária ao médico de modo rápido e preciso visando assim melhorar a qualidade do cuidado e tratamento de pacientes. Em radiologia, a aplicação de técnicas de recuperação de imagens por conteúdo (Content-based Image Retrieval- CBIR) incorporadas aos Sistemas de Comunicação e Armazenamento de Imagens (Picture Archiving and Communication Systems - PACS) proporciona um avanço na recuperação de imagens armazenadas, antes vinculadas a um identificador do paciente ou de um exame. Com essa nova abordagem as buscas passam a ser realizadas por meio de comparações diretas entre imagens por meio de seus descritores pictóricos, possibilitando efetuar buscas por similaridade e abrindo novos caminhos para utilização do computador e das imagens médicas em atividades de auxílio ao diagnóstico. Este projeto visa permitir integrar a percepção do especialista do que é similar, no processo de recuperação de imagens baseada em seu conteúdo. Assim, deve-se diminuir um dos principais problemas dos sistemas CBIR, quando aplicados em ambientes de apoio ao diagnóstico (Computer-Aided Diagnosis - CAD), que é a lacuna semântica (semantic gap). Tal lacuna origina-se do fato que medidas de similaridade sobre os descritores das imagens, baseados na distribuição de cores/níveis de intensidade, textura e formas, em geral não possuem correlação direta com a semântica subjetiva humana. A idéia principal é desenvolver um mecanismo automático de otimização de consulta por similaridade baseado em parâmetros de percepção levantados pelos próprios radiologistas. Esse método fará uma escolha automática de quais os parâmetros perceptuais deverão ser considerados relevantes no processamento da consulta. Esses parâmetros serão detectados automaticamente, através de mineração de palavras-chave nas justificativas do pedido de exame, dos dados contidos no cabeçalho DICOM das imagens sob processamento
Financiadores- Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico · AUXILIO_FINANCEIRO
EquipeAgma Juci Machado Traina (Responsável), Caetano Traina Jr, Paulo Mazzoncini de Azevedo Marques, Elaine Parros M de Sousa, Joaquim Cézar Felipe, André Guilherme Ribeiro Balan, Marcela Xavier Ribeiro, José Fernando Rodrigues Jr. +9 integrantes
- Em andamento2009 – 2012Pesquisa
AgroDataMine: Desenvolvimento de Métodos e Técnicas de Mineração de Dados para apoiar Pesquisas em Mudanças Climáticas com Ênfase em Agrometeorologia
O aquecimento global e suas conseqüências trazem novos desafios para os pesquisadores do Século XXI. Apesar da comunidade científica não ter dúvidas sobre o aquecimento do planeta, é premente a identificação das causas do aumento da temperatura média global, bem como a quantificação desse aquecimento e suas consequências para os ecossistemas. Modelos matemáticos e estatísticos têm sido empregados para analisar os possíveis cenários futuros e consequentemente uma grande quantidade de dados tem sido gerada. Além disso, o avanço tecnológico tem propiciado melhorias nos diversos sensores utilizados para medições de dados climáticos e de imageamento da superfície terrestre, contribuindo para o aumento na quantidade e complexidade dos dados gerados. As pesquisas envolvendo grande volume e diversidade de dados remete a dois dos Grandes Desafios da Computação: a gestão da informação em grandes volumes de dados e a modelagem computacional de sistemas complexos. Neste contexto, este projeto de pesquisa propõe investigar e desenvolver técnicas e métodos computacionais para analisar os conjuntos de dados complexos utilizados por meteorologistas e agrometeorologistas, para auxiliá-los na pesquisa de impactos das mudanças climáticas na agricultura brasileira. Em linhas gerais, o objetivo deste projeto é desenvolver métodos para analisar os resultados dos modelos regionais de prognóstico de mudanças climáticas e compará-los com medidas reais coletadas pelas estações de superfície, a fim de avaliar a qualidade dos dados gerados e dar subsídios para a calibração dos modelos de previsão. Adicionalmente, pretende-se desenvolver novos métodos para filtrar, analisar e extrair padrões da associação entre dados climáticos e dados extraídos de sensores remotos para auxiliar nas pesquisas agrícolas. O projeto embasa-se na parceria de pesquisadores do Grupo de Bases de Dados e Imagens (GBdI) do ICMC-USP, da Embrapa Informática Agropecuária, do Centro de Pesquisas Meteorológicas e Climáticas
Financiadores- Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo · AUXILIO_FINANCEIRO
- Instituto Microsoft Research-FAPESP de Pesquisas em TI · AUXILIO_FINANCEIRO
EquipeAgma Juci Machado Traina (Responsável), Caetano Traina Jr, Renato Bueno, Humberto Luiz Razente, Ives Rene Venturini Pola, Elaine Parros de Sousa, Marcela Xavier Ribeiro, José Fernando Rodrigues Jr. +18 integrantes
- Concluído2008 – 2009Pesquisa
MICAD - Mineração de Imagens Médicas por Conteúdo apoiando CAD: Aplicações em um Hospital Escola
O volume de dados e imagens gerados nos hospitais e clínicas médicas cresce a um ritmo cada vez mais acelerado, devido ao barateamento do custo de coletar e armazenar tais informações. O diagnóstico baseado em imagens pode ser grandemente aprimorado se o especialista da área médica puder recuperar de modo rápido e pertinente informações que o apoiem na tomada de decisão. Por exemplo, recuperar casos parecidos com o que está sendo analisado, verificar o inter-relacionamento entre itens de dado e tratamentos/resultados alcançados, bem como visualizar num piscar de olhos a evolução de casos semelhantes e já diagnosticados por colegas especialistas. Este projeto visa o desenvolvimento de técnicas e algoritmos que constituirão o arcabouço teórico e prático para o desenvolvimento de ferramentas que possibilitem compreender o inter-relacionamento entre as características das imagens (que as representam) e seu significado semântico, de modo a obter os dados mais relevantes para serem utilizados para responder consultas por similaridade para apoiar o processo de decisão na elaboração de diagnósticos médicos. Os resultados alcançados por este projeto serão aplicados a sistemas de arquivamento e recuperação de imagens médicas (PACS), permitindo alcançar um patamar mais elevado em tais sistemas. Ou seja, sistemas PACS que já organizam as imagens e dados e pacientes, passarão a apoiar a tomada de decisão para suporte ao diagnóstico médico por imagens.
Financiadores- Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico · AUXILIO_FINANCEIRO
EquipeAgma Juci Machado Traina (Responsável), Caetano Traina Jr, Renato Bueno, Paulo Mazzoncini de Azevedo Marques, Elaine Parros M de Sousa, André Guilherme Ribeiro Balan, Humberto Luiz Razente, Marcela Xavier Ribeiro +11 integrantes
- Concluído2006 – 2009Pesquisa
MIRVisIM - Mineração, Indexação, Recuperação e Visualização de Dados em Sistemas de Arquivamento de Imagens Médicas
Este projeto visa propor e implementar novas técnicas e ferramentas que permitam extrair o conhecimento inerente a exames médicos por imagens, aumentando a funcionalidade de um sistema PACS em desenvolvimento (cbPACS). O ferramental a ser desenvolvido depende de quatro vertentes de pesquisa, desde o suporte básico do desenvolvimento de técnicas de extração de características de imagens de modo a propiciar sua recuperação por conteúdo e efetuar consultas por similaridade; o desenvolvimento e aprimoramento de métodos de acesso eficientes para processar tais consultas de modo rápido e efetivo; o desenvolvimento de técnicas de mineração de dados através de regras de associação e seleção de atributos. Todas as vertentes anteriores serão suportadas por técnicas de visualização de dados que serão propostas e implementadas visando auxiliar o desenvolvimento e afinamento dos algoritmos das vertentes anteriores. A recuperação de imagens por conteúdo vale-se da extração de características das imagens, porém as características extraídas individualmente têm pouco significado de forma isolada para a busca de imagens específicas. Assim, para que as consultas por similaridade recuperem imagens significativas em aplicações destinadas ao usuário final, é necessário que as consultas especifiquem detalhadamente como as características devem ser comparadas, integrando diversas características na mesma consulta. Este projeto objetiva também disponibilizar ferramental para auxiliar o preparo das consultas que serão embutidas em aplicativos para o usuário final. Para atingir tal meta, o projeto deve explorar a utilização de maneira integrada de quatro recursos: sistemas de bancos de dados relacionais; indexação de dados em domínios métricos; consultas por similaridade; e mineração de imagens.
Financiadores- Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo · AUXILIO_FINANCEIRO
EquipeAgma Juci Machado Traina (Responsável), Caetano Traina Jr, Renato Bueno, Paulo Mazzoncini de Azevedo Marques, Elaine Parros M de Sousa, Joaquim Cézar Felipe, Natália Abdala Rosa, Gisele Busichia Baioco +15 integrantes
- Concluído2004 – 2007Pesquisa
Consultas por Similaridade em um Sistema de Arquivamento de Imagens Médicas: Indexação, Recuperação e Visualização das Informações através de seu Conteúdo
Quando é necessário manipular informações complexas e volumosas, como são as imagens de exames médicos, um dos problemas a serem tratados é o de como armazenar e recuperar tais informações de maneira rápida e precisa. Uma técnica usual é a extração de características (parâmetros) da imagem, que idealmente possibilitem a identificação da mesma de forma inequívoca, ou com a menor ambiguidade possível. Muitas vezes esse processo é baseado na redução da dimensionalidade dos dados: parâmetros são extraídos das imagens e a seguir utilizados para indexá-las agilizando sua busca e recuperação. As estruturas de indexação são ferramentas fundamentais nos sistemas de gerenciamento de bancos de dados, pois habilitam os sistemas gerenciadores de dados a armazenar e recuperar eficientemente os dados de interesse dentre um grande volume de dados. Este projeto propõe construir um Subsistema de Recuperação de Imagens Baseada em Conteúdo (SiRIC), utilizando duas grandes frentes de atuação. Esse subsistema servirá como base para um sistema de armazenagem e recuperação de imagens médicas que será utilizado no núcleo de um protótipo de um sistema PACS, chamado cb-PACS. A primeira frente de atuação corresponde à construção do módulo de indexação de imagens, o qual utilizará uma estrutura de indexação métrica adequada. Para isso iremos utilizar a Slim-tree, devido às suas características de ser dinâmica e possibilitar a otimização de acessos a disco necessários para responder consultas por similaridade. Um tratamento adicional, para minimizar também o cálculo de distâncias na Slim-tree, deverá ser realizado no escopo do projeto proposto. A segunda grande frente de atuação refere-se ao desenvolvimento do módulo de extração de características (parâmetros) das imagens a serem indexadas.
Financiadores- Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico · AUXILIO_FINANCEIRO
EquipeAgma Juci Machado Traina (Responsável), Caetano Traina Jr, Joaquim Cézar Felipe, Carolina Yukari Veludo Watanabe, Joselene Marques, Marcela Ribeiro Xavier, Gisele Busichia, Elaine Parros de Sousa +3 integrantes
- Em andamento2002 – 2004Pesquisa
VisIR - Indexação, Recuperação e Visualização de Dados Multimídia em um Sistema de Arquivamento de Imagens Médicas
O objetivo direto desse projeto é o desenvolvimento de um ferramental teórico e prático para a análise e indexação de imagens, que permita a visualização das análises feitas sobre os conjuntos de imagens de forma multi-modal, isto é, segundo abordagens diferentes (por atributo em linhas, por pixels e cores, por projeção e mapeamento). É importante ressaltar desde o início que os processos de visualização a que se refere este projeto correspondem à visualização dos conjuntos de imagens, seus relacionamentos, agrupamentos, etc., e não à visualização de cada imagem individual (por exemplo de um exame médico). A recuperação de imagens por conteúdo vale-se da extração de características das imagens, porém as características extraídas individualmente têm pouco significado de forma isolada para a busca de imagens específicas. Assim, para que as consultas recuperem imagens significativas em aplicações destinadas ao usuário final, é necessário que as consultas especifiquem detalhadamente como as características devem ser comparadas, integrando diversas características na mesma consulta. Este projeto tem por objetivo a disponibilidade desse ferramental para auxiliar o preparo das consultas que serão embutidas em aplicativos para o usuário final. Para atingir esse objetivo, o projeto deve explorar a utilização de maneira integrada de quatro recursos: sistemas de bancos de dados relacionais; indexação de dados em domínios métricos; consultas por similaridade; e mineração visual interativa de dados. Como a idéia é integrar a capacidade de processamento dos computadores com a capacidade humana de interpretação de informações representadas graficamente, para "afinar" as consultas feitas sobre conjuntos de imagens, serão utilizadas as consultas por similaridade, apoiadas por estruturas de indexação métricas (aproveitando a capacidade de processamento dos computadores), juntamente com operaçtes de seleção visual, onde o usuário interage com visualizações geradas.
Financiadores- Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo · AUXILIO_FINANCEIRO
EquipeAgma Juci Machado Traina (Responsável), Caetano Traina Jr, Josiane Maria Bueno, Fábio Jun Takada Chino, José Fernando Rodrigues Junior, Mário Jorge Beloti Avelino
- Concluído2001 – 2003Pesquisa
Sistemas de Indexação de Imagens para Busca por Conteúdo: Aplicações em Imagens Médicas
Os chamados Sistemas de Informaçtes Médicas (SIM) armazenagem informaçtes textuais (nome, idade, tratamento, etc.) e em alguns casos permitem a associaçno das informaçtes textuais com informaçtes gráficas, provenientes de exames como Raio-X, tomografia (CT ou RM), ultrasson, etc. Recentemente, com a introduçno dos sistemas PACS (Picture Archiving and Communication Systems), cresceu o interesse por integrar num sistema só todas as informaçtes dos pacientes (textos, imagens, gráficos temporais, etc). Em sistemas PACS pode-se recuperar também informaçtes baseadas apenas no conteúdo das próprias informaçtes. Por exemplo, pode-se querer recuperar "todas as imagens obtidas em exames de CT de coraçno similares a uma imagem dada". Nesse caso, o cruzamento das informaçtes é independente das chaves de busca tradicionais baseadas em informaçtes numéricas e textuais, as quais associam exames e pacientes em um SIM tradicional. A facilidade de recuperaçno de dados baseada em seu conteúdo é um dos pontos altos dos sistemas PACS. Um sistema PACS deve entno ser capaz de responder consultas por similaridade, isto é, questtes do tipo: 'quais sno as 10 imagens mais próximas de uma dada imagem' ou 'quais sno as imagens que diferem de até 5 unidades de uma imagem padrno'. Note que tanto as imagens quanto a funçno de dissimilaridade (distância) entre elas devem ser definidas. O presente projeto trata do desenvolvimento de um dos módulos principais de um sistema PACS, que é o Sub-Sistema de Recuperaçno de Imagens por Conteúdo (SiRIC). Esse sub-sistema integra um módulo gerenciador de indexaçno e um módulo de extraçno de parâmetros de imagens, os quais serno utilizados para o armazenamento e a recuperaçno das imagens no banco de dados da aplicaçno.
Financiadores- Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico · AUXILIO_FINANCEIRO
EquipeAgma Juci Machado Traina (Responsável), Caetano Traina Jr, Fábio Jun Takada Chino, Roberto Figueira Santos Filho, Myrian Renata Barros Araújo, Natália Abdala Rosa, Camilo Yamauchi Campo, Luis Marcelo Bortolotti
- Concluído2000 – 2005Pesquisa
IMiMD - Indexing and Data Mining in Multimedia Databases
Este projeto envolve cooperação científica entre instituições de pesquisa brasileiras coordenadas pelo Instituto de Ciências Matemáticas e Computacionais - ICMC da USP em São Carlos e a Carnegie Mellon University - CMU. A duração do projeto é de 4 anos, e pretende enfocar dois problemas relacionados: a indexação de informações multimídia, tratadas como conjuntos de dados em espaços métricos; e o desenvolvimento de técnicas de ?data mining ? para a visualização e descoberta de padrões nesses conjuntos. Uma consulta típica envolvendo esses tipos de dados poderia ser: ?encontre todos os rostos de pessoas que estejam dentro de determinado grau de similaridade de um rosto dado?. Já uma consulta cuja resposta necessita o emprego de técnicas de data mining seria: ?encontre todos os pares de impressões digitais dentro de determinado grau de similaridade?. 	A função de dissimilaridade é específica para o domínio de dados em questão, e sempre que ela for comutativa e respeitar a desigualdade triangular, o conjunto de dados será considerado em um espaço métrico. Técnicas já desenvolvidas pelo coordenador americano mostraram como mapear objetos de um espaço métrico para um espaço vetorial de características (?features?). Assim, espaços vetoriais (ou espaciais), métricos e espaços multimídia são conceitos estreitamente ligados. Para as tarefas de indexação dos dados multimídia, este projeto propõe: prover técnicas de estimativa de seletividade e de acessos a disco para responder esses tipos de consultas; e tornar mais eficientes as estruturas de indexaçno em espaços métricos existentes, melhorando os algoritmos e estruturas de dados empregadas. Nosso otimismo em atingir esses objetivos são baseados em trabalhos conjuntos já realizados, que indicaram que a distribuição de distâncias em espaços métricos e espaciais frequentemente segue uma razão de potíncias. Essa é a primeira e ainda única evidência de alguma regularidade observada em conjuntos de dados métricos reais.
Financiadores- Universidade de São Paulo · COOPERACAO
- Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico · AUXILIO_FINANCEIRO
EquipeAgma Juci Machado Traina, Caetano Traina Jr (Responsável), Josiane Maria Bueno, Mauro Biajiz, João E Ferreira, Maria Camila Nardini Barione, Humberto L Razente, Roberto Figueira Santos Filho +10 integrantes
- Concluído1998 – 2002Pesquisa
Midia Lab
MIDIALAB possui três áreas básicas de pesquisa: Animação, Edição Digital e Multimídia. A área de Edição Digital possui um papel central para todas as pesquisas científicas que serão realizadas, e a grande vantagem do MIDIALAB é sua capacidade de, através da área de Edição Digital, integrar todas as demais áreas. Sendo assim, toda administração e "coordenação" dos projetos de pesquisa deverá ocorrer a partir da área de Edição Digital. O modelo Single Master "Domain" Model foi adotado. Neste modelo temos 03 (três) "Domains" de recursos ("Resource Domains"): "Domain" Multimídia, "Domain" Ensino e "Domain" Animação. O "Master Domain" é representado pelo "Domain" Edição Digital (para edição, montagem e administração). As setas representam as relações de trust, cuja função principal é permitir que os usuários de um determinado "Domain" possam acessar recursos de outros "Domains". Este tipo de relação é implementada pelo administrator através de ferramentas administrativas do Windows NT ("User Manager for Domains" - "Trust Relationship"). Assim, por exemplo, um pesquisador poderá gerar uma sequência de animação em equipamentos do "Domain" Animação e acessar esta sequência a partir de estações do "Domain" Edição Digital para pós-produção acrescentando a trilha sonora. Caberá ao administrador do "Domain" manter a integridade da estrutura do modelo, facilitando a utilização cotidiana de aplicativos e consequentemente o desenvolvimento dos projetos de pesquisa. Cabe salientar que devido a distribuição de recursos e as características interdisciplinares dos projetos de pesquisa, um determinado projeto poderá aparecer em mais de um "Domain".
Financiadores- Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo · AUXILIO_FINANCEIRO
EquipeAgma Juci Machado Traina, Eduardo Leone (Responsável), Marcello G. Tassara, Heitor Capuzo, Ricardo Defaveri Murer, Daniela Troya M. Murer
- Concluído1998 – 2000Pesquisa
Aplicações de Informática para Engenharia
Desenvolvimento de técnicas de apoio à Engenharia baseadas em processamento de imagens e visão computacional.
Financiadores- Financiadora de Estudos e Projetos · AUXILIO_FINANCEIRO
EquipeAgma Juci Machado Traina (Responsável), Fábio Jun Takada Chino, Adilson Gonzaga
Orientações
- Mestrado
desde 2025Lucas Basolli Borsatto · OrientaçãoFusão multimodal para auxílio ao diagnóstico médico: explicabilidade e análise de robustez de modelos profundos com dados faltantes · Ciências de Computação e Matemática Computacional · Instituto de Ciências Matemáticas e de Computação - USPEm andamento - Mestrado
desde 2025Pedro Augusto Luiz · OrientaçãoEstimativa da Confiabilidade em Diagnóstico Assistido por IA com Base na Similaridade de Biomarcadores · Ciências de Computação e Matemática Computacional · Instituto de Ciências Matemáticas e de Computação - USPEm andamento - Iniciação Científica
desde 2025Matheus Rodrigues Ferreira · OrientaçãoBases de Dados para Análise de Métodos em Sistemas de Apoio ao Diagnóstico Baseados em Imagens Médicas por Conteúdo no Contexto de Big Data - Parte 2 · Bacharelado em Ciências de Dados · Instituto de Ciências Matemáticas e de Computação - USP · Bolsa Universidade de São PauloEm andamento - Mestrado
desde 2024Thiago Fernandes Coucello da Fonseca · OrientaçãoAnálise de imagens multimodais para auxílio à tomada de decisão clínica · Ciências de Computação e Matemática Computacional · Instituto de Ciências Matemáticas e de Computação - USPEm andamento - Mestrado
desde 2024Larissa Freire de Jesus Costa · OrientaçãoAnálise de dados de Prontuários Eletrônicos de Pacientes Considerando Multimodalidade e Interoperabilidade · Ciências de Computação e Matemática Computacional · Instituto de Ciências Matemáticas e de Computação - USPEm andamento - Doutorado
desde 2024Graciella dos Santos Favoreto · OrientaçãoClassificação Aprimorada de Nódulos Tireoidianos: Comparação entre Aprendizado de Máquina Tradicional e Profundo · Ciências de Computação e Matemática Computacional · Instituto de Ciências Matemáticas e de Computação - USP · Bolsa Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São PauloEm andamento - Mestrado
desde 2023Mariana Aya Suzuki Uchida · OrientaçãoEstudo e Análise de Técnicas de Segmentação de Imagens de Corpos Vertebrais de Exames por Ressonância Magnética · Ciências de Computação e Matemática Computacional · Instituto de Ciências Matemáticas e de Computação - USPEm andamento - Iniciação Científica
desde 2023Rafael Comitre Garcia Conrado · OrientaçãoInteroperabilidade de Dados de Sistemas de Apoio ao Diagnóstico Médico em Contexto de Big Data: Explorando o Modelo Comum de Dados OMOP-CDM · Bacharelado em Ciências de Computação · Instituto de Ciências Matemáticas e de Computação - USP · Bolsa Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e TecnológicoEm andamento - Mestrado
desde 2022Êrica Peters do Carmo · OrientaçãoAnálise Comparativa de Métodos para Interoperabilidade de Dados de Saúde · Ciências de Computação e Matemática Computacional · Instituto de Ciências Matemáticas e de Computação - USPEm andamento - Pós-doutorado
desde 2022Guilherme Sydow Nunes Bueno Brandão · Orientação· Instituto de Ciências Matemáticas e de Computação - USPEm andamento - Doutorado
desde 2021Erikson Júlio de Aguiar · OrientaçãoSegurança e privacidade de imagens médicas contra modelos de aprendizado de máquina adversários · Ciências de Computação e Matemática Computacional · Instituto de Ciências Matemáticas e de Computação - USPEm andamento
Bancas julgadoras
265 registros- 2025Felipe Antunes QuirinoAvaliação sobre a Confiabilidade de Conjuntos de Imagens de RX para Treinamento de Redes Neurais Convolucionais em Apoio ao Diagnóstico · Ciências de Computação e Matemática Computacional · Instituto de Ciências Matemáticas e de Computação - USPBanca: Marcela Xavier Ribeiro, Marcel Koenigkam Santos, Marcelo Andrade da Costa Vieira, Agma Juci Machado TrainaMestrado
- 2025Eddy Jens Rivero ZavalaAplicação de Deep Learning para detecção automática de nódulos pulmonares em imagens de tomografia computadorizada do tórax · Bioengenharia · Escola de Engenharia de São Carlos - USPBanca: Paulo Mazzoncini Azevedo-Marques, Marcel Koenigkam Santos, Agma Juci Machado Traina, Lucas Ferrari de OliveiraMestrado
- 2025Jesus Francisco Paucar-EscalanteMachine Learning Techniques for Detecting Parkinson?s Disease-Associated Biometric Patterns from Wearable Sensor Data · Computação · Instituto de Computação - UNICAMPBanca: Agma Juci Machado Traina, Sandra Eliza Fontes de Avila, Esther Colombini, Aurea Soriano-VargasMestrado
- 2025João Vitor Silva LeiteAgregação Multimodal para Exames de Tórax · CIÊNCIAS DA COMPUTAÇÃO · Universidade Federal FluminenseBanca: Agma Juci Machado Traina, Marcos Vinicius Naves Bedo, Daniel Cardoso Moraes de OliveiraMestrado
- 2025Wesley Nogueira GalvãoSegmentação de vasos sanguíneos com poucos dados via transferência de informação de forma · Ciência da Computação · Universidade Federal de São CarlosBanca: Cesar Henrique Comin, Agma Juci Machado Traina, Jurandy Gomes de Almeida JuniorMestrado
- 2025Johanna Elisabeth RogalskyAvaliação prognóstica Multi-modal de Opacidades Pulmonares baseada em Inteligência Artificial · Interunidades em Bioengenharia · Escola de Engenharia de São Carlos - USPBanca: Agma Juci Machado Traina, Marcel Koenigkam Santos, Lucas Ferrari de Oliveira, Paulo Mazzoncini Azevedo-MarquesExame de qualificação de doutorado
- 2025Banca Examinadora Professor Titular - Especialidades: !II: Banco de Dados; VIII: Processamento de Linguagens Naturais; XII: Redes Complexas para Ciências da Computação· Instituto de Ciências Matemáticas e de Computação - USPBanca: Agma Juci Machado Traina, Adenilso da Silva Simão, Alexandre Xavier Falcão, João Paulo Papa, Renata Maria Cardoso Rodrigues de SouzaProfessor titular
- 2025Banca Examinadora Professor Titular, areas: ?Wavelet Transform and its application? e ?Digital Speech Processing?· Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita FilhoBanca: Aleardo Manacero Junior, Geraldo Nunes Silva, Glauco Augusto de Paula Caurin, João Bosco Augusto London Junior, Agma Juci Machado TrainaProfessor titular
- 2025Provimento de Um Cargo de Professor Doutor - Departamento de Engenharia Elétrica e de Computação - área de Processamento Digital de Sinais e Aplicações· Escola de Engenharia de São Carlos - USPBanca: Agma Juci Machado Traina, Marcelo Andrade da Costa Vieira, Leonardo Bonato Felix, Moisés Vidal Ribeiro, Danton Diego FerreiraConcurso público
- 2025Provimento de Um Cargo de Professor Doutor - Departamento de Engenharia de Biossistemas - área de Ciências de Dados· Escola Superior de Agricultura Luiz de QueirozBanca: Thiago Liborio Romanelli, Fabio Ricardo Marin, Roseli Aparecida Francelin Romero, Agma Juci Machado Traina, Glauco RolimConcurso público
- 2025Banca Examinadora Livre-Docência - Disciplinas MC886 ? Aprendizado de Máquina e MO444 ? Aprendizado de Máquina e Reconhecimento de Padrões· Instituto de Computação - UNICAMPBanca: Agma Juci Machado Traina, Cláudia Maria Bauzer Medeiros, Rodolfo Jardim de Azevedo, Anna Helena Reali Costa, Thiago Alexandre Salgueiro PardoLivre-docência
- 2024Matheus Corrêa LindinoUnveiling Mental Well-being: Stress, State-Anxiety, and Stressor Detection in a Case Study · Computação · Instituto de Computação - UNICAMPBanca: Anderson Rocha, Helena de Almeida Maia, Paula Costa, Agma Juci Machado TrainaMestrado
- 2024Alaor Cervati NetoDimensionality reduction-based metric learning using information theoretic measures · Ciência da Computação · Universidade Federal de São CarlosBanca: Alexandre Levada, João Paulo Papa, César Comin, André Backes, Fabrício Breve, Agma Juci Machado TrainaDoutorado
- 2024Caroline de Oliveira Costa Souza RosaComplex Networks to Model and Mine Patient Pathways · Modelagem Computacional · Laboratório Nacional de Computação CientíficaBanca: Antônio Tadeu Azevedo Gomes, Agma Juci Machado Traina, Fabio André Machado Porto, Deborah Ribeiro CarvalhoDoutorado
- 2024Lucas Lins de LimaRedes neurais profundas e aprendizagem de máquina aplicados na diferenciação de tumores pulmonares primários de metástases em exames de tomografia computadorizada · Interunidades em Bioengenharia · Escola de Engenharia de São Carlos - USPBanca: Paulo Mazzoncini de Azevedo Marques, Agma Juci Machado Traina, Danilo Tadao Wada, Lucas Ferrari de Oliveira, Thales Vieira, Juliana Pereira de Souza ZinaderDoutorado
- 2024Ricardo Alexandre NevesMétodo para Reconhecimento e Classificação de Padrões em Imagens Digitais para Controle da Ferrugem Asiática em Cultura de Soja · Ciência da Computação · Universidade Federal de São CarlosBanca: Paulo Estevão Cruvinel, Agma Juci Machado Traina, Alexandre Luis Magalhães Levada, Kalinka Regina Lucas Jaquie Castelo Branco, José Mário de MartinoDoutorado
- 2024Jing YangCombating Disinformation with Efficient and Explainable Fact-checking · Ciências de Computação · Instituto de Computação - UNICAMPBanca: Agma Juci Machado Traina, Roberto Marcondes Cesar Jr, Paula Dornhofer Paro Costa, Marcelo da Silva ReisDoutorado
- 2024Rafael Luiz TestaFacial expression synthesis in videos based on generative adversarial networks and inter-frame coherence · Sistemas de Informação · Escola de Artes, Ciências e Humanidades - USPBanca: Agma Juci Machado Traina, Fátima de Lourdes dos Santos Nunes Marques, André Carlos Ponce de Leon Ferreira de Carvalho, Renato Tinós, João Paulo GoisDoutorado
- 2024Lucas Pascotti ValemContextual Similarity Learning for Image Retrieval and Classification: Applications in Person Re-Identification · Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita FilhoBanca: Agma Juci Machado Traina, Daniel Carlos Guimarães Pedronette, Helio Pedrini, João Paulo Papa, Wallace Correa de Oliveira CasacaDoutorado
- 2024Matheus de Freitas Oliveira BaffaCaracterização do tecido tireoidiano por meio da análise de imagens hiperespectrais utilizando aprendizagem profunda · Interunidades em Bioengenharia · Escola de Engenharia de São Carlos - USPBanca: Agma Juci Machado Traina, Joaquim Cézar Felipe, Luciano BachmannDoutorado
- 2024Wesley Nogueira GalvãoAproveitamento de informações de forma previamente adquiridas por redes neurais em imagens naturais para a segmentação de vasos sanguíneos · Ciência da Computação · Universidade Federal de São CarlosBanca: Agma Juci Machado Traina, Cesar H Comin, Edson Takashi Matsubara, Jurandy AlmeidaExame de qualificação de mestrado
- 2024Banca Examinadora Professor Titular· Universidade Federal de Minas GeraisBanca: Agma Juci Machado Traina, Anna Helena Reali Costa, Teresa Ludermir, Marley VellascoProfessor titular
- 2024Provimento de Um Cargo de Professor Doutor - Departamento de Ciências de Computação - IME-USP, área Engenharia de Software· Instituto de Matemática e Estatística - IME - USPBanca: Agma Juci Machado Traina, Alfredo Goldman, Ivan do Carmo Machado, Carla Taciana Lima Lourenço Silva Schuenemann, Christian Rodolfo Esteve RothenbergConcurso público
- 2024Para provimento de cargo de Pesquisador Adjunto· Instituto Nacional de Pesquisas EspaciaisBanca: Agma Juci Machado Traina, João Paulo Papa, Fabiano Morelli, Gilvan SampaioConcurso público
- 2024Provimento de Um Cargo de Professor Doutor - Departamento de Ciências de Computação - ICMC-USP, área Ciências de Computação· Instituto de Ciências Matemáticas e de Computação - USPBanca: Agma Juci Machado Traina, Thiago Alexandre Salgueiro Pardo, Helio Pedrini, Kelly Rosa Braghetto, Valdir Grassi JuniorConcurso público
Revisor de periódico
18 registros- 2017 – presenteVínculo atualIEEE Transactions on Medical ImagingRevisor de periódico
- 2014 – presenteVínculo atualIEEE Journal of Biomedical and Health InformaticsRevisor de periódico
- 2011 – presenteVínculo atualComputers in Biology and MedicineRevisor de periódico
- 2009 – presenteVínculo atualThe VLDB JournalRevisor de periódico
- 2009 – presenteVínculo atualInformation SystemsRevisor de periódico
- 2008 – presenteVínculo atualIEEE/ACM Transactions on Computational Biology and BioinformaticsRevisor de periódico
- 2008 – presenteVínculo atualIEEE Transactions on MultimediaRevisor de periódico
- 2008 – presenteVínculo atualMultimedia Tools and ApplicationsRevisor de periódico
- 2007 – presenteVínculo atualJournal of Digital Information ManagementRevisor de periódico
- 2006 – presenteVínculo atualJournal of Visual Languages and ComputingRevisor de periódico
- 2006 – 2006TEMA. Tendências em Matemática Aplicada e ComputacionalRevisor de periódico
- 2005 – 2007Pattern Analysis and Applications (1433-7541)Revisor de periódico
- 2005 – 2006IEEE Transactions on Information Technology in BiomedicineRevisor de periódico
- 2005 – presenteVínculo atualImage and Vision ComputingRevisor de periódico
- 2004 – presenteVínculo atualIEEE Transactions on Pattern Analysis and Machine IntelligenceRevisor de periódico
- 2003 – 2004Journal of the Brazilian Computer SocietyRevisor de periódico
- 2003 – 2005IEEE Transactions on Knowledge and Data EngineeringRevisor de periódico
- 1999 – 1999IEEE Transactions on Image ProcessingRevisor de periódico
Prêmios e títulos
37 registros- 2025Best Student Paper (advisor) IEEE CBMS2025 com artigo: Improving U-Net with Attention Mechanism for Medical Image Segmentation ApplicationsIEEE Computer Society - Technical Committee on Computational Life Sciences (TCCLS)
- 2025Reconhecimento da Comissão Especial de Computação Aplicada à Saúde (CE-CAS) da SBC pela contribuição à área.CE-CAS - Sociedade Brasileira de Computação
- 2024Best Student Paper (advisor) IEEE CBMS2024 com artigo: RADAR-MIX: How to Uncover Adversarial Attacks in Medical Image Analysis through ExplainabilityIEEE Computer
- 2021Best Presentation - Melhor apresentação do Third Dataset Showcase Workshop (DSW) do SBBD 2021: ?FeatSet: A compilation of visual features extracted from public image datasets"Sociedade Breasileira de Computação
- 2021Menção honrosa do 36' Simpósio Brasileiro de Bancos de Dados para o artigo"Similarity Search and Correlation-Based Exploratory Analysis in EHRs: A Case Study with COVID-19 Databases"Sociedade Breasileira de Computação
- 2019Best Paper runner-up do IEEE CBMS 2019 - artigo: 3DBGrowth: Volumetric Vertebrae Segmentation and Reconstruction in Magnetic Resonance ImagingIEEE Computer Society Technical Committe on Computational Life Sciences
- 2019Best Paper runner-up IEEE CBMS2019 com artitgo: A Two-Phase Learning Approach for the Segmentation of Dermatological WoundIEEE Computer Society Technical Committe on Computational Life Sciences
- 2019Best Paper - Demos and Applications Session do SBBD 2019 - Artigo: ?J-EDA: A Diversified Similarity Workbench for Content-based Image Retrieval"Sociedade Brasileira de Computação (SBC)
- 2019Best Paper - Melhor Artigo do Second Dataset Showcase Workshop (DSW) do SBBD 2019: ?Beyond Tears and Smiles with ReactSet: Records of Users? Emotions in Facebook Posts"Sociedade Brasileira de Computação (SBC)
- 2019Runner-up do Best Paper - Melhor Artigo do Second Dataset Showcase Workshop (DSW) do SBBD 2019: ?G-FranC: A dataset of Criminal Activities mapped as a Complex Network in a Relational DBMS"Sociedade Brasileira de Computação (SBC)
- 2017Best Paper - Melhor Artigo do 32 SBBD (Prêmio José Mauro Castilho): ?Relational graph data management on the edge: Grouping vertices? neighborhood with Edge-k"SBC
- 2017Best Paper - Melhor Artigo do First Dataset Showcase Workshop (DSW) do SBBD 2017: ?MAMMOSET: An Enhanced Dataset of Mammograms"SBC
- 2016Best Student Paper na área de Databases e Information Systems (ICEIS 2016) - ?Efficient Self-Similarity Range Wide-Joins Fostering Near-DuplicateINSTICC
- 2016Prêmio de Destaque pelo Conjunto da obra na área de Bases de Dados - Simpósio Brasileiro de Banco de Dados (SBBD 2016)Comissão Especial de Banco de Dados - Sociedade Brasileira de Computação
- 2015Best Student Paper na área de Databases e Information Systems (ICEIS 2015) - "Techniques for effective and efficient fire detection from social media images"INSTICC
- 2014Best Paper of ICEIS 2014 - artigo: "TrieMotif: a New and Efficient Method to Mine Frequent K-Motifs from Large Time Series"INSTICC
- 2014Best Paper - Demos and Applications Session do SBBD 2014 - Artigo: ?Have You Met VikS? A Novel Framework for Visual Diversity Search Analysis"SBC
- 2014Best Paper - Melhor Artigo do 29 SBBD (Prêmio José Mauro Castilho): ?Seamless integration of distance functions and feature vectors for similarity-queries processingSBC
- 2013Best Paper do SISAP 2013 - artigo: "A New Concept of Sets to Handle Similarity in Databases: The SimSets?
- 2012Best Paper - IX Demos and Applications Session do SBBD 2012Sociedade Brasileira de Computação - SBC
- 2010Best Paper - First Place of 2009 para o artigo: J. C. Felipe, Caetano Traina Jr, A.J.M. Traina - ?A New Family of Distance Functions for Perceptual Similarity Retrieval of Medical ImagesJournal of Digital Imaging- JDI (Springer)
- 20102 lugar CTIC'2010 - Extração de Séries Temporais de Imagens de Satélite para Monitoramento de Safras Agrícolas e de Dados ClimáticosSociedade Brasileira de Computacao - SBC
- 2008Runner Up Best Paper of CBMS 2008 - How To Improve Medical Image Diagnosis through Association Rules: The IDEA Method. Runner-up do Best Student Paper junto 21º IEEE CBMS (aluna de Doutorado)IEEE Computer Society
- 2007Bulk-loading Dynamic Metric Access Methods - Indicado como um dos 3 melhores trabalhos (de 90 artigos submetidos e 24 selecionados) do 22 Simpósio Brasileiro de Banco de Dados - SBBD2007Sociedade Brasileira de Computação - SBC
- 2006An Efficient Approach to Scale up k-Medoid-based Algorithms in Large DB - Indicado como um dos 3 melhores trabalhos (de 87 artigos submetidos) do 21 Simpósio Brasileiro de Banco de Dados - SBBD2006Sociedade Brasileira de Computação - SBC
Participação em eventos
96 registros- 2025Improving U-Net with Attention Mechanism for Medical Image Segmentation Applications38th IEEE Intl. Symposium on Computer-Based Medical Systems (CBMS2025) · Apresentação Oral · Participante · Madrid
- 2024KluSIM: Speeding Up k-medoids Clustering Over Dimensional Data with Metric Access Method26th Intl Conference on Enterprise Information Systems (ICEIS 2024 · Apresentação oral · Participante · Angers
- 2024Justiça em Modelos de Apoio a Processos de Tomada de Decisão com Uso de Aprendizado Federado39 Simpósio Brasileiro de Banco de Dados (SBBD 2024) · Apresentação oral · Participante · Florianópolis
- 2024MIGUE-Sim: Speeding Up Similarity Queries with Native RDBMS Resources39th ACM/SIGAPP Symposium on Applied Computing (SAC 2024) · Apresentação oral · Participante · Avila
- 2023Calibração de Distância em Métodos de Acesso Métrico por meio de Realimentação de Relevância38 Simpósio Brasileiro de Banco de Dados (SBBD 2023) · Apresentação oral · Participante · Belo Horizonte
- 2022Variational Autoencoders for Medical Image Retrieval, 16th International Conference on Innovations in Intelligente Systems and Applications16th Intl Conference on Innovations in Intelligente Systems and Applications (INISTA 2022) · Apresentação oral · Participante · Biarritz
- 2022MiDaS: extract golden results from Knowledge Discovery even over incomplete DatabasesInternational Conference on Computational Science (ICCS) · Apresentação oral · Participante · Londres
- 2022Analysis of vertebrae without fracture on spine MRI to assess bone fragility: A Comparison of Traditional Machine Learning and Deep Learning35th IEEE International Symposium on Computer-Based Medical Systems (CBMS 2022 - Virtual) · Apresentação oral · Participante · Shenzhen
- 2021I-CovidVis - A Visual Analytics Tool for Interoperable Healthcare Databases using Graphs34th IEEE International Symposium on Computer-Based Medical Systems (CBMS 2021 - Virtual) · Apresentação oral · Participante · Aveiro
- 2021VD-Tree: How to build an efficient and fit metric access method using Voronoi Diagrams36th ACM/SIGAPP Symposium on Applied Computing (SAC 2021 - Virtual) · Apresentação oral · Participante · Gwangju
- 2020Taking Advantage of Highly-correlated Attributes in Similarity Queries with Missing Values13th International Conference on Similarity Search and Applications (SISAP 2020 - Virtual) · Apresentação oral · Participante · Copenhagen
- 2020Bag-of-Attributes Representation: a Vector Space Model for Electronic Health Records Analysis in OMOP33rd IEEE International Symposium on Computer-Based Medical Systems (CBMS 2020 - Virtual · Apresentação oral · Participante · Rochester, USA
- 2020FINE: Improving time and precision of segmentation techniques for vertebral compression fractures in MRI35th ACM/SIGAPP Symposium on Applied Computing (SAC 20120 · Apresentação oral · Participante · Brno, Czech Republic
- 20193DBGrowth: Volumetric Vertebrae Segmentation and Reconstruction in Magnetic Resonance Imaging32th IEEE International Symposium on Computer-Based Medical Systems (CBMS 2019) · Apresentação oral · Participante · Cordoba
- 2019The SimilarQL framework: similarity queries in plain SQL.34th ACM/SIGAPP Symposium on Applied Computing (SAC 2019) · Apresentação Oral · Participante · LimassolDivulgação científica
- 2019Managing Complex Big Databases to Support Decision Making in Health SystemsFAPESP Week France · Conferencista · Convidado · Paris
- 2019Efficient Indexing of Multiple Metric Spaces with SpectraIEEE International Symposium on Multimedia (ISM 2019) · Simposista · Convidado · San Diego
- 20192.	G-FranC: A dataset of Criminal Activities mapped as a Complex Network in a Relational DBMS34th Brazilian Symposium on Databases (SBBD 2019) · Apresentação oral · Participante · Fortaleza
- 2018Efficient and Reliable Estimation of Cell Positions27th ACM International Conference on Information and Knowledge Management (CIKM 2018) · Apresentação oral · Participante · Turin
- 2018Class-constraint similarity queries33rd Annual ACM Symposium on Applied Computing (SAC 2018) · Apresentação oral · Participante · Pau
- 2017VolTime - Unsupervised Anomaly Detection on Users' Online Activity Volume2017 SIAM International Conference on Data Mining (SDM2017) · Apresentação oral · Participante · Houston
- 2017Querying on Complex Databases by Content and Context: Challenges and Real Applications2017 Alberto Mendelzon International Workshop on Foundation of Databases and the Web (AMW) · Conferencista · Convidado · Montevideu
- 2017BREATH: Heat Maps Assisting the Detection of Abnormal Lung Regions in CT Scans30th IEEE International Symposium on Computer-Based Medical Systems (CBMS 2017) · Apresentação oral · Participante · Thessaloniki
- 2017Desafios e Oportunidades de Pesquisa em Consultas por Similaridade no Domínio de Dados Complexos44º Seminário Integrado de Software e Hardware ( SEMISH) · Apresentação oral · Participante · São Paulo
- 2016Vote-and-Comment: Modeling the Coevolution of User Interactions in Social Voting Web SitesIEEE International Conference on Data Mining · Apresentação oral · Participante · Barcelona
