Ana Paula Ulian de Araujo.

Septinas são proteínas citoesqueléticas que ligam GTP, podendo estar envolvidas em eventos chave na biologia de células, como a citocinese, transporte vesicular e exocitose. Em humanos, diferentes septinas se associam de maneira específica para formar heterocomplexos hexaméricos ou octaméricos. Estes complexos interagem via suas extremidades para gerar filamentos capazes de se organizar em estruturas de mais alta ordem. Já foi demonstrado que a expressão ectópica, deleção e/ou mutação des genes correspondentes a septinas são associadas com diversas patologias incluindo infertilidade, neuropatias e vários tipos de tumor. No sistema nervoso, por exemplo, onde septinas são abundantes e envolvidos em quase todas as etapas do desenvolvimento neuronal, anormalidades na expressão e função das septinas tem sido associadas ao envelhecimento e distúrbios neurodegenerativos. Uma compreensão completa dos papéis fisiológicos das septinas e as disfunções que levam às diversas patologias com as quais são associadas, necessita de um conhecimento mais abrangente de vários aspectos do contexto bioquímico onde atuam. Entre outras coisas, pontos críticos incluem um melhor entendimento de: sua estrutura tridimensional e como a mesma se relaciona com a ligação e hidrólise de GTP; o processo de polimerização e interação com membranas; a organização de estruturas de mais alta ordem (feixes, malhas etc.) e os parceiros proteicos com os quais interagem. Visando contribuir para o esclarecimento de vários destes aspectos da fisiologia de septinas, o grupo proponente (atualmente responsável pela maior parte do nosso conhecimento das estruturas de septinas e seus filamentos) propõe o uso de uma série de abordagens complementares incluindo a determinação de estruturas tridimensionais por difração de raios-X e crio-microscopia eletrônica, estudos computacionais complementares empregando métodos de simulação molecular e análise de parceiros de interação. Exemplos específicos da contribuição pretendida incluem esclarecer o mecanismo associado a clivagem da septina 2 pela protease NS3/2b do vírus da zika associada com neuropatia e estudar a associação de complexos de septinas com cadeias leves da toxina botulínica.

Auxílio Pesquisa Regular FAPESP (2020/15542-7)

Auxílio Pesquisa FAPESP - Colaboração Internacional BBSRC/UK

Pesquisadora Associada em projeto temático FAPESP.

Pesquisadora principal.

O principal objetivo desta proposta é consolidar a colaboração científica entre os grupos de pesquisa no Brasil na área de Biofísica Molecular usando SRCD e o grupo liderado pela Profa. Dra. Bonnie Wallace do Birkbeck College. O intuito desta parceria é viabilizar os estudos estruturais de proteínas recombinantes e peptídeos sintéticos investigados e que são possíveis alvos em doenças negligenciadas, utilizando a espectroscopia de dicroísmo circular com radiação síncrotron (SRCD), técnica que é amplamente utilizada pelos parceiros no Reino Unido.

RENOVALAB: Programa de Renovação de Instrumentos para laboratórios Didáticos.

Adequação da infraestrutura dos laboratórios do Grupo de Biofísica Molecular do IFSC após a mudança de prédio, a fim de viabilizar o andamento dos projetos de pesquisa vigentes e futuros, particularmente no que diz respeito à instalação de rede de gases, complementação de mobiliário, manutenção de equipamentos e aquisição de pequenos equipamentos de apoio à pesquisa.

Proc. CNPq nº 553056/2011-5.
Edital/Chamada: Chamada CNPq/BBSRC n° 26/2011 - Segurança Alimentar e Bioenergia e Biotecnologia Industrial.

As septinas fazem parte de uma família de proteínas de ligação ao nucleotídeo guanina e já foram encontradas em nemátodes, moscas, fungos, protozoários e animais, mas nunca em plantas. Neste projeto, pretende-se isolar e caracterizar estrutural e funcionalmente a septina da alga unicelar Chlamydomonas. A escolha de Chlamydomonas, um eucarionte modelo que divergiu há muito do ancestral comum a plantas e metazoários, baseia-se no fato deste possuir uma única septina, diferente dos demais eucariontes estudados até o momento. Este fato, associado a facilidade de se trabalhar com um organismo cujos protocolos de cultivo e transformação estão bem estabelecidos, torna Chlamydomonas um modelo atraente também para o estudo de septinas in vivo. Assim, de forma complementar a caracterização estrutural, pretende-se ainda contribuir com o esclarecimento da questão fundamental da atuação de septinas como homo-filamentos funcionais, bem como determinar o papel primordial que esta proteína desempenha em Chlamydomonas reinhardtii.

Bolsa de Produtividade - PQ 1D (CNPq)

Número do processo: 573607/2008-7
Edital/Chamada: Edital MCT/CNPq Nº 015/2008 - Institutos Nacionais de Ciência e Tecnologia.
vigência: 19/01/2009 a 30/12//2014

Edital MCT/SETEC/CNPq no. 67/2008 ? RHAE ? Pesquisador na Empresa
PROCESSO No.: 580465/2008-0
Recurso aprovado (bolsas): R$ 169.101,36
Vigência: 27/04/09 a 09/07/2013

PROJETO FAPESP ? PIPE Fase I
PROCESSO No.: 2008/58924-5
Recurso aprovado: R$ 97.000,00
Vigência: 01/07 a 31/12/2009

Apoio financeiro complementar aos grupos de pesquisa que efetivamente contribuam para indicadores de desempenho e de excelência. O apoio consiste em auxílio para docente da Universidade credenciado como orientador em um dos Programas de Pós-Graduação da USP avaliados pela CAPES com conceitos 6 ou 7 (último triênio).

Produtividade Pesquisa - PQ - Proc. 305279/2006-8 (Pulchellina: avaliação da atividade, estudos estruturais e potenciais aplicações).
Vigência: 01/03/2007 a 28/02/2010

As proteínas inativadoras de ribossomo (RIPs) possuem atividade RNA N-glicosidase e polinucleotídeo: adenosina glicosidase. Essas proteínas despertaram interesse devido às atividades tóxicas contra células humanas e animais, criando perspectivas do seu uso como compostos antivirais e anti-tumorais em aplicações terapêuticas. O potencial uso das RIPs como imunotoxinas estimularam estudos de isolamento e caracterização de novas RIPs em diversas espécies de plantas. Porém, existem ainda questões cruciais pendentes relacionadas às atividades enzimáticas e biológicas das RIPs. Sabe-se ainda que elas podem existir como diferentes isoformas na mesma planta, como já descrito para ricina e abrina. Em nosso grupo temos resultados recentes que confirmam a presença de cinco isoformas da pulchellina, uma RIP tipo 2 altamente tóxica, as quais podem diferir em citotoxidade e ligação a açúcares. Assim, os estudos bioquímicos e biofísicos envolvidos nesse trabalho poderão ser muito úteis na caracterização destas isoformas, bem como na avaliação de seu potencial terapêutico e papel biológico.

Contra partida de auxílio pesquisa
Valor total concedido: R$ 3.000,00

Bolsa Produtividade Nível 2C;
Número do processo: 305480/2003-0;
Vigência: 01/03/2004 a 28/02/2007.

MCT/CNPq Nº 021/2004 - RHAE-Inovação;
Empresa: Nanocore Biotecnologia Ltda;
Número do processo: 505180/2004-9;
Vigência: 11/2004 a 10/2006.

Contra partida de auxílio pesquisa;
Valor total concedido: R$ 3.500,00

Contra partida de auxílio pesquisa;
Valor total concedido: R$ 3.500,00.

Número do processo: 00/15044-3;
Vigência: 01/2002 a 12/2004.

Contra partida de auxílio pesquisa;
Número do Processo USP: 2001.1.7052.1.7

Número do processo: 98/14138-2
Vigência: 01/10/2000 a 31/12/2008

Número do processo: 99/10607-0;
Valor total concedido: R$ 17.750,00 + US$ 36.916,09 + RT R$ 9.971,03;
Vigência: 01/02/2000 a 31/01/2002

Contra partida de auxílio pesquisa;
Valor total concedido: R$ 3.500,00.

Vigência: 10/2000 a 24/05/2004.

Contra partida de auxílio pesquisa;
Valor total concedido: R$ 3.500,00.

PRONEX/FINEP