Flávio Alicino Bockmann.

A despeito da enorme importância das coleções biológicas e extraordinários avanços tecnológicos disponíveis, há uma carência frente à crescente demanda por expertise em curadoria qualificada e infraestrutura de manutenção e pesquisa. Diante do exposto, o presente projeto tem por objetivo a aquisição de um conjunto de equipamentos multiusuários para a geração de imagens radiográficas 2D e de reconstrução de modelos 3D das coleções científicas do Departamento de Biologia da FFCLRP-USP (DB/FFCLRP/USP), Ribeirão Preto, para uso em pesquisas, ensino e disponibilização na internet. O DB/FFCLRP/USP abriga atualmente quatorze (14) coleções científicas, sendo onze (11) delas acervos de espécimes mortos/preservados, as quais juntas mantêm mais de 500.00 espécimes distribuídos em mais de 134.000 lotes. Cada uma dessas coleções está associada a um laboratório de pesquisa e respectivo curador específico, suportado por infraestrutura física, humana e organizacional dedicada, além de contar com um laboratório multiusuário, Centro para Documentação da Biodiversidade (CDB). Mais especificamente, o presente projeto tem por objetivo a compra de: um sistema de inspeção radiográfica digital para rápido acesso a informações anatômicas internas, especialmente do esqueleto; conjunto de 6 estações de trabalho computacionais e respectivos softwares para segmentação de reconstruções 3D geradas pelo nano/micro CT-Scan computadorizado; uma estação de trabalho computacional para armazenamento, organização e disponibilização de imagens relacionadas aos espécimes das coleções na internet. Além disso, almejamos abrir a oportunidade para a formação humana especializada com o treinamento técnico de três bolsistas TT FAPESP.

O conhecimento humano passa atualmente por uma crise pela incapacidade de responder questões fundamentais do Universo de forma global. Portanto, este necessita de uma revisão quanto à sua estrutura filosófica e teórica, com vistas a retomada de sua integridade de forma a explanar de forma mais completa os fenômenos naturais. Em grande parte, essa premência se deve a fragmentação do conhecimento em diferentes áreas do saber, sucedida pelo desenvolvimento de teorias e práticas aparentemente singulares para cada um destes universos. Neste contexto, a Teoria Evolutiva, apoiada pelos desenvolvimentos teóricos e metodológicos da Sistemática Filogenética, aponta para um forte potencial para desempenhar a função de catalisador do conhecimento científico, ao menos para as Ciências Naturais e Humanas. Proponho, com este projeto, prospectar possibilidade de integração diferentes áreas do saber nas Ciências Biológicas e Humanidades, por meio da Teoria Evolutiva e a Sistemática Filogenética, utilizando dois eixos de investigação (mas que possuem ampla sobreposição): A) Aspectos Teóricos, Filosóficos, Históricos e Metodológicos da Teoria Evolutiva e da Sistemática Filogenética (incluindo Taxonomia e Nomenclatura Zoológica); e B) Aplicações Práticas da Sistemática Filogenética e Biogeografia. Para viabilizar a consecução deste objetivo geral, são delineados os seguintes subprojetos, que abordam diferentes dimensões do assunto em tela (cada um com numerosos objetivos específicos): 1) Investigação dos fundamentos teóricos e filosóficos do estudo de padrões em áreas externas às Ciências Biológicas; 2) História da Sistemática Filogenética no Brasil; 3) Análise Filogenética e Taxonomia de peixes da superordem Ostariophysi; 4) Evolução dos arcos viscerais de Gnathostomata; 5) Evolução do sistema látero-sensorial e elementos ósseos circundantes em Vertebrados; 6) Sistemática e Biogeografia dos peixes da bacia do Rio Juruena, MT.

A ictiofauna Neotropical é bastante diversa (ca. de 4600 espécies válidas) e apresenta elevado grau de endemismo. Seu atual padrão de distribuição está diretamente relacionado ao isolamento dessa região ao longo do tempo geológico, bem como à ocorrência de diversos eventos geológicos que permitiram a expansão da distribuição e/ou o isolamento de diversas espécies. Algumas evidências sugerem que taiseventos sejam de natureza vicariante, principalmente nas regiões de cabeceiras dos rios, enquanto que outros resultados apontam para a ocorrência de geodispersão, as quais devem estar mais associadas aos ambientes e espécies que habitam as planícies. Desde o século XIX se conhece a íntima relação entre as cabeceiras do Rio Tapajós (principalmente o alto Rio Juruena), as quais drenam a vertente Norte da Chapada dos Parecis e correm para o Rio Amazonas, e as cabeceiras do alto Rio Paraguai, cujas nascentes drenam a vertente Sul da mesma chapada fazendo, assim, parte da bacia do Paraná/Paraguai. Hipóteses da correlação entre ambas as ictiofaunas datam desde o início do século XX, entretanto estudos mais aprofundados e maiores descobertas não podem ser feitas, pois esbarram no pouco material disponível que seja proveniente das cabeceiras de ambas as drenagens. Recentemente, o Laboratório de Ictiologia de Ribeirão Preto (LIRP) recebeu duas coleções de peixes: 1) oriunda do alto Rio Juruena e que conta com cerca de 500 lotes#894; e 2) proveniente do alto Rio Paraguai com cerca de 200 lotes. Ambas as coleções necessitam passar por uma revisão taxonômica antes que possam ser propriamente armazenadas e tombadas no catálogo do LIRP, disponibilizando online os dados referentes a tais coleções via specisLink. De posse de ambas as coleções propriamente organizadas e identificadas, e sabendo do histórico compartilhado entre as mesmas, é proposto o presente projeto, que visa analisar a relações biogeográficas entre ambas as bacias, com base em suas ictiofaunas.

Coleções científicas biológicas encerram uma incomensurável quantidade de informações sobre os mais diversos aspectos da Biodiversidade. Seus dados contribuem para as mais diversas aéreas da ciência e do interesse público, tais como: investigações em evolução, taxonomia, sistemática e biogeografia; saúde pública, segurança residencial, controle de pragas e espécies invasoras; estudos de avaliação, conservação e planejamento ambiental, entre muitos outras. Com advento da internet e o acelerado processo de desenvolvimento econômico, a demanda por informações biológicas e, conseqüentemente, pela disponibilização de dados qualificados (auditados) de coleções científicas é crescente. Notoriamente, as Universidades hospedam muitos dos mais importantes acervos biológicos, os quais atuam como esteio acadêmico para pesquisa e para formação de recursos humanos altamente qualificados para a investigação da Biodiversidade. No entanto, estas coleções, geralmente por carecerem de um comprometimento institucional formal, são as que mais sofrem riscos, inclusive quanto à salvaguarda de seus dados. O Departamento de Biologia da Faculdade de Filosofia, Ciências e Letras de Ribeirão Preto da Universidade de São Paulo (DB/FFCLRP/USP) abriga o maior acervo biológico de todos os campi da Universidade de São Paulo, com 12 coleções contendo mais de 800.000 espécimes de diversos grupos de animais, de fungos e de vegetais. Estas encontram-se em diferentes níveis de desenvolvimento quanto à informatização e disponibilização on-line de seus dados. Tendo em vista os propósitos desta Chamada, que focalizam a informatização e a disponibilização de dados de acervos biológicos com vistas ao estabelecimento de políticas públicas direcionadas à Conservação, os seguintes objetivos foram delineados: 1) digitalizar todos os lotes/espécimes ainda não processados em todos os acervos do DB/FFCLRP/USP, 2) revisar os dados primários (localidade, coletores e data) de todos os registros; 3) geo-referenciar todos os registros; 4) triar e identificar todo material nos acervos que ainda não foi estudado; 5) revisar as identificações dos espécimes de grupos taxonômicos complexos, com apoio de pesquisadores colaboradores; 6) integrar as coleções malacológica (moluscos), ornitológica (aves) e mastozoológica (mamíferos) por meio da migração de dados para o programa Specify 6.0; 7) unificar todas as coleções em uma plataforma única, cujos dados poderão ser acessados pelo website dos acervos do DB/FFCLRP (a ser criado) e pelo site do SpeciesLink (http://splink.cria.org.br/); 8) disponibilizar fotografias de alta resolução de exemplares-tipo e aqueles considerados de importância; 9) disponibilizar pela internet um conjunto de cerca de 1.500 radiografias já tiradas e todas as demais que serão geradas durante a vigência do projeto; e 10) treinar técnicos em curadoria científica. Estes objetivos serão levados a cabo com a auditoria dos dados taxonômicos, a ser feita com apoio de pesquisadores visitantes, com a digitação, revisão e geo-referenciamento dos dados, a ser feita com apoio de técnicos. Os dados auditados serão disponibilizados no website dos acervos do DB/FFCLRP/USP e na plataforma do SpeciesLink. A obtenção das fotografias de alta resolução será feita por meio de equipamentos fotográficos digitais, aqui solicitados. Estas, juntamente com radiografias de alta resolução serão disponibilizadas no website dos acervos do DB/FFCLRP/USP.

A presente proposta encontra-se inserida no Plano de Metas do Departamento de Biologia (DB) da FFCLRP/USP que visa melhorar e capacitar as coleções cientificas presentes no DB. Tais coleções abrangem peixes, insetos (himenópteros, com ênfase em abelhas, vespas e dípteros), crustáceos, répteis, fósseis, plantas e fungos. Dentre estas coleções podem ser destacadas a coleção de abelhas sem ferrão (com mais de 250 mil registros), a coleção de peixes do Laboratório de Ictiologia de Ribeirão Preto e o Herbário do Departamento de Biologia (Herbário SPFR). Tanto as coleções maiores como as menores estão associadas a laboratórios e linhas de pesquisa dos docentes, sendo de importância fundamental para a consecução de suas pesquisas e também para a educação, estando disponíveis para a consulta por pesquisadores externos, alunos de pós-graduação e graduação da instituição e do público externo em geral. Os objetivos deste projeto são: 1) melhorar as condições de acomodação destas coleções, através da aquisição de mobiliário específico e adequação do espaço; 2) informatizar estas coleções, através da aquisição de equipamentos (computadores, scanners e máquinas fotográficas) e a contratação (por meio de serviços de terceiros) de pessoal para digitalizar e disponibilizar os acervos on-line. De caráter inovador, os registros de nossas coleções serão conectados às filogenias mais atuais de cada grande grupo biológico em questão, o que permitirá efetuar um planejamento mais eficiente da pesquisa biológica, otimizar o uso do material da coleção localmente e, de caráter experimental, induzir a utilização da informação filogenética na Conservação. Com a melhoria das coleções, tanto do ponto de vista de uso do espaço e acomodação do acervo, quanto de informatização do acervo e sua disponibilizarão on-line, pretende-se dar novo impulso à pesquisa ligada à sistemática e taxonômica, bem como a estudos ligados à conservação.

O presente projeto visa o financiamento para execução de um projeto de pesquisa na área de Paleontologia, o qual deve abordar a revisão e filogenia de um grupo de peixes fósseis (Teleostei: Ostariophysi: Gonorynchiformes: Chanoidei) de importante representatividade no Cretáceo Inferior do Brasil. Trata-se de uma proposta multi-institucional, envolvendo a Universidade Federal de Mato Grosso, Universidade de São Paulo, campus de Ribeirão Preto e Universidade de São Paulo, campus de São Paulo. O projeto pretende abordar a taxonomia e filogenia do gênero Dastilbe, com ênfase na investigação aprofundado de um de seus representantes menos conhecidos, Dastilbe moraesi Silva-Santos, 1955. O projeto também visa a obtenção de espécimes adicionais deste importante e pouco conhecido peixe do Cretáceo Inferior da Formação Areado a partir de trabalho
de campo de coleta de material na localidade tipo no município de Varjão de Minas e Minas Gerais, onde representantes desta espécie são facilmente coletados. O trabalho de campo também visa a investigação deste sítio paleontológico pouco explorado e potencialmente importante para a paleoictiologia brasileira.

O Brasil, com uma das mais ricas ictiofaunas subterrâneas de todo o mundo, crustáceos relictos filogenéticos e vocação para estudos em campo, oferece grande potencial de interesse científico na área de Bioespeleologia aquática, com importantes desdobramentos para a conservação dos frágeis ecossistemas subterrâneos. Partindo de levantamentos faunísticos intensivos em 12 áreas cársticas (BA, MG, GO, MT, MS, SP) e localidades da Bac. Amazônica, o projeto abrangerá um amplo leque de aspectos da biologia de táxons troglóbios, alguns já abordados em estudos anteriores, porém em maior detalhe e sofisticação metodológica, avançando em termos quali- e quantitativos (cronobiologia, comportamento), e outros abordados pela primeira vez para troglóbios aquáticos brasileiros (respirometria, sistemas sensoriais). A história natural e a ecologia populacional (incluindo marcação e recaptura) serão estudadas em campo através de mergulho-livre e autônomo. Exemplares vivos e preservados serão trazidos a São Paulo, para estudos sistemáticos, comportamentais e fisiológicos.

An All Catfish Species Inventory (ACSI) is proposed as Phase I of a long- term PBI of the Otophysi, the largest clade of freshwater fishes. The inventory is expected to result in the discovery and description of up to 1,750 new species of catfishes and, ultimately, in the description of between 2,300 and 4,600 new species of freshwater fishes. It will result in the completed taxonomy of a globally diverse taxon, Siluriformes, and later in the completed taxonomy of Otophysi, the clade containing over two-thirds of all freshwater fishes. Products of ACSI will include a completed taxonomy of catfishes with up-to-date identification guides, atlases, catalogues and checklists of species, phylogenetic studies of higher-level relationships among catfishes and an improved predictive classification, large samples of freshwater fishes from poorly collected regions added to permanent collections in U.S. and foreign institutions, and enhanced international communication among fish taxonomists. The project's website <http://clade.acnatsci.org/allcatfish/> and electronic mail listserver will continue after the grant period for dissemination of ACSI data and products, and provide for communication among taxonomists about research, educational and outreach opportunities. ACSI will be authoritative and rapid because it concerns organisms of immediate interest to its many participants. Further, ACSI will set the stage for the continuing inventory of other otophysans with an established international network of senior and newly trained systematists, new and well documented museum collections, identification of gaps in the global freshwater survey, and the framework for documentation, analysis and delivery of large amounts of information on specimens, taxonomy, phylogeny and freshwater biodiversity.

A tribo Heptapterini, da família Heptapteridae, é constituída por bagres de pequeno a médio porte que habitam riachos de quase toda região Neotropical. Dos 24 gêneros desta tribo que são reconhecidos como válidos (10 dos quais ainda não descritos formalmente), apenas Mastiglanis, Nemuroglanis e Taunayia foram revisados. Tendo por base a metodologia cladista, objetiva-se através desta pesquisa: 1)realizar uma rigorosa re-análise das relações filogenéticas das espécies da família Heptapteridae (através de programas de parcimônia), com especial atenção à tribo Heptapterini; 2)implementar uma classificação para toda família até o nível genérico; 3)realizar uma revisão taxonômica da tribo Heptapterini, com a descrição de vários novos táxons; 4)formular uma hipótese sobre a biogeografia histórica da tribo Heptapterini, e postular uma hipótese geral sobre história evolutiva das bacias hidrográficas Neotropicais; e 5)levantar informações ecológicas e de distribuição geográfica dos membros da tribo Heptapterini, para subsidiar futuras ações conservacionistas.

Esta proposta trata da implementação de um sistema distribuído de informação sobre diversidade biológica (fauna, flora e microbiota) do Estado de São Paulo, associado a um sistema de previsão de distribuição geográfica de espécies, baseado em modelagem matemática. O projeto pretende explorar os mais recentes avanços na área de bancos de dados distribuídos, protocolos de comunicação, conectividade (especialmente a Internet 2 e inteligência artificial, para atingir os três objetivos a seguir: i) desenvolver e implantar um sistema distribuído de informação sobre biodiversidade integrando várias coleções biológicas (dados históricos) do estado, o sistema de informação ambiental do programa Biota/Fapesp (dados atuais) e a rede do projeto Species Analyst; ii) desenvolver e implementar modelos matemáticos para previsão de distribuíção geográfica de espécies, usando como entrada os dados obtidos na rede descrita no item anterior; iii) desenvolver aplicativos específicos para a resolução de problemas em biodiversidade e meio-ambiente, tais como estudos de espécies invasoras, mudanças climáticas, proteção de espécies ameaçadas, planejamento de áreas de conservação, entre outros, utilizando os dados do sistema distribuído (item i) e os modelos de distribuição geográfica de espécies (item ii) e torná-las disponíveis através da Internet, para a comunidade científica, comunidade educacional, formuladores de políticas ambientais e tomadores de decisão na área de conservação ambiental. O projeto conta com a participação inicial de doze coleções biológicas (3 herbários, 2 coleções de ácaros, 3 de peixes, 1 de algas e 3 de microrganismos) e prevê a repatriação de dados de subcoleções específicas fora do estado de São Paulo (no Brasil e no exterior).

A bacia do Alto Rio Paraná abrange toda a drenagem do Rio Paraná a montante do Salto de Sete Quedas (atualmente submerso pelo reservatório de Itaipú). Associados à estes cursos de água existe um enorme número de riachos e cabeceiras hidrográficas, habitados primariamente por espécies de pequeno porte, com distribuição comparativamente restrita, de pouco ou nenhum valor comercial e grandemente dependentes da vegetação ripária para alimentação, reprodução e abrigo. Espécies de peixes de pequeno porte compõem aproximadamente 50% do total de espécies de peixes de água doce descritas da América do Sul e apresentam elevado grau de endemismo, sendo o estudo da sua sistemática, evolução e biologia geral a grande fronteira e desafio da ictiologia sul-americana neste final de século. Assim, o objetivo principal deste projeto é o estudo da ictiofauna de riachos e cabeceiras hidrográficas da porção paulista da bacia do Alto Rio Paraná, através da aplicação de uma metodologia padronizada - utilizando pesca elétrica, redes de arrasto manuais e peneiras metálicas - em 66 pontos distintos de coleta, que permitirá obter, no mínimo, as seguintes informações: 1) localização geográfica precisa; 2) composição taxonômica da ictiofauna e contribuição, em termos de número de indivíduos e biomassa, de cada espécie para comunidade de peixes como um todo; 3) amplitude de tamanho dos indivíduos de cada espécie coletada; 4) principais componentes da dieta das 4 espécies mais abundantes; 5) documentação fotográfica de cada espécie coletada com as cores em vida; 6) descrição de cada ambiente, com ilustrações fotográficas coloridas e seus principais parâmetros bióticos e abióticos; 7) coleções testemunhos que, junto com os dados de campo, permitam análises comparativas entre as diferentes regiões, visando o diagnóstico do grau de conservação e estabelecimento de prioridades de conservação e estudo e, futuramente, avaliações do sucesso de tais medidas.

A conservação e o uso sustentável da biodiversidade em ecossistemas aquáticos a Região Neotropical ainda representam um desafio considerável em virtude da falta de conhecimento dos organismos e suas relações e do aproveitamento dos recursos para consumo humano. Com o crescimento acelerado da população, a exploração desses ecossistemas à procura de alimento, principalmente peixes, tende a aumentar. No ambiente marinho, a fauna de peixes é melhor conhecida e mais estudada, mas o conhecimento da composição e diversidade de algumas regiões da costa brasileira, como por exemplo as zonas recifais e áreas de profundidade maior, ainda é incipiente. Nos ambientes de água doce do Brasil existem cerca de 1800 espécies nominais de peixes, a maioria concentrada na Bacia Amazônica, mas este número certamente não reflete a verdadeira diversidade dos peixes presentes nas diversas bacias hidrográficas brasileiras. Menezes (1996) demonstrou que qualquer estimativa da biodiversidade para tomada de medidas posteriores de conservação e exploração dos recursos é enormemente prejudicada pela falta de informações nos níveis mais básicos de conhecimento. O problema é particularmente acentuado nas regiões de cabeceiras dos rios e riachos, uma vez que os esforços de coleta tem-se concentrado tradicionalmente junto a calha dos grandes rios, de acesso mais fácil. O projeto tem como objetivos principais produzir um diagnóstico do estado atual do conhecimento da diversidade da fauna de peixes de água doce e marinhos do Brasil e completar o quadro de conhecimento com coletas em áreas estratégicas pouco ou totalmente inexploradas. Com base nos resultados obtidos espera-se fornecer à comunidade, ao setor produtivo e às áreas governamentais, informações atualizadas que permitam ações efetivas quanto à definição de prioridades de conservação e uso sustentável da diversidade.

A família neotropical Heptapteridae, anteriormente denominada de subfamília Rhamdiinae da família Pimelodidae, é composta de bagres de pequeno e médio porte habitantes de pequenos riachos com águas turbulentas. Esta família inclui 31 gêneros nominais, sendo que a maioria deles não são diagnosticados. O presentes trabalho foi um estudo filogenético desta família, conduzido à luz da metodologia cladista, implementada pelo programa de parcimônia Hennig86. Os membros das famílias estreitamente aparentadas, Bagrichthyidae e Olyridae, foram incluídos. Foi analisada uma matriz composta por 80 terminais (incluindo um grupo zero) e 278 caracteres. A análise foi implementada pelos algoritmos heurísticos &quot;mh*&quot; and &quot;bb*&quot;, a as árvores mais curtas resultantes foram submetidas ao protocolo de pesagem sucessiva, através do comando &quot;xs w&quot;. A árvore de consenso estrito mostra os seguintes resultados: 1- O monofiletismo de Bagrichthyidae somente é corroborado após a inclusão de Olyridae como seu sub-grupo;2- O monofiletismo de Heptapteridae foi corroborado;3- Goeldiella é o gênero mais basal de Heptapteridae;4- Todos os gêneros sem a margem orbital livre pertencem à um grupo monofilético bem corroborado, aqui chamado de subfamília Heptapterinae;5- Heptapterinae foi dividida em duas tribos: Phreatobiini, a qual inclui Phreatobius, Gladioglanis e os membros da família Heptapteridae com músculos adductor mandibulae hipertrofiados (Brachyglanis, Leptorhamdia etc.); e Heptapterini (=&quot;Nemuroglanis sub-clade&quot;);6-Gladioglanis é o grupo-irmão de Phreatobius; 7- Cetopsorhamdia é o grupo-irmão de todos os outros membros de Heptapterinae;8-A maioria do gêneros nominais da família Heptapteridae foram demonstrados serem válidos; 9-Pimelenotus e Caecorhamdia são sinônimos de Rhamdia; Brachyrhamdia, Caecorhamdella e Typhlobagrus de Pimelodella; Nannorhamdia de Imparfinis; e Imparales e Medemichthys de Nemuroglanis. 10-onze novos gêneros são estabelecidos.