Roberto do Nascimento Silva.

O programa De Volta à Escola: Eu na USP tem como objetivo aproximar estudantes da rede básica do ambiente universitário, promovendo vivências acadêmicas, culturais e científicas dentro da Universidade de São Paulo. A iniciativa oferece aos participantes a oportunidade de conhecer laboratórios, museus, espaços de extensão, salas de aula e atividades práticas, permitindo que vivenciem, de forma ativa, como é estudar na USP.

O Sarau da FMRP é um evento cultural consolidado na unidade, promovendo a integração entre alunos, docentes, funcionários e a comunidadeexterna por meio da música e outras expressões artísticas. O evento visa ampliar seu impacto dentro do Festival de Arte e Cultura da USP,oferecendo uma programação diversificada e acessível ao público.A proposta do Sarau da FMRP alinha-se ao objetivo do edital, promovendo a cultura e a extensão universitária. O evento é uma ferramenta devalorização da produção artística da comunidade acadêmica, incentivando a interação social e a difusão da arte e da cultura como elementosfundamentais da formação universitária. Além disso, reforça o compromisso da FMRP com a sociedade, ao abrir suas portas para um públicoamplo e diverso.

As Visitas Monitoradas têm como finalidade apresentar a infraestrutura, os espaços acadêmicos, culturais e de extensão da FMRP-USP ao público externo, especialmente estudantes da educação básica, grupos comunitários e instituições parceiras. Conduzidas por monitores treinados, essas visitas proporcionam uma experiência guiada que inclui explicações sobre a história da Unidade, demonstrações de atividades acadêmicas e científicas, além da apresentação de laboratórios, museus, centros de memória e ambientes de ensino.

Especialização EAD

As infecções causadas por fungos matam mais de um milhão de pessoas por ano. O ritmo deinovação na área de doenças fúngicas é mais lento que em doenças com morbimortalidadesimilar, o que decorre em função do fato de que a área recebe expressivamente menosfinanciamento para pesquisa e inovação do que áreas correlatas. Pretendemos contribuir deforma decisiva para o progresso nesta área através do estabelecimento de INCT de ?FungosPatogênicos Humanos?. Nós vamos investigar de forma abrangente e exploratóriadeterminantes genéticos que codificam fatores de virulência e patogenicidade emCryptococcus neoformans, C. gatti, Candida albicans, C. auris e Aspergillus fumigatus.Estratégias como ?genome-wide association study (GWAS)? com isolados clínicos poderãolevar à descoberta de determinantes genéticos completamente novos. Serão tambémincluídos estudos da plasticidade genética e fenotípica de diversos fungos patogênicoshumanos. Existem apenas cinco classes de compostos antifúngicos atualmente disponíveispara o tratamento de doenças fúngicas em humanos. Os nossos projetos coletivamentepropõem a descoberta de novas drogas antifúngicas ou compostos que possam potencializaras drogas atualmente em uso clínico. A evolução da resistência a drogas antifúngicas pormutações em alvos específicos é bem compreendida, mas pouco se conhece sobre quaisoutros determinantes genéticos são importantes para o estabelecimento de doenças fúngicasem humanos. Vias de sinalização, componentes da célula ou da hifa fúngica, tais como, aparede celular, moléculas secretadas de forma canônica ou não-canônica, moléculas dasuperfície ou mesmo fatores citoplasmáticos de fungos, podem colaborar com aimunomodulação do sistema imune humano. Investigaremos como lipídeos fúngicos modulamas interações entre fungos patogênicos e os seus hospedeiros humanos e como vesículasextracelulares fúngicas colaboram para esses mecanismos de imunomodulação e evasão porfungos patogênicos humanos.

O fungo Trichoderma reesei é reconhecido como um produtor industrial de celulases. Essas enzimas movimentam um mercado que cresce a cada ano na ordem de milhões de dólares. Os principais genes de celulases são regulados de forma coordenada de acordo com a fonte de carbono disponível. A expressão desses genes pode ser induzida por celulose e outras substâncias (por exemplo: celobiose, soforose e lactose), enquanto a glicose atua como uma fonte de carbono repressora. O potencial industrial das celulases levou a uma investigação das propriedades bioquímicas, estrutura tridimensional e mecanismo de ação de uma série dessas proteínas. Apesar disso, a natureza do indutor nem as vias de sinalização de sensoriamento e transporte estão elucidadas. Diante disso, esse projeto propõe o estudo sistemático funcional das redes de regulação gênica deste fungo durante a produção de celulases. Os esforços serão focados na elucidação do sensoriamento de nutrientes por receptores do tipo GPCrs, PTH11 e proteínas com domínio CFEM; identificação de novos transportadores de açúcares por proteômica de membrana; identificação de novos fatores de transcrição envolvidos na regulação da expressão de celulases; genômica funcional por CRISPR-Cas9 dos genes candidatos diferencialmente expressos nas condições de produção e repressão de celulases; avaliação de alvos de fosforilação por PKA, TMK1 e TMK2 por estudos de fosfoproteoma e por fim; a integração dessas informações para entender a biologia sistêmica do fungo durante a produção de celulases. Com os resultados gerados nesse projeto, pretendemos contribuir para o maior entendimento da biologia desse importante fungo industrial, com vistas na produção de mutantes metabólicos a fim de aumentar a produção de celulases e diminuir os custos de produção que ainda oneram grande parte dos produtos biotecnológicos obtidos a partir de T. reesei.

O Brasil é um dos países com maior diversidade em termos de biomassa lignocelulósica. A produção de enzimas lignocelulolíticas por fungos filamentosos tem sido um constante objeto de estudo, principalmente porque tais enzimas são de fundamental importância em processos de geração de biocombustíveis a partir de biomassa vegetal. Entretanto, ainda não se conseguiu um microrganismo considerado altamente eficaz para a hidrólise da biomassa. Isso se deve muito a falta de um conhecimento sólido na regulação da produção dessas enzimas. Um dos principais mecanismos de regulação da síntese de proteínas se dá pela ativação de cascatas de fosforilação que acarretam na ativação de fatores de transcrição. Dessa forma, a compreensão das vias de sinalização ativadas em determinadas condições pode fornecer conhecimento que permita "engenheirar" o microrganismo de forma que este se torne um melhor produtor de enzimas lignocelulolíticas, mesmo em condições com altas concentrações de glicose em que ocorreria a repressão catabólica. Assim, são objetivos deste projeto: (1) Elucidação das vias de sinalização celular mediadas por Proteína quinase A (PKA), MAPK e cálcio, (2) identificação por fosfoproteômica de alvos potenciais de fosforilação por PKA e MAPK, (3) estudo da genômica funcional de genes que fazem parte das vias de sinalização por PKA, MAPK e transportadores de cálcio identificados em T. reesei. (4) purificar e caracterizar as vesículas secretoras de T. reesei na indução por bagaço de cana de açúcar. (5) determinar e identificar o conteúdo proteico das vesículas extracelulares de T. reesei. Ao final do projeto pretendemos contribuir para o maior entendimento da biologia desse importante fungo industrial, com vistas na produção de linhagens mutantes a fim de aumentar a produção de holocelulases e diminuir os custos de produção de coquetéis enzimáticos que ainda oneram grande parte dos produtos biotecnológicos obtidos a partir de T. reesei, principalmente na produção de bioetanol. (AU)

A bioprodução de etanol a partir de materiais lignocelulósicos é de interesse nacional, sendo necessária a utilização de linhagens microbianas capazes de não somente fermentar os principais açúcares, mas também realizar a hidrólise enzimática de polímeros de carboidratos. Polissacarídeos presentes nestes materiais lignocelulósicos são matérias-primas para produção de etanol de segunda geração, devido à sua grande disponibilidade e riqueza em açúcares. A celulose é um dos três principais componentes da biomassa lignocelulósica, juntamente com hemicelulose e lignina. Trichoderma reesei (anamorfo deHypocrea jecorina) é conhecido por sua elevada capacidade de secreção de enzimas celulases, que atuam na hidrólise da celulose, sendo esse um ponto chave na produção de bioetanol. A hidrólise da celulose resulta na liberação de moléculas de glicose que podem causar repressão catabólica, isto é, na presença de glicose, uma fonte de carbono prontamente metabolizável, diminui-se a expressão de genes necessários para a utilização de outras fontes de carbono alternativas, CRE1 é uma fosfoproteína responsável pela repressão em presença de glicose, diminuindo a expressão de genes de celulases. Para que CRE1 exerça tal função, esta deve ser fosforilada, sendo provável que a proteína, caseína- quinase II, fosforile CRE1 afetando a repressão catabólica. Os objetivos deste projeto serão: avaliar a atuação da caseína-quinase II na repressão catabólica de carbono em Trichoderma reesei pela deleção nos genes codificadores de caseína-quinase II; analisar a expressão dos genes de celulase por PCR em Tempo Real; verificar a interação entre CRE1 em seu estado fosforilado e regiões promotoras de genes que codificam para celulases pelo ensaio de retardamento em gel ou EMSA (Eletrophoretic Mobility Assay). O novo mutante reprimido catabolicamente obtido poderá ser utilizado na hidrólise de biomassa vegetal contribuindo para os estudos que envolvem a produção de biocombustíveis.

O fungo Trichoderma reesei (Hypocrea jecorina) é um saprófito envolvido na degradação de polissacarídeos da parede celular de plantas. T. reesei apresenta uma capacidade surpreendente de formar e secretar celulases, sendo o fungo industrial mais importante na produção dessas enzimas que são utilizadas, dentre outros fins, na indústria de biocombustíveis, tal como o bioetanol. A degradação dos componentes da parede lignocelulósica é um processo complexo que requer uma série de proteínas regulatórias para torná-lo mais eficiente e poupar gastos energéticos desnecessários. Esse projeto tem como principal objetivo contribuir para o entendimento dos mecanismos moleculares envolvidos no processo de desconstrução da biomassa em T. reesei através da identificação e caracterização de novos transportadores de açúcar associados a este. Para isso, uma série de transportadores potencialmente envolvidos na degradação de biomassa, identificados anteriormente pelo nosso grupo através de análises in silico de dados de RNA-seq, serão deletados para verificação de suas respectivas funções. Posteriormente, faremos a caracterização dos transportadores por meio de teste de complementação em linhagem de Sacharomyces cerevisiae.. Com os dados obtidos, será construído um modelo relacionado ao papel desses transportadores no metabolismo de diferentes fontes carbono, possibilitando uma melhor compreensão do comportamento das enzimas celulolíticas produzidas por T. reesei e contribuindo para a aplicação desse fungo na indústria de bioetanol.

Para atender o aumento da demanda por biocombustíveis, microrganismos produtores de etanol, como a bactéria Gram-negativa Zymomonas mobilis, são de grande interesse devido ao seu potencial para a produção de bioetanol. Z. mobilis tem atraído atenção no início do desenvolvimento da tecnologia de combustível etanol; pois cresce e fermenta rapidamente e tem uma taxa de rendimento e significativamente maior do que a do produto de levedura; além disso, ela tolera altos níveis de etanol, uma propriedade praticamente única entre as bactérias. Além da engenharia de vias metabólicas mais eficientes para a síntese de biocombustíveis, os esforços para melhorar o rendimento de produção de sistemas engenheiros de efluxo para superar os problemas de toxicidade também é crucial. Um dos objetivos deste programa será usar evolução dirigida para selecionar mutantes para sistemas de transporte (bombas, por exemplo tripartidas que geralmente conferem resistência a produtos químicos tóxicos) em Z. mobilis que irá aumentar a sua capacidade de secretar etanol (e conferem tolerância a hidrolisados tóxicos derivados de biomassa lignocelulósica). Além disso, o nosso objetivo é o de expressar celulases em Z. mobilis, que foram marcados no seu N-terminal com a seqüência sinal para exportação de proteínas; e para colocar esses genes de celulase sob o controle de um AI-2 promotor responsivo (já identificados), de modo que a expressão e secreção destas enzimas pode ser coordenado com o processo de fermentação. (AU)

O fungo filamentoso Trichoderma reesei (Hypocrea jecorina) produz um grande número de celulases e hemicelulases que podem ser usadas na degradação de componentes da biomassa com aplicação na produção de bicombustível. A transcrição da maioria dos componentes do complexo de celulases é induzida não apenas por celulose, mas também por uma variedade de dissacarídeos incluindo lactose, celobiose e soforose e antagonizado por glicose. Entretanto, nem a natureza do indutor nem as vias de sinalização celular são totalmente conhecidas. O objetivo deste projeto é entender os mecanismos de formação de celulases pelo fungo T. reesei, bem como o mecanismo de repressão e as vias de sinalização celular envolvidas nesses processos. Como estratégia, utilizaremos técnicas de genômica e proteômica. Bibliotecas de cDNA serão construídas nas diferentes condições citadas acima e seqüenciadas utilizando Seqüenciamento Massal em Paralelo (Next Generation Sequencing-NGS) e a expressão dos genes diferencialmente expressos serão validados por PCR em Tempo Real (RT-qPCR) . O secretoma e a identificação de proteínas fosforiladas nas condições citadas serão analisados pela técnica de eletroforese 2-D fluorescente em gel diferencial (DIGE). Com os dados obtidos, um modelo de expressão gênica global será construído utilizando ferramentas de bioinformática o que possibilitará um melhor entendimento do comportamento da expressão gênica das enzimas celulolíticas produzidas pelo T. reesei contribuindo para sua aplicação na indústria de biocombustível

A crescente preocupação com o meio ambiente e saúde, bem como, com o aumento da produtividade agrícola tem impulsionado o desenvolvimento de métodos de controle de patógenos mais eficientes, menos poluentes e menos tóxicos. O controle biológico e o desenvolvimento de cultivares resistentes, por transgenia, são estratégias promissoras para este fim, pois além de apresentam baixo impacto ambiental estes processos não são óxicos, são mais específicos e eficientes. Sendo assim, torna-se necessário a busca e caracterização de agentes de biocontrole, bem como, o estudo dos mecanismos de defesa de plantas visando a identificação de genes associados à defesa e resistência ao ataque de patógenos. Os fungos do gênero Trichoderma são eficientes agentes de biocontrole de fungos fitopatogênicos de solo e foliares. O mecanismo pelo qual este gênero controla a ocorrência de doenças fúngicas é complexo e envolve o micoparasitismo, a competição por nutrientes e espaço, bem como, a indução de resistência e resposta de defesa em plantas hospedeiras. O micoparastismo é um processo que ocorre em várias etapas iniciando pelo contato micoparasita-hospedeiro. Os fungos do gênero Trichoderma reconhecem o fungo fitopatogênico crescendo em sua direção e uma vez estabelecido o contato mediado pela interação proteínas receptoras e lectinas, uma série de genes envolvidos no processo de micoparasitismo são expressos, como por exemplo, as hidrolases de parede celular (quitinases, -1,3-glucanases e proteases). O controle da expressão destes genes não é completamente entendido, mas já existem trabalhos que descrevem a participação de proteínas G, quinases e AMP cíclico. Pouco se sabe também sobre o mecanismo utilizado pelo fungo para induzir resposta de defesa e resistência em plantas hospedeiras e como estas respondem à associação com o fungo micoparasita