Jaqueline Goes de Jesus.

O sequenciador portátil MinION (ONT) tem revolucionado o campo de sequenciamento de DNA e RNA pela sua portabilidade e capacidade de geração de longas sequências. Cada flow cell pode gerar de 10 a 30 Gb de dados de sequência de DNA. O MinION gera dados em tempo real permitindo que a análise possa ser realizada durante o experimento e os fluxos de trabalho sejam totalmente versáteis. Sua metodologia tem sido empregada em diversos ambientes como em regiões de montanhas, no Ártico, em cavernas e até mesmo em aeronaves espaciais. Neste curso, será empregada a metodologia utilizada pela equipe de profissionais que introduziu a metodologia no Brasil e conta com mais de 6 anos de experiência no uso das plataformas da Oxford Nanopore Technologies, como o MinION, GridIon e PromethION. Será abordado todo o workflow para geração de genomas completos, desde o desenho do esquema de primers à geração de sequências

O HTLV-1 foi o primeiro retrovírus humano descrito, seguido pelo HTLV-2 e HTLV-3. Acredita-se que HTLV-1, HTLV-2 e HTLV-3 se originaram independentemente e teriam emergido do contato entre humanos e primatas não-humanos infectados com STLV. Durante o ciclo de replicação desses retrovírus pode ocorrer a formação de retroelementos, os elementos com repetições terminais longas. Estima-se que mais de 40% do genoma humano seja composto de retroelementos, sendo 8% de elementos LTR. Sugere-se ainda que os HERVs estão no genoma humano por um período de aproximadamente 30 milhões de anos, e alguns eventos de transposição envolvendo-os podem ter modificado a expressão gênica celular, conferindo ao hospedeiro uma vantagem seletiva. Esse estudo tem como objetivo identificar a presença de isolados de HTLV-1, HTLV-2, HTLV-3, STLV-1, STLV-2 e STLV-3 como retrovírus internos humanos.

Vários fatores relacionados ao hospedeiro e/ou ao vírus podem contribuir para a susceptibilidade à infecção pelo HIV-1 e para a evolução para AIDS em indivíduos infectados. A transmissão vertical do HIV durante a gestação ou parto, na falta de tratamento, chega a atingir uma taxa de 25%. Vários estudos têm demonstrado que células de Langerhans (LC), abundantes no cordão umbilical e canal vaginal, podem ser infectadas pelo HIV-1 e subsequentemente transmití- los para os linfócitos T através de uma lecitina do tipo C específica de células dendríticas, denominada de langerina, justificando o sucesso da infecção nesse tipo de transmissão. Entretanto, a infecção de LC só é eficiente em carga viral bastante elevada. A proteína langerina é responsável pela captura e internalização do HIV por grânulos intracelulares, os quais degradam a partícula viral inibindo a apresentação do HIV-1 para os linfócitos T e prevenindo a infecção pelo vírus (em carga viral baixa e mucosa intacta). Diferenças na função da langerina devido a fatores genéticos podem influenciar na susceptibilidade à infecção pelo HIV-1. Considerando que a epidemia de HIV/AIDS é um sério problema de saúde pública em nosso país e que os mecanismos de transmissão vertical do vírus ainda não estão bem caracterizados, é de grande importância conhecer a influência dos fatores genéticos do hospedeiro na infecção pelo HIV -1 para a elaboração de novas formas terapêuticas, preventivas e profiláticas para o tratamento da AIDS.