Jose Gregorio Cabrera Gomez.

Curso intitulado "Análise de fluxos metabólicos: produção de PHA e TAG como modelos de estudo" realizado no âmbito do Centro Brasileiro-Argentino de Biotecnologia - CBAB-CABBIO, Ministério da Ciência e Tecnologia - Coordenação Geral de Biotecnologia e Saúde.

Serão utilizadas linhagens bacterianas desenvolvidas em outros projetos para a produção de ramnolipídeos em biorreator. Também se buscará por atingir cultivos em alta densidade celular. Planeja-se avançar no conhecimento sobre enzimas relacionadas à síntese de ramnolipídeos com estudantes de IC e potencialmente com posdoc futuro que seja incorporado ao projeto.

Seleção de bactérias produtoras de polihidroxialcanoatos a partir de glicerol. Melhoramento genético para a utilização de glicerol. Produção de copolímeros P3HB-co-3HHx. Avaliação biomédica do polímero.

Seleção de bactérias para a produção de ácido succínico.

Projeto visa ao desenvolvimento de processos de produção de polihidroxialcanoatos (plásticos biodegradáveis) a partir de resíduos-subprodutos cítricolas. Seleção de bactérias. Estudo da utilização de pectina. Estudo de bioprocesso utilizando pectina ou subprodutos cítricolas.

Avalia-se a produção de PHA por Pseudomonas sp. LFM046 utilizando-se propionato para modificação da composição do polímero. Fluxômica por medidas de fluxos de troca. Modificação genética da bactéria. Tem como desdobramento a produção de 2-metilisocitrato a partir de glicose e propionato.

13C-MFA está sendo utilizada para estimar a distribuição de fluxos no metabolismo central de Pseudomonas realcionado à produção de PHA e RHL a partir de glicose

Projeto FAPESP sob a coordenação da Dra. Luiziana Ferreira da Silva. Encerrado na FAPESP em 31/07/2019, continua com a atividade de bolsistas de mestrado e doutorado.

Projeto Universal CNPq coordenado pela Dra. Luiziana Ferreira da Silva.
Polihidroxialcanoatos (PHA) são polímeros termoplásticos bacterianos biodegradáveis e biocompatíveis que podem ser obtidos a partir de recursos renováveis. A alta incidência da fonte de carbono no custo final do polímero tem sido um dos principais fatores limitantes para a produção de PHA, assim, resíduos agrícolas, particularmente materiais lignocelulósicos, ganharam atenção para superar este problema. No Brasil, a produção de etanol de 2a geração a partir da fração de glicose derivada do hidrolisado de bagaço de cana de açúcar tem sido estudada. No entanto, como a fração de xilose ainda não é de fato eficientemente fermentada por leveduras etanologênicas, grandes quantidades de xilose estarão disponíveis, criando uma oportunidade para desenvolver processos biológicos gerando novos produtos a serem introduzidas em um modelo de biorrefinaria. Esta proposta apresenta abordagens de estudo que podem facilitar essa integração. Para ser utilizado por microorganismos produtores de etanol, PHA, ou outros produtos, resíduos lignocelulósicos precisam ser submetidos ao processo de hidrólise (ácida ou enzimática), gerando uma mistura complexa de substâncias (acetatos, compostos alifáticos e aromáticos fenólicos) que inibem vários organismos, reduzindo produtividade, sendo, portanto, uma barreira na utilização de materiais lignocelulósicos. Várias estratégias para reduzir a toxicidade dos hidrolisados foram estudadas, mas mesmo com este problema resolvido, o produto final seria uma mistura de hexoses e pentoses, principalmente glicose e xilose e arabinose. O uso eficiente de xilose ainda representa uma barreira técnica, devido a duas limitações principais: repressão catabólica e ineficiência do consumo de xilose, resultando em redução da produtividade. Dentro deste contexto, pretendemos melhorar o consumo de xilose na bactéria Burkholderia sacchari. O produto alvo é o polímero biodegradável PHB, e a sua inclusão numa biorrefinaria, mas o mesmo método pode ser aplicado a quaisquer microrganismos recombinantes que produzem outros compostos de interesse biotecnológico. Além de melhorar a utilização da xilose, espera-se melhorar o consumo bacteriano de mistura de açúcares geralmente liberados a partir de hidrolisados de cana de açúcar (glicose, xilose e arabinose). Para isso, pretende-se analisar o metabolismo como um todo, em busca de organizações de genes catabólicos de xilose mais eficientes, propor a sua inclusão no modelo de bactéria. Além disso, a partir de prévias Análises de Fluxos metabólicos (AFM), pretende-se construir recombinantes modificados em genes importantes para aumentar a eficiência de consumo de xilose e reduzir ou abolir a repressão catabólica para melhorar a eficiência da utilização de misturas de açúcares. Finalmente, empregando técnicas de engenharia evolutiva, clones bacterianos com maior taxa de crescimento em xilose serão procurados, já que nossos estudos anteriores indicaram que este é um outro fator que contribui para melhorar o uso de hidrolisados hemicelulósicos. Ainda, usando AFM com xilose marcada não-radioativamente (13C), podemos apontar novos alvos potenciais para a modificação genética que nem sempre são evidentes a partir de uma primeira avaliação.

Projeto em edital FAPESP-NWO em cooperação com a TUDelft.

Projeto de pesquisa em cooperação com empresa holandesa (ChainKraft) sob coordenação da Profa. Luiziana Ferreira da Silva

Projeto financiado pela FAPESP (Processo 2010/51692-1) sob coordenação da Dra. Marilda Keico Taciro com enfase sobre a aplicação de técnicas de engenharia metabólica para avaliar processo de produção de biopolímero.

Projeto financiado pela FAPESP (Processo 2010/51989-4) sob coordenadação da Dra. Luiziana Ferreira da Silva, que trata da produção de etanol e polihidroxialcanoatos a partir de xilose.

Trata-se de uma rede composta por pesquisadores do Brasil, Argentina, Uruguai, México, Portugal e Espanha. Conta ainda com a participação de duas empresas (PHB industrial S/A e Biopolis, S.L.). O objetivo é promover cooperações para o desenvolvimento de processos de produção de polihidroxialcanoatos e outros bioprodutos.

Projeto financiado pela FAPESP (Processo 2008/51324-2), coordenado pela Prof. Dra. Luiziana Ferreira da Silva, no qual se utilizam diferentes estratégias para obtenção de linhagens capazes de produzir copolímeros P3HB-co-HAmcl.

Projeto financiado inicialmente pela FAPESP (Processo 03/01602-2) relacionado ao desenvolvimento de microrganismos e processos para a produção de PHA com diferentes composições. Atualmente, sendo financiado por bolsas de pesquisa (iniicação científica, mestrado e pós-doutorado) da FAPESP.

Projeto Temático coordenado pelo Prof. Dr. Carlos Osamu Hokka da UFSCar, com participação da UFSCar, USP e UNICAMP. Desenvolvimento de microrganismos e processos para produção de ácido clavulânico, cefamicina C e outros compostos bioativos de Streptomyces.

Projeto financiado pela FAPESP no qual se avaliou o metabolismo de propionato em B. sacchari com o objetivo de melhorar o processo de produção do copolimero P3HB-co-3HV

Projeto financiado pelo Centro Brasileiro-Argentino de Biotecnologia (CBAB) através do CNPq.