Luiz Paulo Moura Andrioli.

O conhecimento dos mecanismos moleculares responsáveis pela transcrição diferencial, especialmente pelo modo como os fatores de transcrição atuam, ainda é mínimo. Nosso grupo aborda essa questão investigando o sistema modelo da cascata de segmentação que especifica o eixo ântero-posterior do corpo da Drosophila melanogaster. Recentemente publicamos artigos focando níveis iniciais dessa rede reguladora, onde fatores de transcrição repressores operam de forma aditiva na delimitação das faixas de expressão dos genes pair-rule e impedem que os módulos reguladores destas faixas sejam ativados em regiões mais anteriores do embrião. Propomos dar continuidade a essa linha de pesquisa empregando diferentes abordagens: genética (remoção simultânea de vários repressores e análise dos padrões de expressão de genes da segmentação no embrião), bioquímica (experimentos de interação DNA-proteína in vitro) e in silico (predição de sítios de ligação para fatores de transcrição em genes alvo seguidas de análises de bioinformática, estatística e computacional). A integração de abordagens promoverá a detecção de propriedades dos fatores de transcrição investigados e dos mecanismos de regulação mediados pela interação deles com sítios de ligação nos módulos reguladores de genes alvo. A aprovação desta proposta viabilizará o avanço de investigações atualmente em diferentes fases de execução e contribuição com estudos transcricionais e da segmentação de drosófila com a publicação de artigos científicos. Esta proposta também consolidará nossa equipe multidisciplinar e o engajamento de alunos com interesses diversos.

No projeto propomos estudar a regulação da expressão gênica e sondar mecanismos evolutivos envolvidos na segmentação dos dípteros. Nosso principal objetivo é investigar a regulação transcricional dos genes gap da cascata de segmentação de Drosophila melanogaster. Focamos a porção anterior da blastoderme sincicial de Drosophila onde os genes gap têm domínios de expressão parcialmente sobrepostos. Investigamos a hipótese de que esse padrão de expressão é responsável por um mecanismo combinado de atividades repressoras da transcrição que delimitam faixas pair-rule mais anteriores, bem como limites dos domínios de expressão entre os genes gap. Dados da literatura e principalmente dados genéticos não publicados do nosso laboratório sustentam essa hipótese. Propomos experimentos genéticos, bioquímicos e a utilização de recursos da área da computação e bioinformática para verificar o papel dos genes gap CG9571 e Tll nesse sistema combinatorial e também, para elaborar um modelo de regulação da expressão gênica envolvida na segmentação da parte anterior da futura cabeça. Paralelamente, nosso objetivo é a identificação de ortólogos da segmentação no díptero Trichosia pubescenes, e mapear o padrão de expressão destes genes. Esses resultados poderão revelar uma situação mais típica para os dípteros, pois a Drosophila parece não ser o modelo mais representativo para o grupo, de acordo com a literatura e dados preliminares do laboratório.

EDITAL 2012-2013 ?Ampliação e Melhoramento da Infraestrutura de Pesquisa INFRA-USP da Pró-Reitoria da USP?

AUXÍLIO REGULAR DE PESQUISA/ FAPESP

AUXÍLIO JOVEM PESQUISADOR/ FAPESP