Oswaldo Keith Okamoto.

O IRIS USP (Interdisciplinary Research for Innovative Solutions) é uma iniciativa que visa articular projetos capazes de desenvolver soluções inovadoras disruptivas para problemas de alto impacto na ciência, economia e na sociedade, a partir de abordagem interdisciplinar e equipes multidisciplinares, em colaboração com os setores privado e público. O IRIS está integrado ao INOVA USP, um conglomerado de novos laboratórios, desvinculados de unidades, que deverá oferecer uma infraestrutura de pesquisa de última geração, marcada pela interdisciplinaridade, com o objetivo de se tornarem instituições de encruzilhada, preparadas para a pesquisa colaborativa, com atores diversificados, públicos e privados.

Chamada: MCTI/CNPq/DBT N º 17/2015 Programa de Cooperação
SEPED/MCTI/CNPq com o Departamento de Biotecnologia (DBT) do Ministério
da Ciência e Tecnologia da Índia

CNPq / chamada Universal 2014

CEPID - Centros de Pesquisa, Inovação e Difusão / Edital 2011

O Instituto Nacional de Ciência e Tecnologia de Células-Tronco em Doenças Genéticas Humanas está associado ao Centro de Estudos do Genoma Humano (CEGH). Sua missão é estabelecer um banco de células tronco de pacientes com doenças genéticas, atuando como um centro de referência mundial para pesquisas e um banco de DNA de idosos saudáveis. O Instituto também proverá ensino e treinamento para profissionais no uso de células-tronco em projetos de pesquisa e em abordagens terapêuticas.

Pesquisador integrante do Centro de Tecnologia Celular com foco em células tronco humanas provenientes de diferentes fontes e ensaios pré-clínicos em doenças neuromusculares, neurodegenerativas e craniofaciais. Coordenador: Dra. Maria Rita dos Santos e Passos Bueno (USP).

O principal objetivo deste estudo é avançar no entendimento dos mecanismos moleculares subjacentes à tumorigênese, que possam evidenciar uma correlação entre a biologia de células-tronco e o câncer. Tal conhecimento é pertinente ao desenvolvimento de estratégias terapêuticas racionais direcionadas à supressão tumoral.

O nosso grupo integra um consórcio formado por universidades e instituições de pesquisa do Estado de São Paulo para a realização do Projeto Genoma Clínico do Câncer, que visa desenvolver novas formas de diagnóstico e tratamento do câncer a partir do estudo de genes expressos. Nosso projeto financiado pela FAPESP está conectado a outros seis projetos de pesquisa (quatro temáticos e dois individuais da FAPESP), centrados no estudo molecular de quatro tipos de manifestação do câncer: as doenças linfoproliferativas, tumores gastrointestinais, tumores neurológicos e de cabeça e pescoço. 
Nosso grupo é responsável pela coordenação de estudos em genômica funcional, utilizando a tecnologia de microarrays (chips de DNA). Genes hiper- e hipo-expressos em tumores estão sendo identificados por esta metodologia, mediante validação dos dados por RT-PCR em tempo real. Perfis de expressão gênica global serão determinados pelo agrupamento de genes com variação e amplitude de expressão semelhantes nas diversas amostras de tumor. Essa abordagem permite estabelecer padrões de transcrição (assinaturas moleculares) que podem auxiliar na identificação de genes que sejam relevantes ao diagnóstico, prognóstico, definição de subtipos tumorais, predição de resposta às diferentes abordagens terapêuticas ou que possam representar alvo para desenvolvimento de novas drogas.

Nosso grupo vem trabalhando com células-tronco adultas, utilizando citometria de fluxo, imunocitoquímica, microarrays e PCR quantitativo em tempo real como ferramentas experimentais que, em conjunto, podem facilitar a caracterização molecular e funcional destas células. O objetivo principal deste estudo é a compreensão dos mecanismos moleculares envolvidos na regulação dos processos de auto-renovação, diferenciação e transformação maligna de células-tronco. 
Nossa proposta para estudos nesta área é bastante abrangente e envolve experimentação em áreas básicas, ensaios em modelos animais e testes para aplicação clínica nas áreas de neurologia, cardiologia e oncologia.

Este projeto de pesquisa tem por objetivo principal entender programas de expressão genômica mediados por espécies reativas de oxigênio (ERO) e nitrogênio (ERN), envolvidos na diferenciação de células-tronco (stem cells), através de análises de padrões globais de expressão gênica por cDNA Microarrays. 
Neste projeto, pretende-se investigar os eventos moleculares associados à auto-renovação e diferenciação de células-tronco em estudos de genômica funcional.

Estudo de padrões globais de expressão gênica em eucariotos. Estudo onde foram gerados os primeiros cDNA microarrays e banco de ESTs de dinoflagelados.

Clonagem, análise de estrutura gênica e genômica e evolução molecular de luciferases de dinoflagelados.

Clonagem da enzima superóxido dismutase de dinoflagelados e estudo de sua expressão mediante estresse oxidativo e oscilações circadianas.