Aline Silva Mello Cesar.

O presente projeto tem como objetivo disseminar informações científicas sobre alimentos funcionais e educação alimentar saudável por meio da criação e utilização de materiais interativos, como jogos, quizzes e cartilhas. Estes materiais serão desenvolvidos para atrair e engajar o público, alcançando tanto a comunidade local de Piracicaba-SP e região quanto uma audiência global através de atividades interativas realizadas em eventos dentro e fora da Universidade. Além disso, o projeto visa aprimorar as habilidades dos bolsistas na produção de conteúdo digital e nas mídias sociais, promovendo uma maior interação entre a Universidade e a sociedade. Este projeto visa fornecer informações baseadas em evidências sobre alimentos funcionais e seus benefícios para a saúde, abordando problemas de saúde pública e incentivando práticas alimentares saudáveis. A integração entre alunos, docentes, servidores e a comunidade externa enriquecerá a formação acadêmica e fortalecerá os laços entre a Universidade de São Paulo e a sociedade, promovendo futuras colaborações. Além disso, ao destacar o papel dos profissionais na produção de alimentos funcionais, o projeto atrai novos alunos para a área, incentivando a continuidade das pesquisas. A disseminação de informações através de materiais interativos garantirá acesso a conteúdos de qualidade, enquanto a criação de materiais interativos desenvolverá competências essenciais nos alunos, preparando-os para comunicar eficazmente com a sociedade e impactar positivamente a saúde pública.

Nos últimos anos, a sociedade vem se tornando cada vez mais exigente em relação à produtos saudáveis, aumentando a procura pelos alimentos funcionais. Desta forma, levar informações correta à sociedade sobre o tema alimentos funcionais e alimentação saudável trata-se de um trabalho muito importante e deve ser difundido por profissionais que dominam este conhecimento. Esta proposta complementará de forma mais abrangente e inclusiva o projeto Desmistificando a Biologia Molecular e os Alimentos Funcionais já em andamento e com atuação em escolas públicas e privadas de Piracicaba/SP. Com a extensão universitária, o estudante, assim como professores e colaboradores, pode disseminar e compartilhar dos seus conhecimentos técnico e científico sobre o assunto para contribuir com o desenvolvimento socioeconômico e ambiental de comunidades menos privilegiadas. Esta interação e aproximação da Universidade com a sociedade, irá ajudar na disseminação de informações com embasamento científico que poderão impactar na problemática de saúde pública. Sendo assim, o principal objetivo desse projeto é levar o conhecimento sobre alimentos funcionais e alimentação saudável de forma a contemplar instituições e escolas que possuam estudantes do ensino médio com deficiência visual de Piracicaba-SP e região por meio de atividades interativas com materiais e atividades práticas específicas. O projeto visa alcançar resultados como: integração dos alunos de graduação da nossa instituição com a sociedade; aproximação do meio acadêmico com a comunidade externa; preparação dos nossos alunos para tomadas de decisões liderança e desenvoltura, motivar candidatos à área de alimentos funcionais; além de trazer aos nossos alunos o espírito de criação de material interativo para a divulgação de informações de qualidade de forma inclusiva.

Projeto desenvolvido por alunos da Esalq em resposta ao desafio promovido pela Wageningen University and Research (WUR), cuja minha participacao foi como mentora e coordenadora da equipe da Esalq. Nao fui a proponente da ideia inovadora, a qual surgiu do grupo do Prof. Paulo Hercilio, no entanto, fiz consideracoes que foram realizadas pelos alunos. A proposta aqui foi o desenvolvimento de um corante natural a partir de planta amazonica com elevado potencial antioxidante,

O INCT-FoRC está focado no tema Biotecnologia e Uso Sustentável da Biodiversidade, explorando a interseccionalidade entre biodiversidade de plantas, produção sustentável de alimentos, biotecnologia e saúde humana. O INCT-FoRC será hospedado pelo Centro Especial de Pesquisa e Inovação em Alimentos daUniversidade de São Paulo(CEPIx-FoRC), derivado de um CEPID/FAPESP, e atuará em parceria com outras instituições nacionais e internacionais para trabalhos estruturados em três plataformas interconectadas: 1)Estudos Biológicos e Sustentáveis da Biodiversidade Vegetal Brasileira, focando a identificação, caracterização ebioa1vidade de compostos funcionais em espécies vegetais com fins alimen]cios; 2) Processos BiotecnológicosAplicados a Produtos e Subprodutos Alimen]cios, priorizando novas tecnologias sustentáveis e 3) ImpactosEconômico/Socioambientais e Educação no Uso Sustentável da Biodiversidade, para capacitação de pequenosprodutores, avaliação ambiental de cadeias produ1vas e disseminação de boas práticas. O projeto tem uma abordagem farm-to-fork-to-gut, estudando a biossíntese de compostos bioativos in planta e avaliando os processos biotecnológicos aplicáveis para obtenção de produtos e subprodutos alimentícios e os efeitos na saúde humana, através de estudos pré-clínicos e clínicos. O INCT-FoRC fomentará a inclusão social e sustentabilidade,capacitando produtores e promovendo práticas de economia circular e a transferência de conhecimento e tecnologia por meio de parcerias estratégicas, publicações científicas e ações educacionais. A formação de recursos humanos especializados é também um dos objetivos. Busca-se contribuir para a saúde humana, a valorização da biodiversidade e o fortalecimento das cadeias produtivas nacionais de maneira sustentável,alinhando-se com vários ODS da ONU, especificamente as ODS 1, 2, 3, 4, 8, 9, 10, 11, 12 e 17.

O presente projeto tem como objetivo disseminar informações científicas sobre alimentos funcionais e educação alimentar saudável por meio da criação e divulgação de materiais digitais, como cartilhas e infográficos. Estes materiais serão desenvolvidos para atrair e engajar o público, alcançando tanto a comunidade local de Piracicaba-SP e região quanto uma audiência global através de uma plataforma online de livre acesso. Além disso, o projeto visa aprimorar as habilidades dos bolsistas na produção de conteúdo digital e nas mídias sociais, promovendo uma maior interação entre a Universidade e a sociedade. Este projeto visa fornecer informações baseadas em evidências sobre alimentos funcionais e seus benefícios para a saúde, abordando problemas de saúde pública e incentivando práticas alimentares saudáveis. A integração entre alunos, docentes, servidores e a comunidade externa enriquecerá a formação acadêmica e fortalecerá os laços entre a Universidade de São Paulo e a sociedade, promovendo futuras colaborações. Além disso, ao destacar o papel dos profissionais na produção de alimentos funcionais, o projeto atrai novos alunos para a área, incentivando a continuidade das pesquisas. A disseminação de informações através de materiais digitais garantirá amplo acesso a conteúdos de qualidade, enquanto a criação de materiais didáticos desenvolverá competências essenciais nos alunos, preparando-os para comunicar eficazmente com a sociedade e impactar positivamente a saúde pública.

Programas de Inovação Tecnológica / PIPE - Programa FAPESP Pesquisa Inovativa em Pequenas Empresas / PIPE - Fase 1

O principal objetivo desta proposta é identificar as diferenças na comunidade microbiana de suínosalimentados com dieta basal com adição de 3 de óleo degomado de soja (SOJ) x dieta basal com adição de 3 de óleo de canola (CAN), e explorar as correlações entre o perfil transcriptômico e o microbioma desses animais. O suíno é um excelente modelo animal para se estudar distúrbios metabólicos que podem ocorrer em humanos. Assim sendo, 48 suínos machos imunocastrados da raça Large White, provenientes da população experimental do projeto Jovem Pesquisador FAPESP (2017/25180-2), foram submetidos às dietas experimentais (SOJ e CAN), e foram abatidos aos 169 dias de idade (peso vivo médio final de 133,9 + 9,4 kg). O músculo esquelético (análises transcriptômicas) e o conteúdo do ceco (microbioma) foram coletados durante o abate. As fezes foram coletadas, diretamente do reto dos animais, aos 166 dias de vida (microbioma). A caracterização do microbioma será feita pelo sequenciamento do gene 16S rRNA, seguindo o protocolo 16S Metagenomic Sequencing Library Preparation (Illumina), e utilizando a plataforma Illumina MiSeq. Para integração do perfil transcriptômico e microbioma dos animais em cada uma das dietas serão realizadas análises de co-expressão gênica utilizando o pacote do R WGCNA (Weighted Correlation Network Analysis). Essa análise irá revelar módulos de genes correlacionados com a abundância das bactérias (nível de gênero) identificadas no ceco dos animais. Por fim, será usada análise de correlação do coeficiente de Spearman para calcular a correlação entre os hub-genes dos módulos significativos e as abundâncias das bactérias do ceco. Que seja do nosso conhecimento, este será o primeiro estudo em suínos que visa integrar dados transcriptômicos e do microbioma utilizando redes de co-expressão gênicas. O potencial de inovação do estudo está na identificação de alterações no microbioma do trato gastrointestinal em função de dietas diferenciadas, podendo contribuir para programas de dietas individualizadas e mitigação de doenças metabólicas em seres humanos.

O Brasil é um dos maiores produtores e exportadores mundiais de alimentos, fibras e (bio)combustíveis. Estimativas indicam que o país precisaria aumentar a produção de alimentos em 40 para atender às demandas globais até 2050. Enquanto isso, os sistemas agrícolas tropicais precisam ser aliados importantes para sequestrar carbono (C) e reduzir a emissão de gases de efeito estufa e, consequentemente, contribuir para a mitigação das mudanças climáticas. Portanto, o desafio é aumentar a produção agrícola conciliando a sustentabilidade ambiental, social e econômica. Nesse contexto, propomos a criação do Centro de Pesquisa de Carbono em Agricultura Tropical (CCARBON), sediado na ESALQ/USP, uma das mais conceituadas Faculdades de Agricultura do mundo. A missão do CCARBON será desenvolver soluções e estratégias inovadoras na agricultura tropical sustentável baseada no carbono para mitigar as mudanças climáticas e melhorar os padrões e condições de vida. Nossa visão é ser reconhecida como um centro líder de classe mundial em agricultura tropical de baixo C e qualificação de recursos humanos por meio de atividades de pesquisa, inovação e disseminação. Para atingir os objetivos do CCARBON, linhas de pesquisa estratégicas, multidisciplinares e inovadoras abrangerão cinco grandes áreas: solo, planta e animal, gases, clima e ferramentas digitais. O centro também será integrado a um grande ecossistema de inovação para apoiar descobertas e novas tecnologias por meio de parcerias público-privadas institucionais. Há múltiplas estratégias para disseminar ativamente o conhecimento e as inovações, contribuindo para que produtores adotem práticas mais sustentáveis, além de conscientizar a população sobre ações de baixo C e apoiar a elaboração de políticas públicas. Esperamos que nosso centro de pesquisa de classe mundial identifique os principais desafios e desenvolva e implemente soluções para aumentar a produção agroalimentar sustentável de agrossistemas tropicais, reduzindo as emissões de GEE e aumentando o sequestro de C por meio de práticas de gestão inteligentes para o clima. Os resultados abrirão o caminho para uma economia de baixo C e promoverão o desenvolvimento social sustentável nas próximas décadas.

Programas Especiais / PAIP - Programa de Apoio à Infraestrutura / EMU - Pequeno-Médio Porte

A carne suína é a mais consumida no mundo e fonte de ácidos graxos na dieta humana. Estratégias nutricionais vêm sendo utilizadas para promover alteração e melhora do perfil lipídico da carne aumentando os efeitos benéficos a saúde humana. A composição dos ácidos graxos (AG) depositados nos tecidos de suínos pode ser modificada através da dieta adotada com diferentes tipos de óleos. No entanto, os efeitos da inclusão dietética de óleos como canola, peixes e soja na expressão gênica de suínos são em sua maioria desconhecidos. Nesse sentido, nosso objetivo é identificar redes de co-expressão gênica associadas ao perfil de AG do músculo esquelético e fígado de suínos alimentados com diferentes níveis e fontes de óleo. Nesse estudo serão utilizados dados RNA-Seq de 72 suínos machos imunocastrados, alimentados com dietas consistindo em dieta basal de milho e farelo de soja suplementadas com 1,5 de óleo de soja (SOY1.5 nível comum usado na produção comercial de suínos) ou 3 de óleo de soja (SOY3.0), ou 3 de óleo de canola (CO) ou 3 de óleo de peixe (FO) por um período experimental de 98 dias durante as fases de crescimento e terminação (18 animais/tratamento). Assim como o perfil de AG depositados no músculo esquelético e fígado. A estimativa da associação entre os genes expressos e AG depositados será através de construção de redes de co-expressão a partir dos dados de RNA-Seq (n = 72) com as contagens normalizadas por transcrição por milhão (TPM), através do pacote WGCNA (Weighted Correlation Network Analysis) R e o enriquecimento funcional e análise de rede serão realizados pelos softwares Cytoscape e DAVID. Os resultados aqui esperados possuem um perfil tecnológico e de inovação significativos uma vez que fornecem informações relevantes aos conhecimentos de biologia de sistemas e podem apontar alvos a serem explorados na seleção genômica.

A carne suína destaca-se como uma das proteínas mais consumida mundialmente. Pela sua importância tanto econômica, quanto na área de saúde, sendo utilizado como animal modelo em pesquisas humanas, essa espécie, Sus scrofa, foi a escolhida para este estudo. Essa carne possui um alto valor nutricional, é uma grande fornecedora de ácidos graxos insaturados, já que os humanos precisam incluí-los na dieta alimentar. Nesse experimento, foram utilizadas informações de setenta e dois machos da raça Large White, imunocastrados e halotano homozigoto-negativo (NN), abatidos entorno de 130 kg. Os animais durante sua criação, obtiveram quatro dietas alimentares, sendo elas: basal com 1,5 de óleo de soja degomado, basal com 3 de óleo de soja, basal com 3 de óleo de canola e basal com 3 de óleo de peixe: óleo proveniente da sardinha boca torta (Cetengraulis edentulus). Logo após o abate, foram coletadas amostras dos tecidos para extração e sequenciamento de RNAm. O objetivo do presente projeto é identificar polimorfismos funcionais do tipo SNP e eQTLs associados às características do perfil de ácidos graxos a partir de dados de genotipagem em larga escala e do transcriptoma de músculo de suínos da raça Large White submetidos à dieta com diferente perfil de ácidos graxos. Para isto foi utilizada a abordagem de estudo de associação por modelo linear dos dados genotípicos (chip de SNP - GGP Porcine 50k) e de expressão gênica (RNA-Seq).

A modulação da microbiota intestinal por meio do perfil de ácidos graxos presente na dieta pode desempenhar papel crucial na prevenção e tratamento da obesidade e comorbidades. Entretanto, ainda não está esclarecido se é o microbioma cecal ou o fecal o mais relevante para a compreensão de sua conexão com o início da obesidade. Portanto, o presente estudo será realizado com o objetivo de avaliar a composição da comunidade bacteriana, bem como identificar Single Nucleotide Polymorphisms (SNPs) associados à abundância de bactérias presentes no conteúdo cecal e nas fezes de suínos alimentados com dieta enriquecida com ácido oleico em diferentes idades. Serão utilizadas amostras do conteúdo do ceco e das fezes oriundas de 48 suínos, machos imunocastrados, com peso vivo médio inicial e final de 28,5 2,7 kg (71 dias de idade) e 133,9 9,4 kg (169 dias de idade), respectivamente. Os animais foram distribuídos em um delineamento em blocos completos casualizados, com seis repetições por tratamento e quatro animais por baia. Os tratamentos consistiram em ração basal, composta principalmente por milho e farelo de soja, com adição de 3 de óleo degomado de soja (SOJ) ou 3 de óleo de canola (CAN), sendo este último rico em ácido oleico. O período experimental foi de 98 dias, durante o qual os animais receberam ração e água à vontade. As amostras de fezes foram coletadas diretamente do reto dos animais aos 71, 134 e 166 dias de vida. Amostras do tecido muscular e do conteúdo cecal foram obtidas de cada animal apenas no momento do abate. O DNA genômico bacteriano será extraído das amostras do conteúdo cecal e das fezes e amplificado com os oligonucleotídeos iniciadores da região V3 e V4 do gene 16S RNA ribossomal (16S rRNA) bacteriano. As bibliotecas do gene 16S rRNA serão sequenciadas por meio da plataforma Illumina MiSeq. A abundância relativa de cada grupo taxonômico será gerada na plataforma QIIME2 e testes PERMANOVA serão utilizados para comparar a diversidade beta entre cada grupo. O tecido muscular será utilizado para a extração de DNA genômico para o estudo de identificação de SNPs. O DNA genômico do tecido muscular será genotipado com o painel Illumina PorcineSNP60 BeadChip e, por fim, análises de associação serão realizadas pelo método Bayesiano com o programa GenSel.

No decorrer dos últimos anos, é evidente o aumento na busca por alimentos que trazem benefícios à saúde - alimentos funcionais - por parte dos consumidores de todo o mundo. É válido dizer que, observando a crescente tendência e valorização do "comer bem", diversos novos produtos vêm sendo desenvolvidos, melhorados, inseridos e até mais valorizados pelo mercado consumidor, tais como, por exemplo, soja e seus derivados, peixes marinhos (ricos em ácidos graxos ômega 3), cereais integrais como aveia e/ou cevada. Além desses, é indispensável a presença dos produtos lácteos fermentados como leites fermentados e iogurtes, esses que são importantes alimentos probióticos que trazem benefícios no funcionamento do trato gastrointestinal, além de reduzirem riscos de câncer de cólon e ocorrência de constipação. Em decorrência dos importantes benefícios proporcionados pelo consumo dos produtos lácteos fermentados, assim como a presença, disponibilidade e divulgação de informações sobre a presença de probióticos e efeitos dos produtos para o mercado consumidor, este projeto tem como objetivo estudar e comparar as diferenças físico-químicas entre iogurtes comerciais "comuns" e com alegação de funcionais (probióticos), assim como a comunidade microbiana, a fim de entender a comunidade microbiana deste produto presente na dieta de grande parte da população.

O cruzamento entre raças ou linhagens de suínos pode ser utilizado como uma importante ferramenta para a eficiência da produção animal e melhoria nas características de qualidade da carne de forma a atender aos anseios da cadeia de produção e dos consumidores da carne suína. Os principais fatores que influenciam a qualidade da carne são: idade, sexo, nutrição, manejo, bem-estar e genética dos animais. Os atributos da qualidade da carne suína, como suculência, maciez, sabor, pH e cor podem influenciar de maneira positiva ou negativa o consumidor na hora da compra, sendo a genética um fator muito relevante para esses atributos. No entanto, o conhecimento dos mecanismos biológicos associados à estas diferenças genéticas, linhagens selecionadas por diferentes atributos de produção e qualidade da carne, ainda apresentam muitas lacunas e pouco se conhece sobre o nível de expressão dos principais genes associados aos atributos de qualidade da carne suína em diferentes cruzamentos comerciais. Assim, este estudo tem como objetivo principal avaliar características de desempenho e consumo, bem como dos atributos de qualidade da carcaça e da carne e o nível de expressão gênica de genes relacionados à mecanismos biológicos associados a estes atributos entre diferentes linhagens genéticas de suínos. Serão utilizados um total de 528 suínos produtos do cruzamento de diferentes linhagens genéticas: (1) cruzamento F1 x Duroc puro (n= 176); (2) cruzamento F1 x macho híbrido (50 Duroc x 50 Pietrain) (n= 176); e (3) cruzamento F1 x macho de linhagem comercial (n= 176), que receberão dietas basais comerciais formuladas para atender as exigências nutricionais mínimas para suínos em fase de crescimento e terminação. Durante todo o experimento, os animais serão submetidos a pesagens individuais semanalmente para a obtenção de curvas de crescimento, além de avaliações de espessura de toucinho, profundida de lombo e área de olho de lombo por meio de ultrassonografia. Medidas de desempenho e de consumo serão obtidas semanalmente por baia. Ao final do período experimental serão coletadas amostras de sangue, no momento do abate serão coletadas amostras do músculo Longissimus lumborum para estudo de expressão gênica e após 24 horas do abate serão realizadas as análises de qualidade de carcaça e da carne, como área de olho do lombo, peso da carcaça quente e fria, espessura do toucinho, pH, cor, perda por cocção, perda por gotejamento, maciez e porcentagem de gordura intramuscular. Por meio dos resultados obtidos neste estudo é esperado identificar diferenças nos atributos de desempenho, consumo, qualidade da carcaça e da carne e do nível de expressão de genes relacionados a mecanismos biológicos importantes que contribuirão para o melhor entendimento biológico destas características de interesse econômico e o melhor direcionamento da produção da carne suína mundial.

Os lipídios atuam como moléculas de sinalização, participam de diversos processos e são importantes para todos os tipos de células. O fígado, tecido adiposo e músculo esquelético, são os principais tecidos responsáveis pelo metabolismo de lipídios, processo complexo e dinâmico, que envolve diversos reguladores transcricionais. Os lncRNA e circRNA são reguladores-chave no metabolismo, apresentam papel chave em relação a lipídios e têm sido amplamente estudados em modelos animais como os suínos. Para este projeto, serão utilizados dados de 72 suínos machos, provenientes de um estudo com período experimental de 98 dias. Os tratamentos experimentais consistiram de dietas de milho e farelo de soja contendo 1,5 de óleo de soja (SOY1.5), ou 3,0 de óleo de soja (SOY3.0), ou 3,0 de óleo de canola (CO), ou 3,0 de óleo de peixe (FO). As amostras de fígado e músculo foram coletadas e a extração de RNAm total foi realizada pela tecnologia Illumina. Com os dados do sequenciamento serão identificados novos transcritos e lncRNA e circRNA. Com os novos lncRNA e circRNA será feita a análise de expressão diferencial pelo pacote estatístico DESeq2 e a análise de enriquecimento funcional será feita pelos softwares PANTHER e DAVID. Com isso, a hipótese desse trabalho é que dietas com diferentes fontes de óleo fornecidas a suínos nas fases de crescimento e terminação, podem alterar o perfil de expressão gênica de novos lncRNA e circRNA e afetar processos associados ao metabolismo de lipídios do músculo e fígado. Como objetivo principal iremos identificar novos lncRNA e circRNA no músculo e fígado de suínos alimentados com diferentes fontes de óleo e verificar como as dietas modulam a expressão gênica em diferentes tecidos.

A modulação da microbiota intestinal por meio do perfil de ácidos graxos presente na dieta pode desempenhar papel crucial na prevenção e tratamento da obesidade e comorbidades. Entretanto, ainda não está esclarecido se é o microbioma cecal ou o fecal o mais relevante para a compreensão de sua conexão com o início da obesidade. Portanto, o presente estudo será realizado com o objetivo de avaliar a composição da comunidade bacteriana, bem como identificar Single Nucleotide Polymorphisms (SNPs) associados à abundância de bactérias presentes no conteúdo cecal e nas fezes de suínos alimentados com dieta enriquecida com ácido oleico em diferentes idades. Serão utilizadas amostras do conteúdo do ceco e das fezes oriundas de 48 suínos, machos imunocastrados, com peso vivo médio inicial e final de 28,5 ± 2,7 kg (71 dias de idade) e 133,9 ± 9,4 kg (169 dias de idade), respectivamente. Os animais foram distribuídos em um delineamento em blocos completos casualizados, com seis repetições por tratamento e quatro animais por baia. Os tratamentos consistiram em ração basal, composta principalmente por milho e farelo de soja, com adição de 3% de óleo degomado de soja (SOJ) ou 3% de óleo de canola (CAN), sendo este último rico em ácido oleico. O período experimental foi de 98 dias, durante o qual os animais receberam ração e água à vontade. As amostras de fezes foram coletadas diretamente do reto dos animais aos 71, 134 e 166 dias de vida. Amostras do tecido muscular e do conteúdo cecal foram obtidas de cada animal apenas no momento do abate. O DNA genômico bacteriano será extraído das amostras do conteúdo cecal e das fezes e amplificado com os oligonucleotídeos iniciadores da região V3 e V4 do gene 16S RNA ribossomal (16S rRNA) bacteriano. As bibliotecas do gene 16S rRNA serão sequenciadas por meio da plataforma Illumina MiSeq. A abundância relativa de cada grupo taxonômico será gerada na plataforma QIIME2 e testes PERMANOVA serão utilizados para comparar a diversidade beta entre cada grupo. O tecido muscular será utilizado para a extração de DNA genômico para o estudo de identificação de SNPs. O DNA genômico do tecido muscular será genotipado com o painel Illumina PorcineSNP60 BeadChip e, por fim, análises de associação serão realizadas pelo método Bayesiano com o programa GenSel.

O metabolismo dos lipídeos pode ser regulado pelo fígado, músculo esquelético e tecido adiposo, sendo esses lipídeos utilizados na beta-oxidação. Alguns ácidos graxos, como alfa-linolênico (ômega três, n-3) e linolênico (ômega seis, n-6), não são sintetizados pelos suínos (modelo animal para doenças metabólicas em humanos), devendo ser suplementados na dieta. A participação desses ácidos graxos é antagônica em relação aos processos inflamatórios, em que os ácidos graxos n-6 possuem uma atividade pró-inflamatória e o n-3 anti-inflamatória. A razão n-6:n-3 da dieta pode influenciar o metabolismo lipídico dos animais, assim como sua resposta inflamatória sendo sinalizada por meio da liberação de citocinas. Assim, o objetivo deste projeto consistirá em avaliar parâmetros bioquímicos e a abundância de citocinas no soro sanguíneo e correlacioná-los ao nível de expressão gênica total dos tecidos muscular esquelético e hepático de suínos submetidos às dietas com diferentes fontes de ácidos graxos. Para isso serão utilizadas amostras de soro sanguíneo, fígado e músculo esquelético (Longissimus dorsi) de 36 suínos, os quais serão avaliados estatisticamente pela análise de variância ANOVA e teste de Tukey através de técnicas colorimétricas, sequenciamento de nova geração (RNA-Seq), ELISA (Enzyme Linked ImmunoSorbent Assay) e uma abordagem de análise de sistemas por meio do pacote R WGCNA (Weighted Gene Co-expression Network Analysis). Este estudo trará informações inovadoras e relevantes para o melhor entendimento do efeito dos ácidos graxos sobre mecanismos biológicos associados à resposta imune em animal modelo para doenças inflamatórios como a obesidade e aterosclerose podendo direcionar estudos futuros de nutrigenômica e genômica funcional.

Duas características cruciais da pecuária são a eficiência alimentar (EA) e a emissão de metano entérico (EM) dos animais. Estudos utilizando diferentes tecnologias ômicas relataram que a microbiota ruminal pode promover variações fenotípicas no hospedeiro a curto e longo prazo. Existem muitas teorias possíveis para a comunicação interespécies entre a microbiota e as células hospedeiras, como por meio de proteínas, RNA e metabólitos, que podem ser transportados por todo o corpo do hospedeiro por meio de vesículas extracelulares (EVs). Pequenos RNAs não codificantes (sRNAs), como os microRNAs (miRNAs), representam candidatos promissores a uma "linguagem comum" entre as espécies, pois são produzidos por todos os organismos vivos e podem ser transportados por todo o corpo do hospedeiro por EVs. Estudos recentes sugerem que os miRNAs podem regular a expressão gênica bacteriana e, assim, influenciar a composição do microbioma. Além disso, as observações de estudos suportam a existência de RNAs em organismos procarióticos semelhantes aos miRNAs (msRNAs), capazes de regular a expressão gênica do hospedeiro. Nossa hipótese é que o hospedeiro pode regular sua microbiota através da ação de elementos reguladores (como miRNAs) e da interação entre genes, assim como os microrganismos podem regular várias vias metabólicas do hospedeiro por meio de msRNA e proteínas específicas. Além disso, levantamos a hipótese de que os EVs podem transportar esses mediadores primários nas comunicações microbiota-hospedeiro. Assim, os objetivos desta proposta de pesquisa são: (1) investigar a interação e regulação molecular entre o hospedeiro e candidatos microbianos associados à EA e EM em bovinos, (2) investigar msRNAs microbianos e miRNAs hospedeiros, e procurar por potenciais interações com base na regulação de sRNA, (3) identificar moléculas de sRNA transportadas por EVs e investigar o impacto de msRNAs candidatos em células do rúmen de bovinos cultivadas in vitro e, (4) identificar sRNAs e miRNAs candidatos no conteúdo ruminal, sangue e saliva como biomarcadores para os fenótipos de interesse.

O custo com alimentação corresponde cerca de 70 dos custos totais da produção de suínos. Um dos desafios da suinocultura é o aproveitamento de resíduos agroindustriais que viabilizem economicamente o preço da ração, desde que mantenham o desempenho animal equivalente ao obtido com ingredientes convencionais, milho e farelo de soja. A casca de soja, subproduto fibroso obtido do processamento da soja, pode ser empregada nas dietas de suínos, em substituição ao milho, para tornar a produção menos onerosa e mais sustentável. Porém, dietas ricas em fibra possuem ação abrasiva no intestino, o que induz a secreção de mucina, glicoproteína rica em treonina, o desequilíbrio da microbiota intestinal e a inflamação sistêmica. Portanto, as necessidades dietéticas do aminoácido treonina aumentam para manter a homeostase intestinal em suínos alimentados com dietas fibrosas. O nível de treonina digestível recomendado pelas tabelas de exigências nutricionais para suínos não considera o uso de ingredientes ricos em fibra na dieta. Dessa forma, novos ajustes aminoacídicos com o fornecimento de dietas com casca de soja para suínos devem ser avaliados e propostos, sobretudo em regiões que possuem alta oferta desse resíduo, como é o caso do Centro-Oeste. A hipótese a ser investigada é que dietas com casca de soja e suplementadas com treonina digestível acima da recomendação atual podem contribuir para manutenção da homeostase intestinal e potencializar as respostas produtivas dos suínos. Se a demanda extra de treonina não for atendida pela dieta, a proteína muscular é mobilizada para defesa e reparo intestinal, comprometendo o crescimento animal. As combinações entre dois níveis de casca de soja (0 ou 15) e dois níveis de treonina digestível (exigência do animal e 19 acima da exigência do animal) serão avaliadas para suínos em crescimento em dois experimentos: (1) desempenho, marcadores sanguíneos de processo inflamatório e composição da microbiota fecal e (2) balanço de nitrogênio.

Dentre os produtos cárneos processados a partir da carne de suínos mais consumidos e, portanto, mais vendidos podemos destacar a linguiça frescal. No entanto, por ser um produto com alta proporção de gordura em sua composição, questionamentos têm sido levantados e despertado o interesse dos consumidores em relação às suas características de "saudabilidade" o que inclui o perfil de ácidos graxos dessa gordura. No caso de suínos a composição de ácidos graxos pode ser alterada por meio da dieta fornecida aos animais. Devido ao fato que os suínos são animais monogástricos e que apresentam uma direta relação entre o perfil de ácidos graxos de sua dieta e o perfil de ácidos graxos depositados em seu músculo e consequentemente em sua carne, o presente estudo tem como objetivo avaliar as características físico-químicas e lipídicas, cor, pH, condições microbiológicas, parâmetros sensoriais e verificar a aceitação e intenção de compra pelos consumidores de linguiça frescal fabricada a partir da carne de suínos alimentados com diferentes fontes de óleo em três tempos (0, 7 e 14 dias) de vida de útil. Para isso, serão utilizadas linguiças fabricadas a partir da carne de animais que receberam três diferentes óleos em sua dieta durante a fase de crescimento e terminação e, também a carne adquirida em estabelecimento comercial, representando o tratamento controle. Os óleos e proporções adicionadas na dieta foram 3 de óleo de soja (SOJ), 3 de óleo de canola (CAN) e 3 de óleo de peixe (PEI), os quais foram selecionados com base no diferente perfil de ácidos graxos que esses óleos apresentam. Os resultados obtidos neste projeto são inovadores e poderão trazer informações relevantes para a área da indústria e para os consumidores que buscam um produto diferente e com melhor valor nutricional.

A biologia molecular estuda moléculas como proteínas, lipídios, carboidratos e ácidos nucleicos, estes últimos responsáveis por processos celulares como a duplicação, transcrição, e tradução do DNA. O DNA fornece informações importantes as quais são capazes de determinar características fenotípicas e de identificação específica de espécies. Baseado nestas particularidades e especificidades do DNA, cientistas de muitas áreas do conhecimento têm se debruçado em pesquisas que colaborem para os avanços tecnológicos aplicados à área da saúde animal e humana. Assim, nas últimas décadas significativos avanços tecnológicos na área da biologia molecular foram alcançados com êxito. No entanto, muitas destas tecnologias desenvolvidas ainda estão distantes da sociedade como um todo, sejam elas úteis para solução de problemas ou para a capacitação de profissionais nesta área. Assim, nesta proposta temos como objetivo principal colocar adolescentes de escolas públicas do Ensino Médio em contato com o ambiente da Universidade e capacitá-los quanto às ferramentas da biologia molecular aplicadas para a detecção de fraude em alimentos de origem animal. O grupo de pesquisa do Laboratório de Biologia Molecular e Micotoxinas (LABMIC) do Departamento de Agroindústria, Alimentos e Nutrição da ESALQ/USP possui expertise nesta área do conhecimento e domina ferramentas da biologia molecular aplicadas para a segurança dos alimentos e garantia da qualidade de alimentos. O LABMIC possui atualmente duas bolsistas CNPq de pré-iniciação científica ligadas ao projeto WASH/USP, as quais têm apresentado êxito em suas atividades e desempenho escolar. As estratégias propostas para o alcance dos objetivos aqui apresentados são juntamente com as escolas parceiras selecionar três alunos do Ensino Médio com mérito escolar e frequência acima de 85; treiná-los quanto às boas práticas de laboratório e de descarte de resíduos, treinamento teórico- prático da biologia molecular; treinamento quanto à pesquisa; formação ética e social; e proporcionar o contato com o ambiente universitário. Os resultados esperados a partir da realização desta proposta é despertar o interesse dos jovens envolvidos para com a Universidade, ciência e pesquisa, bem como estimular o perfil ético social destes jovens. Desta forma, retornamos à sociedade respostas e soluções às suas demandas sociais.

Nos últimos anos, a sociedade vem se tornando cada vez mais exigente em relação à produtos saudáveis, aumentando a procura pelos alimentos funcionais. Desta forma, levar informações correta à sociedade sobre o tema alimentos funcionais trata-se de um trabalho muito importante e deve ser difundido por profissionais que dominam este conhecimento. Com a extensão universitária, o estudante, assim como professores e colaboradores, pode disseminar e compartilhar dos seus conhecimentos técnico e científico sobre o assunto para contribuir com o desenvolvimento socioeconômico e ambiental de comunidades menos privilegiadas. Esta interação e aproximação da Universidade com a sociedade, irá ajudar na disseminação de informações com embasamento científico que poderão impactar na problemática de saúde pública. Sendo assim, o principal objetivo desse projeto é levar conhecimento sobre alimentos funcionais às escolas de ensino médio de Piracicaba-SP e região através de vídeos animados com linguagem clara e objetiva, além da disponibilização desses vídeos em plataforma online com acesso aberto a todas as pessoas; e criação de cartilhas informativas sobre o tema para disponibilização nas escolas vinculadas ao projeto. O projeto visa alcançar resultados como: integração dos alunos de graduação da nossa instituição com a sociedade; aproximação do meio acadêmico com a comunidade externa; preparação dos nossos alunos para tomadas de decisões liderança e desenvoltura, motivar candidatos à área de alimentos funcionais; além de trazer aos nossos alunos o espírito de criação de material didático para a divulgação de informações de qualidade.

Lipídios são fontes energéticas essenciais na dieta humana, pois agem diretamente na homeostase corporal. A suplementação de dietas animais com ácidos graxos poliinsaturados (PUFA) podem trazer benefícios importantes para a saúde e desempenho dos mesmos, uma vez que esses ácidos graxos apresentam propriedades funcionais com atuação na regulação da expressão gênica, resposta imunológica e à inflamação. Sendo assim, este trabalho busca compreender o potencial efeito de ácidos graxos provenientes de uma fonte de óleo rica em PUFA, quando adicionados à dieta de suínos, sobre o perfil transcriptômico do fígado destes animais. Para isso, serão analisados os dados do transcriptôma (RNA-Seq) do fígado de 36 suínos machos imunocastrados, halotano homozigoto-negativo (NN) e da raça Large White provenientes do projeto Jovem Pesquisador (processo FAPESP número 2017/25180-2). Esses animais foram divididos em dois grupos, em que, um grupo recebeu uma dieta basal contendo milho e farelo de soja com 1,5 de óleo de soja (dieta utilizada comumente em granjas comerciais) e o outro grupo uma dieta basal contendo milho e farelo de soja com 3 de óleo de peixe proveniente da sardinha boca torta (Cetengraulis edentulus) por um período experimental de 98 dias. Os resultados aqui obtidos contribuirão para o melhor entendimento do efeito dos PUFA como componentes funcionais das dietas animais, assim como o seu papel como um imunonutriente. Este projeto ainda tem a importância do treinamento e capacitação do aluno de graduação na pesquisa e na formação de recurso humano em uma área emergente como da genômica funcional e bioinformática, com foco na nutrigenômica.

Projeto com o objetivo de levar à comunidade informações sobre a biologia molecular e alimentos funcionais. Por meio da elaboração de livretos informativos em uma linguagem de fácil compreensão em todos os níveis sociais; realização de abordagens para a transferência do conhecimentos até os futuros profissionais do mercado de trabalho da cidade de Piracicaba/SP por meio de atividades lúdicas e práticas realizadas em feiras em locais públicos (preferencialmente feira de ciências e profissões) com realização de pequenos ensaios de biologia molecular; visita ao laboratório científico da área (laboratório da coordenadora proponente); e da possibilidade dos alunos de graduação da ESALQ/USP o convívio, o compartilhamento de conhecimento e a prática de extensão; e elaboração de vídeos, vídeo aulas e material digital para a divulgação dos temas de forma remota ou à distância para atingir futuros profissionais fora da cidade de Piracicaba/SP.

A carne suína apresenta um alto valor nutricional sendo uma importante fonte de ácidos graxos insaturados, como ácido oleico e ácido linoleico, os quais apresentam efeitos benéficos sobre a saúde humana e saturados como esteárico e palmítico. Devido à importância dos suínos tanto na questão econômica, quanto na questão de pesquisas como modelo para estudos científicos em humanos, a espécie Sus scrofa é comumente utilizada em diferentes estudos que envolvem as ciências ômicas. No presente experimento serão utilizados dados de setenta e dois machos da raça Large White, imunocastrados e halotano homozigoto-negativo (NN), abatidos entorno de 130 kg. Os animais foram criados sob quatro dietas: basal com 1,5% de óleo de soja degomado, basal com 3% de óleo de soja, basal com 3% de óleo de canola e basal com 3% de óleo de peixe: óleo proveniente da sardinha boca torta (Cetengraulis edentulus). Após abate, foram coletadas amostras dos tecidos para extração e sequenciamento de RNAm. O objetivo do presente projeto é identificar polimorfismos do tipo nucleotídeo único (SNP, single nucleotide polymorphism) presentes em regiões codificantes do DNA, identificadas a partir do sequenciamento completo do RNAm, e associá-los ao nível de expressão gênica do músculo e fígado de suínos alimentados com diferentes fontes de ácidos graxos.

Os ácidos graxos têm funções estrutural, endócrina e energética para as células do organismo de suínos. Os tipos de ácidos graxos, tempo de administração, sexo e espécie são variáveis que podem influenciar a composição de ácidos graxos nas membranas de células inflamatórias de suínos. O metabolismo dos lipídeos pode ser regulado pelo fígado, músculo esquelético e tecido adiposo, sendo esses lipídeos utilizados na beta-oxidação. Alguns ácidos graxos, como ômega três e seis, não são sintetizados pelos suínos, devendo ser suplementados na dieta. Sendo assim, a relação ômega seis e ômega três pode influenciar o metabolismo dos animais e sua resposta inflamatória através da produção de citocinas. Dietas suplementadas com ômega três podem aumentar a síntese de citocinas no fígado e tecido adiposo. Alguns fatores de transcrição relacionados com o metabolismo dos lipídeos podem estimular ou inibir a síntese de citocinas nos tecidos. Assim como, as citocinas podem interferir na absorção gastrointestinal e deposição de gordura intramuscular. O objetivo deste projeto consistirá em avaliar a abundância de citocinas nos tecidos muscular, hepático e nervoso de suínos sob diferentes fontes dietéticas de ácidos graxos através da técnica de ELISA em formato multiplex.

De acordo com a Pesquisa de Orçamentos Familiares (POF) 2017-2018, mais da metade (53,4%) das calorias ingeridas pela população são de alimentos processados, e dentre eles, a carne. A segurança de alimentos, que se refere à garantia da qualidade do produto que consumimos, está diretamente ligada com a autenticidade adequada do produto conforme o seu padrão de identidade, ou seja, a rotulagem. Contudo, nos produtos cárneos a identificação das espécies animais ainda é um desafio para as autoridades, uma vez que após o processamento nem sempre é possível a detecção das mesmas por meio dos métodos convencionais, por exemplo microscopia eletrônica de varredura (MEV). Com isso, a fraude em produtos de origem animal em que ocorre a substituição intencional da carne de uma espécie animal por outra, normalmente motivada por fatores econômicos, tem se tornado recorrente diante destas limitações metodológicas e/ou de alto custo e tempo de análises como a MEV. No entanto, com os avanços na área da biologia molecular, redução significativa dos custos e capacitação de recursos humanos a técnica de Reação em Cadeia de Polimerase (PCR), tem-se mostrado muito eficiente na identificação de espécies animais. Regiões do DNA mitocondrial são altamente conservadas e apresentam regiões específicas entre as diferentes espécies animais o que as tornam regiões alvo para a identificação de espécies específicas para diferentes finalidades. Entre estas finalidades estão atender algumas áreas da segurança dos alimentos como Food Fraud (fraude alimentar ou dos alimentos) e Traceability (rastreabilidade dos alimentos). Assim, o presente projeto apresenta como objetivos principais avaliar diferentes produtos de origem animal quanto aos tipos de carne (espécies) utilizadas na sua fabricação e validar segundo a rotulagem dos mesmos, por meio da técnica de PCR quantitativa (qPCR) e realizar um levantamento de possíveis casos de fraude nestes alimentos. Os resultados esperados deste projeto são a formação técnica-científica dos alunos em uma área multidisciplinar que abrange legislação dos alimentos, segurança dos alimentos e biologia molecular, além de detectar a ocorrência de fraude em alimentos de origem animal que traz aos consumidores significativos prejuízos financeiros, moral e religiosos (religiões que não consomem carnes de algumas espécies).

Por meio da extensão universitária é possível a prática de atividades em que a Universidade pode levar conhecimentos, assistências e soluções à sociedade ao mesmo tempo que a sociedade permite a interação com as comunidades e o entendimento das suas necessidades. A equipe do Laboratório de Biologia Molecular e Micotoxinas (LABMIC), formado por professores e alunos do curso de graduação em Ciências dos Alimentos e Engenharia Agronômica da ESALQ/USP, tem capacitado alunos de graduação na área da biologia molecular e micotoxinas voltadas para qualidade e segurança dos alimentos. Esta capacitação também tem envolvido práticas de extensão universitária, cujo objetivo principal é criar oportunidades que permitam que os alunos de graduação desenvolvam habilidades e competências na disseminação dos seus conhecimentos adquiridos para a solução de problemáticas sociais. O grupo já vem trabalhando com esta prática de extensão levando conhecimento e visão para os futuros universitários do país que se interessam pela área de estudo e pesquisa exercida por este grupo. Assim, o projeto proposto permitirá a participação dos nossos alunos em atividades que contribuirão para a formação do chamado profissional-cidadão, para informar a sociedade quanto à segurança dos alimentos que impacta na sua saúde e de sua família, a qual é uma questão social de relevância e que demanda soluções adequadas. A atividade de extensão proposta neste projeto é interagir com a sociedade de forma presencial (quando possível) e/ou de forma à distância aplicando o conhecimentos dos alunos e despertando suas habilidades como cidadãos, levando à sociedade o conhecimento e a informação das ferramentas da biologia molecular e da importância e ocorrência de micotoxinas no que se refere à segurança dos alimentos, atendendo à uma das demandas sociais e também permitindo que a Universidade pratique sua função social.

A produção de etanol teve um aumento significativo na última década devido à alta demanda pela produção de biocombustíveis. Dentre os produtos agrícolas, o milho é o cereal mais utilizado para a produção de etanol. O Brasil possui em funcionamento 16 usinas que produzem etanol utilizando milho. O processo de produção de etanol a partir do milho empregando o processo moagem seca apresenta como coproduto os grãos secos de destilaria com solúveis (DDGS) usados na produção animal, principalmente para gado, pelo seu alto valor de proteína, fibra e energia. Embora haja vantagens na utilização de DDGS na alimentação animal, existe o risco potencial da ocorrência de micotoxinas nos coprodutos da produção de etanol. Dentre as micotoxinas presentes no milho e que, consequentemente, podem estar presentes em DDGS, as aflatoxinas (AFB1, AFB2, AFG1 e AFG2), que são produzidas por fungos potencialmente toxigênicos do gênero Aspergillus. Além disso, as aflatoxinas possuem efeito tóxico, mutagênico, imunotóxico, teratogênico e cancerígeno em humanos e animais. Portando, o objetivo desse trabalho será verificar a presença de fungos potencialmente aflatoxigênicos do gênero Aspergillus em amostras de DDGS por meio de ferramentas da biologia molecular e verificar a presença de aflatoxinas nas mesmas. As análises serão realizadas no Laboratório de Biologia Molecular e Micotoxinas (LABMIC) do Departamento de Agroindústria Alimentos e Nutrição da ESALQ/USP. Para a análise de aflatoxinas será realizado os processos de extração e purificação da amostra para aflatoxinas e posterior separação e quantificação por cromatografia líquida de alta eficiência (CLAE). Para verificar a presença de fungo do gênero Aspergillus, será realizada as etapas de extração, quantificação e verificação da qualidade do DNA para, posteriormente, fazer a identificação de fungos pela reação em cadeia da polimerase (em inglês, Polimerase Chain Reaction ? PCR), que permite a identificação de fungos em nível de espécie de maneira rápida e específica.

Por meio da extensão universitária é possível a prática de atividades em que a Universidade pode levar conhecimentos, assistências e soluções à sociedade ao mesmo tempo que a sociedade permite a interação com as comunidades e o entendimento das suas necessidades. A equipe do Laboratório de Biologia Molecular e Micotoxinas (LABMIC), formado por professores e alunos do curso de graduação em Ciências dos Alimentos e Engenharia Agronômica da ESALQ/USP, tem capacitado alunos de graduação na área da biologia molecular e micotoxinas voltadas para qualidade e segurança dos alimentos. Esta capacitação também tem envolvido práticas de extensão universitária, cujo objetivo principal é criar oportunidades que permitam que os alunos de graduação desenvolvam habilidades e competências na disseminação dos seus conhecimentos adquiridos para a solução de problemáticas sociais. O grupo já vem trabalhando com esta prática de extensão levando conhecimento e visão para os futuros universitários do país que se interessam pela área de estudo e pesquisa exercida por este grupo. Assim, o projeto proposto permitirá a participação dos nossos alunos em atividades que contribuirão para a formação do chamado profissional-cidadão, para informar a sociedade quanto à segurança dos alimentos que impacta na sua saúde e de sua família, a qual é uma questão social de relevância e que demanda soluções adequadas. A atividade de extensão proposta neste projeto é interagir com a sociedade de forma presencial (quando possível) e/ou de forma à distância aplicando o conhecimentos dos alunos e despertando suas habilidades como cidadãos, levando à sociedade o conhecimento e a informação das ferramentas da biologia molecular e da importância e ocorrência de micotoxinas no que se refere à segurança dos alimentos, atendendo à uma das demandas sociais e também permitindo que a Universidade pratique sua função social.

A modulação da microbiota intestinal por meio do perfil de ácidos graxos presente na dieta pode desempenhar papel crucial na prevenção e tratamento da obesidade e comorbidades. Entretanto, ainda não está esclarecido se é o microbioma cecal ou fecal o mais relevante para a compreensão de sua conexão com o início da obesidade. Portanto, o presente estudo será realizado com o objetivo de avaliar a composição da comunidade bacteriana, bem como identificar Single Nucleotide Polymorphisms (SNPs) associados à abundância de bactérias no conteúdo cecal e nas fezes em um modelo experimental com suínos alimentados com dietas enriquecidas com ácido oleico em diferentes idades. Serão utilizadas amostras do conteúdo do ceco e das fezes oriundas de 48 suínos, machos imunocastrados, com peso vivo médio inicial e final de 28,5 2,7 kg (71 dias de idade) e 133,9 9,4 kg (169 dias de idade), respectivamente. Os animais foram distribuídos em um delineamento em blocos completos casualizados, com seis repetições por tratamento e quatro animais por baia. Os tratamentos consistiram em ração basal, composta principalmente por milho e farelo de soja, com adição de 3 de óleo degomado de soja ou 3 de óleo de canola. O período experimental foi de 98 dias, durante o qual os animais receberam ração e água à vontade. As amostras de fezes foram coletadas diretamente do reto dos animais aos 71, 134 e 166 dias de vida. Amostras do tecido muscular e do conteúdo cecal foram obtidas de cada animal no momento do abate. O DNA genômico bacteriano será extraído das amostras do conteúdo cecal e das fezes e amplificado com os oligonucleotídeos iniciadores da região V3 e V4 do gene 16S RNA ribossomal (16S rRNA) bacteriano. As bibliotecas do gene 16S rRNA serão sequenciadas por meio da plataforma Illumina MiSeq. A abundância relativa de cada grupo taxonômico será gerada na plataforma QIIME2 e testes PERMANOVA serão utilizados para comparar a diversidade beta entre cada grupo. O DNA genômico do tecido muscular será isolado, genotipado com o painel Illumina PorcineSNP60 BeadChip e, por fim, análises de associação serão realizadas pelo método Bayesiano com o programa GenSel.

Os ácidos graxos mono (MUFA) e poli-insaturados (PUFA) possuem propriedades funcionais, como ação anti-inflamatória, regulação da resposta imunológica, efeito comprovado na prevenção de DCNT, efeito protetor contra infecções virais e desenvolvimento de alguns tipos de câncer. Observa-se um importante papel dos PUFA, como o n-3, na modulação das funções do sistema imunológico diminuindo a gravidade dos distúrbios inflamatórios. O incremento de óleos ricos em PUFAs, na dieta de suínos melhora os parâmetros bioquímicos sanguíneos dos animais. Isso se deve ao fato que esses ácidos graxos têm efeito hipocolesterolêmico tanto em seres humanos como nos suínos. Tem-se observado simultâneamente ao aumento de PUFAs se observa um aumenta da produção de receptores de LDL-colesterol nas células, aumentando a sua secreção e a de ácidos biliares na bile, ou seja, aumenta a excreção de colesterol diminuindo seus níveis no soro sanguíneo. Sendo que se torna imprescindível investigar as alterações ao nível da transcrição do ADN e a e sua relação com parâmetros bioquímicos medidos no soro sanguíneo para melhor entendimento dos processos biológicos envolvidos com doenças metabólicas. Desta forma, o objetivo deste estudo é verificar o efeito das dietas de suínos machos imunocastrados nas fases de crescimento e terminação, com diferentes perfis de ácidos graxos, sobre os parâmetros bioquímicos do soro sanguíneo e sua associação com o perfil transcriptômico do fígado destes animais.

This project aims to identify single nucleotide polymorphisms (SNP) located in coding regions of the DNA, identified from the complete mRNA sequencing, and associate them with the level of gene expression in pig muscle and liver fed with different sources of fatty acids. A total of 72 genetically lean immunocastrated male pigs were used in a 98-day study to evaluate the effects of including 3 soybean oil (SO), canola oil (CO), or fish oil (FO) in the diets vs. feeding a standard commercial diet with 1.5 SO (control) on growth performance, carcass and meat quality traits of the longissimus lumborum (LL) muscle. Pigs were grouped by initial body weight (BW; 28.44 2.95 kg) and assigned to one of four treatments, with six replicate pens per treatment and three pigs per pen. The animals were slaughtered with an average live weight of 132.710.9 kg. Subsequently, muscle and liver tissue samples were collected for extraction and sequencing of mRNA. Subsequently, an association analyses of the eQTLs with performance traits (e.g., live weight, carcass yield, intramuscular fat, ribeye area, and fat thickness) will be conducted based on different statistical methods. A quantitative genomics approach for summarizing the findings of this study and integrating the results in genomic prediction methods will be proposed. In summary, this project will contribute for advancing the knowledge and developing practical tools in the area of functional genomics of pork quality and nutrient utilization in pigs.

Edital Santander de Políticas Públicas/USP Municípios

Os lipídeos são importantes nutrientes atuando em diversas funções no organismo. Atuam no transporte de vitaminas lipossolúveis, ajudam no armazenamento de energia, são isolantes e possuem outras funções biológicas. O valor nutricional da carne é influenciado pelas moléculas de lipídeos os quais podem ser alterados devido a dieta fornecida aos animais. O perfil de ácidos graxos presente na carne tem sido um fator relevante aos consumidores, uma vez que estão preocupados com sua nutrição e saúde. A carne tem alto valor nutricional e é uma importante fonte de ácidos graxos não saturados, como monoinsaturados (MUFA) e poli-insaturados (PUFA), os quais têm efeitos benéficos na saúde humana. Estudos anteriores relataram uma importante contribuição da ingestão de MUFA e PUFA para a saúde humana, o que pode levar a uma diminuição dos níveis de colesterol, risco de aterosclerose, ocorrência de diabetes e doenças neurodegenerativas como Parkinson e Alzheimer. A carne tem um perfil de ácidos graxos de alta insaturação, e é considerada uma importante fonte de ácidos graxos insaturados na nutrição humana. O óleo de canola é rico em ácido oleico (MUFA) e o óleo de peixe é rico em ácido eicosapentaenoico e docosahexaenoico (PUFA), os quais já foram associados às doenças metabólicas, câncer e doenças neurodegenerativas. Sendo assim, nossa hipótese é que a adição de óleo de canola e de peixe na ração de suínos pode alterar os parâmetros de qualidade e o perfil de ácidos graxos do cérebro desses animais. Os objetivos deste projeto são: (1) avaliar parâmetros de qualidade da carne, (2) a percepção dos consumidores quanto aos parâmetros sensoriais da carne, e (3) o perfil de ácidos graxos do tecido cerebral de animais alimentados com óleo de canola e de peixe. Serão utilizadas amostras de lombo e cérebro de 72 suínos, machos imunocastrados, com peso vivo médio inicial de 27 kg (71 dias de idade) e final de 132,70 kg (169 dias de idade) provenientes do projeto Jovem Pesquisador (processo FAPESP 2017/25180-2), cuja pesquisadora responsável é a Profa. Dra. Aline Silva Mello Cesar. As dietas consistiram em ração basal de farelo de soja e milho moído com adição de 3% de óleo de canola (CAN) e basal com adição de 3% de óleo de peixe (PEI). Os resultados obtidos neste projeto são inovadores e poderão trazer informações relevantes na área da ciência da carne e nutrição animal e humana, uma vez que os suínos são modelos animais para estudos de doenças metabólicas em humanos.

Devido a sua composição nutricional e alta atividade de água, o leite é um alimento muito nutritivo para os humanos, mas também proporciona um ambiente favorável para o crescimento e proliferação de microrganismos que podem provocar alterações químicas, físicas e sensoriais no alimento. O leite cru naturalmente já apresenta uma carga natural de microrganismos, porém esta varia de acordo com as condições de higiene no momento da ordenha, da saúde, alimentação e alojamento dos animais, armazenamento do produto, entre outros. A microbiota do leite pode ser constituída de microrganismos mesófilos, psicrotróficos, termorresistentes, esporulados, patogênicos e bactérias láticas. Microrganismos patogênicos são veiculados pelo leite podendo causar zoonoses como a brucelose, listeriose e tuberculose, além de causar inflamação na glândula mamária das vacas, doença mais conhecida como mastite. Devido ao seu grande impacto financeiro e de saúde pública, a detecção correta e rápida do patógeno causador é muito importante. Diante disto, o grupo de pesquisa do Laboratório de Biotecnologia Animal (LBA) da ESALQ/USP vêm utilizando ferramentas da biologia molecular, como o sequenciamento de nova geração, para sequenciar a região V4 do gene 16S, a fim de estudar o microbioma do leite. O grupo já identificou diferentes classes e espécies de microrganismos presentes em amostras de leite cru provenientes de tanque, caminhão e silo industrial oriundas de fazendas e plantas industriais dos estados de São Paulo e Minas Gerais, entre elas psicotróficos, patogênicos e mesófilos. No entanto, a técnica utilizada e os resultados obtidos necessitam de validação por meio de outras ferramentas da biologia molecular. O objetivo do presente projeto é utilizar a ferramenta de reação em cadeia da polimerase quantitativa (q-PCR) para validar a detecção destes microrganismos. Para isso estão sendo utilizadas 100 amostras de leite do estudo realizado pelo grupo do LBA para a validação da presença de cinco microrganismos que foram associados à contagem de células somáticas (CCS) e que sejam importantes tanto para a saúde animal quanto do consumidor humano. Até o momento já foram selecionados os cinco microrganismos que terão sua detecção validada por qPCR.

A qualidade e frescor da carne dependem de diversos fatores, desde a raça, nutrição, manejo com garantia de bem-estar animal, abate, embalagem, armazenamento, transporte e manutenção da cadeia do frio. Para a garantia do oferecimento de um produto com cor e sabor agradáveis e menores perdas econômicas é preciso que as características de frescor se mantenham estáveis durante toda a vida de prateleira deste produto. Um dos fatores responsáveis pelo sabor, cor e odor desagradáveis nas carnes, que afetam a aceitação da carne pelo consumidor, é a oxidação lipídica. A oxidação lipídica por sua vez é dependente do perfil dos ácidos graxos presentes na carne, uma vez que ácidos graxos monoinsaturados (um exemplo é o ácido graxo oleico) e poliinsaturados (um exemplo é o ácido graxo linoléico) são mais susceptíveis à oxidação, ao mesmo tempo, que são nutricionalmente mais favoráveis. Por meio da inclusão de óleos ricos em ácidos graxos monoinsaturados (óleo de canola) e poliinsaturados (óleo de soja) na dieta de animais é possível modificar o perfil de ácidos graxos da carne proveniente destes animais. Com isso, é possível a produção de uma carne com um perfil nutricional favorável (tendência do mercado). No entanto, ainda é um desafio para a indústria garantir a qualidade desta carne rica em ácidos graxos insaturados, devido à maior vulnerabilidade à oxidação lipídica causada principalmente por bactérias deteriorantes. Assim, a hipótese deste projeto é que o perfil de ácidos graxos da carne modula o desenvolvimento de microrganismos deteriorantes em carne in natura de suínos alimentados com dietas adicionadas de óleo de canola, soja e peixe, podendo afetar a vida de prateleira do produto e a segurança alimentar do consumidor. Portando, o projeto teve como objetivo identificar possíveis alterações no perfil microbiológico da carne oriunda de animais alimentados com diferentes fontes de óleo e perfil de ácidos graxos, com diferentes tempos de vida de prateleira. Para o estudo do efeito das dietas sobre o perfil microbiológico nos três tempos foi realizado o teste de variância (ANOVA) e a comparação entre médias pelo teste de Tukey (nível de significância de 5%). Os resultados mostraram que houve diferença significativa entre os tempos e tratamentos (P<0,05) para os parâmetros L, a* e b*. Nas análises de Psicrotróficos, Mesófilos, Bolores e Leveduras não houve diferença significativa entre os tratamentos (P>0,05), mas houve diferença no crescimento de Enterobacteriaceae (P=0,01) e coliformes totais (P=0,02). Em relação ao tempo de vida útil, houve diferença significativa de crescimento para todos os microrganismos (P<0,01). Assim foi possível concluir que as diferentes dietas não afetaram o perfil microbiológico da carne de suínos alimentados com diferentes fontes de óleo, no entanto, houve comprometendo da qualidade e segurança do alimento em relação ao tempo de vida útil, nas condições em que o experimento foi realizado.

Os lipídios são uma classe de moléculas presentes em todos os tipos de células, contribuindo na estrutura celular, no armazenamento de energia e nas várias funções biológicas, desde a regulação transcricional até os processos fisiológicos. Estudos anteriores mostraram que ácido oleico (AO), bem como outros ácidos graxos, como o ácido linoleico (AL), o ácido docosaexaenoico (DHA) e o ácido eicosapentaenoico (EPA) estão associados à regulação da transcrição de genes em tecidos como músculo, cérebro, fígado, adiposo, monócitos e células mononucleares do sangue. Além disso, os ácidos graxos desempenham papéis importante nas respostas cognitivas, respostas de citocinas, reações inflamatórias e respostas imunológicas específicas e inespecíficas em seres humanos e animais. Devido a importância dos suínos tanto na questão econômica, quanto na questão de pesquisas na área da saúde (animal modelo para estudos científicos em humanos), a espécie (Sus scrofa) foi a escolhida para o estudo. Fatores como alimentação e interações metabólicas influenciam de maneira direta ou indireta na expressão de alguns genes específicos. Dentre os benefícios da utilização de ácidos graxos, destacam-se o uso para aumentar densidade energética das dietas de suínos; melhorar a eficiência geral da alimentação; e podem ser utilizados como coadjuvantes na absorção de vitaminas lipossolúveis, ácidos graxos essenciais e sinalização molecular e seu uso pode reduzir o custo de produção aumentando o retorno financeiro. Dessa forma, é de extrema importância a realização de pesquisas visando a inclusão de diferentes fontes de ácidos graxos na dieta. Para realização do estudo em questão, a criação dos animais foi realizada em colaboração com a empresa DB Genética, no qual as etapas do experimento incluíram: inseminação artificial das matrizes, manejo dos animais, programa nutricional e coleta de dados de desempenho (peso vivo e consumo de ração), bem como dos materiais biológicos (sangue, pelo e fezes). As dietas experimentais utilizadas foram: (1) soja (SOJ): dieta basal com adição de 3% de óleo degomado de soja e (2) canola (CAN): dieta basal com adição de 3% de óleo de canola. Os animais (125 kg de peso vivo médio) foram abatidos após 12 h de restrição alimentar e as amostras de cérebro foram coletadas dentro de 30 minutos, no máximo, após a sangria, imediatamente congeladas em nitrogênio líquido e posteriormente armazenadas a -80°C em ultra freezer. Essas amostras serão usadas para extração de RNAm total. A hipótese deste trabalho é que a inclusão desses óleos na dieta de suínos, na fase de crescimento e terminação, possa alterar o perfil lipídico e perfil transcriptômico do cérebro, afetando vários processos biológicos e possivelmente características fenotípicas dos animais, além de sua correlação com a incidência de doenças. Esses conhecimentos poderão ser aplicados tanto na área de produção animal (melhoramento genético, nutrição e ambiência) quanto na área da saúde animal e do consumidor de carne suína. Outro aspecto de grande potencial deste projeto é a identificação de marcadores moleculares causais candidatos, marcadores moleculares funcionais, a consolidação da importância dos ácidos graxos como imunonutrientes, bem como, a identificação de vias metabólicas candidatas as quais podem ser foco da atuação de drogas.

A presente proposta tem por objetivo contribuir com capacitação em boas práticas para manipuladores de alimentos que atuam em entidades filantrópicas no município de Piracicaba. Este localiza-se a noroeste do estado de São Paulo (164 km da capital), com uma população estimada em 404.142 habitantes (IBGE-2019) e possui aproximadamente 24 entidades filantrópicas cadastradas.

Os lipídeos são uma classe de moléculas presentes em todos os tipos de células. Contribuem para a estrutura celular, o armazenamento de energia e várias funções biológicas, desde a regulação transcricional até os processos fisiológicos. Essas moléculas também são responsáveis pelo valor nutricional da carne, que são diretamente influenciados pela dieta animal. A carne tem alto valor nutricional e é uma importante fonte de ácidos graxos não saturados (FA), como ácido oleico (OA, C18: 1 cis 9) e ácido linoleico (LA, C18: 2 cis9, 12), o que têm efeitos benéficos na saúde humana. Estudos anteriores relataram uma importante contribuição da ingestão de OA para a saúde humana, o que pode levar a uma diminuição dos níveis de colesterol, risco de aterosclerose e ocorrência de diabetes. Além disso, OA tem efeitos protetores contra infecção viral e desenvolvimento de câncer. A carne tem um perfil de ácidos graxos de alta insaturação, e é considerada uma importante fonte de OA na nutrição humana. Nossa hipótese é que o OA incluído na dieta de terminação de suínos pode alterar o perfil transcriptômico e a resposta inflamatória em diferentes tecidos, como músculo esquelético, fígado e cérebro, afetando vários processos biológicos e consequentemente as características fenotípicas dos animais. Assim, nossos objetivos são identificar mudanças no perfil do transcriptoma e no perfil da resposta inflamatória do músculo esquelético, fígado e cérebro induzidos por uma dieta enriquecida com ácido oléico; bem como, caracterizar os processos biológicos relacionados a doenças metabólicas, reações inflamatórias e respostas imunes; avaliar as características organolépticas, físicas e sensoriais da carne; e a eficiência alimentar dos animais.

Os lipídeos são uma classe de moléculas presentes em todos os tipos de células. Contribuem para a estrutura celular, o armazenamento de energia e várias funções biológicas, desde a regulação transcricional até os processos fisiológicos. Essas moléculas também são responsáveis pelo valor nutricional da carne, que são diretamente influenciados pela dieta animal. A carne tem alto valor nutricional e é uma importante fonte de ácidos graxos não saturados (FA), como ácido oleico (OA, C18: 1 cis 9) e ácido linoleico (LA, C18: 2 cis9, 12), o que têm efeitos benéficos na saúde humana. Estudos anteriores relataram uma importante contribuição da ingestão de OA para a saúde humana, o que pode levar a uma diminuição dos níveis de colesterol, risco de aterosclerose e ocorrência de diabetes. Além disso, OA tem efeitos protetores contra infecção viral e desenvolvimento de câncer. A carne tem um perfil de ácidos graxos de alta insaturação, e é considerada uma importante fonte de OA na nutrição humana. Nossa hipótese é que o OA incluído na dieta de terminação de suínos pode alterar o perfil transcriptômico e a resposta inflamatória em diferentes tecidos, como músculo esquelético, fígado e cérebro, afetando vários processos biológicos e consequentemente as características fenotípicas dos animais. Assim, nossos objetivos são identificar mudanças no perfil do transcriptoma e no perfil da resposta inflamatória do músculo esquelético, fígado e cérebro induzidos por uma dieta enriquecida com ácido oléico; bem como, caracterizar os processos biológicos relacionados a doenças metabólicas, reações inflamatórias e respostas imunes; avaliar as características organolépticas, físicas e sensoriais da carne; e a eficiência alimentar dos animais.

O Hologenoma é um conceito evolutivo de que tanto o hospedeiro quanto seus microrganismos associados (microbiota) formam uma entidade biológica coesiva conhecida como holobionte, cuja interação afeta o desenvolvimento e aptidão geral do chamado hologenoma, de tal forma que esse vem sendo considerado como um nível independente de seleção. Nos ruminantes em particular, além de permitir quebrar complexos polissacarídeos encontrados nas pastagens, a fermentação microbiana no rúmen produz metano como subproduto, um gás de efeito estufa com elevado impacto ambiental. Assim como a redução do custo e impacto ambiental, a melhoria da qualidade é fator fundamental para a conquista de novos mercados para a carne bovina brasileira. Em projeto temático anterior, produzimos dados genômicos estruturais e funcionais em uma população de referência da raça Nelore, revelando, com isso, os principais atores da regulação da expressão gênica e dos processos biológicos relevantes para características de qualidade da carne e eficiência alimentar. Na proposta atual, ampliaremos a análise de dados para integrar ainda mais os diferentes níveis de informação genômica e fenotípica, buscando mutações causais que expliquem as diferenças observadas na expressão gênica. Investigaremos também, além do genoma funcional do hospedeiro, a metagenômica e metabolômica do rúmen de uma nova amostra de bovinos da raça Nelore. A adição da camada meta-ômica à genômica funcional do hospedeiro permitirá responder questões cruciais sobre as inter-relações entre a diversidade funcional da microbiota e o ambiente do hospedeiro. Além disso, a construção de um banco de dados relacional deve facilitar a exploração desse conjunto ímpar de dados experimentais multi-ômicos de Bos indicus e sua futura integração a esforços internacionais para a compreensão do genoma funcional dos bovinos.

A produção de carne de frango brasileira temuma grande importância na economia mundial, o que é umresultado da constante melhoria de características de desempenho, principalmente devido ao melhoramento genético. Entretanto, animais selecionados para crescimento rápido e maior deposição de músculo apresentam também, maior deposição de gordura na carcaça. A identificação dos componentes genéticos responsáveis por parte da variação observada (fenótipo) é fundamental aos programas de melhoramento genético permitindo assim, a seleção de animais que apresentama característica fenotípica de interesse. Diversos estudos genômicos vêmsendo desenvolvidos como objetivo de identificar QTLs (quantitative trait locus) e variações do tipo SNP(single nucleotide polymorphism) associadas com características de interesse econômico emaves, entretanto, poucos estudos foramdesenvolvidos comvariações estruturais. Sendo assim, a arquitetura genética destas características continua pouco elucidada. Oobjetivo deste estudo é identificar CNVs (copy number variation) associadas comcaracterísticas de interesse econômico (desempenho e deposição de gordura) emgalinhas. Serão integrados ainda, resultados anteriores de estudos de associação genômica ampla (GWAS) usando SNPs, realizado na mesma população, auxiliando no melhor entendimento da arquitetura genética das características. Espera-se por meio da presente proposta encontrar CNVs associadas, genes candidatos por posição, processos biológicos enriquecidos e vias metabólicas relacionadas às características estudadas.

Os lipídeos são uma classe de moléculas presentes em todos os tipos de células. Contribuem para a estrutura celular, o armazenamento de energia e várias funções biológicas, desde a regulação transcricional até os processos fisiológicos. Essas moléculas também são responsáveis pelo valor nutricional da carne, que são diretamente influenciados pela dieta animal. A carne tem alto valor nutricional e é uma importante fonte de ácidos graxos não saturados (FA), como ácido oleico (OA, C18: 1 cis 9) e ácido linoleico (LA, C18: 2 cis9, 12), o que têm efeitos benéficos na saúde humana. Estudos anteriores relataram uma importante contribuição da ingestão de OA para a saúde humana, o que pode levar a uma diminuição dos níveis de colesterol, risco de aterosclerose e ocorrência de diabetes. Além disso, OA tem efeitos protetores contra infecção viral e desenvolvimento de câncer. A carne tem um perfil de ácidos graxos de alta insaturação, e é considerada uma importante fonte de OA na nutrição humana. Nossa hipótese é que o OA incluído na dieta de terminação de suínos pode alterar o perfil transcriptômico e a resposta inflamatória em diferentes tecidos, como músculo esquelético, fígado e cérebro, afetando vários processos biológicos e consequentemente as características fenotípicas dos animais. Assim, nossos objetivos são identificar mudanças no perfil do transcriptoma e no perfil da resposta inflamatória do músculo esquelético, fígado e cérebro induzidos por uma dieta enriquecida com ácido oléico; bem como, caracterizar os processos biológicos relacionados a doenças metabólicas, reações inflamatórias e respostas imunes; avaliar as características organolépticas, físicas e sensoriais da carne; e a eficiência alimentar dos animais.

O conhecimento da base genética da regulação gênica contribui para uma melhor compreensão da variação fenotípica e dos processos biológicos envolvidos com características de interesse econômico. Recentes avanços em estudos genômicos possibilitaram a identificação de regiões genômicas que controlam características quantitativas, porém sem identificar os genes envolvidos ou as mutações causais associados aos fenótipos de interesse. O advento das novas tecnologias de sequenciamento em larga escala do mRNA permitiram a identificação de genes diferencialmente expressos, mutações em regiões exônicas, novas isoformas, e vias metabólicas associadas com variação biológica. Contudo, poucos esforços foram direcionados ao mapeamento de regiões genômicas associadas com a regulação da transcrição (expression quantitative loci - eQTL). Nesse contexto, a presente proposta tem como objetivo principal proporcionar um avanço em nosso conhecimento sobre a estrutura genética de bovinos por meio da identificação de mutações funcionais candidatas associadas ao perfil de expressão gênica no fígado. O fígado foi escolhido por estar envolvido no metabolismo de carboidratos e lipídeos e porque estudos anteriores revelaram a importância da expressão gênica do tecido hepático na eficiência alimentar em bovinos. Para este estudo, serão obtidos dados de expressão gênica e de SNPs (single nucleotide polymorphisms) a partir do sequenciamento do mRNA total do fígado de 105 animais da raça Nelore. Em seguida, será realizada uma análise de associação entre a variação genética e a expressão gênica com o auxílio do pacote Matrix eQTL do programa estatístico R. Marcadores associados à variação na expressão gênica que estiverem próximos em até 1 Mb do gene serão definidos como cis-eQTLs, enquanto marcadores distantes em mais de 1 Mb do gene serão definidos como trans-eQTLs. Os resultados obtidos neste projeto, permitirão a identificação de mutações funcionais causais (cis e trans-eQTLs) associadas à expressão gênica em fígado de bovinos Nelore e de vias metabólicas cujos genes expressos estão envolvidos; caracterização da arquitetura genética e das regiões regulatórias, bem como, a possível indicação de marcadores moleculares candidatos aos estudos de seleção genômica.

Os lipídios são uma classe de moléculas presentes em todos os tipos de células. Contribuem para a estrutura celular, o armazenamento de energia e várias funções biológicas, desde a regulação transcricional até os processos fisiológicos. Essas moléculas também são responsáveis pelo valor nutricional da carne, que são diretamente influenciadas pela dieta animal. A carne tem alto valor nutricional e é uma importante fonte de ácidos graxos insaturados (PUFA), como ácido oleico (AO, C18: 1 cis 9) e ácido linoleico (AL; C18: 2 cis9, 12), os quais apresentam efeitos benéficos à saúde humana. Estudos anteriores relataram uma importante contribuição da ingestão de AO na saúde humana, levando à diminuição dos níveis de colesterol, risco de aterosclerose e ocorrência de diabetes do tipo 2. Além disso, AO tem efeitos protetores contra infecção viral e desenvolvimento de câncer. A carne tem um perfil de ácidos graxos de alta insaturação, e é considerada uma importante fonte de AO na nutrição humana. Nossa hipótese é que o AO incluído na dieta de suínos na fase de terminação pode alterar o perfil transcriptômico e a resposta inflamatória em diferentes tecidos, como músculo esquelético, fígado e cérebro, afetando vários processos biológicos e consequentemente as características fenotípicas dos animais. Assim, nosso objetivo é identificar e validar as mutações funcionais associadas ao perfil de ácidos graxos, desempenho e parâmetros imunológicos a partir do transcriptoma de músculo de suínos da raça Large White submetidos à dietas com diferente perfil de ácidos graxos.

Os lipídeos são uma classe de moléculas presentes em todos os tipos de células. Contribuem para a estrutura celular, o armazenamento de energia e várias funções biológicas, desde a regulação transcricional até os processos fisiológicos. Essas moléculas também são responsáveis pelo valor nutricional da carne, que são diretamente influenciados pela dieta animal. A carne tem alto valor nutricional e é uma importante fonte de ácidos graxos não saturados (FA), como ácido oleico (OA, C18: 1 cis 9) e ácido linoleico (LA, C18: 2 cis9, 12), o que têm efeitos benéficos na saúde humana. Estudos anteriores relataram uma importante contribuição da ingestão de OA para a saúde humana, o que pode levar a uma diminuição dos níveis de colesterol, risco de aterosclerose e ocorrência de diabetes. Além disso, OA tem efeitos protetores contra infecção viral e desenvolvimento de câncer. A carne tem um perfil de ácidos graxos de alta insaturação, e é considerada uma importante fonte de OA na nutrição humana. Nossa hipótese é que o OA incluído na dieta de terminação de suínos pode alterar o perfil transcriptômico e a resposta inflamatória em diferentes tecidos, como músculo esquelético, fígado e cérebro, afetando vários processos biológicos e consequentemente as características fenotípicas dos animais. Assim, nossos objetivos são identificar mudanças no perfil do transcriptoma e no perfil da resposta inflamatória do músculo esquelético, fígado e cérebro induzidos por uma dieta enriquecida com ácido oléico; bem como, caracterizar os processos biológicos relacionados a doenças metabólicas, reações inflamatórias e respostas imunes; avaliar as características organolépticas, físicas e sensoriais da carne; e a eficiência alimentar dos animais.

A inconsistência da maciez e o conteúdo de gordura intramuscular são os principais fatores limitantes da qualidade da carne brasileira. Estudos proteômicos buscam compreender os mecanismos moleculares envolvidos no desenvolvimento das características de qualidade de carne. Proteínas do metabolismo de energia, estruturais, resposta ao estresse, chaperonas (heat shock proteins), proteólise e apoptose estão entre as mais relatadas. Entretanto, poucos são os estudos que validamos resultados por meio de técnica imunoenzimática. Nesse contexto, existe uma necessidade de confirmar as informações oriundas de prévios estudos emproteômica, por meio de validação de proteínas específicas relacionadas às características fenotípicas de interesse econômico. Dessa forma, o objetivo do presente projeto é quantificar a abundância de oito proteínas no músculo Longissimus dorsi de bovinos de dif erentes grupos genéticos (Nelore, Aberdeen Angus x Nelore, Rubia Gallega x Nelore), a fimde validá-los como biomarcadores para maciez, deposição e composição de gordura intramuscular. Os animais serão terminados emconfinamento sob o mesmo programa nutricional. Durante o abate serão coletadas amostras do músculo LD para preparação dos extratos proteicos, e oito proteínas serão detectadas e quantificadas por western - blotting. As análises de força de cisalhamento, quantificação d e lipídeos totais e perfil de ácidos graxos serão realizadas em amostras do músculo LD coletado na desossa. A relação entre a maciez, conteúdo e composição de gordura intramuscular com a abundância das proteínas será avalia da por me i o de análises de correlação Momento-Produto de Pearson. Uma análise de regressão será realizada para criar o melhor modelo para predizer as características em função das proteínas biomarcadoras. Os resultados obtidos nesse projeto alavancarão o uso de biomarcadores auxiliando na melhor compreensão das vias e processos biológicos envolvidos na qualidade da carne de animais da raça Nelore e cruzados Aberdeen Angus x Nelore, Rubia Gallega x Nelore.

A inconsistência da maciez e o conteúdo de gordura intramuscular são os principais fatores limitantes da qualidade da carne brasileira. Estudos proteômicos buscam compreender os mecanismos moleculares envolvidos no desenvolvimento das características de qualidade de carne. Proteínas do metabolismo de energia, estruturais, resposta ao estresse, chaperonas (heat shock proteins), proteólise e apoptose estão entre as mais relatadas. Entretanto, poucos são os estudos que validamos resultados por meio de técnica imunoenzimática. Nesse contexto, existe uma necessidade de confirmar as informações oriundas de prévios estudos emproteômica, por meio de validação de proteínas específicas relacionadas às características fenotípicas de interesse econômico. Dessa forma, o objetivo do presente projeto é quantificar a abundância de oito proteínas no músculo Longissimus dorsi de bovinos de dif erentes grupos genéticos (Nelore, Aberdeen Angus x Nelore, Rubia Gallega x Nelore), a fimde validá-los como biomarcadores para maciez, deposição e composição de gordura intramuscular. Os animais serão terminados emconfinamento sob o mesmo programa nutricional. Durante o abate serão coletadas amostras do músculo LD para preparação dos extratos proteicos, e oito proteínas serão detectadas e quantificadas por western - blotting. As análises de força de cisalhamento, quantificação d e lipídeos totais e perfil de ácidos graxos serão realizadas em amostras do músculo LD coletado na desossa. A relação entre a maciez, conteúdo e composição de gordura intramuscular com a abundância das proteínas será avalia da por me i o de análises de correlação Momento-Produto de Pearson. Uma análise de regressão será realizada para criar o melhor modelo para predizer as características em função das proteínas biomarcadoras. Os resultados obtidos nesse projeto alavancarão o uso de biomarcadores auxiliando na melhor compreensão das vias e processos biológicos envolvidos na qualidade da carne de animais da raça Nelore e cruzados Aberdeen Angus x Nelore, Rubia Gallega x Nelore.

O aumento do interesse do consumidor por produtos de qualidade vem fazendo com que as indústrias de carne bovina ofereçam cortes com melhor perfil qualitativo. Dentre as características de qualidade de carne bovina, a maciez é a mais apreciada pelo consumidor e, a que agrega maior valor comercial. Entretanto, é uma característica altamente complexa, influenciada por diversos fatores e que apresenta grande variabilidade. Portanto, entender os fatores que afetama maciez continua s e n d o u ma d a s p r i n c i p a i s p r e o c u p a ç õ e s d e p e s q u i s a d o r e s e d a i n d ú s t r i a d a c a r n e . O e n t e n d i me n t o a n í v e l t r a n s c r i c i o n a l d o s f a t o r e s q u e i n f l u e n c i a m a ma c i e z p o d e m ajudar a predizer precocemente essa característica. Assim, o presente projeto visa avaliar as diferenças no transcriptoma, por meio do estudo dos mRNA e microRNAs no músculo Longissimus dorsi (LD) de bovinos da raça Nelore e cruzados Angus x Nelore, associado a característica de maciez da carne. Serão avaliadas amostras do músculo LD de 200 animais, sendo 100 animais da raça Nelore e 100 animais cruzados Angus x Nelore. Do nascimento até o sobreano (18 a 20 meses) os animais serão criados a pasto, posteriormente os animais serão terminados emconfinamento sob as mesmas condições de manejo e nutrição. As amostras para transcriptômica serão coletadasdomúsculoLDnaalturada12acostelaimediatamenteapósoabate. Paraasanálisesdemaciez,serãocoletadosbifesentrea10ae13acostelasdomúsculo L D a p ó s ma t u r a ç ã o s a n i t á r i a . A a n á l i s e d e ma c i e z s e r á r e a l i z a d a c o n f o r me p r o t o c o l o p r o p o s t o p e l a A me r i c a n Me a t S c i e n c e A s s o c i a t i o n . O p e r f i l t r a n s c r i p t ô mi c o d e mRNA e microRNAs será realizado por meio da técnica de sequenciamento de RNA emlarga escala. Para essas análises serão utilizados trinta e dois animais, divididos emquatro grupos visando comparar os animais entre diferentes populações (Nelore x Cruzados) e dentro da mesma população. Os resultados possibilitarão a caracterização de potenciais biomarcadores e permitirão uma melhor compreensão dos mecanismos moleculares que regulama maciez da carne. Os conhecimentos gerados contribuirão como aumento da acurácia na predição genética da maciez, possibilitando a inclusão dessas informações emprogramas de melhoramento genético.

A quantidade de gordura intramuscular (GIM) afeta as características sensoriais e o valor nutricional das carnes. Muitos consumidores associam esta gordura com doenças coronarianas, diabetes e obesidade, devido à presença de colesterol, à alta concentração de ácidos graxos saturados e à baixa concentração de poliinsaturados presentes na carne bovina. No entanto, o consumo dos ácidos graxos presentes na composição desta gordura intramuscular é necessário para a nutrição humana. Variações genéticas em genes envolvidos no armazenamento de lipídios musculares podem representar marcadores úteis em programas de seleção assistida por marcadores, os quais podem interferir em características fenotípicas como a deposição de gordura intramuscular (DGI). Os principais processos biológicos envolvidos com a DGI são: adipogênese (diferenciação de pré-adipócito em adipócitos) e lipogênese (síntese de gordura), comandadas por diferentes genes. Alguns desses genes são acetil coenzimaA carboxilase (ACC), adiponectina (adipoQ) e perilipin 2 (PLIN2). Devido ao importante papel do gene PLIN2 na captação de ácidos graxos de cadeia longa e na formação e estabilização de gotículas lipídicas em diferentes tecidos incluindo tecido muscular, tem-se como objetivo a validação de polimorfismos previamente identificados em estudos de RNA-Seq e eQTL no gene PLIN2, por meio de sequenciamento de última geração do DNA genômico de novilhos da raça Nelore. Até o momento não se tem muitas informações sobre mutações no gene PLIN2 em animais Bos indicus. Espera-se com este estudo poder identificar novos marcadores moleculares associados à deposição de gordura intramuscular e poder indica-los como candidatos em programas de seleção assistida por marcadores para a qualidade da carne.

Em eucariotos, o DNA é organizado juntamente com histonas em complexos nucleoproteicos conhecidos como nucleossomos. A cromatina apresenta-se de duas maneiras: eucromatina, região estruturalmente menos condensada e, portanto, mais facilmente transcrita e heterocromatina, região muito condensada e transcricionalmente silenciosa. Na forma de eucromatina há fácil acesso dos fatores de transcrição a regiões de DNA livres de nucleossomos enquanto, na forma de heterocromatina os fatores de transcrição não conseguem acessar o DNA para ativar ou reprimir a expressão gênica inferindo, assim, que o grau de compactação da cromatina interfere na regulação da expressão gênica e que o nucleossomo atua como silenciador gênico. Experimentos com Genome Wide-Association (GWAS) têm associado regiões de Quantitative Trait Locus (QTL) a regiões intergênicas indicando presença de mutações causais em regiões regulatórias. O objetivo do presente projeto é encontrar regiões de eucromatina que revelem sítios regulatórios no genoma de bovinos da raça Nelore e, posteriormente, correlaciona-las com regiões expression quantitative trait loci (eQTL), previamente identificadas, candidatas à regulação da deposição e composição da gordura intramuscular, do músculo Longissimus dorsi, refinando, assim, a busca por mutações causais. Este projeto é vinculado ao projeto Temático &quot;Bases moleculares da qualidade da carne em bovinos da raça Nelore&quot;, cujos resultados contribuirão para o conhecimento da regulação da transcrição em bovinos da subespécie Bos indicus.

A pecuária de corte é um dos principais destaques do agronegócio nacional, e tem grande importância no mercado mundial, pois o Brasil possui um dos maiores rebanhos de bovinos do mundo, com mais de 200 milhões de cabeças. Esse rebanho é composto, predominantemente por animais de origem Bos indicus, sendo que a raça Nelore e seus cruzamentos compõe aproximadamente 90% do total. Os dados efetivos de produção de carne bovina em 2012 indicam que 16,5% foram exportadas e a maior parte da produção (83,5%) abasteceu o mercado interno. (Foram retirados os dados informativos do rebanho de Ovinos) Devido à importância, interesse econômico e aumento da produção de alimentos, melhorias são necessárias para maior eficiência de produção, como, por exemplo, a seleção de animais geneticamente superiores e resistentes ao ambiente adverso dos trópicos. O uso de painéis contendo centenas de milhares de polimorfismos de nucleotídeo único (SNP - Single Nucleotide Polymorphisms) tem possibilitado aos programas de melhoramento genético animal traçar estratégias para identificação de genes ou regiões genômicas responsáveis pelas características de interesse, tornando mais eficiente o processo de seleção. A metodologia de Genome-wide Association Study (GWAS) compara os resultados dos painéis de alta densidade disponíveis em indivíduos não relacionados, que possuam uma condição fenotípica de interesse, para identificar marcadores associados a tal fenótipo, e pode apontar regiões de interesse no genoma que possam influenciar em características quantitativas. O objetivo deste projeto é realizar um estudo de genética de sistemas, abordando análises de associação genômica, desequilíbrio de ligação, variações do número de cópias de regiões genômicas (CNVs) e enriquecimento funcional em medidas de crescimento, reprodução, qualidade de carne e eficiência alimentar em bovinos da raça Nelore (Foram retirados os objetivos dos estudos de Ovinos). Adicionalmente, realizar um estudo de expressão gênica global (sequenciamento do RNA mensageiro total - RNA-Seq) e dos mecanismos epigenéticos de controle da expressão da eficiência alimentar em bovinos da raça Nelore. Com o expertise gerado, as metodologias poderão, ainda dentro da abrangência deste projeto temático, ser aplicadas a outras espécies animais.

Dentre as características de qualidade da carne bovina, a maciez é uma das mais importantes economicamente, pois tem grande influencia na comercialização e valorização do produto final. Entretanto, uma das principais dificuldades do sistema de produção de carnes no Brasil é em relação à sua qualidade, principalmente a maciez, uma vez que a maior parte do rebanho brasileiro é predominantemente constituído por animais da raça Nelore que conhecidamente produzem uma carne menos macia. O principal aspecto a ser estudado no processo de conversão do músculo em carne e o desenvolvimento da maciez é o metabolismo post mortem. Nesse contexto, a fim de explorar os mecanismos moleculares envolvidos na maciez e entender os desafios que levam uma carne ser menos macia, o presente projeto abordará um estudo de metabolômica. O perfil de metabólitos de um tecido caracteriza mais fielmente as atividades da célula em um nível funcional e, portanto, mais fielmente caracterizará o fenótipo. Assim, o presente projeto tem como objetivo identificar o conjunto de metabólitos presentes no músculo Longissimus dorsi de bovinos da raça Nelore e avaliar as diferenças entre animais com perfis contrastantes para maciez da carne. Para isso, os metabólitos serão extraídos de 40 amostras de músculo Longissimus dorsi, previamente selecionadas com os maiores e menores valores de força de cisalhamento (20 animais de cada), provenientes de uma população experimental de 386 bovinos Nelore. O perfil dos metabólitos será investigado por meio de cromatografia líquida de alta eficiência acoplada a espectrômetro de massas (HPLC-MS). Os cromatogramas e espectros de massas serão analisados e comparados entre grupos no programa MarkerLynx XS Application Manager. Com esse estudo pretende-se ampliar os conhecimentos sobre o ponto de vista fisiológico dos possíveis fatores que influenciam na maciez da carne e agregar informações aos estudos de genoma, transcriptoma e proteoma que já estão sendo desenvolvidos nessa mesma população. O presente projeto integrará conhecimentos de forma a contribuir com programas de melhoramento genético para o rebanho brasileiro.

O Brasil apresenta o maior rebanho comercial de bovinos do mundo, contando com aproximadamente 208 milhões de cabeças. O rebanho brasileiro é constituído principalmente por raças zebuínas, sendo a raça Nelore a que apresenta maior expressão como produtora de carne, com índices de desempenho econômicos notáveis. A eficiência alimentar é uma característica produtiva importante de mensuração onerosa e tardia, e apesar de apresentar herdabilidade moderada, não vem sendo contemplada nos programas de avaliação genética do Brasil. A seleção para animais mais eficientes poderá contribuir para reduções de área de pasto e produção de poluentes, com maior rentabilidade para o produtor. Novas metodologias para sequenciamento, genotipagem e análise de expressão gênica têm contribuído para o conhecimento das bases genéticas da variação e para a seleção precoce de bovinos. Um projeto anterior intitulado ?Estratégias genéticas para produção de carne bovina de qualidade? produziu 796 novilhos, descendentes de 34 touros selecionados para amostrar a diversidade da raça Nelore, os quais foram fenotipados para eficiência alimentar e submetidos à análise de associação genômica com através do Illumina BovineHD chip (770K). Esse projeto permitiu identificar regiões genômicas e genes associados à eficiência alimentar. O presente projeto tem por objetivo alcançar melhor compreensão dos mecanismos genéticos envolvidos na variação de caracteres quantitativos apontados pela análise de associação. Para tanto, propõe-se complementar as análises de associação genômica e expandir as análises de expressão de transcritos com a identificação de mecanismos regulatórios, microRNAs e regiões promotoras, de tecidos de bovinos da raça Nelore extremos para eficiência alimentar.

A quantidade e composição da gordura intramuscular (GIM) podem influenciar as características sensoriais, o valor nutricional da carne bovina e a saúde humana, uma vez que o perfil dos seus ácidos graxos pode se apresentar de maneira diversificada conforme a genética, o manejo e a nutrição dos animais de origem. A deposição e composição da gordura são determinadas por muitos genes que participam direta ou indiretamente da adipogênese e do metabolismo lipídico. Na última década, presenciamos um grande avanço na área da genômica bovina que resultou no sequenciamento completo do genoma, no desenvolvimento de estratégias de sequenciamento de RNA para estudos de expressão gênica e chips de alta densidade de SNP para genotipagem. O objetivo deste estudo é integrar informações de genotipagem e de sequenciamento de mRNA para mapear regiões de eQTL associadas à deposição e composição de gordura intramuscular, assim como caracterizar a arquitetura genética da expressão gênica. Os dados de genotipagem (390 animais) já foram obtidos pelo presente grupo e o sequenciamento do mRNA total será obtido a partir de 200 amostras do músculo Longissimus dorsi de machos castrados da raça Nelore. As regiões de eQTL identificadas no presente projeto ampliarão o conhecimento dos mecanismos biológicos envolvidos com a biossíntese de ácidos graxos em bovinos. Estes resultados irão compor a base de dados do projeto Temático &quot;Bases moleculares da qualidade da carne em bovinos da raça Nelore&quot; (Processo 2012/23638-8), contribuindo para o conhecimento da regulação dos processo biológicos envolvidos com fenótipos de interesse econômico.

Projeto temático com objetivo de alcançar melhor compreensão dos mecanismos genéticos&#10;envolvidos na variação de caracteres quantitativos apontados pela análise de associação.

Este trabalho tem como objetivo avaliar por meio da ferramenta proteômica o efeito do complexo calpaína/calpastatina na proteólise post mortem da carne de bovinos Nelore com genótipos contrastantes para maciez. Para tanto serão analisadas amostras provenientes de 192 animais da raça Nelore. Serão coletadas amostras de sangue no momento do abate para posteriores análises genômicas e de carne, no músculo Longissimus dorsi (LD), a uma, 12 e 24 horas post mortem para análises proteômicas. Amostras do LD serão maturadas por zero, sete ou 14 dias. Após cada período de maturação serão realizadas análises proteômicas, perdas de água por cocção e a força de cisalhamento das carnes. A caracterização e determinação dos genótipos polimórficos (SNP) para os marcadores do gene da m-calpaína (CAPN4751 e CAPN4753) e do marcador UOGCAST1, associado à calpastatina serão realizadas por meio de PCR em Tempo Real. A identificação das principais proteínas relacionadas com o processo de amaciamento da carne será realizada por meio da análise de eletroforese bi-dimensional e de Western Blotting.

Tracciabilità molecular dei prodotti agroalimentare di origine animale nela regione Lombardia (Fondazione Cariplo)

Projeto de iniciação científica orientado pelo Prof.Dr.Flávio Meirelles.