Fernando Batista da Costa.

Edital de Apoio a Eventos Científicos da Pró-Reitoria de Pesquisa e Inovação da USP

Cooperação acadêmica nas áreas de Quimioinformática e de Química de Produtos Naturais para para o desenvolvimento de plataforma web baseada em quimioinformática para o gerenciamento e disponibilização de dados de extratotecas e de perfis químicos de ativos industriais

Cooperação acadêmica na área de Química de Produtos Naturais

Cooperação acadêmica na área de Química de Produtos Naturais

Convênio de cooperação acadêmica na área de Química de Produtos Naturais, a fim de promover o intercâmbio de docentes/pesquisadores, estudantes de pós-graduação e
estudantes de graduação (com reconhecimento mútuo de estudos de graduação) das respectivas instituições. Processo USP no. 08.1.01337.60.1.

Proc. no. 2008.1.797.60.9. Auxílio financeiro para visitas a instituições de ensino e pesquisa no exterior.

Projeto para bolsa de produtividade em pesquisa.

Cooperação técnica com a integração de esforços entre as partes para a execução conjunta de trabalhos de pesquisa agrícola, de interesse mútuo, consistente na execução de ações de pesquisa e desenvolvimento, em consonância com o projeto de pesquisa intitulado Aplicação de técnicas metabolômicas para caracterizar e autenticar vinhos produzidos em diferentes regiões brasileiras.

Projeto para bolsa de produtividade em pesquisa.

Proc. FAPESP no. 2019/01486-0. Além de avaliar o desenvolvimento e produção de inflorescências de lúpulo de interesse para a indústria farmacêutica e fabricantes de cerveja, o objetivo do plano é também estudar o desempenho fisiológico (avaliação de trocas gasosas, fluorescência da clorofila a, antioxidantes enzimáticos e não enzimáticos) e a metabolômica (utilizando LC-MS) de folhas e inflorescências de quatro cultivares de lúpulo cultivados sob clima tropical, em Ribeirão Preto, SP.

Proc. FAPESP no. 17/50293-5 (Sprint, University of Missouri, USA). The proposed project explores a botanical, Harpagophytum procumbens subsp. procumbens (Burch.) DC. ex Meisn, family Pedaliaceae (Devils Claw; Garra do Diablo) for which there is evidence of benefit to human health, namely its use in management of inflammatory arthritis, lower back pain and other musculoskeletal conditions. H. procumbens is one of the most frequently used herbal products for these conditions in Europe, and also is widely used in Africa, the United States and Brazil (and other countries). Recent studies support its potential utility, however the variability in the products being marketed and lack of well-defined mechanisms and biological targets impede medical acceptance.

Implementar uma plataforma de Produtos Naturais contendo bibliotecas de substâncias e de extratos (extratoteca) da família Anacardiaceae, além de uma biblioteca de estruturas químicas.

The research focus is part of the strategic partnership program wwu.usp, focus topic "Neglected Tropical Diseases".

Processo FAPESP no. 2014/26866-7. Com vistas ao aumento de produtividade na busca por componentes inéditos ou bioativos, bem como realizar estudos in silico e de desreplicação de matrizes biológicas, também é importante a criação de coleções de substâncias puras e de suas estruturas químicas, bem como de extratos e frações cromatográficas. O principal objetivo desse projeto é empregar a metabolômica via cromatografia líquida acoplada a espectrometria de massas e métodos in silico para encontrar substâncias naturais oriundas de plantas da família Asteraceae com potencial anti-inflamatório e antiparasitário. Os alvos selecionados são enzimas envolvidas na inflamação (cicloxigenase e lipoxigenase) e em doenças causadas por parasitas (diidroorotato desidrogenase ? DHODH de Leishmania major). Propõe-se desenvolver ainda uma biblioteca de substâncias puras, uma extratoteca, uma biblioteca de estruturas químicas e uma base de dados integrada. Estruturas químicas oriundas da desreplicação de extratos e do levantamento bibliográfico dos grupos vegetais estudados, bem como dados de bioensaios, serão utilizados na triagem virtual de substâncias com potencial anti-inflamatório. Os dados resultantes deste projeto serão integrados e inseridos em um banco de dados. Trata-se, portanto, do desenvolvimento de uma plataforma integrada para a descoberta de substâncias bioativas e desreplicação.

Auxílio para publicação de artigo científico em periódico internacional (Molecules)

Proc. no. 2012.1.10020.1.6. Valor R$ 6.000,00

Program Cátedra Brasil da Universidade de Münster - Edital CAPES nº 042/2011 - na Área de Química de Produtos Naturais.
A Cátedra Brasil na Universidade de Münster tem o objetivo de apoiar pesquisadores
brasileiros para desenvolver atividades de ensino e pesquisa na Westfäliche
Wilhelms-Universität Münster (WWU) e de apoio ao recém-criado Centro Brasileiro da WWU.
ABSTRACT: Infections caused by protozoan parasites classified as ?neglected diseases? (NDs) are the major cause of death in many tropical countries. Once big pharmaceutical companies have little interest in the development of new drugs against NDs, the search for new bioactive compounds, especially natural products, is of interest. Before these compounds are tested in vitro or in vivo it is recommended that the physicochemical properties of their structures are known beforehand. At this stage chemoinformatic tools and in silico methods play an important role. The main aim of this project is to build a database consisting of chemical structures of plant secondary metabolites, especially from the family Asteraceae. The database will comprise data such as 3D coordinates, botanical source, biological activities, spectroscopic data, and chromatographic retention times as well as calculated physicochemical properties. Based on the information from the database and with the help of chemoinformatic tools it will be possible to perform dereplication of plant extracts as well as property predictions of chemical structures based on molecular modeling so that lead compounds against NDs can be rapidly identified in plant matrices. The proposed research plan herein is intended to be part of the network multilateral and multinational Research Network Natural Products against Neglected Diseases (ResNetNPND).

Projeto temático (Pesquisador principal). Processo FAPESP no. 2010/51454-3. O projeto está organizado em três subprojetos cuja meta principal é ampliar os conhecimentos morfoanatômicos e efetuar estudos metabolômicos de Asteraceae para aplicá-los, juntamente com dados moleculares, em estudos filogenéticos de dois importantes grupos (tribos Vernonieae e Heliantheae), além de levantar o potencial farmacológico das espécies escolhidas através de ensaios anti-inflamatórios in vitro.

Proc. no. 10.1.26268.1.0. Valor R$ 4.000,00.

Proc. no. 453850/2010-3. Auxílio para participação no evento "'Terpenes- Application, Activity and Analysis'', em Istambul, Turquia.

Proc. no. 473870/2010-0. Edital MCT/CNPq no. 14/2010 - Universal - Faixa A (R$18.000,00). Propõe-se efetuar a desreplicação, comparar perfis metabólicos, isolar e identificar substâncias de diferentes extratos de espécies de Asteraceae e ainda criar uma biblioteca de substâncias naturais com os constituintes isolados juntamente com seus dados cromatográficos, espectrométricos e físico-químicos (semi-empíricos). Os metabólitos identificados através da desreplicação comporão uma base de dados contendo seus dados cromatográficos e físico-químicos. Com base nestes dados, serão obtidos modelos computacionais utilizando-se inteligência artificial para estudar, in silico, a relação entre estruturas químicas e tempos de retenção (QSRR - Quantitative Structure-Retention Relationships). Através do estudo de QSRR poder-se-á predizer tempos de retenção de substâncias e facilitar sua busca e identificação em matrizes biológicas. Por fim, os extratos e as substâncias isoladas serão utilizados em ensaios "in vitro" com as enzimas ciclooxigenase e lipoxigenase com vistas à busca de inibidores para ambos os alvos.

Processo FAPESP no. 08/57149-8 (R$ 310.777,39). Estudos preliminares realizados por nosso grupo de pesquisas revelaram três plantas medicinais promissoras da família Asteraceae com potencial farmacológico: Smallanthus sonchifolius (yacón), Tithonia diversifolia (margaridão) e Dasyphyllum brasiliense (espinho-agulha). Estas espécies foram parcialmente investigadas do ponto de vista químico e farmacológico. Entretanto, justifica-se uma investigação integrada e detalhada sobre seus efeitos farmacológicos e principalmente sobre os mecanismos de ação. Os extratos de lavagem foliar do yacón e do margaridão possuem lactonas sesquiterpênicas antiinflamatórias, classe de metabólitos não detectada no espinho-agulha, que também possui ação antiinflamatória. Contudo, ainda não há dados sobre o grau de toxicidade destas plantas, em especial devido à presença das lactonas, conhecidas por sua ação tóxica. 
Logo, propõe-se realizar um estudo multidisciplinar com o objetivo de se obter perfis metabólicos de diferentes extratos das três espécies, isolar, identificar e quantificar diferentes classes de micromoléculas. Com o material obtido, realizar-se-ão ensaios antiinflamatórios in vivo e in vitro em diferentes alvos moleculares e celulares para investigar seus mecanismos de ação. Propõe-se ainda investigar a citotoxicidade, a toxicidade e a genotoxicidade. As substâncias a serem isoladas e aquelas presentes no laboratório serão reunidas para se compor uma biblioteca de substâncias puras. Com base nos dados biológicos e empregando-se inteligência artificial, propõe-se realizar estudos in silico e obter modelos computacionais para estudar a relação entre estrutura química e atividade biológica. Assim, pela primeira vez, através da integração de estudos fitoquímicos, computacionais e de bioatividade, pretende-se investigar as ações biológicas e os mecanismos de ação destas três espécies medicinais, além de se elaborar uma biblioteca de substâncias puras.

Proc. no. 2009.1.13732.1.3 - Valor R$ 3.000,00

Processo FAPESP no. 2009/00572-9. Projeto para Reparo de Equipamento (linha de programas regulares; US$ 2.847,85 e R$ 800,00).

A Missão do INCT_if é desenvolver, internalizar e difundir práticas científicas e tecnológicas capazes de superar as fragilidades e lacunas da cadeia inovativa e produtiva farmacêutica, propondo mecanismos operacionais capazes de viabilizar a transformação de resultados científicos promissores em resultados econômicos efetivos com impactos sociais.

Proc. no. 314/09. Projeto de Cooperação Internacional PROBRAL CAPES/DAAD. Auxílio financeiro (R$ 20.000,00) e missões de trabalho e de estudo para a Alemanha. Objetivos: (1) obter diferentes tipos de extratos e os perfis metabólicos das partes aéreas de Smallanthus sonchifolius (yacón), Tithonia diversifolia (margaridão) e Dasyphyllum brasiliense (espinho-agulha). Estes extratos referem-se ao aquoso (infuso), de lavagem superficial das folhas e das folhas previamente lavadas com solvente orgânico; (2) isolar e identificar diferentes classes de micromoléculas destes extratos para serem avaliadas em ensaios antiinflamatórios ?in vivo? e ?in vitro?, empregando-se diferentes modelos, incluindo a proposição de mecanismos de ação; (3) com base nos dados biológicos e a combinação destes com ferramentas de quimioinformática, propõe-se obter modelos computacionais para estudar a relação entre estrutura química e atividade biológica.

Proc. no. 06/07308-7. Auxílio para participação no evento "50 Years of the Phytochemical Society of Europe", em Cambridge, Inglaterra, e visita ao Institut fuer Organische Chemie, Universitaet Erlangen-Nuernberg, Erlangen, Alemanha.

Proc. no. 07.1.00265.60.6. Auxílio financeiro para participação em evento científico no exterior e visitas a outros centros.

Proc. no. 07.1.7596.1.2. Valor R$ 2.931,80