Milton Groppo Júnior.

Esse projeto foi obtido em 2023 e visou a obtenção de fundos para a realização XI Encontro de Biologia Comparada, Programa de Pós-Graduação em Biologia Comparada. O Encontro também foi coordenado por mim, e as verbas foram utilizadas para custear a vinda de palestrantes, ministrantes de cursos e material de divulgação. Os alunos do Programa em Biologia Comparada tomam a frente de grande parte das ações, sendo um ótimo aprendizado em eventos científicos e de extensão universitária, pois o Encontro é realizado visando alunos de outras instituições de ensino superior e estudos de nível fundamental e médio. O evento ocorreu de de 29 de julho a 3 de agosto de 2024. A página do Encontro pode ser vista em https://www.even3.com.br/xi-encontro-de-biologia-comparada-458160/

O projeto Viveiro da Botânica on-line tem como finalidade a difusão do conhecimento científico gerado no Viveiro da Botânica da FFCLRP-USP, espaço de aproximadamente 3.000 m voltado ao ensino, pesquisa e ações de cultura e extensão universitária. Essa área abriga estufas para cultivo experimental, tanque com plantas aquáticas, mesa de suculentas, canteiros didáticos e o Herbário SPFR, com mais de 17 mil exsicatas utilizadas em estudos botânicos. Também se destaca a recente introdução de 40 colônias de abelhas sem ferrão, ampliando as possibilidades de estudos sobre polinização e interações ecológicas.Por meio da criação de uma página na internet, o projeto visa disponibilizar imagens e informações sobre as espécies vegetais, os ambientes e os polinizadores presentes no viveiro. A iniciativa incluiu a identificação taxonômica das espécies, a produção de fotografias científicas, vídeos explicativos e a instalação de placas com códigos QR para acesso direto ao conteúdo digital. O público-alvo contempla estudantes do ensino fundamental ao universitário, professores e visitantes em geral, ampliando significativamente o alcance das ações educativas e de divulgação científica. O projeto também é considerado um passo inicial para a catalogação on-line da flora do campus Ribeirão Preto. Essa proposta foi contemplada pelo 6 Edital Santander/USP/FUSP de Fomento às Iniciativas de Cultura e Extensão Universitária.

The objectives of this proposal are: - accelerate the digitization of the SPFR Herbarium collection from c. 11,000 to 16,000 digitized records;- make records available on the Specieslink online platform- photograph at least 2,000 materials and make these records available online on the Specieslink platform- check the collection periodically for pests such as beetle larvae and moths.- package the material for incorporation, including procedures for previously freezing the material to avoid contamination (mold and insects)- Return of loans.- organize the collection for assembly and correct packaging of exsiccates- train students in scientific collection management activities and curation activities The SPFR Herbarium was founded in 1985 and indexed in the Index herbariorum in 1988.Most collections come from the Northeast of the state of São Paulo, but recent collections from the states of Minas Gerais, Bahia, and Espírito Santo, as well as the Brazilian Amazon, have been more common recently. The Herbarium also has a good amount of test materials for phytochemical studies. The Herbarium also has 18 type materials, including holotypes (5), isotypes (6) and paratypes (7). The Herbarium is being computerized, with records made available on the Specieslink online platform (https://specieslink.net/col/SPFR/). Currently 11000 records (exsicatas) are online, with 992 images (data from March 2024). This number of registrations was only 4790 in March 2023, that is, there was an increase of 6210 online registrations in one year. Currently around 61 of the collection (total: 18,000 records) is available online. A 150 L Drying Oven for drying plants is requested since the material must be dehydrated as soon as possible after being pressed (price: US$ 1000,00). Currently the collection has an old drying oven with restricted use due to constant breakages. Other US$ 1000,00 of the funding is requested to finance students for the task of photographing, digitizing, and making the specimens available online (US$ 1000.00). *- estimated prices originally in Brazilian Real (RS$), and then converted to US dollar, quotation US $1.00 dollar = RS$5.01, March, 30th, 2024).

As coleções do Departamento de Biologia (DB) da FFCLRP constituem, em conjunto, um dos maiores acervosbiológicos da Universidade de São Paulo. Os acervos que estão efetivamente constituídos são a ColeçãoEntomológica Prof. J.M.F. Camargo (sigla RPSP), a Coleção de Peixes do Laboratório de Ictiologia, DB/FFCLRP(sigla LIRP), o Herbário do Departamento de Biologia (sigla SPFR), a coleção de fósseis do Laboratório dePaleontologia da FFCLRP (LPRP), na Coleção Herpetológica de Ribeirão Preto (CHRP), e a Coleção deCrustáceos do DB - Laboratório de Bioecologia e Sistemática de Crustáceos (CCDB). Em conjunto estas coleçõesrepresentam mais de 500.000 registros biológicos, possuindo o Cadastro Técnico Federal do IBAMA (CTF-APP)unificado para a Unidade. Todas as são fiéis-depositárias junto ao CGEN/Ministério do Meio Ambiente, abrigandomateriais-testemunho para estudos de taxonomia, sistemática, genética, conservação, química, farmacêutica eestudos médicos. As coleções do DB são fontes de consulta do público externo e pesquisadores, com programasde permuta de materiais. Os acervos também cumprem papel na de Cultura e Extensão, sendo utilizados ematividades voltadas para escolas e comunidade externa. A captação de recursos em projetos conjuntos tem tidosucesso: exemplo são os projetos Melhoria das coleções científicas do DB/FFCLRP-USP (FAPESP, Proc.2009/54931-0, valor ca. R$ R$ 922.724,95 + U$ 42.864,26); Informatização e disponibilização dos acervosbiológicos do DB, FFCLRP-USP (CNPq 504322/2012-5, valor R$ 129.000,00) e Integração e Preservação doAcervo Biológico da FFCLRP/USP INFRA-USP (PRO-INFRA USP, 2012, valor R$ 100.000,00). Por conta detodos os fatores acima, as coleções biológicas do DB têm sido um dos destaques do reconhecimento daexcelência das atividades do DB, transcendendo os seus limites além da FFCLRPOs acervos biológicos do DB/FFCLRP-USP têm tido um papel preponderante na pesquisa focada no estudo daBiodiversidade desenvolvida no Departamento e na Unidade. Em conjunto, as coleções do DB abrigam 4094materiais-tipo. Três coleções delas estão presentes na plataforma Specieslink (https://specieslink.net/), o SPFR, oLIRP e o RPSP, totalizando cerca de 144.000 registros online, incluindo 3.500 imagens de espécies. Ao menosuma, a CCDB tem sua base de dados cadastrada no Sistema de Informação Ambiental do Biota (SinBiota) e noSistema de Informação sobre a Biodiversidade Brasileira (SIBBr). Todo esse material é proveniente de coletas dematerial biológico, que apoiam estudos ligados à sistemática (incluindo a descrição de espécies novas, dado ogrande número de materiais-tipo), conservação biológica, paleontologia, anatomia, palinologia, ecologia, evolução,genética e biogeografia. As coleções apoiam os projetos desenvolvidos no DB, notadamente aqueles ligados aosPPGs em Entomologia e em Biologia Comparada, ambos de excelência internacional segundo a Capes, comconceitos 7 e 6, respectivamente. Os acervos também são importantes para a internacionalização da pesquisa,com troca de materiais tanto para instituições brasileiras como de fora do Brasil, notadamente com os EUA, ReinoUnido, França, Colômbia, Alemanha, Chile, México e Argentina. Todas as coleções do DB, com exceção dacoleção de fósseis (LPRP) são fiéis-depositárias junto ao CGEN/Ministério do Meio Ambiente, abrigandomateriais-testemunho para estudos taxonômicos, genéticos, químicos, de indústria farmacêutica, e estudosmédicos. O acervo biológico do DB é fonte principal de espécimes biológicos em estudos com imagem avançadasproduzidas no Centro para a Documentação da Biodiversidade (CDB) sediado no mesmo Departamento, comnano CT-Scan e microscópio eletrônico de varredura, o que propicia a produção de imagens acuradas utilizadasem artigos científicos e atividades de divulgação científica

Herbários e seus componentes (exsicatas, xiloteca, carpoteca, material em meio líquido ou em sílica), representam parte fundamental da pesquisa biológica, sendo base de estudos que transcendem a Taxonomia, pois áreas diversas do conhecimento demandam dados de qualidade provenientes das coleções biológicas. A disponibilização das coleções dos acervos físicos nas redes virtuais tem ampliado muito o acesso aos registros da biodiversidade Neotropical, permitindo extensas pesquisas, contribuindo para um melhor conhecimento e conservação dessa riquíssima flora por meio de análises espaciais em diferentes escalas. Os cinco herbários paulistas envolvidos neste projeto estão entre os maiores do estado, sendo responsáveis por parte substancial da produção científica botânica do Brasil e pela formação de grande parte dos profissionais do país nesta área do conhecimento. No entanto, ainda existem lacunas de amostragem no território brasileiro e o processo de digitalização destas coleções ainda não está completo, demandando mais atividades de campo e esforços para que os dados sejam disponibilizados nas redes virtuais e viabilizem estudos futuros abrangentes e completos

O valor das coleções biológicas, especialmente no atual contexto de perda acelerada da biodiversidade planetária, é indubitável. Atualmente, face ao grande desenvolvimento tecnológico e popularização dos meios digitais, grandes bancos de dados de coleções biológicas vêm sendo disponibilizados na internet, o que consequentemente aumenta exponencialmente a sua visibilidade e o seu uso. Neste contexto, a qualidade e precisão das informações contidas nas coleções biológicas é de extrema importância, sendo a revisão dos registros um desafio que precisa ser enfrentado para qualificar os dados das coleções, especialmente quanto às localidades e coordenadas e, assim, possibilitar a vinculação de informações fidedignas aos organismos, possibilitando análises em fina escala. Outro avanço tecnológico que afeta diretamente o uso das coleções biológicas é a possibilidade de disponibilizar em ambiente virtual imagens de alta qualidade tanto do exterior do material biológico quanto de seu interior, utilizando equipamentos de inspeção radiológica e micro/nano tomógrafos e técnicas computacionais de reconstrução de modelos 3D, permitindo a disseção virtual de partes anatômicas. Diante do exposto, o presente projeto tem por objetivo a aquisição de um conjunto de equipamentos multiusuários para a geração de imagens radiográficas 2D e de reconstrução de modelos 3D das coleções científicas do Departamento de Biologia da FFCLRP-USP, Ribeirão Preto, para uso em pesquisas, ensino e disponibilização na internet. Mais especificamente, o presente projeto tem por objetivo a compra de: um sistema de inspeção radiográfica digital para rápido acesso a informações anatômicas internas, especialmente do esqueleto; conjunto de 6 estações de trabalho computacionais e respectivos softwares para segmentação de reconstruções 3D geradas pelo nano/micro CT-Scan computadorizado; uma estação de trabalho computacional para armazenamento, organização e disponibilização de imagens relacionadas aos espécimes das coleções na internet. Além disso, almejamos abrir a oportunidade para a formação humana especializada com o treinamento técnico de três bolsistas TT FAPESP. O DB/FFCLRP/USP abriga atualmente quatorze (14) coleções científicas, sendo onze (11) delas acervos de espécimes mortos/preservados, as quais juntas mantêm mais de 500.00 espécimes distribuídos em mais de 134.000 lotes. Cada uma dessas coleções está associada a um laboratório de pesquisa e respectivo curador específico, suportado por infraestrutura física, humana e organizacional dedicada, além de um laboratório multiusuário, Centro para Documentação da Biodiversidade (CDB). O CDB é estruturado por um Comitê Gestor, um Responsável por Equipamentos e por uma Comissão de Usuários, e possui corpo técnico dedicado a operar e dar manutenção aos equipamentos multiusuários (tomógrafo industrial (nano/micro-CT e ao estereomicroscópio com captura de imagem). O CDB faz parte da plataforma USP Multi - Centrais de Equipamentos Multiusuários, a qual torna o parque de equipamentos da instituição visível e de fácil acesso ao compartilhamento e traz facilidades para sua gestão otimizada e manutenção prioritária institucional, com uso prioritário de verbas como a reserva técnica institucional FAPESP, além de possuir mecanismos instalados para transferência orçamentária e para recebimento de pagamentos externos a partir da fundação da FFCLRP

Esta proposta é uma continuidade da proposta do período anterior, centrada no auxílio à pesquisa de projetos que são atualmente desenvolvidos pelo proponente Milton Groppo, seus colaboradores e seus alunos do Laboratório de Sistemática de Plantas do Departamento de Biologia da FFCLRP-USP. O fio-condutor destes projetos é o entendimento da Sistemática e da evolução em um modo integrativo, que envolve deste a taxonomia alfa (como a revisão taxonômica de grupos ou levantamentos da flora), estudos filogenéticos e biogeográficos e a investigação da anatomia de órgãos foliares e órgãos reprodutivos (flores, frutos e sementes). Os projetos apoiados estão concentrados em três táxons (famílias) Rutaceae, Asteraceae e Rubiaceae. As atividades propostas estão formatadas segundo estes três eixos principais, cada um deles correspondendo às famílias botânicas com a maior concentração de estudos. No primeiro eixo RUTACEAE serão realizados estudos filogenéticos baseados em dados moleculares (métodos de Sanger e NGS) focados nos grupos neotropicais da tribo Galipeeae, com suas duas subtribos Galipeinae e Pilocarpinae, um grupo com 27 gêneros e cerca de 150 espécies. Outros táxons que são tradicionalmente posicionados em outros grupos de Rutaceae, mas que hoje se sabe que são filogeneticamente próximos à Galipeeae, como Balfourodendron, Helietta e Hortia, também serão incluídos. As hipóteses filogenéticas geradas, mais acuradas que as hoje disponíveis, serão utilizadas como base de estudos envolvendo a anatomia foliar de grupos em Galipeinae e em Hortia. Em Rutaceae também serão feitos estudos de levantamento de flora, como monografias para a família para a Flora dos Estados da Bahia. Estão previstos também continuação do tratamento da família para a Flora do Brasil, além do tratamento de Rutaceae para a Flora Mesoamericana. No segundo eixo do projeto ASTERACEAE - os estudos serão focados na subfamília Barnadesioideae, o grupo-irmão de todas as outras Asteraceae. Este estudo tem por objetivos investigar a monofilia dos gêneros em Barnadesioideae e das classificações infragenéricas de Dasyphyllum, Chuquiraga e Barnadesia com a utilização de dados moleculares. As hipóteses filogenéticas serão associadas a estudos de biogeográfia histórica como áreas ancestrais, diversificação e tempos de divergência. Um estudo morfológico envolvendo anatomia e dados ontogenéticos dos espinhos axilares (caráter sinapomórfico para a subfamília) será realizado, pois há dúvidas sobre a sua real natureza e a sua função primitiva na subfamília. O terceiro eixo é focado na família RUBIACEAE, com estudos de revisão do gênero neotropical Simira Aubl., com 40-50 espécies da América Central ao norte da Argentina. Outro gênero da mesma família, Rudgea Salisb., com ca. 100 espécies, será estudado, com uma sinopse do gênero para o Brasil e também uma análise filogenética e biogeográfica para o grupo como um todo. Outros projetos paralelos sobre floras e levantamentos florísticos terão amostras coletadas, maximizando o uso de recursos. Em todos os projetos serão coletadas amostras em campo, para extração de DNA para possíveis estudos filogenéticos futuros, além de haver a possibilidade de descrição de espécies novas para a ciência. (Projeto Bolsa de Produtividade em Pesquisa CNPq, Nível 1D, Processo 307925/2022-6)

The objectives of this proposal are:-to accelerate the digitization of the SPFR Herbarium collection from c. 4,600 to 7,000 digitalized records-make the records available on an online platform-photograph at least 1,000 materials and make records available online-pack the material for incorporation, including procedures for prior freezing of the material to avoid contamination (mold and insects)-Return of loans. -organize the collection for assembly and correct packaging of the exsiccates (nearly 4,000 numbers waiting to the mounted) -training students in scientific collection management activitiesTo continue digitizing the collection, a more modern computer is requested (price c. US$665.00*) for the collection, given that the computer currently available for the task is 10 years old and with limited operational capacity. The change of computer is important because one of the other objectives of the present proposal is to photograph the collection and make the photos of the specimens available online on the SpeciesLink Platform. Currently only images of types from the SPFR collection are available online (17 materials) and the plan is to photograph the entire collection (20,000 plants), 1,000 of which in the period of the present project (by the end of 2023). Therefore, a stative for photos, with two lamps and board (price c. US$ 570.00) is also requested to photograph the specimens. A portion of the funding is requested to finance students for the task of photographing, digitizing and making the specimens available online (US$ 385.00). *- estimated prices originally in Brazilian Real (RS$), and then converted to US dollar, quotation US $1.00 dollar = RS$5.2681, December, 28th, 2022).Finally, an upright freezer (price c. US$380.00) is also requested to store material that has been sent to the SPFR collection, or to store material received as a donation or loan. Currently, the Herbarium has a freezer that is about 30 years old, which from time to time breaks and has to be repaired, which puts the material at risk.

Projeto institucional do Programa de Pós-Graduação em Biologia Comparada visando a obtenção de bolsas de mestrado e doutorado junto ao Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)

Projeto institucional do Programa de Pós-Graduação em Biologia Comparada visando a obtenção de bolsas de mestrado e doutorado junto ao Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)

One of the main challenges in maintaining the SPFR Herbarium is the lack of trained personnel in managing scientific collections, as the Herbarium does not have a staff member for this task. Thus, the Herbarium is maintained by undergraduate scholarship students, who after a certain period of time leave the collection management.Thus, to achieve the proposed objectives, the objective is to offer funds so that people can be trained in managing collections, including the assembly and organization of materials. About 5,000 numbers are still waiting to be sorted and assembled. A part of this material will be assembled by undergraduate scholarship students supported by CNPq ("National Research Council, Brazil") funding and the other will be funded by the IAPT grant.The digitization of 4,000 numbers will be performed by personnel supported by the IAPT budget, using an Excel spreadsheet (Microsoft). Afterwards, the records will be made available on the SpeciesLink Platform, where the SPFR Herbarium already has about 2500 online records (see https://specieslink.net/col/SPFR/) . Thus, the number of online registrations is expected to increase from 2500 to 6500 at least.Finally, there are materials from other Herbaria that are on loan to SPFR, such as from ALCB, BHCB, HUEFS, RB, SP SPF, UEC Herbarium that need to be returned. The IAPT budget would be used to fund staff to organize this material for return, make invoices and pack the material. Shipping costs will be borne by USP.

O presente projeto é um pedido de bolsas de mestrado e doutorado junto ao CNPq para o Programa de Pós-Graduação em Biologia Comparada, sediado no Departamento de Biologia da FFCLRP-USP.

O presente projeto é um pedido de bolsas de mestrado e doutorado junto ao CNPq para o Programa de Pós-Graduação em Biologia Comparada, sediado noDepartamento de Biologia da FFCLRP-USP.

Esta proposta está centrada no auxílio à pesquisa de projetos que são atualmente desenvolvidos pelo proponente Milton Groppo, seus colaboradores e seus alunos do Laboratório de Sistemática de Plantas do Departamento de Biologia da FFCLRP-USP. O fio-condutor destes projetos é o entendimento da Sistemática e da evolução em um modo integrativo, que envolve deste a taxonomia alfa (como a revisão taxonômica de grupos ou levantamentos da flora), estudos filogenéticos e biogeográficos e a investigação da anatomia de órgãos foliares. Os projetos apoiados estão concentrados em três táxons (famílias) Rutaceae, Asteraceae eRubiaceae. As atividades propostas estão formatadas segundo estes três eixos principais, cada um deles correspondendo às famílias botânicas com a maior concentração de estudos. No primeiro eixo RUTACEAE serão realizados estudos filogenéticos baseados em dados moleculares focados nos grupos neotropicais da tribo Galipeeae, com suas duas subtribos Galipeinae e Pilocarpinae, um grupo com 27 gêneros e cerca de 150 espécies. Outros táxons que são tradicionalmente posicionados em outros grupos de Rutaceae, mas que hoje sesabe que são filogeneticamente próximos à Galipeeae, como Balfourodendron, Helietta e Hortia, também serão incluídos. As hipóteses filogenéticas geradas, mais acuradas que as hoje disponíveis, serão utilizadas como base de estudos envolvendo a anatomia foliar de grupos em Galipeinae e em Hortia. Em Rutaceae também serão feitos estudos de levantamento de flora, como monografias para a família para a Flora dos Estados do Sergipe, Espírito Santo e Bahia. Estão previstos também a confecção do tratamento para a Flora do Brasil, além do tratamento de Rutaceae para a Flora Mesoamericana. Uma revisão para as espécies de Almeidea A.St.-Hil., um gênero agora reduzido à sinonímia de Conchocarpus J.C.Mikan também será realizada. No segundo eixo do projeto ASTERACEAE - os estudos serão focados na subfamília Barnadesioideae, o grupo-irmão de todas as outras Asteraceae. Este estudo tem por objetivos investigar a monofilia dos gêneros em Barnadesioideae e das classificações infragenéricas de Dasyphyllum, Chuquiraga e Barnadesia com a utilização de dados moleculares. As hipóteses filogenéticas serão associadas a estudos de biogeográfia histórica como áreas ancestrais, diversificação e tempos de divergência. Um estudo morfológico envolvendo anatomia e dados ontogenéticos dos espinhos axilares (caráter sinapomórfico para a subfamília) será realizado, pois há dúvidas sobre a sua real natureza e também a sua função primitiva na subfamília. Oterceiro eixo é focado na família RUBIACEAE, com estudos de revisão do gênero neotropical Simira Aubl., com 40-50 espécies da América Central ao norte da Argentina. Outro gênero da mesma família, Rudgea Salisb., com ca. 100 espécies, será estudado, com uma sinopse do gênero para o Brasil e também uma análise filogenética e biogeográfica para o grupo como um todo. Outros projetos paralelos sobre floras e levantamentos florísticos terão amostras coletadas, maximizando o uso de recursos. Em todos os projetos serão coletadas amostras em campo, para extração de DNA para possíveis estudos filogenéticos futuros, além de haver a possibilidade de descrição de espécies novas para a ciência. (Projeto Bolsa Produtividade em Pesquisa CNPq Nível 2, Processo 309088/2016-0 )

Esta proposta está centrada no auxílio à pesquisa de projetos que são atualmente desenvolvidos pelo proponente Milton Groppo, seus colaboradores e seus alunos do Laboratório de Sistemática de Plantas do Departamento de Biologia da FFCLRP-USP. O fio-condutor destes projetos é o entendimento da Sistemática e da evolução em um modo integrativo, que envolve deste a taxonomia alfa (como a revisão taxonômica de grupos ou levantamentos da flora), estudos filogenéticos e biogeográficos e a investigação da anatomia de órgãos foliares. Os projetos apoiados estão concentrados em três táxons (famílias) - Rutaceae, Asteraceae e Rubiaceae. As atividades propostas estão formatadas segundo estes três eixos principais, cada um deles correspondendo às famílias botânicas com a maior concentração de estudos. No primeiro eixo - RUTACEAE - serão realizados estudos filogenéticos baseados em dados moleculares focados nos grupos neotropicais da tribo Galipeeae, com suas duas subtribos Galipeinae e Pilocarpinae, um grupo com 27 gêneros e cerca de 150 espécies. Outros táxons que são tradicionalmente posicionados em outros grupos de Rutaceae, mas que hoje se sabe que são filogeneticamente próximos à Galipeeae, como Balfourodendron, Helietta e Hortia, também serão incluídos. As hipóteses filogenéticas geradas, mais acuradas que as hoje disponíveis, serão utilizadas como base de estudos envolvendo a anatomia foliar de grupos em Galipeinae e em Hortia. Em Rutaceae também serão feitos estudos de levantamento de flora, como monografias para a família para a Flora dos Estados do Sergipe, Espírito Santo e Bahia. Estão previstos também a confecção do tratamento para a Flora do Brasil, além do tratamento de Rutaceae para a Flora Mesoamericana. Uma revisão para as espécies de Almeidea A.St.-Hil., um gênero agora reduzido à sinonímia de Conchocarpus J.C.Mikan também será realizada. No segundo eixo do projeto - ASTERACEAE - os estudos serão focados na subfamília Barnadesioideae, o grupo-irmão de todas as outras Asteraceae. Este estudo tem por objetivos investigar a monofilia dos gêneros em Barnadesioideae e das classificações infragenéricas de Dasyphyllum, Chuquiraga e Barnadesia com a utilização de dados moleculares. As hipóteses filogenéticas serão associadas a estudos de biogeográfia histórica como áreas ancestrais, diversificação e tempos de divergência. O terceiro eixo é focado na família RUBIACEAE, com estudos de revisão do gênero neotropical Simira Aubl., com 40-50 espécies da América Central ao norte da Argentina. Outro gênero da mesma família, Rudgea Salisb., com ca. 100 espécies, será estudado, com uma sinopse do gênero para o Brasil e também uma análise filogenética e biogeográfica para o grupo como um todo. Outros projetos paralelos sobre floras e levantamentos florísticos terão amostras coletadas, maximizando o uso de recursos. Em todos os projetos serão coletadas amostras em campo, para extração de DNA para possíveis estudos filogenéticos futuros, além de haver a possibilidade de descrição de espécies novas para a ciência.

Subtribe Galipeinae (tribe Galipeeae, subfamily Rutoideae) is the most diverse group of Neotropical Rutaceae, with 28 genera and approximately 130 species. One of its genera is Almeidea, whose species are morphologically similar to those of the genus Conchocarpus. Species of Almeidea occur in the Atlantic Rain Forest of Eastern Brazil, with one species (Almeidea rubra) also present in Bolivia. The objective of this study was to perform a phylogenetic analysis of Almeidea, using a broader sampling of Galipeinae and other Neotropical Rutaceae, the first such study focused on this subtribe. To achieve this objective, morphological data and molecular data from the nuclear markers ITS-1 and ITS-2 and the plastid markers trnL-trnF and rps16 were obtained. Representatives of eight genera of Galipeinae and three genera of Pilocarpinae (included also in Galipeeae) and Hortia (closely related to Galipeeae) were used. Five species of Almeidea and seven of Conchocarpus were included, given the morphological proximity between these two genera. Individual (for each molecular marker) and combined phylogenetic analyses were made, using parsimony and Bayesian inference as optimization criteria. Results showed Galipeinae as monophyletic, with the species of Almeidea also monophyletic (supported by the presence of pantocolporate pollen) and nested in a clade with a group of species of Conchocarpus, a non-monophyletic group. Additionally, C. concinnus appeared in a group with Andreadoxa, Erythrochiton, and Neoraputia, other members of Galipeinae. As a result, Conchocarpus would be monophyletic only with the exclusion of a group of species related to C. concinnus and with the inclusion of all species of Almeidea with the group of species of Conchocarpus that includes its type species, C. macrophyllus. Thus, species of Almeidea are transferred to Conchocarpus, and the new combinations are made here. (Auxílio Publicação Fapesp)

A tribo Galipeeae (subfamília Rutoideae) é a maior grupo taxonômico da família Rutaceae, com ca. 30 gêneros e mais de 200 espécies exclusivamente neotropicais. A grande maioria dos gêneros e espécies ocorre no Brasil, especialmente em áreas da Mata Atlântica. A tribo está dividida tradicionalmente em duas subtribos, Galipeinae e Pilocarpinae, delimitadas principalmente pela presença de flores zigomorfas em Galipeinae(actinomorfas em Pilocarpinae) e pela presença de estaminódios em Galipeinae (ausentes em Pilocarpinae). Sendo tão diverso, há problemas em se saber se Galipeeae corresponde a um grupo monofilético, dados os resultados obtidos em alguns estudos recentes da família Rutaceae com o uso de dados moleculares. Por outro lado, há também dúvidas se as duas subtribos que compõe a tribo Galipeeae são monofiléticos, do mesmo modo que alguns gêneros subordinados a estas subtribos, como Conchocarpus (Galipeinae) e Esenbeckia (Pilocarpinae), os dois maiores gêneros de cada subtribo. Esse projeto tem como um dos objetivos, portanto,avaliar a filogenia de Galipeeae, utilizando a metodologia cladística em um contexto molecular, na tentativa de clarificar as relações entre os gêneros e apresentar nova proposta de circunscrição para os grupos em questão. Pra tanto serão utilizadas sequencias de DNA de cloroplasto (rps-16 e trnL-F) e do núcleo (região ITS), com parcimônia como critério de escolha de árvores e análise bayesiana. Algumas características morfológicas como grau de conação das pétalas, dos carpelos e zigomorfia da corola serão otimizadas nas árvores moleculares resultantes. Serão incluídos nas análises também gêneros que emergiram como próximos aGalipeeae em estudos recentes, como Balfourodendron, Helietta e Hortia. (Bolsa de Produtividade em Pesquisa CNPQ Nível 2, Processo 309994/2012-8)

Coleções científicas biológicas encerram uma incomensurável quantidade de informações sobre os mais diversos aspectos da Biodiversidade. Seus dados contribuem para as mais diversas aéreas da ciência e do interesse público, tais como: investigações em evolução, taxonomia, sistemática e biogeografia; saúde pública, segurança residencial, controle de pragas e espécies invasoras; estudos de avaliação, conservação e planejamento ambiental, entre muitos outras. Com advento da internet e o acelerado processo de desenvolvimento econômico, a demanda por informações biológicas e, conseqüentemente, pela disponibilização de dados qualificados (auditados) de coleções científicas é crescente. Notoriamente, as Universidades hospedam muitos dos mais importantes acervos biológicos, os quais atuam como esteio acadêmico para pesquisa e para formação de recursos humanos altamente qualificados para a investigação da Biodiversidade. No entanto, estas coleções, geralmente por carecerem de um comprometimento institucional formal, são as que mais sofrem riscos, inclusive quanto à salvaguarda de seus dados. O Departamento de Biologia da Faculdade de Filosofia, Ciências e Letras de Ribeirão Preto da Universidade de São Paulo (DB/FFCLRP/USP) abriga o maior acervo biológico de todos os campi da Universidade de São Paulo, com 12 coleções contendo mais de 800.000 espécimes de diversos grupos de animais, de fungos e de vegetais. Estas encontram-se em diferentes níveis de desenvolvimento quanto à informatização e disponibilização on-line de seus dados. Tendo em vista os propósitos desta Chamada, que focalizam a informatização e a disponibilização de dados de acervos biológicos com vistas ao estabelecimento de políticas públicas direcionadas à Conservação, os seguintes objetivos foram delineados: 1) digitalizar todos os lotes/espécimes ainda não processados em todos os acervos do DB/FFCLRP/USP, 2) revisar os dados primários (localidade, coletores e data) de todos os registros; 3) geo-referenciar todos os registros; 4) triar e identificar todo material nos acervos que ainda não foi estudado; 5) revisar as identificações dos espécimes de grupos taxonômicos complexos, com apoio de pesquisadores colaboradores; 6) integrar as coleções malacológica (moluscos), ornitológica (aves) e mastozoológica (mamíferos) por meio da migração de dados para o programa Specify 6.0; 7) unificar todas as coleções em uma plataforma única, cujos dados poderão ser acessados pelo website dos acervos do DB/FFCLRP (a ser criado) e pelo site do SpeciesLink (http://splink.cria.org.br/); 8) disponibilizar fotografias de alta resolução de exemplares-tipo e aqueles considerados de importância; 9) disponibilizar pela internet um conjunto de cerca de 1.500 radiografias já tiradas e todas as demais que serão geradas durante a vigência do projeto; e 10) treinar técnicos em curadoria científica. Estes objetivos serão levados a cabo com a auditoria dos dados taxonômicos, a ser feita com apoio de pesquisadores visitantes, com a digitação, revisão e geo-referenciamento dos dados, a ser feita com apoio de técnicos. Os dados auditados serão disponibilizados no website dos acervos do DB/FFCLRP/USP e na plataforma do SpeciesLink. A obtenção das fotografias de alta resolução será feita por meio de equipamentos fotográficos digitais, aqui solicitados. Estas, juntamente com radiografias de alta resolução serão disponibilizadas no website dos acervos do DB/FFCLRP/USP.

The observed and predicted rise in global atmospheric carbon dioxide concentration ([C02]), together with potential global warming and changes in precipitation, will undoubtedly have a significant economical and ecological impact on world agricultural crop plants, grasslands and forests. However, the response of tropical species to elevated [C02] and warming has received little attention to date. The major contribution of this research proposal to FAPESP-RPGCC is regarding the production of new and relevant scientific knowledge with emphasis in adaptation of tropical grazing species to a conservative climate change scenario. This proposal has been specifically designed to address a number of highly focused scientific questions in an interdisciplinary approach (in a national and international collaborative effort among agronomists, biologists, plant physiologists, molecular biologists, husbandry specialists) in order to provide milestones and scientific deliverables regarding the responses of contrasting tropical plants to global climate change. This research proposal aims to determine the effects of elevated CO2 (600 ppm) and warming (+ 2C), induced by infrared heaters, on the physiological, gene expression, biochemical, growth, carbon and nitrogen dynamics and yield responses of two tropical grazing species Panicum maximum (C4 grass) and Stylosanthes. guianensis (C3 legume) grown in consortium on a climate-change impact experiment using a miniF ACE (Free air CO2 enrichment) system. The hypothesis of the proposal is that exposure of plants to high [C02] impact positively the performance of both functional groups grown in consortium, but the responses of plants will be modified by effect of warning. The major challenge of this project is that it will provide the first study concerning adaptation of grass and leguminous plants growing in consortium to the climate expected 50 years from now and regarding the ability of grazing plants to act as CO2 sink in Brazilian tropics. (AU)

Esta proposta solicita recursos para a suplementação de projeto enviado ao CNPq no último mês de setembro, para a realização de expedições de coleta a localidades ou regiões selecionados pelo PROPONENTE e COLABORADORES, durante quatro anos, com base em experiências anteriores de trabalho de campo ou de laboratório (exame de exsicatas) que evidenciaram a presença de taxa não descritos ou já descritos mas com amostragem deficiente para estudos morfológicos ou moleculares. Visando a maximização dos esforços, serão associados às coletas dos taxa específicos o recolhimento de espécimes da vegetação em geral e amostras de DNA de todas as coletas, com subseqüente depósito em banco de DNA. Dissertações e teses já em andamento, ou que serão iniciadas nos próximos anos, irão beneficiar-se diretamente com as coletas. Ou seja, além de complementar ou dar continuidade a estudos que resultarão, na hipótese de localização e coleta dos taxa visados, em diversos artigos científicos em taxonomia vegetal, a proposta aqui apresentada resultará também em incremento das coleções abrigadas nos herbários mencionados, como também no aumento da coleção de amostras de DNA do banco selecionado. Essas coleções poderão ser utilizadas em estudos futuros por quaisquer outros pesquisadores interessados, já que o acervo é disponível para intercâmbio nacional e internacional, obedecendo a legislação pertinente. (Projeto Auxílio Regular Fapesp Processo 2010/17400-3)

O presente projeto tem como objetivo efetuar uma análise cladística do gênero Rudgea (Rubiaceae) baseada em dados moleculares e também uma realizar uma sinopse para o gênero, aliada a uma análise de evolução de caracteres morfológicos. Rudgea é um gênero exclusivamente neotropical, com ca. 100 espécies, que estão distribuídas do México a Argentina e possuem dois principais centros de diversidade, um no Oeste da América do Sul e outro no Sudeste do Brasil, sendo que os principais ambientes ocupados pelas espécies são as florestas úmidas da Amazônia e da Mata Atlântica brasileira. O estudo filogenético será baseado em dados moleculares, no qual serão utilizados a região trnl-trnf e o íntron rps-16 do cloroplasto e a região nuclear ITS (ITS1, 5.8s e ITS2). As análises serão feitas segundo os critérios da máxima parcimônia, máxima verossimilhança e de análise bayesiana. Caracteres morfológicos serão selecionados para uma análise de evolução no grupo, pois uma filogenia molecular aliada à identificação de possívei

Esta proposta visa o estudo de distribuição, riqueza, conservação e aspectos taxonômicos do gênero Davilla nos neotrópicos, utilizando modelagem de distribuição potencial. As distribuições serão realizadas utilizando o algoritmo Maxent, do qual produz extrapolação da distribuição das espécies no espaço geográfico, a partir de dados primários de ocorrência. As distribuições de todas as espécies serão sobrepostas, gerando um mapa de riqueza potencial para as espécies deste gênero. Parâmetros conservacionistas como espécies raras, zonas de endemismo, zonas de alta riqueza, áreas de preservação ambiental, serão confrontados com os resultados da distribuição das espécies, buscando indicar áreas prioritárias para a conservação do grupo. Além disso, inferências taxonômicas sobre complexos de espécies como Davilla lacunosa e D. elliptica serão testados utilizando os parâmetros de modelagem de distribuição e aspectos morfológicos. Os dados resultantes de visitas a herbários e coletas também servirão como subsídio para a confecção da monografia de Dilleniaceae para a Flora Fanerogâmica do Estado de São Paulo, coordenada pelo Instituto de Botânica de São Paulo e outras instituições paulistas. (562282/2010-6 - PROTAX) Edital MCT/CNPq/MEC/CAPES/PROTAX n 52/2010 - Programa de Capacitação em Taxonomia

A subtribo Galipeinae (da tribo Galipeae) é a maior grupo taxonômico da famíliaRutaceae, com ca. 26 gêneros e 160 espécies exclusivamente neotropicais. Dessas, ca.120 espécies (22 gêneros) ocorrem no Brasil, 45 (43 brasileiras) pertencentes aogênero Conchocarpus. Sendo tão diverso, há problemas na delimitação genérica dealguns grupos, os gêneros definidos por limitados conjuntos de estados de caráter, enão por estados de caráter exclusivos (sinapomorfias). Vários gêneros são monotípicosou com menos de cinco espécies. Além disso, estudos moleculares recentesdemonstraram que a subtribo não é monofilética, necessitando ser re-circunscrita. Esseprojeto tem como um dos objetivos avaliar a filogenia de Galipeineae, utilizando ametodologia cladística em um contexto molecular, na tentativa de clarificar as relaçõesentre os gêneros e apresentar nova proposta de circunscrição para alguns grupos,notadamente Conchocarpus, além de testar a própria circunscrição da subtribo.Características morfológicas como grau de conação das pétalas, dos carpelos ezigomorfia da corola serão otimizadas nas árvores moleculares resultantes, na tentativade relacionar as características florais e do fruto com possíveis polinizadores edispersores. Serão incluídos nas análises também gêneros que emergiram comopróximos a Galipeinae em estudos recentes (como Hortia), que fazem parte de umgrupo informalmente denominado #8213;Galipeinae expandida(Bolsa Produtividade em Pesquisa Nível 2, Processo 307627/2009-8)

O desenvolvimento da presente proposta, além da sua importância para o próprio PG em Entomologia, proporcionando aprimoramento e consolidação de várias linhas de pesquisa, produzirá, também, subsídios importantes para o avanço tecnológico necessário para a utilização das espécies de abelhas em grande escala como mais uma ferramenta disponível para a conservação de áreas naturais e para nossa agricultura. Dentre os polinizadores, as abelhas estão entre os mais importantes nos ecossistemas naturais e agroecossistemas, principalmente pela facilidade no seu manejo, além de serem especializadas para muitos tipos de flores e haver muitas espécies no mundo todo. A identificação das plantas que mantém as abelhas tornou-se de grande importância para a elaboração de planos de manejo e conservação em áreas de vegetação nativa e áreas cultivadas, o que poderia minimizar os impactos gerados pelas ações antrópicas. Mais do que simplesmente a elaboração de listas de espécies visitadas e/ou polinizadas, é necessário também analisar os padrões de utilização das plantas na dieta das abelhas em uma escala espaço-temporal. Nesse contexto, a análise polínica é uma ferramenta importante para definir parâmetros quantitativos e qualitativos que possam auxiliar: na avaliação da amplitude do nicho alimentar das abelhas, na determinação dos padrões de escolha de espécies-chave e na compreensão das redes de interações que se estabelecem entre as espécies de abelhas e espécies de plantas em um determinado ecossistema. A organização destes dados a partir de tais técnicas e parâmetros para análises de redes de interações pode ajudar a caracterizar algumas das propriedades dessas interações e suas conseqüências para ações de conservação das abelhas e outros polinizadores.

A presente proposta encontra-se inserida no Plano de Metas do Departamento de Biologia (DB) da FFCLRP/USP que visa melhorar e capacitar as coleções cientificas presentes no DB. Tais coleções abrangem peixes, insetos (himenópteros, com ênfase em abelhas, vespas e dípteros), crustáceos, répteis, fósseis, plantas e fungos. Dentre estas coleções podem ser destacadas a coleção de abelhas sem ferrão (com mais de 250 mil registros), a coleção de peixes do Laboratório de Ictiologia de Ribeirão Preto e o Herbário do Departamento de Biologia (Herbário SPFR). Tanto as coleções maiores como as menores estão associadas a laboratórios e linhas de pesquisa dos docentes, sendo de importância fundamental para a consecução de suas pesquisas e também para a educação, estando disponíveis para a consulta por pesquisadores externos, alunos de pós-graduação e graduação da instituição e do público externo em geral. Os objetivos deste projeto são: 1) melhorar as condições de acomodação destas coleções, através da aquisição de mobiliário específico e adequação do espaço; 2) informatizar estas coleções, através da aquisição de equipamentos (computadores, scanners e máquinas fotográficas) e a contratação (por meio de serviços de terceiros) de pessoal para digitalizar e disponibilizar os acervos on-line. De caráter inovador, os registros de nossas coleções serão conectados às filogenias mais atuais de cada grande grupo biológico em questão, o que permitirá efetuar um planejamento mais eficiente da pesquisa biológica, otimizar o uso do material da coleção localmente e, de caráter experimental, induzir a utilização da informação filogenética na Conservação. Com a melhoria das coleções, tanto do ponto de vista de uso do espaço e acomodação do acervo, quanto de informatização do acervo e sua disponibilizarão on-line, pretende-se dar novo impulso à pesquisa ligada à sistemática e taxonômica, bem como a estudos ligados à conservação.

A subtribo Galipeinae (da tribo Galipeae) é a maior grupo taxonômico da família Rutaceae, com ca. 26 gêneros e 160 espécies exclusivamente neotropicais. Dessas, ca. 120 espécies (22 gêneros) ocorrem no Brasil, 45 (43 brasileiras) pertencentes ao gênero Conchocarpus. Sendo tão diverso, há problemas na delimitação genérica de alguns grupos, os gêneros definidos por limitados conjuntos de estados de caráter, e não por estados de caráter exclusivos (sinapomorfias). Vários gêneros são monotípicos ou com menos de cinco espécies. Além disso, estudos moleculares recentes demonstraram que a subtribo não é monofilética, necessitando ser re-circunscrita. Esse projeto tem como um dos objetivos avaliar a filogenia de Galipeineae, utilizando a metodologia cladística em um contexto molecular, na tentativa de clarificar as relações entre os gêneros e apresentar nova proposta de circunscrição para alguns grupos, notadamente Conchocarpus, além de testar a própria circunscrição da subtribo. Características morfológicas como grau de conação das pétalas, dos carpelos e zigomorfia da corola serão otimizadas nas árvores moleculares resultantes, na tentativa de relacionar as características florais e do fruto com possíveis polinizadores e dispersores. Serão incluídos nas análises também gêneros que emergiram como próximos a Galipeinae em estudos recentes (como Hortia), que fazem parte de um grupo informalmente denominado "Galipeinae expandida". Programa Jovem Pesquisador - Fapesp

A subtribo Galipeinae (da tribo Galipeae), como definida tradicionalmente, é a maior grupo taxonômico da família Rutaceae, com ca. 160 espécies em 26 gêneros, exclusivamente neotropicais. Dessas, ca. 120 espécies (22 gêneros) ocorrem no Brasil. Só o gênero Conchocarpus possui 45 espécies (43 brasileiras). Sendo tão diverso, há problemas na delimitação genérica de alguns grupos, os gêneros definidos por limitados conjuntos de estados de caráter, e não por estados de caráter exclusivos (sinapomorfias). Vários gêneros são monotípicos ou com menos de cinco espécies. Além disso, estudos moleculares recentes demonstraram que a subtribo não é monofilética, necessitando ser re-circunscrita. Esse trabalho tem como objetivos avaliar a filogenia de Galipeineae, utilizando a metodologia cladística em um contexto molecular, na tentativa de clarificar as relações entre os gêneros e apresentar nova proposta de circunscrição para alguns grupos, notadamente Conchocarpus, além de testar a própria circunscrição da subtribo. Características morfológicas como grau de conação das pétalas, dos carpelos e zigomorfia da corola serão otimizadas nas árvores moleculares resultantes, na tentativa de relacionar as características florais e do fruto com possíveis polinizadores e dispersores. Serão incluídos nas análises também gêneros que emergiram como próximos à Galipeinae em estudos recentes (como Hortia), que fazem parte de um grupo informalmente denominado Galipeinae expandida. (Projeto USP - Novos Docentes)