Eduardo Antônio Donadi.

Sou o supervisor do laboratório de HLA do Hemocentro da FMRP-USP que centraliza a tipifificação e as provas cruzadas dos pacientes com insuficência renal do Interior do estado de São Paulo, realizando cerca de 1000 tipificaçãoes por mês dos alllelos HLA de classe I e II para avaliar compatibiolidade entre receptores e doadores e envio dessas tipificaçoes para o REDOME no RJ para cadastramento desses doadores esse registro,

As doenças desmielinizantes (DD) estão relacionadas à perda da bainha de mielina dos neurônios, usualmente desencadeada por mecanismos imunológicos, comprometendo a transmissão do sinal elétrico em resposta aos estímulos do ambiente, ocasionando incapacidade motora, cognitiva ou ambas. A doença pode ser herdada ou adquirida, destacando aquelas secundárias à infecção viral, pois o mimetismo molecular entre peptídeos virais e dos componentes da bainha gera clones de linfócitos T e B autorreativos, promovendo inflamação e lesão neural. O objetivo desse projeto é esclarecer os mecanismos patogênicos da desmielinização por meio do estudo dos componentes genéticos e imunológicos associados às diferentes DD na população brasileira, cuja ancestralidade miscigenada pode contribuir para processos adaptativos distintos de outras populações. Essa diferença é importante na definição de fatores etiopatogênicos, caracterização clínica da doença, na definição de risco de evolução para formas graves, decisão terapêutica e seguimento do paciente. Neste projeto, analisaremos uma amostra de pacientes registrados em unidade de referência para DD do SUS, sequenciaremos o genoma completo e identificaremos variantes comuns e raras associadas à susceptibilidade e gravidade da doença. Diante da complexidade dos dados, utilizaremos a estratégia de aprendizado de máquina para gerar um modelo genético/imunológico explicativo da lesão neural na DD. A partir desses dados, construiremos testes moleculares, baseado em painel de genes para o diagnóstico diferencial das DD e classificação de risco, com menor custo de execução, mais amigável e facilmente escalonado para a rotina do SUS, com impacto nas políticas de promoção integral de saúde de portadores de doenças crônicas no país, e inclusão de pacientes com incapacidades. Investiremos na capacitação de profissionais para a integração da bioinformática e inteligência artificial na medicina e na divulgação sobre medicina de precisão.

Tanto Aire como as moléculas não clássicas de histocompatibilidade estão associados com tolerância imunológica por mecanismos diferentes. Este projeto tem como objetivo reduzir a expressão do gene AIRE e verificar a sua implicação na expressão de moléculas não clássicas de histocompatibildade em modelos murinos. Ainda, embasados nas descrições de imunodeficiências humanas associadas com defeitos do genes AIRE, vamos sequenciar o gene AIRE em pacientes com perda da tolerãncia aos autoantígenos, como lúpus eritematoso sistêemico e esclerose sistêemica da infância.

Tanto Aire como as moléculas não clássicas de histocompatibilidade estão associados com tolerância imunológica por mecanismos diferentes. Este projeto tem como objetivo reduzir a expressão do gene AIRE e verificar a sua implicação na expressão de moléculas não clássicas de histocompatibildade em modelos murinos. Ainda, embasados nas descrições de imunodeficiências humanas associadas com defeitos do genes AIRE, vamos sequenciar o gene AIRE em pacientes com perda da tolerãncia aos autoantígenos, como lúpus eritematoso sistêemico e esclerose sistêmica da infância, vituiigo e cãnceres.

Embora o cancer basocelular seja mesno agressivo que o melanoma, pode ser recidivante. Caracteristicamente, os raios ultra-violeta estão implicados na patogenia desse tipo de câncer. Neste estudo, estamos interessados em avaliar a expressão das moléculas não clássicas de histocompatibilidade HLA-E e HLA-G em pacientes provenientes de dois locais com distintas exposições à radiação UV, ou seja de Ribeirão Preto (exposição medina), no Estado de São Paulo, e de Quito no Equador onde a exposição aos raios UV é intensa.

A esclerose múltipla (EM) e a neuromielite ótica (NMO) são doenças autoimunes que apresentam mecanismos patogênicos distintos: a primeira envolvendo mecanismos celulares e humorais contra diversos antígenos, particularmente contra mielina, ao passo que a segunda apresenta anticorpos contra aquaporina 4. |Nosso grupo foi pioneiro na identificação de marcadores de histocompatibilidade diferencialmente associados com essas doenças,sendo o grupo de alelos HLA-DRB1*15 associado com EM e o grupo de alelos HLA-DRB1*03 com NMO. Além desses genes, outros genes de histocompatibilidade não clássicos também estão diferencialmente associados com o desenvolvimento dessas doenças, destacando o gene HLA-G que apresenta associação diferencial na região 3' não traduzida do gene. Este projeto busca encontrar associações dessas doenças com marcadores genéticos e sorológicos continuem a diferenciar essas doenças em termnos de patogenia e resposta ao tratamento.

Avaliação de microRNAS implicados na regulação de genes associados com a patogenia do carcinoma papilífero de tiroide, incluindo HLA-G e BRAF.

A doença de Chagas impõe problema médico social grave na América Latina devido a sua alta morbidade. Os danos tissulares observados em pacientes chagásicos são devidos ao processo inflamatório gerado pela resposta imune exacerbada na tentativa de eliminar o parasito. O estudo de genes e moléculas que controlam a resposta imune é pertinente nas doenças virais e parasitárias. Dentre essas moléculas destacam- se o Human Leukocyte Antigen G (HLA-G) e o E (HLA-E), que inibem o processo de ativação das células T e B e a atividade citolítica das células Natural Killer (NK) e T CD8+, além de induzirem células T reguladoras. Considerando a importância das moléculas imunoreguladoras nas diferentes infecções humanas, os objetivos deste estudo são: i) avaliar a expressão das moléculas HLA-G e HLA-E no coração, esôfago e cólon de pacientes chagásicos; ii) avaliar o nível de HLA-G solúvel no plasma de pacientes chagásicos; iii) tipificar os genes HLA-G e HLA-E utilizando a tecnologia de sequenciamento de nova geração; e iv) avaliar o perfil de expressão gênica diferencial (mRNA) nas células linfomononucleares do sangue periférico de pacientes chagásicos.

Estima-se que, até 2030, mais de 400 milhões de pessoas no mundo apresentem diabetes. Diversos tipos de diabetes mellitus têm sido descritos, incluindo o multigênico do tipo 1 (DM-1), de natureza autoimune ou idiopático, os monogênicos, o gestacional (DMG) e o do tipo 2 (DM-2). O diabetes mellitus gestacional é o distúrbio mais comum da gravidez. A definição padrão do DMG consiste no metabolismo anormal da glicose diagnosticado pela primeira vez durante a gestação. Mulheres que têm história de DMG geralmente apresentam diabetes pós-parto, resistência à insulina, síndrome metabólica, hipertensão e dislipidemia. A detecção precoce deste estado metabólico pode permitir uma intervenção prévia para impedir ou mesmo retardar o aparecimento dos outros tipos de diabetes. Alguns estudos em mulheres com DMG têm apontado indução de genes envolvidos com resposta imune, particularmente aqueles associados com inflamação. Neste contexto, o presente projeto visa detectar polimorfismos e haplótipos dos genes HLA de classe I (considerando todos os seus segmentos - promotor, codificador e 3' não traduzida) associados com susceptibilidade ao DMG e avaliar computacionalmente os mecanismos subjacentes a estas associações. Ainda, o projeto visa detectar microRNAs expressos diferencialmente e que seriam marcadores para o DMG, além da construção de redes de interação microRNAs e RNAs mensageiros de genes envolvidos com o DMG.

Desde 2014, temos sido procurados pelas Universidades do Perú, Equador e Colômbia para que os docEntes de algumas universidades desses países façam seus doutorados juntos à FMRP-USP. Assim, já foram titulados cerca de 40 alunos da Universidad Central del Ecuador e e vários estão em fase de titulção ou postulando suas candicaturas ao doutorado nos programas de pós-graduação da FMRP-USP..

Estudo de diversos genes do complexo principal de histocompatibilidade de classe I e II em pacientes com diferentes tipos de diabetes, avaliando fatores transcricionais e pós-transcricionais associados com a função desses genes.

Avaliar os perfis transcricionais, usando sequenciamento de nova geração, em pacientes com diabetes do tipo 1 ou 2, apresentando ou não complicações microvasculares.

O papel fisiológico de expressão de moléculas não clássicas de histocompatibilidade ainda é pobremente entendido. Nesse contexto, estamos estudando a expressão constitutiva dessas moléculas em diversos tecidos murinos, e ainda, em a modificação dessa expressão em doenças, em camundongos de diferentes cepas. Ainda, considerando que algumas dessas moléculas têm potencial tolerogênico, estamos avaliação a interação delas com o gene AIRE, caracteristicamente associado com tolerância tímica.

A malária é uma das principais doenças infecciosas na àfrica. Em parceria com pesquisadores da França e do Benin, estamos avlaindo o papel dos genes não clássicos de histocompatibilidade em grávidas e em seus filhos

A malária é uma das principais doenças infecciosas na àfrica. Em parceria com pesquisadores da França e do Benin, estamos avlaindo o papel dos genes não clássicos de histocompatibilidade em grávidas e em seus filhos

Considerando que as drogas remissivas de atividade reumática apresentam boa resposta em alguns pacientes mas não em outros, a proposta é estudar a expressão gênica diferencial (transcriptoma e miRnoma) em pacientes que respondem ou não ao metotrexato ou aos agentes biológicos, particularmente, os que inibem o TNF

As ferramentas de bioinformática têm contribuído para avaliação de elementos de regulação transcricional (fatores de transcrição), pós-transcricionais para o entendimento da regulação da expressão gênica, possibilitando a identificação de elementos de regulação para posteriores estudos in vitro. Nesse aspecto, estamos estudando os elementos de regulação, principalmente, em genes do complexo principal de histocompatibilidade. Ainda, estamos avaliando modelos de proteínas, segundo as variabilidades alélicas de moléculas codificadas pelo complexo principal de histocompatibilidade.

Identificar a expressão gênica em grande escala (perfil do transcriptoma) de pacientes com DM2, DMG e seus respectivos controles utilizando a metodologia de DNA microarrays. Ferramentas de bioinformática serão utilizadas nos estudos de alterações metabólicas ou do sistema imune compartilhados entre os controles e entre si, na possibilidade de compartilhamento de perfis de expressão gênica.

Considerando que o início da doença coincide com o final da destruição imunológica das células beta pancreáticas, o estudo do transcriptoma desses pacientes revelou a modulação de diversos genes associados com apoptose, função do sistema imune e metabolismo de DNA, RNA, lípides e proteínas.

Avaliar os diferentes perfis transcricionais em pacientes com lúpus, estratificados segunda a atividade da doença.

Diversos genes que codificam moléculas importantes da resposta imune apresentam sítios polimórficos, responsáveis pela modificação da função ou magnitude de produção da proteína codificada. Assim, nesta linha estamos avaliando sítios polimórficos de genes do complexo principal de histocompatibilidade (genes clássicos HLA-A, -B, C DR e DQ e não clássicos HLA-E e G) em doenças auto-imunes endocrinológicas (diabetes mellitus tipo 1, doença de Graves), reumatológicas ( artrtite reumatóide do adulto, lúpus eritematosos sistêmico, esclerose sistêmica) e neurológicas (esclerose múltipla, neuromielite óptica0, em doenças infecciosas crônicas (aids, hepatites, HPV, COVID-19, malária), neoplasias (tumores de rins) e ainda em alotrransplantes renais e hepáticos.